新的α/β水解酶W14和W15的三维结构模建及分子对接研究

利用同源模建和分子动力学模拟方法,模建了两个新发现的α/β水解酶超家族成员W14和W15的三维结构,并通过与α-醋酸萘酯的对接研究,从理论上提出Gly82和Val13为形成"氧洞"的关键残基,有利于稳定水解过程中的带负电的过渡态,以及其它对复合物形成起到重要作用的氨基酸残基.

α/β水解酶结构域-6在中枢神经系统中的研究进展

α/β水解酶结构域-6(ABHD6)是近些年来被发现的一种具有丝氨酸水解酶活性的分子,在中枢神经系统中发挥重要调控作用。作为突触后内源性大麻素的主要水解酶,ABHD6参与调节神经元内源性大麻素系统(ECS);此外,ABHD6还是α-氨基-3-羟基-5-甲基-4-异恶唑丙酸受体(AMPAR)复合体的重要组成部分,可抑制AMPAR向突触后膜转位和AMPAR的兴奋性。随着不断深入的研究,ABHD6在神经炎症通路和自身免疫调节中发挥着潜在的调控效应,有望成为干预神经系统疾病的新型靶点。该文从ABHD6的分子结构与表达、中枢神经系统中的作用机制等方面,对其在神经系统疾病治疗中的最新研究进展进行综述。

血清lncRNAs ABHD11-AS1、miR-1231表达与胃癌根治术后复发转移及远期预后的相关性

目的探究血清长链非编码RNAα/β水解酶域11反义RNA1(lncRNAs ABHD11-AS1)、微小RNA-1231(miR-1231)表达与胃癌根治术后复发转移及远期预后的相关性。方法选取2018年7月至2020年7月进行胃癌根治术治疗的147例患者(胃癌组),根据复发转移情况,将患者分为复发转移组48例和未复发转移组99例,根据3年预后情况,分为生存组40例和死亡组107例,选取同期体检的健康人员132例作为对照组,采用实时荧光定量PCR法测定血清lncRNAs ABHD11-AS1、miR-1231表达水平,采用Pearson法分析血清lncRNAs ABHD11-AS1、miR-1231的相关性,采用Logistic回归分析影响胃癌根治术后复发转移的因素。结果与对照组比较,胃癌组lncRNAs ABHD11-AS1表达水平显著升高(P<0.05),miR-1231表达水平显著降低(P<0.05)。血清lncRNAs ABHD11-AS1和miR-1231表达呈负相关(r=-0.691,P<0.05)。复发转移组肿瘤直径>5 cm、TNM分期Ⅲ+Ⅳ期、分化程度低分化、浸润深度T3+T4、有淋巴结转移的患者比例及lncRNAs ABHD11-AS1表达水平显著高于未复发转移组(P<0.05),miR-1231表达水平显著低于未复发转移患者,差异有统计学意义(P<0.05)。肿瘤直径、浸润深度、lncRNAs ABHD11-AS1是胃癌根治术后复发转移的独立危险因素,miR-1231是保护因素(P<0.05)。死亡组lncRNAs ABHD11-AS1表达水平显著高于生存组(P<0.05),miR-1231水平显著低于生存组(P<0.05)。结论胃癌患者血清中lncRNAs ABHD11-AS1表达水平升高,miR-1231表达水平降低,与胃癌根治术后复发转移及远期预后密切相关,可能作为胃癌根治术后复发转移及远期预后的标志物。

人分化相关基因Ndr2的克隆与组织表达谱研究

人Ndr1基因参与细胞终末分化 ,并且对肿瘤细胞增殖和肿瘤转移具有抑制作用 .从人 2 2周孕龄胎肝cDNA文库中获得与人Ndr1基因同源的一段表达性序列标签 ,继而从成人脑cDNA文库分离出其全长cDNA(2 12 1bp) ,并将该基因命名为Ndr2 .其染色体定位为 14q11 1- 11 2 ,开放阅读框编码 371个氨基酸 ,且与NDR1蛋白一样 ,含有一个典型的α β水解酶折叠类结构域 (α βhydrolasefold) .Northern杂交和点杂交分析显示 ,该基因与Ndr1一样 ,在脑中高表达 ,在胚胎组织的表达较低 ,在 8种人肿瘤细胞中的表达极低 .然而 ,Ndr2基因的组织表达谱与Ndr1又有鲜明的差异 :其在成人骨骼肌和脑等神经组织中表达最高 ,在唾液腺、肝、肾、心肌和气管中的表达次之 .结果提示 ,NDR2具有与NDR1相似或相关的重要功能 .

