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Ligand Induced Conformational Transitions of Tissue Factor ? Loop
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作者 谢写 雪光浦 +1 位作者 江龙光 黄明东 《Chinese Journal of Structural Chemistry》 SCIE CAS CSCD 2018年第6期887-898,共12页
Tissue factor(TF), the cell surface receptor and requisite cofactor for the inactive serine protease factor VⅡa(VⅡa), binds VⅡa and its zymogen factor VⅡ with picomolar affinity on the cell surface. The TF:V... Tissue factor(TF), the cell surface receptor and requisite cofactor for the inactive serine protease factor VⅡa(VⅡa), binds VⅡa and its zymogen factor VⅡ with picomolar affinity on the cell surface. The TF:VⅡa complex proteolytically converts downstream zymogen factors X and IX to their active protease states in the cascade responsible for thrombogenesis and hemostasis. The TF pathway also produces cellular signaling through protease activated receptors. Here we present a crystal structure of the completely intact surface domain of TF in complex with VⅡa that reveals a significant conformational difference as compared to free TF. A long loop of residue 78~91 of the tissue factor(named Ω loop here) was found to have well-ordered conformation, whereas this loop in free TF has an expanded conformation and is largely disordered. This loop adopts a tight conformation consisting of five β turns in the TF:VⅡa complex. The Ω loop is located at the interface of the proteins of the complex, has a few interactions with VⅡa, and is possible to accommodate the sequence variations of TF in different mammalian species. 展开更多
关键词 blood coagulation tissue factor(TF) factor VⅡa Ω loop crystal structure
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活性位点邻近的?-loop对胰蛋白酶热稳定性和活性的影响 被引量:3
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作者 杜坤 甘一如 黄鹤 《高校化学工程学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2017年第3期657-662,共6页
以猪源胰蛋白酶作为研究对象,尝试利用删除猪源胰蛋白酶活性位点邻近?-loop的方法来提高其热稳定性和活性。首先通过Gromacs v4.5.5分子动力学模拟软件,预测出了胰蛋白酶的柔性区Fragment 41~46(即?-loop所在区域)。然后根据删除?-loop... 以猪源胰蛋白酶作为研究对象,尝试利用删除猪源胰蛋白酶活性位点邻近?-loop的方法来提高其热稳定性和活性。首先通过Gromacs v4.5.5分子动力学模拟软件,预测出了胰蛋白酶的柔性区Fragment 41~46(即?-loop所在区域)。然后根据删除?-loop结构中不同的氨基酸数目,确立了三个突变R1Q、K3Q及C5Q;通过重叠延伸PCR技术构建突变菌株,发酵表达后,进行了酶热稳定性和活性分析。结果表明,R1Q、K3Q及C5Q的活性在一定程度上均有提高,在热稳定性上R1Q和K3Q有所提高,C5Q有所下降,其中R1Q突变体酶的最高活性较野生型提高了1.42倍,同时,失活半衰期和最适反应温度较野生型也分别提高了213.3 min和11.8℃。实验结果证明,在删除该?-loop中的异亮氨酸后,得到了突变型R1Q酶,成功实现酶双功能的共同进化。该策略有潜力应用于其他工业酶分子的热稳定性和活性改造,为推动生物酶的工业化应用奠定基础。 展开更多
关键词 猪源胰蛋白酶 Ω-loop 理性设计 热稳定性 活性
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α、ω-二羟基二甲基硅氧烷齐聚物的合成与研究 被引量:1
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作者 方少明 王昊 《郑州轻工业学院学报》 1992年第1期69-73,共5页
本文介绍了用自制酸性催化剂、乙酸酐作助催化剂对八甲基环四硅氧烷进行开环聚合制备出低分子量的α,ω-二羟基二甲基硅氧烷齐聚物(PSi)的方法;研究过程中发现,通过改变乙酸酐用量可调节PSi分子量的大小,其收率可达90%以上。
关键词 合成 开环聚合 PSI
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量子威尔逊圈首项的引力场激发
