全基因组关联分析筛选文昌鸡体尺性状相关分子标记

【目的】体尺是评价禽类生长特性的主要指标,通过筛选与文昌鸡体尺性状相关的分子标记及候选基因,为解析体尺性状的遗传机制及分子育种提供理论支撑。【方法】利用海南省文昌鸡品系3个世代(n=2024)群体作为研究对象,测定每只鸡在上市日龄的胫长、胫围、体斜长、龙骨长及胸宽等5个体尺性状。采集血液进行鸡“京芯一号”55 K芯片测序及基因分型,使用GEMMA软件与PLINK软件进行全基因组关联分析,鉴定与体尺性状相关的SNP位点和候选基因,通过LD分析鉴定与体尺性状显著相关的单倍型。【结果】表型结果显示,113日龄文昌鸡公鸡平均胫长8.64 cm,胫围0.46 cm,体斜长19.73 cm,龙骨长12.32 cm,胸宽6.81 cm;母鸡平均胫长6.98 cm,胫围0.40 cm,体斜长17.79 cm,龙骨长10.45 cm,胸宽6.24 cm。经过质控后,共保留42206个SNPs和2024个个体用于后续研究。使用Plink软件进行PCA主成分分析,结果发现3个世代群体存在一定的分散情况,因此在GWAS关联分析中加入了前3个主成分作为协变量,以校正群体结构对关联分析的影响。GWAS结果研究共鉴定出19个SNPs位点与胫长性状显著或建议性显著相关(P值分别为2.17789E-06和4.35578E-05),23个SNPs位点与胫围性状显著或建议性显著相关,7个SNPs位点与体斜长性状显著或建议性显著相关,2个SNPs位点与龙骨长性状显著或建议性显著相关,未鉴定出与胸宽性状或建议性显著相关的SNPs位点。通过对显著性位点进行注释,结果共鉴定到16个体尺性状相关的候选基因,包括羧基末端LIM结构域结合蛋白2(LIM domain binding 2,LDB2)、染色体缩合蛋白G(non-SMC condensin I complex subunit G,NCAPG)、序列相似家族184成员B基因(family with sequence similarity 184 member B,FAM184B)、A型钾离子通道调节蛋白4(potassium voltage-gated channel interacting protein 4,KCNIP4)等。通过LD单倍型分析结果显示,GGA4存在3个显著关联的单倍型,对于胫长性状,rs316943436和rs313978573两个位点位于单倍型区块中;对于胫围性状,rs313196946AA、rs316242963、rs315796839、rs313978573、rs734365522共5个位点位于单倍型区块中;对于体斜长性状,只有1个位点(rs313978573)位于单倍型区块中,其中候选基因LDB2和NCAPG在显著的block区块中被注释到。【结论】经GWAS方法筛选出SEPSECS、LGI2、DHX15、KCNIP4、NCAPG、FAM184B、LDB2、CC2D2A作为胫长性状潜在的候选基因;FH、TBC1D1、DTHD1、SEPSECS、LGI2、SOD3、PPARGC1A、KCNIP4、NCAPG、FAM184B、CLRN2、LDB2、TAPT1、CC2D2A作为胫围性状潜在的候选基因,KCNIP4、LDB2、TAPT1、NRXN3作为体斜长性状潜在的候选基因,FAM184B作为龙骨长性状潜在的候选基因。总之,本文确定了LDB2、NCAPG和FAM184B等作为胫长、胫围、体斜长和龙骨长等体尺性状的潜在功能基因。为文昌鸡体尺性能的分子标记辅助选择育种提供理论支撑。

