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PCDH17 restricts dendritic spine morphogenesis by regulating ROCK2-dependent control of the actin cytoskeleton,modulating emotional behavior 被引量:1
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作者 Laidong Yu Fangfang Zeng +14 位作者 Mengshu Fan Kexuan Zhang Jingjing Duan Yalu Tan Panlin Liao Jin Wen Chenyu Wang Meilin Wang Jialong Yuan Xinxin Pang Yan Huang Yangzhou Zhang Jia-Da Li Zhuohua Zhang Zhonghua Hu 《Zoological Research》 SCIE CSCD 2024年第3期535-550,共16页
Proper regulation of synapse formation and elimination is critical for establishing mature neuronal circuits and maintaining brain function.Synaptic abnormalities,such as defects in the density and morphology of posts... Proper regulation of synapse formation and elimination is critical for establishing mature neuronal circuits and maintaining brain function.Synaptic abnormalities,such as defects in the density and morphology of postsynaptic dendritic spines,underlie the pathology of various neuropsychiatric disorders.Protocadherin 17(PCDH17)is associated with major mood disorders,including bipolar disorder and depression.However,the molecular mechanisms by which PCDH17 regulates spine number,morphology,and behavior remain elusive.In this study,we found that PCDH17 functions at postsynaptic sites,restricting the number and size of dendritic spines in excitatory neurons.Selective overexpression of PCDH17 in the ventral hippocampal CA1 results in spine loss and anxiety-and depression-like behaviors in mice.Mechanistically,PCDH17 interacts with actin-relevant proteins and regulates actin filament(F-actin)organization.Specifically,PCDH17 binds to ROCK2,increasing its expression and subsequently enhancing the activity of downstream targets such as LIMK1 and the phosphorylation of cofilin serine-3(Ser3).Inhibition of ROCK2 activity with belumosudil(KD025)ameliorates the defective F-actin organization and spine structure induced by PCDH17 overexpression,suggesting that ROCK2 mediates the effects of PCDH17 on F-actin content and spine development.Hence,these findings reveal a novel mechanism by which PCDH17 regulates synapse development and behavior,providing pathological insights into the neurobiological basis of mood disorders. 展开更多
关键词 Synapse development Dendritic spine Mood disorder actin cytoskeleton Animal behavior
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Scinderin promotes glioma cell migration and invasion via remodeling actin cytoskeleton 被引量:1
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作者 Xin Lin Zhao Zhao +1 位作者 Shu-Peng Sun Wei Liu 《World Journal of Clinical Oncology》 2024年第1期32-44,共13页