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作者 侯阳来 侯三林 +1 位作者 陈克亮 鄂学壮 《武汉科技大学学报》 CAS 2007年第4期444-448,共5页
在四维R引力场中,采用时空联络展式的线性和扩展表示的平方项,计算出引力场激发的曲率,这是由量子威尔逊圈通过两点联系格林函数给出的。同时以引力三维传播子对〈w〉的最低级校正(k4)和引力场自能计算的结果为基础,在精确的k4级条件下... 在四维R引力场中,采用时空联络展式的线性和扩展表示的平方项,计算出引力场激发的曲率,这是由量子威尔逊圈通过两点联系格林函数给出的。同时以引力三维传播子对〈w〉的最低级校正(k4)和引力场自能计算的结果为基础,在精确的k4级条件下,能得到来自于〈w〉的〈w(2)〉首项激发的完整表达式。 展开更多
关键词 引力场激发 威尔逊圈首项 (ω^(2))的k^4级贡献
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头孢菌素及其相关应用研究新进展
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作者 王丽 《煤炭与化工》 CAS 2013年第1期53-55,72,共4页
头孢菌素类抗生素是临床常用的一类十分重要的抗菌药。基于检索和分析国内外相关文献,归纳出近几年头孢类抗生素的研究新动向:新型检测发现,对"血清特异性IgE抗体"与"头孢菌素-人血清白蛋白"结合过程的监测,是一项... 头孢菌素类抗生素是临床常用的一类十分重要的抗菌药。基于检索和分析国内外相关文献,归纳出近几年头孢类抗生素的研究新动向:新型检测发现,对"血清特异性IgE抗体"与"头孢菌素-人血清白蛋白"结合过程的监测,是一项敏化检测的重要指标。突变学研究发现,氧亚氨基取代类头孢菌素特异性荧光标记,可有效监测这种结构诱导性形变。新型头孢菌素CXA-101的相关研究、新生儿头孢菌素类药代动力学研究、毒理学及耐药性问题的较新研究,都可以为头孢类项目研究提供思路,从而推动头孢类抗生素研究与生产的发展。 展开更多
关键词 头孢菌素 CXA-101 Ω环 药代动力学 耐药性
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删除Loop区域表面不稳定氨基酸提高(R)-ω-转氨酶热稳定性 被引量:3
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作者 谢东芳 吕常江 +5 位作者 方卉 杨卫康 胡升 赵伟睿 黄俊 梅乐和 《生物工程学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第12期1923-1933,共11页
手性胺是一类具有重要价值的医药及精细化工中间体,如何实现手性胺类化合物的不对称合成是目前人们普遍关注的一个焦点问题。ω-转氨酶(ω-Transaminase,ω-TA)是一类能直接合成对映体手性胺的天然生物催化剂。相比于(S)-ω-TA,(R)-ω-T... 手性胺是一类具有重要价值的医药及精细化工中间体,如何实现手性胺类化合物的不对称合成是目前人们普遍关注的一个焦点问题。ω-转氨酶(ω-Transaminase,ω-TA)是一类能直接合成对映体手性胺的天然生物催化剂。相比于(S)-ω-TA,(R)-ω-TA的研究较少,但其需求量随着手性胺类药物的发展日趋增大。提高具有潜在应用价值的(R)-ω-TA的热稳定性,将有利于手性胺的制备。本文利用Py MOL软件和YASARA软件预测来源于土曲霉Aspergillus terreus的(R)-ω-TA中具有高温度因子(B-factor)的Loop区域,通过定点突变对Loop区域表面不稳定氨基酸逐步进行删除获得突变酶。结果表明,突变酶R131del和突变酶P132-E133del半失活温度分别为41.1℃和39.4℃,比野生酶提高了2.6℃和0.9℃;在40℃下的半衰期分别为15.0 min和10.0 min,为野生酶的2.2倍和1.5倍。此外,在400 K和10 ns的分子模拟条件下,突变酶R131del在Loop区域的均方根涨落(Root mean square fluctuation,RMSF)比野生型低,突变酶P132-E133del在Loop区域增加了4个氢键。本研究通过删除(R)-ω-转氨酶Loop区域表面不稳定氨基酸提高了该蛋白的热稳定性,同时也为其他酶热稳定性的理性设计提供了方法学指导。 展开更多
关键词 手性胺 ω-转氨酶 B-FACTOR loop区域 均方根涨落 热稳定性
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核物质的物态方程的研究 被引量:1
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作者 陈伟 梅仲豪 刘良钢 《高能物理与核物理》 EI CSCD 北大核心 1999年第7期681-688,共8页
在相对论σ-ω模型的单圈图近似下,详细推导了核物质的能量密度和压强密度表达式,数值计算了核物质的结合能和压强随核密度的变化,并分别在热力学和流体力学的理论框架下,计算了核物质的压强密度,结果表明这两种方法得到的压强密... 在相对论σ-ω模型的单圈图近似下,详细推导了核物质的能量密度和压强密度表达式,数值计算了核物质的结合能和压强随核密度的变化,并分别在热力学和流体力学的理论框架下,计算了核物质的压强密度,结果表明这两种方法得到的压强密度相同. 展开更多
关键词 相对论 σ-ω模型 真空起伏 单圈图 物态方程
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二阶PLL特性参量的一种新测试方法
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作者 熊慎勋 《山东大学学报(自然科学版)》 CSCD 1999年第4期427-432,共6页
通常测量二阶锁相环(PLL) 的自然角频ωn 和阻尼系数ζ时,需要分别测量环路直流总增益和滤波器的时间常数等有关参量,此方法繁琐且误差较大.本文讨论一种通过输入小频偏的调频信号,可以方便、且较准确地测出理想二阶PLL的ωn 和ζ的实际... 通常测量二阶锁相环(PLL) 的自然角频ωn 和阻尼系数ζ时,需要分别测量环路直流总增益和滤波器的时间常数等有关参量,此方法繁琐且误差较大.本文讨论一种通过输入小频偏的调频信号,可以方便、且较准确地测出理想二阶PLL的ωn 和ζ的实际值.该方法同样适用于非理想二阶环,以及由相位超前无源比例积分器构成的二阶环. 展开更多
关键词 PLL 特性参量 测试方法 二阶锁相环 调频信号 自然角频 阻尼系数ζ 相位误差函数
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