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溶藻弧菌Ⅲ型分泌系统分子伴侣护航蛋白VscO的基因克隆及其生物信息学分析
被引量:
12
1
作者
庞欢瑛
周泽军
+3 位作者
丁燏
黄郁葱
吴灶和
简纪常
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2014年第6期155-161,共7页
克隆了溶藻弧菌(Vibrio alginolyticus)ZJ03株Ⅲ型分泌系统(T3SS)分子伴侣护航蛋白(Chaperone escort protein)vscO基因,并对其进行生物信息学分析。结果表明,vscO基因全长462 bp,编码153个氨基酸,理论分子量约为18.43 kD,pI值为9.22。...
克隆了溶藻弧菌(Vibrio alginolyticus)ZJ03株Ⅲ型分泌系统(T3SS)分子伴侣护航蛋白(Chaperone escort protein)vscO基因,并对其进行生物信息学分析。结果表明,vscO基因全长462 bp,编码153个氨基酸,理论分子量约为18.43 kD,pI值为9.22。细胞定位分析显示vscO基因位于外周质,不存在信号肽,无跨膜区。vscO基因具有转录起始区-35区和-10区,以及翻译识别信号SD序列(Shine-Dalgarno sequence)。该氨基酸序列含有多种活性位点,如蛋白激酶C磷酸化位点等。系统进化树发现溶藻弧菌的VscO蛋白与副溶血弧菌聚为同一亚族。VscO亚基三维结构模型显示其与副溶血弧菌T3SS的YscO蛋白有相似构型。信号通路分析推测VscO位于T3SS的针状样结构上。蛋白网络互作图谱发现VscO与10种T3SS蛋白具有相邻关系。本研究结果将为溶藻弧菌Ⅲ型分泌系统护航机制的研究奠定基础。
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关键词
溶藻弧菌
Ⅲ型分泌系统(T3SS)
分子伴侣护航
vsco
基因
下载PDF
职称材料
溶藻弧菌Ⅲ型分泌系统注射装置蛋白VscO的原核表达及免疫原性
被引量:
7
2
作者
庞欢瑛
周泽军
+3 位作者
丁燏
黄郁葱
吴灶和
简纪常
《广东海洋大学学报》
CAS
2014年第3期41-46,共6页
为探究溶藻弧菌(Vibrio alginolyticus)ZJ03株Ⅲ型分泌系统(Type III secretion system,T3SS)注射装置蛋白VscO作为疫苗候选抗原的可能性,根据GeneBank上登陆的溶藻弧菌VscO序列(NO.KJ179947),设计1对带酶切位点的特异性引物,PCR扩增vsc...
为探究溶藻弧菌(Vibrio alginolyticus)ZJ03株Ⅲ型分泌系统(Type III secretion system,T3SS)注射装置蛋白VscO作为疫苗候选抗原的可能性,根据GeneBank上登陆的溶藻弧菌VscO序列(NO.KJ179947),设计1对带酶切位点的特异性引物,PCR扩增vscO基因,序列分析结果显示,该基因全长462 bp,理论分子质量为18.430ku。将vscO基因定向插入原核表达载体pET-28a(+),构建重组表达质粒pET-vscO。用异丙基-β-D-硫代半乳糖苷(IPTG)诱导后,可在大肠杆菌(Escherichia coli)BL21(DE3)中表达分子质量约为22 ku的VscO融合蛋白,且该蛋白主要以包涵体形式存在。VscO蛋白表达和纯化的最优条件为:0.1 mmol/L IPTG、37℃条件下诱导4 h,咪唑洗脱浓度为400 mmol/L。用纯化后的融合蛋白免疫SPF级小鼠,获得高效多克隆抗体。Western-blotting结果表明,鼠抗VscO血清既能与重组VscO蛋白发生反应,也能与分离自溶藻弧菌约22 ku的天然蛋白发生反应,提示T3SS注射装置蛋白VscO可能是溶藻弧菌的重要保护性抗原之一。
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关键词
溶藻弧菌
vsco
基因
Ⅲ型分泌系统
原核表达
免疫原性
下载PDF
职称材料
溶藻弧菌vscO基因在不同环境下的表达差异
被引量:
4
3
作者
庞欢瑛
周泽军
+3 位作者
丁燏
黄郁葱
吴灶和
简纪常
《吉首大学学报(自然科学版)》
CAS
2014年第4期59-63,共5页
为阐明溶藻弧菌vscO的在不同环境下的表达情况,用半定量RT-PCR方法检测vscO mRNA在不同生长时期、不同环境因子(温度、盐度和pH值)培养下的相对表达量.结果表明,溶藻弧菌vscO在对数期,温度为28℃,盐度为2%以及培养基起始pH值为7.0时的...
