基于强连通分量的^13C MFA计算模型稳定性判断

基于碳同位素标记实验的代谢通量分析，是代谢工程中一种强大的定量分析工具。^13C MFA在进行定量分析时，需要给定代谢网络及其对应的碳原子转移网络，同时为了保证计算的正确性和可靠性，要求所给定的碳原子转移网络中不能含有陷阱（trap）。本文基于有向图中强连通分量的概念，给出了trap的一种形式化定义，并利用一种基于深度优先搜索的图论算法，实现了对trap的自动检测。实验结果表明，该算法能够得到正确可靠的结果。

^(13)C代谢通量分析

代谢通量分析(metabolic flux analysis,MFA)是通过确定代谢网络中代谢流分布来表征细胞代谢状态的强有力的工具。鉴于计量学代谢通量分析在处理复杂代谢网络时表现出的局限性,发展了以13C标记实验为基础的13C MFA。本文介绍了13C MFA的原理与方法,总结和评述了13C MFA在实验与数据分析方面的最新进展以及MFA在功能基因组研究中的重要地位,同时对代谢通量分析的发展前景进行了展望。