BACKGROUND Glioma is one of the most common intracranial tumors,characterized by invasive growth and poor prognosis.Actin cytoskeletal rearrangement is an essential event of tumor cell migration.The actin dynamics-rel... BACKGROUND Glioma is one of the most common intracranial tumors,characterized by invasive growth and poor prognosis.Actin cytoskeletal rearrangement is an essential event of tumor cell migration.The actin dynamics-related protein scinderin(SCIN)has been reported to be closely related to tumor cell migration and invasion in several cancers.AIM To investigate the role and mechanism of SCIN in glioma.METHODS The expression and clinical significance of SCIN in glioma were analyzed based on public databases.SCIN expression was examined using real-time quantitative polymerase chain reaction and Western blotting.Gene silencing was performed using short hairpin RNA transfection.Cell viability,migration,and invasion were assessed using cell counting kit 8 assay,wound healing,and Matrigel invasion assays,respectively.F-actin cytoskeleton organization was assessed using F-actin staining.RESULTS SCIN expression was significantly elevated in glioma,and high levels of SCIN were associated with advanced tumor grade and wild-type isocitrate dehydrogenase.Furthermore,SCIN-deficient cells exhibited decreased proliferation,migration,and invasion in U87 and U251 cells.Moreover,knockdown of SCIN inhibited the RhoA/focal adhesion kinase(FAK)signaling to promote F-actin depolymerization in U87 and U251 cells.CONCLUSION SCIN modulates the actin cytoskeleton via activating RhoA/FAK signaling,thereby promoting the migration and invasion of glioma cells.This study identified the cancer-promoting effect of SCIN and provided a potential therapeutic target for the treatment of glioma. 展开更多
关键词 GLIOMA Scinderin actin cytoskeleton RhoA/FAK signaling DEPOLYMERIZATION
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Dynamics of perinuclear actin ring regulating nuclear morphology
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作者 Haoxiang YANG Houbo SUN +2 位作者 Jinghao SHEN Hao WU Hongyuan JIANG 《Applied Mathematics and Mechanics(English Edition)》 SCIE EI CSCD 2024年第8期1415-1428,共14页
Cells are capable of sensing and responding to the extracellular mechanical microenvironment via the actin skeleton.In vivo,tissues are frequently subject to mechanical forces,such as the rapid and significant shear f... Cells are capable of sensing and responding to the extracellular mechanical microenvironment via the actin skeleton.In vivo,tissues are frequently subject to mechanical forces,such as the rapid and significant shear flow encountered by vascular endothelial cells.However,the investigations about the transient response of