普通白菜C3H类锌指蛋白基因家族鉴定及表达分析

植物CCCH(C3H)锌指蛋白是一种可识别并结合RNA的蛋白,在植物生长发育、胁迫响应中发挥重要作用。为了了解普通白菜C3H类锌指蛋白家族的特性,通过比对拟南芥C3H类锌指蛋白成员和普通白菜数据库,鉴定普通白菜中C3H类锌指蛋白家族成员,并分析其蛋白质理化性质、系统进化、染色体分布以及在花芽分化阶段不同时期的表达模式。结果显示,共鉴定到84个普通白菜C3H类锌指蛋白家族成员,根据在染色体上的顺序分别命名为BrcC3H1~84,这些成员不均匀地分布在10条染色体上,其中在3号染色体上分布最多,有15名成员;蛋白质理化性质分析表明,该家族成员编码蛋白质氨基酸数量为156~1542个,理论等电点为4.96~10.84。通过构建系统进化树可将其分为3个亚族,各亚族间基因结构及保守基序差异明显,不同的C3H模型可能是导致差异的重要因素。基因结构分析表明,BrcC3H成员多数含有1个或7个CDS。通过转录组数据对BrcC3H成员在白菜花芽分化不同阶段的表达模式进行分析,发现有21个BrcC3H基因在花芽分化临界期高表达,而在后期表达逐渐降低,其可能参与帮助启动花芽分化。这为进一步研究BrcC3H基因在普通白菜的开花机制提供了理论基础。

锌指类基因调控蛋白──生物无机化学和分子生物学发展的新领域

生命必需元素锌，除了以锌酶的形式，参与生物体的各类代谢过程外，近年来发现，锌还以各种锌蛋白的结构方式，包括锌指、锌纽、锌带和锌簇等，参与生物体的基因转录、复制及蛋白质的合成等各种基因调节和控制过程．联想到金属硫蛋白在锌的体内平衡中所扮演的角色，很有可能锌是通过金属硫蛋白和锌指类蛋白的逐级调控，成为生物体生长发育的调控中心．癌基因和人免疫缺陷病毒（ＨＩＶ）的许多调节蛋白也具有锌指类结构，这给癌症和爱滋病的治疗提供了新思路．