全株玉米青贮对泰州鹅肠道长度、器官指数及血清生化指标的影响

试验旨在研究全株玉米青贮对泰州鹅肠道长度、器官指数及血清生化指标的影响。选取180只35日龄的泰州后备母鹅,随机分为6组,每组3个重复,每个重复10只鹅。对照组饲喂基础饲粮,试验Ⅰ~Ⅴ组利用全株玉米青贮替代10%、20%、30%、40%和50%的基础饲粮。预试期7 d,正式试验期49 d。结果表明,71日龄时,试验Ⅱ组和Ⅳ组空肠、试验Ⅴ组盲肠、试验Ⅳ组直肠长度显著高于对照组(P<0.05);92日龄时,试验Ⅳ组直肠长度显著高于对照组(P<0.05)。71日龄时,试验Ⅴ组肝脏指数优于对照组和试验Ⅰ组、Ⅳ组(P<0.05),肌胃指数大于对照组(P<0.05);92日龄时,试验Ⅱ组、Ⅲ组、Ⅳ组和Ⅴ组血清总蛋白(TP)含量均高于对照组,对照组血清谷草转氨酶(AST)活性高于试验Ⅱ组、Ⅴ组(P<0.05)。研究表明,全株玉米青贮替代基础饲粮对43~92日龄泰州鹅心脏和肝脏发育无负面影响,可以促进消化器官发育,提高蛋白质的合成、代谢和沉积,替代量为20%~30%效果较好。

玉米籽粒长度的全基因组关联分析

【目的】筛选与玉米粒长紧密关联的SNP标记和候选基因,为分子标记辅助选择籽粒较长的玉米材料及克隆相关的功能基因奠定基础。【方法】以80个核心玉米自交系作为关联群体,在2014年和2015年分别将其种植在吉林省长春市和梅河口市,收获后考种。同时采用Illumina Hiseq PE150高通量测序仪对关联群体进行全基因组重测序,将获得的高质量SNP标记用于后续玉米粒长的全基因组关联分析。【结果】不同玉米自交系的籽粒长度遗传变异较大,广义遗传力为83.67%,说明该性状主要受到遗传因素的控制。经过全基因组关联分析,在4个环境下共检测到16个与玉米粒长显著关联(P<10-6)的SNP标记,解释的表型变异率在1.68%~27.61%。其中7个标记位于前人已定位的粒长QTL置信区间内,1个标记在2015年的2个环境中都被检测到。在显著性SNP标记的LD范围内共发掘出GRMZM2G018607、GRMZM2G034882和GRMZM2G322641等3个候选基因,其分别编码ABCF4转运蛋白、WIP2互作蛋白和一个含DUF2346结构域的蛋白质,可能与玉米粒长的发育形成密切相关。【结论】筛选出16个与玉米粒长紧密关联的显著性SNP标记和3个候选基因。

基于光纤Bragg光栅的预应力损失监测技术研究

预应力体系结构主要依靠钢绞线张拉来实施预加应力,钢绞线上建立的预应力值会因孔道摩擦、锚具滑移、混凝土收缩、徐变和钢绞线自身松弛等因素产生损失,其中短期损失使得大型预应力结构各部位预应力水平分布不均,长期损失会逐渐降低重要结构的安全裕度,这都会使结构受力性能难以判断。直接对预应力钢绞线进行全时程全长的预应力损失监控是解决这些问题的有效手段。传统的传感器和测试方法难以满足在这项测试中包含的诸如传感器量程、信号传输线路布设保护以及测试信号抗干扰能力等方面的要求。文中提出采用光纤Bragg光栅的测试技术,利用FRP包裹、钢绞线边丝缠绕保护和其固有的光信号传输中性测量的特点解决了上述问题,尤其适用于有粘结预应力钢绞线监测。

两大全文期刊数据库的特色、分析测试及评价

对重庆维普《中文科技期刊数据库》及清华同方《中国期刊全文数据库(CJFD)》对检索方法、速度、获得方法以及收录范围进行比较分析,为图书馆及读者合理选择和使用全文数据库提供参考。

车头长度对高速列车气动特性与声场特性影响的数值分析及降噪研究

在高速列车车身长度保持一定的情况下,不同长度的车头会对列车整体的气动特性(阻力、升力)、列车表面噪声源分布变化、远声场特性(A计权声压级、脉动声压、声场频率等)造成不同的变化。进行三维建模之后,宽频噪声模型采用RNG k-epsilon模型做定常计算,FW-H声学模型采用大涡模拟(LES)模型进行瞬态计算,对时速为350km·h-1,5~13m不同长度车头的高速列车简化模型进行数值模拟,分析气动特性和声场特性。结果表明:高速列车的整车阻力随车头长度增加先呈现减小趋势,当车头长度达到13m时整车阻力开始增大;高速列车远场声压级随车头长度的增加呈现增加态势。综合阻力与远场声压级随车头长度的非线性变化规律,在高速铁路简化模型下最佳车头长度为9m,可保证在减小行车阻力同时控制噪声对环境的污染。研究结论可为高速列车的减阻降噪提供参考。