Ndrg2基因及NDRG2蛋白的生物信息学分析

目的 :对ndrg2 (n mycdownsreamregulatorgene 2 )基因调控区和NDRG2蛋白序列进行生物信息学分析 ,从结构上预测其功能 .方法 :运用internet网络上的数据库及程序 ,对ndrg2基因的调控区和NDRG2蛋白的二级结构进行生物信息学分析 .结果 :ndrg2基因调控区存在多种转录因子结合位点 ,功能主要涉及组织特异性表达调控 ,细胞生长发育相关基因和应激反应基因的表达调控等 ;NDRG2蛋白的结构属于α/β水解酶类折叠 ,其分类预测表明与细菌环氧化物水解酶的二级结构极为相似 .结论 :生物信息学分析提示NDRG2蛋白具有一定的酶活性 ,可能参与细胞抗氧化应激反应 ,内外源有毒物质的代谢 。

ndrg家族研究进展

ndrg家族包括ndrg1、ndrg2、ndrg3和ndrg4四个成员,其中ndrg4分为三个亚型:ndrg4-B、ndrg4-B^(var)和ndrg4-H。ndrg家族在正常组织和肿瘤组织中存在着差异表达,它在细胞的增殖、分化过程中发挥着重要作用。

用比较基因组学方法分析人NDRG2的生物学功能

目的:预测NDRG2的功能,为进一步进行实验研究提供线索.方法:用比较基因组学分析ndrg2的转录调控,搜索其同源蛋白以及理解NDRG2的空间结构.结果:人ndrg2有两个转录起始位点,长转录起始位点与牛ndrg2的转录起始点相似;短转录起始点与小鼠ndrg2的转录起始点相似.发现了许多物种中NDRG2的同源蛋白,其中MESK2为NDRG2在果蝇中的同源蛋白.许多NDRG2的结构邻居被找到.NDRG2蛋白中水解酶的关键氨基酸已发生改变.结论:ndrg2在人中有两种不同的转录调节方式,两个转录起始点之间可能存在一个微小启动子;NDRG2同源蛋白只存在于后生生物层,在原核生物层中不存在,这些同源蛋白参与了细胞的分化;NDRG2在空间结构上属于α/β水解酶超家族,但由于关键氨基酸的缺失,其可能没有水解酶活性.

抗糖尿病小分子ABHD6抑制剂的研究进展

2型糖尿病表现为糖脂代谢紊乱并伴随多脏器慢性损害,已成为威胁人类健康的巨大隐患。α/β水解酶结构域-6(α/βhydrolase domain-6,ABHD6)通过水解单酰甘油,负调控胰岛素的释放。小分子ABHD6抑制剂因其在增强胰岛素敏感性、改善脂肪功能等方面的重要作用而有望成为新一代治疗2型糖尿病的药物。本文介绍了ABHD6的作用机制,根据其结构特点对此类抑制剂的最新研究进展进行综述,并对其构效关系进行分析。

长链非编码RNA ABHD11-AS1对结直肠癌细胞生长和转移的影响及调控机制

目的 探讨长链非编码RNA(lncRNA)α/β水解酶域11反义RNA1(ABHD11-AS1)对结直肠癌细胞生长和转移的影响,并基于miR-133a/真核起始因子4A1(EIF4A1)轴分析其可能的调控机制。方法 (1)取人结直肠癌细胞HT-29、SW480、DLD-1、HCT116、LOVO、SW620,以及正常结直肠黏膜细胞FHC,检测细胞中lncRNA ABHD11-AS1的表达情况。(2)分别通过miRcode、TargetScan数据库预测ABHD11-AS1与miR-133a、miR-133a与EIF4A1的靶向关系,并进行双荧光素酶报告基因实验以验证。(3)将HT-29细胞分为NC组(转染Negative Control)、siABHD11-AS1组(转染lncRNA ABHD11-AS1 siRNA)、miR-133a inhibitor组(转染miR-133a inhibitor)、siABHD11-AS1+miR-133a inhibitor组(转染lncRNA ABHD11-AS1 siRNA和miR-133a inhibitor)和siABHD11-AS1+miR-133a inhibitor+siEIF4a1组(转染lncRNA ABHD11-AS1 siRNA、miR-133a inhibitor、EIF4A1 siRNA)。检测转染后除miR-133a inhibitor组以外的其他组细胞增殖、迁移和侵袭能力,NC组、siABHD11-AS1组、miR-133a inhibitor组、siABHD11-AS1+miR-133a inhibitor组细胞的EIF4A1蛋白表达量。结果 (1)ABHD11-AS1均高表达于各种结直肠癌细胞,在HT-29细胞中的表达最高。(2)miR-133a为ABHD11-AS1靶基因,EIF4A1为miR-133a靶基因。(3)siABHD11-AS1组HT-29细胞的增殖、迁移和侵袭能力均低于NC组(均P<0.05),siABHD11-AS1+miR-133a inhibitor组HT-29细胞的增殖、迁移和侵袭能力均高于siABHD11-AS1组(均P<0.05),siABHD11-AS1+miR-133a inhibitor+siEIF4A1组HT-29细胞的增殖、迁移和侵袭能力均低于siABHD11-AS1+miR-133a inhibitor组(均P<0.05)。(4)miR-133a inhibitor组HT-29细胞中EIF4A1蛋白表达量高于NC组(P<0.05);siABHD11-AS1组HT-29细胞中EIF4A1蛋白表达量低于NC组,而siABHD11-AS1+miR-133a inhibitor组HT-29细胞中EIF4A1蛋白表达量高于siABHD11-AS1组(均P<0.05)。结论 ABHD11-AS1在结直肠癌细胞中呈高表达,抑制其表达后结直肠癌细胞的生长和转移能力均下降,其可能通过调控miR-133a/EIF4A1信号轴发挥作用。