intracellular actin networks under these intense external mechanical forces,their intrinsic mechanisms,and potential implications are very limited.Here,we observe that when cells are subject to the shear flow,an actin ring structure could be rapidly assembled at the periphery of the nucleus.To gain insights into the mechanism underlying this perinuclear actin ring assembly,we develop a computational model of actin dynamics.We demonstrate that this perinuclear actin ring assembly is triggered by the depolymerization of cortical actin,Arp2/3-dependent actin filament polymerization,and myosin-mediated actin network contraction.Furthermore,we discover that the compressive stress generated by the perinuclear actin ring could lead to a reduction in the nuclear spreading area,an increase in the nuclear height,and a decrease in the nuclear volume.The present model thus explains the mechanism of the perinuclear actin ring assembly under external mechanical forces and suggests that the spontaneous contraction of this actin structure can significantly impact nuclear morphology. 展开更多
关键词 mechanical force actin dynamics perinuclear actin ring compressive stress NUCLEUS
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Analysis and Review of Downregulated Actin Cytoskeletal Proteins in Non-Small Cell Lung Cancer
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作者 Hala M. Abdel Mageed Praveen Sahu Raji Sundararajan 《Journal of Biosciences and Medicines》 2024年第4期89-115,共27页
Actin, a highly conserved protein, plays a dominant role in Non-small cell lung cancer (NSCLC). Late diagnosis and the aggressive nature of NSCLC pose a significant threat. Studying the clinic pathological properties ... Actin, a highly conserved protein, plays a dominant role in Non-small cell lung cancer (NSCLC). Late diagnosis and the aggressive nature of NSCLC pose a significant threat. Studying the clinic pathological properties of NSCLC proteins is a potential alternative for developing treatment strategies. Towards this, 35 downregulated actin cytoskeletal proteins on NSCLC prognosis and treatment were studied by examining their protein-protein interactions, gene ontology enrichment terms, and signaling pathways. Using PubMed, various proteins in NSCLC were identified. The protein-protein interactions and functional associations of these proteins were examined using the STRING database. The focal adhesion signaling pathway was selected from all available KEGG and Wiki pathways because of its role in regulating gene expression, facilitating cell movement and reproduction, and significantly impacting NSCLC. The protein-protein interaction network of the 35 downregulated actin cytoskeleton proteins