具有遗传印记效应传递/不平衡检验(TDT)的功效(英文)

根据Knapp在 1999年提出的求TDT渐近功效的方法 ,应用标准的统计大样本理论 ,从两个方面对Knapp的方法进行了推广 :(1)在疾病的遗传中考查了遗传印记的影响 ;(2 )在求概率时考查了标记位点与候选疾病位点之间的位置关系 .

肿瘤坏死因子α基因(TNFα)-G308A多态性与精神分裂症的关联

目的 :探讨肿瘤坏死因子α基因 (TNFα) -G3 0 8A多态性与精神分裂症的关系。方法 :收集14 1个核心家系 ,每家有 1名符合ICD -10精神分裂症诊断标准的患者 ,患者的生物学父母均健在 ;用聚合酶链式反应 -限制性片段长度多态性 (PCR -basedRFLP)分析方法检测所有研究对象的TNFα -G3 0 8A基因型。结果 :传递不平衡检验 (TDT)显示等位基因的传递具有统计学显著性差异 ( χ2TDT=7 70 44 ,P =0 0 0 5 )。结论 :肿瘤坏死因子α基因 (TNFα) -G3 0 8A多态性与精神分裂症相关联 ,支持肿瘤坏死因子α基因(TNFα)是精神分裂症的候选基因。

D1s2628、D1s2673、D16s517与系统性红斑狼疮幼年发病相关性研究

为探讨系统性红斑狼疮(SLE)幼年发病与成人期发病在遗传基础方面是否存在差异 ,选择与SLE成人期发病有关的1q22～24区域的2个微卫星标记D1s2628和D1s2673及16q12区域的1个微卫星标记D16S517,在80例幼年SLE患儿及其核心家系中应用荧光标记PCR微卫星分型技术对其进行基因分型 ,经传递不平衡分析(transmissiondisquilibriumtest,TDT)软件统计处理。结果D1s2628和D1s2673各有一等位基因D1s2628-118bp和D1s2673-102bp 与幼年SLE发病存在连锁不平衡(其传递∶不传递分别为39∶20,P=0.0134;43∶18,P=0.0014)。该结果包括阳性传递的等位基因型与在SLE成人期发病组中所获结论完全一致 ,而与SLE成人期发病有关的D16S517未显示有等位基因与幼年SLE发病有相关性。提示幼年与成人SLE在发病机制上存在遗传基础异同 。

注意缺损多动障碍和儿茶酚-O-甲基转移酶基因无关联性(英文)

以往研究表明,儿茶酚胺系统可能参于注意缺损多动障碍(attentiondeficithyperactivityitydisorder,ADHD)的发生,而儿茶酚胺O甲基转移酶(catechelomethyltransferase,COMT)是一种降解多巴胺和去甲肾上腺素系统的儿茶酚胺神经递质的酶。因此,采用两种以家系为基础的分析方法,即传递不平衡实验(transmissiondisequilibriumtest,TDT)和单倍型为基础的单倍型相对风险率(haplotypebasedhaplotyperelativerisk,HHRR)去探讨COMT和中国人群中79个ADHD核心家系的关联性,ADHD诊断符合DSMIV的诊断标准。TDT(χ2=1.03,df=1,P>0.05)和HHRR(χ2=1.08,df=1,P>0.05)两种方法的分析结果表明,COMT等位基因不能优先传递给ADHD儿童,提示在中国人群中ADHD与COMT基因无关联性。

不同家庭结构下的传递不平衡检验的功效(英文)

近年来 ,连锁和关联分析最流行的方法要属传递不平衡检验 (TDT) 而评估TDT的功效和样本大小至关重要 许多文章已讨论此问题 但以前的方法既不精确也不一般化 他们都作了一个简单的假设 ,即每个家庭仅有一个受累子代或两个受累同胞对或非受累同胞对 一个例外是Chen和Deng发展的方法 但他们并没有考虑不同比例的这些家庭对TDT功效和样本大小的影响 本文应用“PC”软件 ,调查了在四个遗传模式下不同的家庭结构对TDT功效的影响 ,考虑以下三种情形 :(1)不同家庭结构的不同比例 ,(2 )标记和易感基因间的不同重组率 ,(3)父母的不同致病状态 调查具有实践意义 因为在实际中 ,更多的是征集到不同结构的家庭

X伴性遗传疾病易感性基因的定位问题

在具有遗传印记效应的条件下,根据Sp ie lm an等人和K napp的方法,将传递/不平衡检验推广为X伴性遗传疾病的情形.

