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乙型肝炎病毒S基因变异株的研究
被引量:
5
1
作者
王佑春
林京香
+2 位作者
张华远
杨军
李河民
《中国生物制品学杂志》
CAS
CSCD
2000年第2期65-67,共3页
目的 对7份HBsAg诊断试剂检测结果不一致的样品进行确证并分析其原因。方法采用套式 PCR法对7份样品进行DNA扩增,并将阳性产物克隆到pGEM-Teasy载体上,然后进行测序并对其序列进行分析。 结果 7份样品中6...
目的 对7份HBsAg诊断试剂检测结果不一致的样品进行确证并分析其原因。方法采用套式 PCR法对7份样品进行DNA扩增,并将阳性产物克隆到pGEM-Teasy载体上,然后进行测序并对其序列进行分析。 结果 7份样品中6份为HBV DNA阳性,其中5份与Aboott和Orthro HBsAg试剂无反应或反应较弱,而且其a决定 簇的氨基酸均在134位发生改变,由F变为 A;1份与 Abbott和Orthro HBsAg试剂反应较强,其a决定簇的氨基酸也 在134位发生改变,但由F变为S。结论 国内外首次报道HBsAg a决定簇134位由 F变为 A后,其抗原性明显降 低,不易被HBsAg试剂检出;而134位由对变为 S后,其抗原性无明显改变。
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关键词
乙型肝炎病毒
S基因
变异株
抗原性
α决定簇
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职称材料
乙型肝炎病毒突变株对疫苗接种效果的影响
被引量:
1
2
作者
史久华
《国外医学(预防.诊断.治疗用生物制品分册)》
2001年第4期154-156,共3页
近年来在许多国家和地区发现乙型肝炎病毒突变株 ,且其发生率不断增加。研究表明 ,这种突变株可不被筛检试验检出和疫苗诱生的抗体所中和 ,对公共卫生可产生重大影响 ,因而需要加强流行病学监测 。
关键词
乙型肝炎病毒
突变株
疫苗
接种
α决定簇
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职称材料
4例乙肝表面抗原阴性乙肝病毒DNA阳性标本结果分析
被引量:
4
3
作者
吴盛海
余道军
+2 位作者
陈岳明
王贤军
童文娟
《中国微生态学杂志》
CAS
CSCD
2011年第11期976-978,共3页
目的探讨4例乙肝病毒HBV-DNA阳性标本乙肝表面抗原(HbsAg)阴性的原因。方法 4例Hb-sAg阴性HBV-DNA阳性标本和1例HbsAg阳性HBV-DNA阳性标本,碱裂解法提取乙肝病毒基因组,采用巢式PCR扩增s基因全长片段,T-A克隆后测序,根据s基因序列推导...
目的探讨4例乙肝病毒HBV-DNA阳性标本乙肝表面抗原(HbsAg)阴性的原因。方法 4例Hb-sAg阴性HBV-DNA阳性标本和1例HbsAg阳性HBV-DNA阳性标本,碱裂解法提取乙肝病毒基因组,采用巢式PCR扩增s基因全长片段,T-A克隆后测序,根据s基因序列推导氨基酸序列,分析乙肝表面抗原α决定簇区域的氨基酸变异情况。结果与参考株比较,5例血清中HBV-DNA s基因均出现不同位点碱基突变,导致乙肝表面抗原α决定簇区域的氨基酸突变主要为:1号标本R122K、I126A、S143T;2号标本R122K、I126N、Q129N;3号标本R122K、I126S、T131N、M133T;4号标本R122K、I126S、T131N、M133T及5号标本的R122K。结论乙肝表面抗原α决定簇区域126位氨基酸突变可能会影响HbsAg的检测结果。
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关键词
乙型肝炎病毒
乙肝表面抗原
S基因
α决定簇
突变
原文传递
江浙沪地区乙肝病毒B、C基因型S基因突变及选择压力分析
被引量:
2
4
作者
陈海江
崔大伟
+1 位作者
余景璐
陈瑜
《中国微生态学杂志》
CAS
CSCD
2017年第7期771-775,781,共6页
目的系统分析江浙沪三地的乙肝病毒B、C基因型S基因突变和选择压力情况,以期为乙型肝炎的防治提供理论依据。方法采用NCBI数据库提供的乙肝病毒序列,分为B、C基因型两组,分析突变情况,同时采用Datamonkey进行选择压力分析和Bioedit进行...