为阐明溶藻弧菌vscO的在不同环境下的表达情况,用半定量RT-PCR方法检测vscO mRNA在不同生长时期、不同环境因子(温度、盐度和pH值)培养下的相对表达量.结果表明,溶藻弧菌vscO在对数期,温度为28℃,盐度为2%以及培养基起始pH值为7.0时的表达量最高.
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关键词
溶藻弧菌
Ⅲ型分泌系统(T3SS)
vsco
基因
环境因子
基因表达
下载PDF
职称材料
题名
溶藻弧菌Ⅲ型分泌系统分子伴侣护航蛋白VscO的基因克隆及其生物信息学分析
被引量:
12
1
作者
庞欢瑛
周泽军
丁燏
黄郁葱
吴灶和
简纪常
机构
广东海洋大学水产学院
广东省水产经济动物病原生物学及流行病学重点实验室
广东省教育厅水产经济动物病害控制重点实验室
仲恺农业工程学院
出处
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2014年第6期155-161,共7页
基金
国家科技支撑计划(2012BAD17B02)
广东省自然科学基金项目(S2013040014562)
文摘
克隆了溶藻弧菌(Vibrio alginolyticus)ZJ03株Ⅲ型分泌系统(T3SS)分子伴侣护航蛋白(Chaperone escort protein)vscO基因,并对其进行生物信息学分析。结果表明,vscO基因全长462 bp,编码153个氨基酸,理论分子量约为18.43 kD,pI值为9.22。细胞定位分析显示vscO基因位于外周质,不存在信号肽,无跨膜区。vscO基因具有转录起始区-35区和-10区,以及翻译识别信号SD序列(Shine-Dalgarno sequence)。该氨基酸序列含有多种活性位点,如蛋白激酶C磷酸化位点等。系统进化树发现溶藻弧菌的VscO蛋白与副溶血弧菌聚为同一亚族。VscO亚基三维结构模型显示其与副溶血弧菌T3SS的YscO蛋白有相似构型。信号通路分析推测VscO位于T3SS的针状样结构上。蛋白网络互作图谱发现VscO与10种T3SS蛋白具有相邻关系。本研究结果将为溶藻弧菌Ⅲ型分泌系统护航机制的研究奠定基础。
关键词
溶藻弧菌
Ⅲ型分泌系统(T3SS)
分子伴侣护航
vsco
基因
Keywords
Vibrio alginolyticus
T3SS
Chaperone escort
vsco gene
分类号
Q78 [生物学—分子生物学]
下载PDF
职称材料
题名
溶藻弧菌Ⅲ型分泌系统注射装置蛋白VscO的原核表达及免疫原性
被引量:
7
2
作者
庞欢瑛
周泽军
丁燏
黄郁葱
吴灶和
简纪常
机构
广东海洋大学水产学院
广东海洋大学广东省水产经济动物病原生物学及流行病学重点实验室
广东省教育厅水产经济动物病害控制重点实验室
仲恺农业工程学院
出处
《广东海洋大学学报》
CAS
2014年第3期41-46,共6页
基金
国家科技支撑计划(2012BAD17B02
2012 BAD17B03)
广东省自然科学基金(S2013040014562)
文摘