revealed that ACTG1, ACTR2, ACTR3, ANXA2, ARPC4, FLNA, TLN1, CALD1, MYL6, MYH9, MYH10, TPM1, TPM3, TPM4, PFN1, IQGAP1, MSN, and ZXY exhibited the highest number of interactions. Whereas HSPB1, CTNNA1, KRT17, KRT7, FLNB, SEPT2, and TUBA1B displayed medium interactions, while UTRN, TUBA1B, and DUSP23 had relatively fewer interactions. It was discovered that focal adhesions are critical in connecting membrane receptors with the actin cytoskeleton. In addition, protein kinases, phosphatases, and adapter proteins were identified as key signaling molecules in this process, greatly influencing cell shape, motility, and gene expression. Our analysis shows that the focal adhesion pathway plays a crucial role in NSCLC and is essential for developing effective treatment strategies and improving patient outcomes. 展开更多
关键词 Non-Small Cell Lung Cancer NSCLC actin actin Cytoskeletal Proteins Focal Adhesion KEEG Pathway
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拟南芥、水稻和杨树ACTIN家族全基因组分析 被引量:19
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作者 郭景康 陈青云 +2 位作者 戢茜 张亮生 王健 《上海大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2009年第4期426-431,共6页
鉴定了覆盖拟南芥、水稻和杨树3种模式植物全基因组的20个拟南芥、18个水稻、22个杨树ACTIN蛋白基因,对其染色体定位、基因结构、基因复制等进行了综合分析.并在系统进化分析基础上,将ACTIN基因家族分为12个亚家族,有助于揭示植物ACTIN... 鉴定了覆盖拟南芥、水稻和杨树3种模式植物全基因组的20个拟南芥、18个水稻、22个杨树ACTIN蛋白基因,对其染色体定位、基因结构、基因复制等进行了综合分析.并在系统进化分析基础上,将ACTIN基因家族分为12个亚家族,有助于揭示植物ACTIN基因家族的进化历史,为后续ACTIN基因家族的功能提供线索,对研究植物ACTIN基因家族功能和进化上的多样性提供理论基础. 展开更多
关键词 拟南芥 水稻 杨树 actin基因家族
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多浆旱生植物霸王Actin基因片段的克隆及序列分析 被引量:30
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作者 伍国强 席杰军 +1 位作者 包爱科 王锁民 《生物技术通报》 CAS CSCD 2008年第2期101-104,共4页
根据其他植物Actin基因的保守序列设计一对简并性引物,以霸王叶片总RNA为模板,采用RT-PCR的方法扩增出Actin基因片段并克隆到PUCm-T载体。阳性克隆经PCR鉴定后进行测序,序列分析结果表明:该片段长598bp,编码198个氨基酸;所得序列与GenB... 根据其他植物Actin基因的保守序列设计一对简并性引物,以霸王叶片总RNA为模板,采用RT-PCR的方法扩增出Actin基因片段并克隆到PUCm-T载体。阳性克隆经PCR鉴定后进行测序,序列分析结果表明:该片段长598bp,编码198个氨基酸;所得序列与GenBank中注册的Actin基因序列的同源性均在82%以上,与其他肌动蛋白的氨基酸序列的同源性达91%以上。 展开更多
关键词 霸王 actin基因 克隆 序列分析
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紧密连接蛋白ZO-1、occludin和actin参与缺氧缺血诱导的血脑屏障通透性增加 被引量:24
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作者 吴丽文 尹飞 +2 位作者 彭镜 王卫东 甘娜 《中国当代儿科杂志》 CAS CSCD 2008年第4期513-516,共4页
目的探讨血脑屏障紧密连接(blood-brain barrier-tight junction,BBB-TJ)蛋白ZO-1、occludin和ac-tin在缺氧缺血诱导的血脑屏障(blood-brain barrier,BBB)通透性增加中的变化及其机制。方法利用人脐静脉内皮细胞系ECV304与星形胶质细胞(... 目的探讨血脑屏障紧密连接(blood-brain barrier-tight junction,BBB-TJ)蛋白ZO-1、occludin和ac-tin在缺氧缺血诱导的血脑屏障(blood-brain barrier,BBB)通透性增加中的变化及其机制。方法利用人脐静脉内皮细胞系ECV304与星形胶质细胞(astrocytes,AS)共培养建立体外BBB模型,模型随机分为正常对照组和缺氧缺血两组。透射电镜观察两组间BBB-TJ的变化,直接免疫荧光观察细胞骨架蛋白actin分布的改变。γ计数仪检测大分子物质125I-牛血清白蛋白(125I-BSA)通透曲线观察BBB通透性的改变,Western blot检测细胞骨架蛋白actin,胞浆附着蛋白ZO-1,跨膜蛋白occludin的表达量的改变。结果透射电镜观察培养第10天的体外BBB模型,可见内皮细胞连接紧密,细胞间形成光滑、连续、较高密度的紧密连接。缺氧缺血后5 h,内皮细胞间连接开放,形成裂隙。直接免疫荧光下检测可见周边Actin丝带模糊,部分断裂,形成细胞间裂隙。缺氧缺血组125I-BSA的通透量增加,与对照组比较差异有统计学意义(P<0.01)。同时ZO-1的表达量显著减少,而occludin和actin的表达量无明显改变。结论缺氧缺血诱导occludin的位置分布改变和ZO-1的表达量减少进而促使actin蛋白发生重排,是导致缺氧缺血后BBB通透性增加的可能机制之一。 展开更多
