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基于ESTs序列的杨树木质部形成相关EST-SSRs标记的开发与应用 被引量:2
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作者 宋跃朋 江锡兵 +5 位作者 张曼 李博 王泽亮 薄文浩 安新民 张志毅 《分子植物育种》 CAS CSCD 2010年第5期963-970,共8页
ESTs数据库的发展为分子标记的开发提供了宝贵的资源。本研究从NCBI下载与杨树木质部形成相关的5359条ESTs序列,在其中257条序列中检测到279个SSRs位点,检出率为5.2%。全部SSRs共分为84种重复单元,平均长度18.2bp,变幅为15~36bp,平均... ESTs数据库的发展为分子标记的开发提供了宝贵的资源。本研究从NCBI下载与杨树木质部形成相关的5359条ESTs序列,在其中257条序列中检测到279个SSRs位点,检出率为5.2%。全部SSRs共分为84种重复单元,平均长度18.2bp,变幅为15~36bp,平均分布频率1/6.94kb。所有类型中三核苷酸重复单元占总SSRs的41.3%,处于主导地位。AAG占三核苷酸重复单元的比例为27.0%,是三核苷酸重复单元中的优势重复类型。利用primer3在线设计引物,通过生物信息学方法筛选出7对引物,其中6对扩增效果较好。利用筛选出的引物对19个杨树无性系进行扩增,每对引物产生多态性条带数目为3~6条,平均4.16条。引物多态信息量变化范围为0.2267~0.9845,平均0.5485。应用NTSYS软件在相似系数为0.68水平可将19个杨树无性系准确聚类。研究结果表明,利用ESTs序列进行SSRs的开发是一种切实有效的方法,为EST-SSRs在杨树遗传图谱构建以及遗传多样性等方面的应用奠定了基础。 展开更多
关键词 杨树 木质部形成 EST-SSRS 聚类分析
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杉木木材形成过程特异表达基因的鉴定与分析 被引量:8
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作者 王桂凤 高燕 +1 位作者 杨立伟 施季森 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2007年第4期483-489,共7页
为了获得杉木木质化过程中特异表达的基因,本研究利用抑制差减杂交技术,以杉木突变体独干杉无性系为测试方(Tester),正常的句容0号无性系为驱动方(Driver),构建了正向差减文库,获得了618个克隆。利用通用引物T7和SP6进行PCR及EcoRⅠ酶... 为了获得杉木木质化过程中特异表达的基因,本研究利用抑制差减杂交技术,以杉木突变体独干杉无性系为测试方(Tester),正常的句容0号无性系为驱动方(Driver),构建了正向差减文库,获得了618个克隆。利用通用引物T7和SP6进行PCR及EcoRⅠ酶切鉴定文库重组子,同时,利用点杂交技术,以正向差减、反向差减及未差减的测试方和驱动方四种探针,进行了进一步的筛选阳性克隆。用定量PCR对结果进行了初步验证。260个单一ESTs中60%的与已知蛋白具有显著同源性,可分为4个主要类别:新陈代谢、细胞壁生成和结构重构、信号传导和胁迫。系统分析参与杉木木材形成的基因对了解木质部分化的分子机制具有重要意义,是了解木材形成遗传控制的直接信息来源,也是改良材形和纤维性质的潜在候选基因。 展开更多
关键词 杉木 木材形成 抑制差减杂交 特异性表达基因 木质部分化
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环境因子对树木形成层活动及木质部发生影响的研究进展 被引量:4
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作者 郭媛媛 江源 《北京师范大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2015年第6期613-619,共7页
环境条件以及气候变化对树木径向生长的影响是全球关注的热点问题之一.影响树木径向生长的环境因素有很多,其中温度、日照时长、降水、干旱、融雪、氮沉降等都是重要的环境因子.本文综述了使用微树芯法监测的树木径向生长与环境因子的关... 环境条件以及气候变化对树木径向生长的影响是全球关注的热点问题之一.影响树木径向生长的环境因素有很多,其中温度、日照时长、降水、干旱、融雪、氮沉降等都是重要的环境因子.本文综述了使用微树芯法监测的树木径向生长与环境因子的关系.一方面总结了环境因子对树木形成层活动及木质部发生影响的研究进展,另一方面提出了目前研究尚存在的问题并针对问题进行了展望,以期为进一步开展这方面的研究提供参考和依据. 展开更多
关键词 形成层活动 环境因子 木质部发生
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杉木木质化过程特异表达基因文库的构建与分析 被引量:4
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作者 王桂凤 高燕 +3 位作者 杨立伟 徐进 席梦利 施季森 《分子植物育种》 CAS CSCD 2006年第4期489-492,共4页
研究木质部木质化过程及其生物学特性对于了解木本植物水分和矿物质的吸收及运输机制、木材形成的遗传控制、改良材性及提高木材生长量具有十分重要的意义。为了获得杉木木质化过程中特异表达的基因,本研究利用抑制差减杂交技术,以杉木... 研究木质部木质化过程及其生物学特性对于了解木本植物水分和矿物质的吸收及运输机制、木材形成的遗传控制、改良材性及提高木材生长量具有十分重要的意义。为了获得杉木木质化过程中特异表达的基因,本研究利用抑制差减杂交技术,以杉木突变体独干杉无性系为测试方(Tester),正常的句容0号无性系为驱动方(Driver),构建了正向和反向两个差减文库,分别获得了618和409个克隆。利用通用引物T7和SP6进行PCR及EcoRⅠ酶切鉴定文库重组子,结果证明所构建的文库符合要求,具有代表性。该文库的成功构建为获得杉木木质化过程中特异表达的基因及深入了解木本植物木质化的机理奠定了基础。 展开更多
关键词 杉木 木质化 抑制差减杂交 特异性表达基因
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杉木木材形成过程扩展蛋白基因的克隆与表达分析 被引量:5