目的系统分析江浙沪三地的乙肝病毒B、C基因型S基因突变和选择压力情况,以期为乙型肝炎的防治提供理论依据。方法采用NCBI数据库提供的乙肝病毒序列,分为B、C基因型两组,分析突变情况,同时采用Datamonkey进行选择压力分析和Bioedit进行氨基酸置换熵值分析。结果S基因226个氨基酸位点突变分析中,产生突变有位点122个,位点突变率C基因型(45.58%)高于B基因型(30.09%)(χ~2=11.523,P=0.001);总突变率C基因型(1.36%)高于B基因型(0.80%)(χ~2=46.642,P=0.000);α决定簇突变率C基因型(2.40%)高于B基因型(0.96%)(χ~2=20.524,P=0.000)。B基因型α决定簇突变率高于总突变率(χ~2=0.735,P=0.391);C基因型α决定簇突变率高于总突变率(χ~2=44.467,P=0.000)。B基因型氨基酸突变最多的位点为200、213、161和21位点,C基因型氨基酸突变最多的位点为126、68、3、53和194位点。两个基因型dN/dS均值均小于1。B基因型没有发现正向选择位点,发现8个负向选择位点。C基因型发现7个正向选择位点,17个负向选择位点。B基因型仅发现一个易突变位点(200位),C基因型也仅发现一个易突变位点(126位),大多数氨基酸位点熵值<0.4。结论江浙沪地区S基因突变率水平较低,其中C基因型位点突变率、α决定簇突变率和总突变率高于B基因型,α决定簇突变率高于总突变率。C基因型经历外界环境免疫选择压力和自身进化压力双重影响,自身进化压力强于外界环境免疫选择压力;而B基因型主要遭受自身进化压力。尤其要格外关注C基因型的进化进程。
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关键词
乙肝病毒
S基因
α决定簇
突
选择压力
氨基酸置换熵值
原文传递
题名
乙型肝炎病毒S基因变异株的研究
被引量:
5
1
作者
王佑春
林京香
张华远
杨军
李河民
机构
中国药品生物制品检定所
出处
《中国生物制品学杂志》
CAS
CSCD
2000年第2期65-67,共3页
文摘
目的 对7份HBsAg诊断试剂检测结果不一致的样品进行确证并分析其原因。方法采用套式 PCR法对7份样品进行DNA扩增,并将阳性产物克隆到pGEM-Teasy载体上,然后进行测序并对其序列进行分析。 结果 7份样品中6份为HBV DNA阳性,其中5份与Aboott和Orthro HBsAg试剂无反应或反应较弱,而且其a决定 簇的氨基酸均在134位发生改变,由F变为 A;1份与 Abbott和Orthro HBsAg试剂反应较强,其a决定簇的氨基酸也 在134位发生改变,但由F变为S。结论 国内外首次报道HBsAg a决定簇134位由 F变为 A后,其抗原性明显降 低,不易被HBsAg试剂检出;而134位由对变为 S后,其抗原性无明显改变。
关键词
乙型肝炎病毒
S基因
变异株
抗原性
α决定簇
Keywords
HBV S gene Mutant
分类号
R392-33 [医药卫生—免疫学]
R373.21 [医药卫生—病原生物学]
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职称材料
题名
乙型肝炎病毒突变株对疫苗接种效果的影响
被引量:
1
2
作者
史久华
出处
《国外医学(预防.诊断.治疗用生物制品分册)》
2001年第4期154-156,共3页
文摘
近年来在许多国家和地区发现乙型肝炎病毒突变株 ,且其发生率不断增加。研究表明 ,这种突变株可不被筛检试验检出和疫苗诱生的抗体所中和 ,对公共卫生可产生重大影响 ,因而需要加强流行病学监测 。
关键词
乙型肝炎病毒
突变株
疫苗
接种
α决定簇
分类号
R186 [医药卫生—流行病学]
下载PDF
职称材料
题名
4例乙肝表面抗原阴性乙肝病毒DNA阳性标本结果分析
被引量:
4
3
作者
吴盛海
余道军
陈岳明
王贤军
童文娟
机构
杭州市第一人民医院检验科
出处
《中国微生态学杂志》
CAS
CSCD
2011年第11期976-978,共3页
基金
浙江省自然科学基金(Y2101267)
杭州市医药卫生科技计划重点项目(2008Z001)
文摘