关键词 血脑屏障 紧密连接蛋白 actin ZO-1 OCCLUDIN 通透性 细胞培养
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盐生植物碱蓬Actin基因片段的克隆及序列分析 被引量:26
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作者 马清 周向睿 +1 位作者 伍国强 王锁民 《生物技术》 CAS CSCD 北大核心 2009年第1期1-3,共3页
目的:克隆盐生植物碱蓬(Suaeda glauca)Actin基因片段,为研究其它基因在碱蓬的表达和调控提供内参基因。方法:根据已知植物Actin基因的保守序列设计一对简并性引物,采用RT-PCR的方法扩增Actin基因片段,使用分子生物学软件进行序列分析... 目的:克隆盐生植物碱蓬(Suaeda glauca)Actin基因片段,为研究其它基因在碱蓬的表达和调控提供内参基因。方法:根据已知植物Actin基因的保守序列设计一对简并性引物,采用RT-PCR的方法扩增Actin基因片段,使用分子生物学软件进行序列分析。结果:获得一段大小为598bp的基因片段,编码198个氨基酸;该序列与其它Actin基因核苷酸序列的同源性均在80%以上,与氨基酸序列的同源性达93%以上。结论:克隆的基因为Actin基因片段,将其命名为SgACT,并登录在GenBank,登录号为EU429457。 展开更多
关键词 碱蓬 actin基因 克隆 序列分析
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香樟Actin基因的克隆及表达分析 被引量:9
9
作者 李勇鹏 张力维 +2 位作者 姚瑶 黄蕊 杜丽 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第5期120-127,共8页
Actin作为一个看家基因,经常在实时定量PCR中被用作内参对不同样品中的m RNA进行定量,因此在基因表达分析中扮演重要的角色。利用同源克隆的方法,根据Gen Bank中已经公布的其他植物的Actin基因的保守序列设计简并引物,采用RT-PCR(Revers... Actin作为一个看家基因,经常在实时定量PCR中被用作内参对不同样品中的m RNA进行定量,因此在基因表达分析中扮演重要的角色。利用同源克隆的方法,根据Gen Bank中已经公布的其他植物的Actin基因的保守序列设计简并引物,采用RT-PCR(Reverse Transcription Polymerase Chain Reaction)技术从香樟中获得了4个c DNA片段。分子生物学分析软件分析结果显示,4个片段大小为均为998 bp,编码332个氨基酸;同源性分析表明,所获得的片段属于Actin亚家族,分别命名为Cc ACTa、Cc ACTb、Cc ACTc和Cc ACTd并提交Gen Bank(登录号:KM086736、KM086737、KM086738和KM086739)。实时定量PCR结果显示,Cc ACTc在根、茎、叶及低温处理的叶片中表达量相对稳定,可以作为候选内参基因。 展开更多
关键词 香樟 actin 基因克隆 表达分析 实时定量PCR
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中国卤虫actin基因的实时荧光定量PCR方法的建立和优化 被引量:8
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作者 侯林 姜丽娟 +4 位作者 孙文静 张瑞锋 王家庆 赵欣涛 安家璐 《辽宁师范大学学报(自然科学版)》 CAS 北大核心 2006年第4期466-469,共4页
根据GenBank中卤虫actin基因的保守区域序列设计并合成一对引物,采用SYBR GreenⅠ作为染料建立了实时荧光定量PCR(real-time fluorescence quantitative PCR)方法.以Ct值为纵坐标,以稀释倍数的对数为横坐标,建立标准曲线,其相关系数达到... 根据GenBank中卤虫actin基因的保守区域序列设计并合成一对引物,采用SYBR GreenⅠ作为染料建立了实时荧光定量PCR(real-time fluorescence quantitative PCR)方法.以Ct值为纵坐标,以稀释倍数的对数为横坐标,建立标准曲线,其相关系数达到了0.999.溶解曲线分析显示产物为单一的特异峰,Tm为83.6℃.结果表明:本实验建立的中国卤虫actin基因的实时荧光定量PCR法扩增效率高、特异性强、线性范围广、检测周期短,为actin基因作为内参基因进行卤虫早期胚胎发育基因表达的定量分析奠定了基础. 展开更多
关键词 中国卤虫 actin基因 实时荧光定量PCR
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13种植物actin基因的密码子使用特性分析 被引量:8
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作者 赵洋 杨培迪 +2 位作者 刘振 成杨 杨阳 《南方农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第4期519-523,共5页
