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人类DNA序列TSS区域序列特征及±1核小体的位置分布
1
作者
杨小希
李宏
周德良
《内蒙古大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2014年第6期599-605,共7页
基于包含人类基因转录起始位点附近的58989条DNA序列,运用核小体特征量对序列做分类分析,发现±1核小体位于TSS区域两侧的第一类基因约占28%,TSS区域有核小体占据的第二类基因约占30%.用二阶信息冗余特征量分析了DNA序列的碱基关联...
基于包含人类基因转录起始位点附近的58989条DNA序列,运用核小体特征量对序列做分类分析,发现±1核小体位于TSS区域两侧的第一类基因约占28%,TSS区域有核小体占据的第二类基因约占30%.用二阶信息冗余特征量分析了DNA序列的碱基关联分布,发现没有占据TSS区域的核小体对应的序列具有强碱基关联,占据TSS区域的核小体对应的序列具有弱碱基关联,弱关联是TSS区域的普适特征.表明占据TSS区域的核小体具有很强的序列适应性和位置的可变性.通常定义的含TSS的核小体缺失区域仅对第一类基因成立.推测第一类基因具有较高的转录效率.
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关键词
转录起始区
±1核小体
核
小体
特征量
二阶信息冗余
核
小体
动态变化
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职称材料
题名
人类DNA序列TSS区域序列特征及±1核小体的位置分布
1
作者
杨小希
李宏
周德良
机构
内蒙古大学物理科学与技术学院
出处
《内蒙古大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2014年第6期599-605,共7页
基金
国家自然科学基金(31260219)
文摘
基于包含人类基因转录起始位点附近的58989条DNA序列,运用核小体特征量对序列做分类分析,发现±1核小体位于TSS区域两侧的第一类基因约占28%,TSS区域有核小体占据的第二类基因约占30%.用二阶信息冗余特征量分析了DNA序列的碱基关联分布,发现没有占据TSS区域的核小体对应的序列具有强碱基关联,占据TSS区域的核小体对应的序列具有弱碱基关联,弱关联是TSS区域的普适特征.表明占据TSS区域的核小体具有很强的序列适应性和位置的可变性.通常定义的含TSS的核小体缺失区域仅对第一类基因成立.推测第一类基因具有较高的转录效率.
关键词
转录起始区
±1核小体
核
小体
特征量
二阶信息冗余
核
小体
动态变化
Keywords
transcription initiation site region ±nucleosome characteristic quantity of nucleo-some second-order information redundancy nucleosome dynamic change
分类号
Q61 [生物学—生物物理学]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
人类DNA序列TSS区域序列特征及±1核小体的位置分布
杨小希
李宏
周德良
《内蒙古大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2014
0
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