蒲公英萜醇调控ABHD11-AS1介导上皮间质转化对膀胱癌细胞侵袭转移的作用

[目的]探究蒲公英萜醇通过调控α/β水解酶域11反义RNA1(ABHD11-AS1)对膀胱癌细胞侵袭转移的作用,并分析相关机制。[方法]将对数生长期的人膀胱癌细胞系EJ细胞分为空白对照组(细胞不做特殊处理)、蒲公英萜醇组(给予蒲公英萜醇100μmol/L处理24 h)、蒲公英萜醇-pcDNA组(转染pcDNA 24 h给予细胞蒲公英萜醇100μmol/L处理24 h)、蒲公英萜醇-pcDNA-ABHD11-AS1组(转染pcDNA-ABHD11-AS124 h后细胞给予蒲公英萜醇100μmol/L药物处理24 h)。实时荧光定量PCR法检测细胞ABHD11-AS1水平;细胞增殖-毒性8检测试剂盒(CCK-8)法检测细胞增殖;划痕实验、Transwell实验分别检测细胞迁移、侵袭能力;蛋白免疫印迹法检测上皮间质转化标志蛋白E-钙黏附蛋白(E-cadherin)、N-钙黏附蛋白(N-cadherin)、波形蛋白(Vimentin)表达变化。[结果]与空白对照组比较,蒲公英萜醇组EJ细胞ABHD11-AS1水平、侵袭细胞数、细胞迁移率、N-Cadherin、Vimentin蛋白水平均降低(P<0.05),EJ细胞增殖抑制率、E-cadherin蛋白水平升高(P<0.05)。与蒲公英萜醇组、蒲公英萜醇-pcDNA组比较,蒲公英萜醇-pcDNA-ABHD11-AS1组EJ细胞ABHD11-AS1水平、侵袭细胞数、细胞迁移率、N-Cadherin、Vimentin蛋白水平均升高(P<0.05),EJ细胞增殖抑制率、E-cadherin蛋白水平降低(P<0.05)。[结论]蒲公英萜醇能够抑制膀胱癌细胞侵袭及迁移,可能是通过抑制ABHD11-AS1介导的上皮间质转化发生实现的。

NDRG1在肿瘤侵袭转移相关分子机制中的研究进展

N-MYC 下游调节基因（N-MYC down-stream-regulated-gene,NDRG）1是 NDRG 家族成员,人源 NDRG 基因包括NDRG1、NDRG2、NDRG3和NDRG4[1].NDRG家族属于α/β水解酶超家族,但无水解酶催化位点.研究表明,NDRG1与细胞的生长[2]及凋亡[3]、肿瘤细胞增殖[4-5]、缺氧应激反应[6]、肿瘤细胞的药物反应和耐药性[7]、肿瘤侵袭和转移[8]等有关,还能被多种诱导分化剂诱导表达,

人酯酶D的三维结构研究

人酯酶D(EC3.1.1.1)是非特异性酯酶家族的一员,在人体脑、肝脏、肾等器官大量表达,它的功能主要是催化水解乙酰基团。

结核分枝杆菌Rv3084编码酯酶LipR的生物学特性和体内免疫调节功能

目的探究结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis,MTB)Rv3084编码的酯酶LipR的生物学特性及其在体内的免疫调节功能。方法从MTB H37Rv标准毒力株扩增LipR基因,构建重组表达质粒;测序正确的重组质粒转化入大肠杆菌,诱导LipR蛋白表达并纯化,Western blot鉴定;进行LipR酯酶活性检测,分析影响LipR酶活性的因素;将重组质粒于小鼠胫前肌肉注射0.1 mL(含质粒DNA 100μg)3次(第1,8,15天),末次注射后7 d,处死小鼠,取肺、脾脏进行细胞因子检测。结果成功构建重组表达质粒,并发现LipR蛋白在大肠杆菌中主要以包涵体的形式表达,蛋白相对分子质量约为33×10~3;在标准水解活性实验条件(40℃,pH7.5)下,其最适水解底物为4-硝基苯基乙酸酯(pNPA,C2);以4-硝基苯基丁酸酯(pNPB,C4)作为底物,测得LipR水解活性的最适pH值为8.5,最适反应温度为40℃,说明LipR是一种相对耐碱耐热的酯酶;而在不同的除垢剂或金属离子存在的环境下,LipR水解pNPB的活性受到一定程度地抑制。重组质粒注射小鼠后,发现LipR能抑制γ-干扰素(IFN-γ)和白细胞介素(IL)-2的分泌,但IL-10分泌量增加。结论酯酶LipR可能参与帮助MTB协同抵抗宿主内苛刻的环境,并充当免疫调节剂,抑制促炎细胞因子分泌。