【目的】分析13种植物actin基因的密码子组成、密码子偏性及聚类关系,了解其密码子使用模式及影响密码子使用的因素,为深入研究分子进化及物种进化提供参考。【方法】运用Codon W 1.4.4软件分析13种植物的肌动蛋白基因(actin)密码子... 【目的】分析13种植物actin基因的密码子组成、密码子偏性及聚类关系,了解其密码子使用模式及影响密码子使用的因素,为深入研究分子进化及物种进化提供参考。【方法】运用Codon W 1.4.4软件分析13种植物的肌动蛋白基因(actin)密码子组成及使用参数,并对影响密码子偏性的因素进行研究。应用MEGA 4.1对13条基因的CDS序列进行聚类分析,采用SPSS 20.0进行密码子偏性的聚类分析。【结果】双子叶植物中actin基因的GC含量为45.0%~51.2%、GC3s含量为36.3%~53.8%,单子叶植物中GC含量为53.0%~58.3%、GC3s含量为60.9%~75.8%;actin基因在单子叶植物中偏爱G/C结尾的密码子,双子叶植物中偏爱A/T结尾的密码子。GC和GC3s与有效密码子数(ENC)呈极显著负相关(P〈0.01),相关系数均为-0.906。ENC绘图分析结果表明,actin基因密码子偏性同时受突变和选择压力影响,单子叶植物受选择压力影响的程度大于双子叶植物。基于actin基因密码子偏性的聚类将单子叶植物高粱、玉米聚为一类,水稻、大麦、竹聚为一类,8种双子叶植物聚为一类。【结论】actin基因密码子偏性与碱基组成密切相关,其密码子偏性在单、双子叶植物间存在差异,依据密码子偏性的聚类能在一定程度上反映物种间的亲缘关系。 展开更多
关键词 actin基因 密码子用法 密码子偏性
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海州香薷Actin基因片段克隆及表达分析 被引量:5
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作者 蔡深文 熊治廷 +2 位作者 刘晨 徐仲瑞 邓松强 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第2期111-115,共5页
通过克隆海州香薷Actin基因片段并分析其组织表达,为研究海州香薷重金属抗性相关基因的表达调控奠定基础。根据Gen Bank中其他植物Actin基因保守序列设计兼并引物,以海州香薷根总RNA为模板,利用RT-PCR技术分离得到Actin基因片段。序列... 通过克隆海州香薷Actin基因片段并分析其组织表达,为研究海州香薷重金属抗性相关基因的表达调控奠定基础。根据Gen Bank中其他植物Actin基因保守序列设计兼并引物,以海州香薷根总RNA为模板,利用RT-PCR技术分离得到Actin基因片段。序列分析结果表明,海州香薷Actin基因片段长576 bp,编码192个氨基酸,与其他植物同源基因的氨基酸序列相似性为84%-97%,所克隆的序列为Actin基因的同源片段,将其命名为Eh ACT,在Gen Bank中提交序列,获得登录号AGT37260。半定量RT-PCR分析结果表明,Eh ACT在海州香薷的根、茎和叶中表达相对稳定,初步表明其可作为研究海州香薷基因表达的内参基因。 展开更多
关键词 海州香薷 actin基因 克隆 表达
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葡萄Actin基因家族的鉴定及进化和表达分析 被引量:8
13
作者 崔力文 郑婷 +3 位作者 张克坤 张川 上官凌飞 房经贵 《植物资源与环境学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第3期1-10,共10页
采用生物信息学方法从葡萄(Vitis vinifera Linn.)全基因组中鉴定Actin基因家族,并对各基因的染色体定位和结构特征,编码蛋白质的理化性质、亚细胞定位、二级结构、三级结构和系统进化,以及不同组织的基因表达进行研究。结果表明:葡萄Ac... 采用生物信息学方法从葡萄(Vitis vinifera Linn.)全基因组中鉴定Actin基因家族,并对各基因的染色体定位和结构特征,编码蛋白质的理化性质、亚细胞定位、二级结构、三级结构和系统进化,以及不同组织的基因表达进行研究。结果表明:葡萄Actin基因家族16个基因分布在12条染色体上。16个基因的结构特征及其编码蛋白质的理化性质差异较大。16个基因的长度及其内含子总长度的变化范围较大,编码序列(CDS)和外显子总长度的变化范围较小。除登录号GSVIVG01008254001和GSVIVG01014035001的基因外,其他14个基因的GC含量均低于其CDS的GC含量。除登录号GSVIVG01008254001的基因外,其他15个基因编码的蛋白质的理论相对分子质量为12 534.54~82 612.33,理论等电点为p I 4.92~p I 9.13。16个基因编码蛋白质的消光系数为14 105~73 645,脂肪族氨基酸指数为65.54~92.06,其中9个为稳定蛋白,7个为不稳定蛋白。除登录号GSVIVG01014035001的基因外,其他15个基因编码的蛋白质均为亲水性蛋白。登录号GSVIVG01016517001的基因编码的蛋白质定位于细胞质和细胞核,其他15个基因编码的蛋白质定位于细胞质。二级结构和三级结构显示:葡萄Actin基因家族16个基因编码的蛋白质均由α螺旋、无规则卷曲和延伸链构成,且总体以无规则卷曲为主。系统进化分析和不同组织的基因表达分析结果显示:与拟南芥[Arabidopsis thaliana(Linn.)Heynh.]相似,葡萄Actin基因家族16个基因编码的蛋白质分为3个亚家族,ClassⅡ亚家族(营养型)包括登录号GSVIVG01003099001和GSVIVG01026580001的基因编码的蛋白质,这2个基因在所有组织中的表达均较高;ClassⅢ亚家族(生殖型)包括登录号GSVIVG01033494001、GSVIVG01024980001和GSVIVG01016550001的基因编码的蛋白质,这3个基因在花粉、雄蕊和花中的表达均较高;ClassⅠ亚家族包括其他11个基因编码的蛋白质,这11个基因在各组织中的表达总体上较低。研究结果显示:葡萄Actin基因家族的表达具有组织特异性。 展开更多