切碎长度对玉米青贮品质的影响研究

[目的]利用全株玉米进行不同切碎长度青贮,探索适宜的切碎长度。[方法]以贵州本地玉米品种为青贮原料,通过感观评定、化学评定以及相关营养指标分析研究不同切碎长度对玉米青贮品质的影响。[结果]不同切碎长度对全株玉米青贮料品质有一定的影响。切碎长度较短的青贮饲料品质优于切碎长度较长的青贮料,其中1.5 cm组优于2 cm组和3 cm组。[结论]该研究结果可用于指导奶牛生产。

不同切割长度全珠小麦青贮营养价值及其对肉牛的饲养评估

本研究旨在评估不同切割长度全珠小麦青贮营养价值及其对肉牛采食量、瘤胃发酵及养分表观消化率的影响。试验将收割的全珠小麦分别切割成10、15和20 cm,然后在发酵罐中密封青贮14周,发酵成品用于评估青贮营养价值。之后选择平均初始体重为(364.87±6.28)kg的36头肉牛用于开展饲养试验,分为3组,T1、T2、T3分别代表10、15和20 cm 3种切割高度的青贮全珠小麦,其在全混合日粮中的添加水平均为60%,试验期持续4周。结果:T3组青贮全珠小麦粗脂肪含量较T1和T2组分别显著提高10.98%和8.01%(P<0.05),而T1组青贮全珠小麦中性洗涤纤维和酸性洗涤纤维含量显著高于T3组(P<0.05)。T2和T3组青贮全珠小麦好氧稳定性、pH及乙酸浓度均显著高于T1组(P<0.05),但T1组乳酸浓度显著高于T2和T3组(P<0.05)。T3组肉牛瘤胃pH最高(P<0.05),同时,T2和T3组肉牛瘤胃乙酸、异丁酸、异戊酸浓度显著高于T1组(P<0.05)。T1组肉牛瘤胃氨氮和挥发性脂肪酸浓度显著高于T3组(P<0.05),而乙酸与丙酸比较显著高于T2和T3组(P<0.05)。T3组肉牛干物质、粗脂肪、中性洗涤纤维表观消化率显著高于T1和T2组(P<0.05)。但T1组肉牛酸性洗涤纤维表观消化率较T2组和T3组分别显著提高9.23%和9.99%(P<0.05)。结论:全珠小麦切割长度为20 cm时可以改善其青贮后的好氧稳定性、粗脂肪和乙酸浓度,与其他2种切割长度的全株小麦青贮相比,20 cm全珠小麦青贮可提高肉牛干物质、粗脂肪和中性洗涤纤维表观消化率。

关于线性代数教学的一些思考

分析了线性代数课程的特点,提出了抓住主线、阐述背景、以问题为导向和加强应用等提高线性代数教学效果的方法.教学实践表明,这些措施有效地提高了教学效果.

浅谈外文期刊图文混排及方正文易在网上的应用

计算机绘图逐渐取代了手工清绘，在Win95／98下运行的方正书版9．0能插入EPS，JPG，TIF等七种图形文件，从而实现了图文混排；而方正文易格式转换软件则能迅速、方便地把多种文件格式（PS，TIF，EPS）和方正各个时期的排版结果（S2，S72，PS2，PS）转换成PDF文件，实现了全文上网。本文探讨了在书版9．0下插入EPS图的技巧和使用文易软件容易出现的问题及解决方法。

全息数字加工交换和屏幕正交检索研究

通过构建灵活的结构化中间存储件和相关交换标准,可以在保证数据结构和存储方式稳定可靠的前提下,同其它多种数据组织和存储体系保持兼容,并与之进行快速安全的数据交换。即利用XML语言,对电子书籍的内容进行拆解,形成若干“具有完整意义的最小数据集合”,使之易于封装为各种不同的格式。由于格式本身只针对于数据,因此与使用的平台或具体的应用无关,可以作为各种格式的转换中介,把这种格式称之为中间格式。

对中医全身望诊信息采集操作规范的思考

从医生缺乏重视程度、缺乏规范指标、缺乏统一标准3个方面来阐述中医全身望诊信息采集操作程序中亟需解决问题,进而根据中医全身望诊自身特点提出强化医生重视程度、统一规范性指标、制定规范的操作程序3个方面进行规范化的策略研究,以期能引起广泛关注并推动全身望诊信息采集操作的进一步规范。