目的探讨4例乙肝病毒HBV-DNA阳性标本乙肝表面抗原(HbsAg)阴性的原因。方法 4例Hb-sAg阴性HBV-DNA阳性标本和1例HbsAg阳性HBV-DNA阳性标本,碱裂解法提取乙肝病毒基因组,采用巢式PCR扩增s基因全长片段,T-A克隆后测序,根据s基因序列推导氨基酸序列,分析乙肝表面抗原α决定簇区域的氨基酸变异情况。结果与参考株比较,5例血清中HBV-DNA s基因均出现不同位点碱基突变,导致乙肝表面抗原α决定簇区域的氨基酸突变主要为:1号标本R122K、I126A、S143T;2号标本R122K、I126N、Q129N;3号标本R122K、I126S、T131N、M133T;4号标本R122K、I126S、T131N、M133T及5号标本的R122K。结论乙肝表面抗原α决定簇区域126位氨基酸突变可能会影响HbsAg的检测结果。
关键词
乙型肝炎病毒
乙肝表面抗原
S基因
α决定簇
突变
Keywords
Hepatitis B virus
Hepatitis B surface antigen
s gene
ot decision
Mutation
分类号
R512.62 [医药卫生—内科学]
原文传递
题名
江浙沪地区乙肝病毒B、C基因型S基因突变及选择压力分析
被引量:
2
4
作者
陈海江
崔大伟
余景璐
陈瑜
机构
浙江大学医学院附属第一医院检验科
绍兴市妇幼保健院
出处
《中国微生态学杂志》
CAS
CSCD
2017年第7期771-775,781,共6页
基金
国家科技重大专项“传染病监测技术平台”项目(2012ZX10004-210)
文摘
目的系统分析江浙沪三地的乙肝病毒B、C基因型S基因突变和选择压力情况,以期为乙型肝炎的防治提供理论依据。方法采用NCBI数据库提供的乙肝病毒序列,分为B、C基因型两组,分析突变情况,同时采用Datamonkey进行选择压力分析和Bioedit进行氨基酸置换熵值分析。结果S基因226个氨基酸位点突变分析中,产生突变有位点122个,位点突变率C基因型(45.58%)高于B基因型(30.09%)(χ~2=11.523,P=0.001);总突变率C基因型(1.36%)高于B基因型(0.80%)(χ~2=46.642,P=0.000);α决定簇突变率C基因型(2.40%)高于B基因型(0.96%)(χ~2=20.524,P=0.000)。B基因型α决定簇突变率高于总突变率(χ~2=0.735,P=0.391);C基因型α决定簇突变率高于总突变率(χ~2=44.467,P=0.000)。B基因型氨基酸突变最多的位点为200、213、161和21位点,C基因型氨基酸突变最多的位点为126、68、3、53和194位点。两个基因型dN/dS均值均小于1。B基因型没有发现正向选择位点,发现8个负向选择位点。C基因型发现7个正向选择位点,17个负向选择位点。B基因型仅发现一个易突变位点(200位),C基因型也仅发现一个易突变位点(126位),大多数氨基酸位点熵值<0.4。结论江浙沪地区S基因突变率水平较低,其中C基因型位点突变率、α决定簇突变率和总突变率高于B基因型,α决定簇突变率高于总突变率。C基因型经历外界环境免疫选择压力和自身进化压力双重影响,自身进化压力强于外界环境免疫选择压力;而B基因型主要遭受自身进化压力。尤其要格外关注C基因型的进化进程。
关键词
乙肝病毒
S基因
α决定簇
突
选择压力
氨基酸置换熵值
Keywords
Hepatitis B virus
S gene
Alpha determinant
Selection pressure
Amino acid permutation entropy
分类号
R734.2 [医药卫生—肿瘤]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
乙型肝炎病毒S基因变异株的研究
王佑春
林京香
张华远
杨军
李河民
《中国生物制品学杂志》
CAS
CSCD
2000
5
下载PDF
职称材料
2
乙型肝炎病毒突变株对疫苗接种效果的影响
史久华
《国外医学(预防.诊断.治疗用生物制品分册)》
2001
1
下载PDF
职称材料
3
4例乙肝表面抗原阴性乙肝病毒DNA阳性标本结果分析
吴盛海
余道军
陈岳明
王贤军
童文娟
《中国微生态学杂志》
CAS
CSCD
2011
4
原文传递
4
江浙沪地区乙肝病毒B、C基因型S基因突变及选择压力分析
陈海江
崔大伟
余景璐
陈瑜
《中国微生态学杂志》
CAS
CSCD
2017
2
原文传递
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