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ASI基因家族结构及表达分析
1
作者
黄斌翰
何艳艳
+3 位作者
唐婕
叶春
周嘉裕
廖海
《四川大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第2期168-177,共10页
为研究编码α-淀粉酶/枯草杆菌蛋白酶抑制剂(α-amylase/subtilisin inhibitor, ASI)的基因结构特征及功能,本研究利用NCBI、Phytozome等平台工具鉴定到来源于23种植物的33个ASI基因家族成员,分析其进化特点及其编码蛋白的理化性质和保...
为研究编码α-淀粉酶/枯草杆菌蛋白酶抑制剂(α-amylase/subtilisin inhibitor, ASI)的基因结构特征及功能,本研究利用NCBI、Phytozome等平台工具鉴定到来源于23种植物的33个ASI基因家族成员,分析其进化特点及其编码蛋白的理化性质和保守基序等信息.同时结合RT-qPCR技术分析水稻ASI在干旱和盐胁迫条件下的表达模式.结果表明,ASI基因家族具有较高的保守性,但其编码蛋白上下游区域的保守性强弱不一,同时顺式作用元件预测结果提示ASI基因可能参与植物生长发育调控、响应生物及非生物胁迫等生理过程. RT-qPCR分析发现,较未胁迫条件下,幼苗期水稻的根、叶鞘和叶片等组织中RASI基因发生了不同的表达变化,提示ASI基因可能具有多样性的生物学功能.
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关键词
α-淀粉酶/枯草杆菌蛋白酶抑制剂(
asi
)
Kunitz型抑制剂
基因家族鉴定
基因序列分析
基因表达分析
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职称材料
题名
ASI基因家族结构及表达分析
1
作者
黄斌翰
何艳艳
唐婕
叶春
周嘉裕
廖海
机构
西南交通大学生命科学与工程学院
出处
《四川大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第2期168-177,共10页
基金
国家自然科学基金(32270410)
成都市科技局项目(2022-YF05-01357-SN)
中央高校医工结合项目(2682021ZTPY017,2682022ZTPY053)。
文摘
为研究编码α-淀粉酶/枯草杆菌蛋白酶抑制剂(α-amylase/subtilisin inhibitor, ASI)的基因结构特征及功能,本研究利用NCBI、Phytozome等平台工具鉴定到来源于23种植物的33个ASI基因家族成员,分析其进化特点及其编码蛋白的理化性质和保守基序等信息.同时结合RT-qPCR技术分析水稻ASI在干旱和盐胁迫条件下的表达模式.结果表明,ASI基因家族具有较高的保守性,但其编码蛋白上下游区域的保守性强弱不一,同时顺式作用元件预测结果提示ASI基因可能参与植物生长发育调控、响应生物及非生物胁迫等生理过程. RT-qPCR分析发现,较未胁迫条件下,幼苗期水稻的根、叶鞘和叶片等组织中RASI基因发生了不同的表达变化,提示ASI基因可能具有多样性的生物学功能.
关键词
α-淀粉酶/枯草杆菌蛋白酶抑制剂(
asi
)
Kunitz型抑制剂
基因家族鉴定
基因序列分析
基因表达分析
Keywords
α-amylase/subtilisin inhibitor
,
asi
Kunitz-domain
inhibitor
s
Gene family identification
Gene sequences analysis
Gene expression analysis
分类号
Q943.2 [生物学—植物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
ASI基因家族结构及表达分析
黄斌翰
何艳艳
唐婕
叶春
周嘉裕
廖海
《四川大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2024
0
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