政治运行机制与中国政治运行机制

政治运行机制即政治主体的权力配置及其运行过程。中国政治运行机制的目标模式是建构政党、国家、社会团体、经济文化组织和中央、地方、基层单位、公民个人这样纵横四位一体的政治运行机制。

不同水肥互作处理对樱桃萝卜生长及产量的影响

以樱桃萝卜品种"日本聚宏"为试材,设水分和肥料2个因素,每个因素设3个水平,测定了叶长、根径、植株全重和含水量等指标,对水肥互作效应进行了初步研究。结果表明:随土壤水分或施N肥量增加,樱桃萝卜生长速度呈显著增加的趋势,其中,中等水分条件(70%)和中等施N量(4.5kg/667m2)的组合是最佳的;植株含水量有随土壤水分增加而有增大的趋势,与施N肥量无明显关系。

大型预制混凝土沉箱早期温度裂缝控制施工技术

分析大型混凝土沉箱早期温度裂缝特点及影响因素,提出相应施工技术措施,并结合实例计算大体积混凝土整浇长度,为裂缝控制提供施工依据。

下承式钢板梁整体稳定问题研究

用弹性稳定理论及弹塑性稳定理论 ,对下承式钢板梁的整体稳定问题进行了详细分析 ,由此说明了《铁路桥涵设计规范》( TBJ2 - 85 )附录

绳索长度误差对索网天线网面精度影响的分析方法

为分析绳索长度制造误差对索网天线网面精度的影响,提出了一种整体坐标迭代算法.该算法模拟了索网结构的自由节点在考虑绳索随机长度误差后向其他平衡状态运动的过程.分别使用该算法和有限元法分析了一个环形桁架天线计算模型,并将这两种算法的计算结果做了对比,验证了该算法的正确性、可行性和有效性.使用整体坐标迭代法分析了不同的误差分布、绳索长度公差和绳索预张力对网面精度的影响,并对网面综合误差与绳索长度误差、绳索预张力的关系进行了拟合分析,得到了满足工程需求的拟合关系式.

利用ASP实现中国地震信息网的全文检索功能

介绍利用 ASP技术实现中国地震信息网的全文检索功能。重点介绍索引服务器端对象(Indexing Service Server Side Object)控件的使用。另外 ,查询内容显示也是一个重要的方面。

翡翠贻贝壳长与体重关系的研究

本实验研究了翡翠贻贝（Ｐｅｒｎａｖｉｒｉｄｉｓ）的壳长Ｌ（ｃｍ）与整体湿重Ｗ（ｇ）、贝壳干重Ｓ（ｇ）、软体组织干重Ｔ（ｇ）三者之间的关系。结果表明，采自中科院南海海洋研究所海洋生物综合实验站（ＭＢＲＳ）（东山）的贻贝符合关系式：Ｗ＝０．１１２４８８×Ｌ２．７００３８，Ｓ＝０．０４４１６０６×Ｌ２．７１５８３，Ｔ＝０．００３７２４４３×Ｌ２．５２８６；采自惠阳县大亚湾水产资源增殖站（澳头）的贻贝则符合：Ｗ＝０．１６１７９４×Ｌ２．５１５８，Ｓ＝０．０６２２１６３×Ｌ２．５４６３４，Ｔ＝０．０１０４６１×Ｌ２．１３９９４。从两个地点采集的贻贝之间的差别。

机器数补码全字长数位说

大量现行教材与专著中所表述的"机器数补码首位是符号位"之说,其补码加法法则不能被解释,令人困惑。对机器数补码全字长各位定义了位权,提出了"首位负权记数制"及新的机器数补码数据模型。在这个新的模型下,建立了补码与其真值的等量映射,论证了机器数补码的表值域,论证了补码真值负与非负的判定法则及机器数补码x与其真值y二者之间相互转换的求解法则;给出了机器数补码的加法法则,论证了在封闭运算条件下机器数补码加法的等效加法运算法则。揭示了机器系统内部补码信息表示的内涵与补码加法法则的真相,建立了"机器数补码全字长数位说"。"机器数补码首位符号说"中种种无可释然的困惑,在"机器数补码全字长数位说"里不复存在。