食品中大肠杆菌O157的PCR检测与wzy基因的测序分析

大肠杆菌O157:H7和O157:H-是重要食品致病菌。从食品中分离得到一株O157:H7菌株EC5。将该菌株PCR扩增wzy基因全长并克隆测序。结果表明,wzy基因序列与大肠杆菌O157:H7标准株EDL933有100%同源性。从NCBIGenBank数据库下载O157菌株wzy基因序列,针对保守序列设计引物并扩增O157菌株和非O157菌株。PCR结果表明,wzy基因特异性强,可作为检测O157菌株的标志基因。本研究为开发大肠杆菌O157的分子检测技术提供新的研究思路。

猪链球菌wzy基因与血清型别的相关性分析

目的分析wzy基因序列与血清分型相关性,评价基于wzy基因的基因组水平血清分型的可行性。方法建立了33个已知血清型(1～31,33与1/2型)及21种新型cps型别(NCL1～20与Chz型)的wzy基因的氨基酸序列数据库,用来检索公开发表的767个有传统血清分型结果的基因组序列,以确定它们的分子血清型别,并与其用传统血清分型结果进行比对。结果 767个基因组中,有765个基因组含有1种且仅含有1种数据库中的wzy基因,剩余的2个基因组携带数据库中没有的wzy基因,本研究中将其cps型别命名为NCL21。94.13%(722/767)基因组的分子血清型别与其传统血清分型结果一致。在二者结果有差异的基因组中,其cps基因簇的核苷酸序列与其传统血清分型结果相应的血清型标准菌株cps序列有明显的差异。结论基因组水平检测血清型特异性的wzy基因的分型策略,显著优于传统的血清分型方法。