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作者 高燕 《林业科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2011年第11期44-51,共8页
扩展蛋白是一类细胞壁结合蛋白,在一定的pH值下无需任何激活蛋白就可诱导细胞壁的伸展。以杉木木材形成的特异表达基因文库中获得的扩展蛋白ESTs序列为基础,通过RLM-RACE技术成功克隆到3条全长扩展蛋白基因。其中ClEXPA1 cDNA全长1033 ... 扩展蛋白是一类细胞壁结合蛋白,在一定的pH值下无需任何激活蛋白就可诱导细胞壁的伸展。以杉木木材形成的特异表达基因文库中获得的扩展蛋白ESTs序列为基础,通过RLM-RACE技术成功克隆到3条全长扩展蛋白基因。其中ClEXPA1 cDNA全长1033 bp,包括247个氨基酸的开放阅读框(ORF)区;ClEXPA2cDNA全长1374bp,包括268个氨基酸的开放阅读框;ClEXLA1cDNA全长1023bp,包括272个氨基酸的开放阅读框。进化树重建结果表明:ClEXPA1和ClEXPA2属于α-expansin(EXPA);ClEXLA1属于γ-expansin(EXLA)。实时定量PCR显示:ClEXPA1和ClEXPA2具有较为相同的表达模式,在形成层区域表达最高,在针叶及茎尖中度表达,成熟木质部表达较低,而根和花粉中几乎不表达;ClEXLA1在形成层及针叶中均有较高的表达,在木质部及茎尖中度表达,花粉中表达较低,而根中几乎检测不到。该组扩展蛋白的成功克隆,将为系统研究扩展蛋白在木材形成过程中的表达、功能及调控机制提供基因资源。 展开更多
关键词 杉木 木材形成 扩展蛋白 木质部分化
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Transcript Accumulation Dynamics of Phenylpropanoid Pathway Genes in the Maturing Xylem and Phloem of Picea abies during Latewood Formation 被引量:1
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作者 Giovanni Emiliani Maria Laura Traversi +2 位作者 Monica Anichini Guido Giachi Alessio Giovannelli 《Journal of Integrative Plant Biology》 SCIE CAS CSCD 2011年第10期783-799,共17页
In temperate regions, latewood is produced when cambial activity declines with the approach of autumnal dormancy. The understanding of the temporal (cambium activity vs dormancy) and spatial (phloem, cambial region... In temperate regions, latewood is produced when cambial activity declines with the approach of autumnal dormancy. The understanding of the temporal (cambium activity vs dormancy) and spatial (phloem, cambial region, maturing xylem) regulation of key genes involved in the phenylpropanoid pathway during latewood formation represents a crucial step towards providing new insights into the molecular basis of xylogenesis. In this study, the temporal pattern of transcript accumulation of 12 phenylpropanoid genes (PAL1, C4H315, C4H4, 4CL3, 4CL4, HCT1, C3H3, CCoAOMT1, COMT2, COMT5, CCR2) was analyzed in maturing xylem and phloem of Picea abies during latewood formation. Quantitative reverse transcription-polymerase chain reaction analyses revealed a well-defined RNA accumulation pattern of genes involved in the phenylpropanoid pathway during latewood formation. Differences in the RNA accumulation patterns were detected between the different tissue types analyzed. The results obtained here demonstrated that the molecular processes involved in monolignol biosynthesis are not restricted to the cambial activity timeframe but continued after the end of cambium cell proliferation. Furthermore, since it has been shown that lignification of maturing xylem takes place in late autumn, we argue on the basis of our data that phloem could play a key role in the monoliqnol biosynthesis process. 展开更多
关键词 cambial region gene expression latewood formation xylogenesis.
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