为探究溶藻弧菌(Vibrio alginolyticus)ZJ03株Ⅲ型分泌系统(Type III secretion system,T3SS)注射装置蛋白VscO作为疫苗候选抗原的可能性,根据GeneBank上登陆的溶藻弧菌VscO序列(NO.KJ179947),设计1对带酶切位点的特异性引物,PCR扩增vscO基因,序列分析结果显示,该基因全长462 bp,理论分子质量为18.430ku。将vscO基因定向插入原核表达载体pET-28a(+),构建重组表达质粒pET-vscO。用异丙基-β-D-硫代半乳糖苷(IPTG)诱导后,可在大肠杆菌(Escherichia coli)BL21(DE3)中表达分子质量约为22 ku的VscO融合蛋白,且该蛋白主要以包涵体形式存在。VscO蛋白表达和纯化的最优条件为:0.1 mmol/L IPTG、37℃条件下诱导4 h,咪唑洗脱浓度为400 mmol/L。用纯化后的融合蛋白免疫SPF级小鼠,获得高效多克隆抗体。Western-blotting结果表明,鼠抗VscO血清既能与重组VscO蛋白发生反应,也能与分离自溶藻弧菌约22 ku的天然蛋白发生反应,提示T3SS注射装置蛋白VscO可能是溶藻弧菌的重要保护性抗原之一。
关键词
溶藻弧菌
vsco
基因
Ⅲ型分泌系统
原核表达
免疫原性
Keywords
Vibrio alginolyticus
vsco gene
Type Ⅲ secretion system (T3SS)
Prokaryotic expression
Immunogenicity
分类号
Q786 [生物学—分子生物学]
S917.1 [农业科学—水产科学]
下载PDF
职称材料
题名
溶藻弧菌vscO基因在不同环境下的表达差异
被引量:
4
3
作者
庞欢瑛
周泽军
丁燏
黄郁葱
吴灶和
简纪常
机构
广东海洋大学水产学院
广东省水产经济动物病原生物学及流行病学重点实验室
广东省教育厅水产经济动物病害控制重点实验室
仲恺农业工程学院
出处
《吉首大学学报(自然科学版)》
CAS
2014年第4期59-63,共5页
基金
国家科技支撑计划项目(2012BAD17B02
2012BAD17B03)
广东省自然科学基金资助项目(S2013040014562)
文摘
为阐明溶藻弧菌vscO的在不同环境下的表达情况,用半定量RT-PCR方法检测vscO mRNA在不同生长时期、不同环境因子(温度、盐度和pH值)培养下的相对表达量.结果表明,溶藻弧菌vscO在对数期,温度为28℃,盐度为2%以及培养基起始pH值为7.0时的表达量最高.
关键词
溶藻弧菌
Ⅲ型分泌系统(T3SS)
vsco
基因
环境因子
基因表达
Keywords
Vibrio alginolyticus
T3SS
vsco gene
environmental factors
gene
expression
分类号
Q935 [生物学—微生物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
溶藻弧菌Ⅲ型分泌系统分子伴侣护航蛋白VscO的基因克隆及其生物信息学分析
庞欢瑛
周泽军
丁燏
黄郁葱
吴灶和
简纪常
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2014
12
下载PDF
职称材料
2
溶藻弧菌Ⅲ型分泌系统注射装置蛋白VscO的原核表达及免疫原性
庞欢瑛
周泽军
丁燏
黄郁葱
吴灶和
简纪常
《广东海洋大学学报》
CAS
2014
7
下载PDF
职称材料
3
溶藻弧菌vscO基因在不同环境下的表达差异
庞欢瑛
周泽军
丁燏
黄郁葱
吴灶和
简纪常
《吉首大学学报(自然科学版)》
CAS
2014
4
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职称材料
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