汉坦病毒西安分离株基因组全序列测定及分析

目的:测定分离自西安地区黑线姬鼠携带的的汉滩病毒毒株XAAa10091712全基因组序列,对各片段进行进化分析。方法:设计各片段引物,采用反转录-聚合酶链反应,分节段扩增各基因片段,直接用PCR产物或克隆入pMD18-T载体后进行测序分析。结果:汉坦病毒毒株XAAa10091712全基因组由11845个碱基构成,其中A为3800(31.99%),C为2085(17.55%),G为2551(21.47%),T为3444(28.99%);分S、M、L3个片段,各片段进化分析显示其与汉滩病毒贵州分离株高度同源。结论:该毒株属汉滩型病毒,与我国贵州地区汉坦病毒同源性较高,分型属于S2/M9/L4。