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基于强连通分量的^13C MFA计算模型稳定性判断
被引量:
1
1
作者
周宏
郑浩然
+1 位作者
李毅
李恒
《北京生物医学工程》
2009年第1期34-38,共5页
基于碳同位素标记实验的代谢通量分析,是代谢工程中一种强大的定量分析工具。^13C MFA在进行定量分析时,需要给定代谢网络及其对应的碳原子转移网络,同时为了保证计算的正确性和可靠性,要求所给定的碳原子转移网络中不能含有陷阱(t...
基于碳同位素标记实验的代谢通量分析,是代谢工程中一种强大的定量分析工具。^13C MFA在进行定量分析时,需要给定代谢网络及其对应的碳原子转移网络,同时为了保证计算的正确性和可靠性,要求所给定的碳原子转移网络中不能含有陷阱(trap)。本文基于有向图中强连通分量的概念,给出了trap的一种形式化定义,并利用一种基于深度优先搜索的图论算法,实现了对trap的自动检测。实验结果表明,该算法能够得到正确可靠的结果。
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关键词
代谢流量分析
碳同位素标记实验
陷阱
有向图
强连通分量
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职称材料
^(13)C代谢通量分析
被引量:
5
2
作者
李晓静
陈涛
+2 位作者
陈洵
李祥高
赵学明
《化学进展》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2006年第7期995-1001,共7页
代谢通量分析(metabolic flux analysis,MFA)是通过确定代谢网络中代谢流分布来表征细胞代谢状态的强有力的工具。鉴于计量学代谢通量分析在处理复杂代谢网络时表现出的局限性,发展了以13C标记实验为基础的13C MFA。本文介绍了13C MFA...
代谢通量分析(metabolic flux analysis,MFA)是通过确定代谢网络中代谢流分布来表征细胞代谢状态的强有力的工具。鉴于计量学代谢通量分析在处理复杂代谢网络时表现出的局限性,发展了以13C标记实验为基础的13C MFA。本文介绍了13C MFA的原理与方法,总结和评述了13C MFA在实验与数据分析方面的最新进展以及MFA在功能基因组研究中的重要地位,同时对代谢通量分析的发展前景进行了展望。
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关键词
^
^
13
c
mfa
标记模式
微量滴定板
传感反应器
数据分析
功能基因组
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职称材料
题名
基于强连通分量的^13C MFA计算模型稳定性判断
被引量:
1
1
作者
周宏
郑浩然
李毅
李恒
机构
中国科学技术大学计算机科学技术系
出处
《北京生物医学工程》
2009年第1期34-38,共5页
基金
国家重点基础研究发展计划(2006CB910700)资助
文摘
基于碳同位素标记实验的代谢通量分析,是代谢工程中一种强大的定量分析工具。^13C MFA在进行定量分析时,需要给定代谢网络及其对应的碳原子转移网络,同时为了保证计算的正确性和可靠性,要求所给定的碳原子转移网络中不能含有陷阱(trap)。本文基于有向图中强连通分量的概念,给出了trap的一种形式化定义,并利用一种基于深度优先搜索的图论算法,实现了对trap的自动检测。实验结果表明,该算法能够得到正确可靠的结果。
关键词
代谢流量分析
碳同位素标记实验
陷阱
有向图
强连通分量
Keywords
^
^
13
c
mfa
c
LE
trap
dire
c
ted graph
strong
c
onne
c
ted
c
omponent
分类号
TP391 [自动化与计算机技术—计算机应用技术]
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职称材料
题名
^(13)C代谢通量分析
被引量:
5
2
作者
李晓静
陈涛
陈洵
李祥高
赵学明
机构
天津大学化工学院生物化工系
出处
《化学进展》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2006年第7期995-1001,共7页
基金
国家自然科学基金重点项目(No.20536040)
国家重点基础研究发展规划(973)项目(No.2003CB716003)资助
文摘
代谢通量分析(metabolic flux analysis,MFA)是通过确定代谢网络中代谢流分布来表征细胞代谢状态的强有力的工具。鉴于计量学代谢通量分析在处理复杂代谢网络时表现出的局限性,发展了以13C标记实验为基础的13C MFA。本文介绍了13C MFA的原理与方法,总结和评述了13C MFA在实验与数据分析方面的最新进展以及MFA在功能基因组研究中的重要地位,同时对代谢通量分析的发展前景进行了展望。
关键词
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^
13
c
mfa
标记模式
微量滴定板
传感反应器
数据分析
功能基因组
Keywords
^
^
13
c
mfa
^
^
13
c
-labeling model
mi
c
rotiter plates
sensor rea
c
tors
data analysis
fun
c
tional genomi
c
s
分类号
O652 [理学—分析化学]
Q591 [生物学—生物化学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于强连通分量的^13C MFA计算模型稳定性判断
周宏
郑浩然
李毅
李恒
《北京生物医学工程》
2009
1
下载PDF
职称材料
2
^(13)C代谢通量分析
李晓静
陈涛
陈洵
李祥高
赵学明
《化学进展》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2006
5
下载PDF
职称材料
已选择
0
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引用分析
参考文献
引证文献
统计分析
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