5-羟色胺转运体基因启动子区与心境障碍的关联分析

目的 探讨 5 羟色胺转运体基因启动子区 5 HTTLPR与心境障碍之间的分子遗传学联系。方法 在中国汉族人群中 ,以心境障碍核心家系作为研究对象 ,根据哈佛大学提供的遗传学研究用诊断性检查表 (DIGS)自编家系调查表 ,采用DSM Ⅳ诊断标准并结合一些心理测评工具 ,以达到表型一致。在 72个情感性精神障碍核心家系 ,2 2 2个家系成员 (其中双相障碍 5 6例 ,重性抑郁症 34例 )中 ,应用聚合酶链反应 (PCR)和限制性片段长度多态性方法 ,对 5 HTT基因启动子区 5 HTTLPR与心境障碍之间的分子遗传学联系进行了以家系为基础的连锁不平衡分析结果 基因型和等位基因频率在心境障碍患病组和父母对照组之间无显著差异。GHRR和HHRR分析以及多等位基因ETDT统计分析也没有发现存在连锁不平衡。 5 HTTLPR位点除了“L”和“S”片段外 ,还发现 2例出现“L+ ”(5 2 8+ bp)片段 ,频率约占 1%。结论 5 HTTLPR在心境障碍的发病中可能不起重要作用。

5-羟色胺转运体基因3’端非编码区与心境障碍的关联分析

目的探讨5-羟色胺转运体(5-HTT)基因3’端非编码区UTRG/T与心境障碍之间的分子遗传学联系。方法在中国汉族人群中,以心境障碍核心家系作为研究对象,根据哈佛大学提供的遗传学研究用诊断性检查表(DIGS)自编家系调查表,采用DSM-IV诊断标准并结合一些心理测评工具,以达到表型一致。在72个情感性精神障碍核心家系,232个家系成员(其中双相障碍56例,重性抑郁症34例)中,应用聚合酶链反应(PCR)和限制性片段长度多态性方法,对5-HTT基因3’端非编码区UTRG/T与心境障碍之间的分子遗传学联系进行了以家系为基础的连锁不平衡分析。结果(1)5-HTT3’UTRG/T位点PCR产物经MseI酶切后,检测出800bp等位基因G片断和745bp及55bp等位基因T片断,等位基因频率分别为88%和12%,等位片断G的频率占明显优势。(2)基因型和等位基因频率在心境障碍患病组和父母对照组之间差异无显著性。GHRR和HHRR分析以及多等位基因ETDT统计分析也没有发现存在连锁不平衡。结论5-HTT3’UTRG/T位点多态性在心境障碍的发病中可能不起重要作用。

5-羟色胺转运体基因第2内含子VNTR与情感性精神障碍的连锁不平衡分析

目的探讨5-羟色胺转运体基因第2内含子VNTR(5-HTTVNTR)位点多态性与情感性精神障碍之间的分子遗传学联系。方法在中国汉族人群中,以情感性精神障碍核心家系作为研究对象,根据美国哈佛大学提供的遗传学研究用诊断性检查表(DIGS)自编家系调查表,采用中国精神疾病分类与诊断标准(CCMD-3)并结合一些心理测评工具,以达到表型一致。在72个情感性精神障碍核心家系的222个家系成员(其中双相情感性精神障碍56例,重性抑郁症34例)中,应用聚合酶链反应(PCR)和限制性片段长度多态性方法,对5-HTTVNTR位点多态性与情感性精神障碍之间的分子遗传学联系进行了以家系为基础的连锁不平衡分析。结果基因型和等位基因频率在情感性精神障碍患者组和父母组之间无显著差异。GHRR和HHRR分析以及多等位基因ETDT统计分析也未发现存在连锁不平衡。5-HTTVNTR位点仅扩增出12和10拷贝两种形式的等位基因片段,其中等位片段12的频率为88%。结论5-HTTVNTR位点多态性在情感性精神障碍疾病的发病中可能不起重要作用。

单纯性马蹄内翻足易感基因位点筛查

目的将人类单纯性马蹄内翻足(ICTEV)易感基因初步定位,为进一步对其克隆提供基础依据。方法选取与肢体发育、关节翻转及与软骨发育相关的基因作为候选基因,在基因内或其附近选取微卫星标记,应用PCR-短串联重复序列(STR)方法扩增微卫星片段,对84个ICTEV核心家系的252名成员进行基因型分析,并进行遗传连锁不平衡检验(TDT)。结果IX型胶原COL9A1基因(6q12-13区域)内及其附近的2个位点-D6S348及509-8B2经TDT检验表明,此2个位点与ICTEV有相关性(分别χ2=42.15,χ2=31.18,P<0.05);其他位点经TDT检验,不存在连锁不平衡(均P>0.05)。结论COL9A1基因可能是ICTEV的候选基因,从而将ICTEV易感基因初步定位于COL9A1基因所在的染色体区域6q12-13。