关键词 葡萄 actin基因家族 系统进化 基因表达
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山药Actin基因片段的克隆及表达分析 被引量:6
14
作者 龚明霞 周芸伊 +2 位作者 王爱勤 罗海玲 何龙飞 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第7期73-80,共8页
通过山药Actin基因的克隆和表达分析,为研究山药生长发育中肌动蛋白的作用及其他基因的表达和调控奠定基础。根据Gen Bank中已经公布的其他植物肌动蛋白基因(Actin)的保守序列设计一对简并引物,采用RT-PCR技术从山药块茎中分离出1个Acti... 通过山药Actin基因的克隆和表达分析,为研究山药生长发育中肌动蛋白的作用及其他基因的表达和调控奠定基础。根据Gen Bank中已经公布的其他植物肌动蛋白基因(Actin)的保守序列设计一对简并引物,采用RT-PCR技术从山药块茎中分离出1个Actin基因cDNA片段,命名为DoActin。片段长度为1 091 bp,编码357个氨基酸,并提交Gen Bank(登录号:KU669295)。与NCBI核酸和蛋白质数据库序列比对,该序列与其他植物Actin基因核苷酸序列的同源性均在83%以上,氨基酸序列的同源性均在97%以上。进化分析结果显示,DoActin与海枣Actin-2、木本棉Actin-7的亲缘关系最近。实时定量PCR结果显示,DoActin在山药叶片、地上茎和地下块茎以及不同发育期的块茎和叶片中表达量相对稳定,表明其适宜作为山药的内参基因。 展开更多
关键词 山药 actin基因 克隆 表达分析 序列分析
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微孔草Actin基因核心片段的克隆及序列分析 被引量:7
15
作者 吴淑娟 张一弓 +1 位作者 张丽静 傅华 《草业科学》 CAS CSCD 北大核心 2010年第4期97-101,共5页
提取微孔草Microula sikkimensis叶片的总RNA,并以其为模板,运用RT-PCR方法扩增出Actin基因的核心序列。通过连接、转化后对阳性克隆进行PCR鉴定并测序,序列分析结果表明:微孔草Actin基因核心片段长599 bp,编码199个氨基酸。将该序列与G... 提取微孔草Microula sikkimensis叶片的总RNA,并以其为模板,运用RT-PCR方法扩增出Actin基因的核心序列。通过连接、转化后对阳性克隆进行PCR鉴定并测序,序列分析结果表明:微孔草Actin基因核心片段长599 bp,编码199个氨基酸。将该序列与GenBank中已注册的植物Actin基因序列进行同源性比较,发现它们之间的同源性在84%以上,氨基酸序列同源性在95%以上,具有高度的保守性。 展开更多
关键词 微孔草 actin基因 序列分析
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火龙果Actin及UBQ内参基因片段的克隆及序列分析 被引量:6
16
作者 颜凤霞 文晓鹏 +1 位作者 高国丽 陶金 《贵州农业科学》 CAS 北大核心 2013年第9期1-4,共4页
为给火龙果的功能基因表达和调控研究提供内参基因,根据Actin基因和UBQ基因的保守区设计引物,采用RT-PCR方法克隆火龙果Actin基因和UBQ基因片段。结果表明:克隆的Actin基因和UBQ基因片段大小分别为302bp、192bp,分别编码100个氨基酸和6... 为给火龙果的功能基因表达和调控研究提供内参基因,根据Actin基因和UBQ基因的保守区设计引物,采用RT-PCR方法克隆火龙果Actin基因和UBQ基因片段。结果表明:克隆的Actin基因和UBQ基因片段大小分别为302bp、192bp,分别编码100个氨基酸和63个氨基酸。Actin基因片段与其他植物Actin基因核苷酸序列的同源性均在78%以上,与氨基酸序列的同源性达88%以上;UBQ基因片段与其他植物UBQ基因核苷酸序列的同源性均在88%以上,与氨基酸序列的同源性达95%以上。 展开更多
关键词 火龙果 actin基因 UBQ基因 克隆 序列分析
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木薯Actin基因片段的克隆及序列分析 被引量:18
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作者 许娟 罗兴录 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第6期65-70,共6页
克隆木薯Actin基因片段,为研究其他基因在木薯中的表达和调控提供内参基因。通过比较拟南芥、蓖麻和麻风树Actin基因cDNA同源区域,根据基因的保守序列设计一对简并性引物,采用RT-PCR的方法扩增Actin基因片段,使用分子生物学软件进行分... 克隆木薯Actin基因片段,为研究其他基因在木薯中的表达和调控提供内参基因。通过比较拟南芥、蓖麻和麻风树Actin基因cDNA同源区域,根据基因的保守序列设计一对简并性引物,采用RT-PCR的方法扩增Actin基因片段,使用分子生物学软件进行分析。结果显示,获得一段大小为698 bp的基因片段,编码233个氨基酸;该基因序列与其他Actin基因核苷酸序列的同源性均在85%以上,氨基酸序列的同源性达94%以上;系统进化分析表明,木薯Actin基因与大戟科植物橡胶、麻风树及蓖麻的亲缘关系最近,与毛果杨、陆地棉及木瓜等植物Actin基因具有较高的保守性。克隆的基因片段为木薯Actin基因片段,并命名为msACT。 展开更多
关键词 木薯 actin 基因 克隆 序列分析
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蒙古冰草Actin基因片段的克隆及序列分析 被引量:5
18
作者 赵彦 云锦凤 +1 位作者 石凤敏 刘亚玲 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第7期86-89,共4页
旨在利用同源序列法分离蒙古冰草(Agropyron mongolicumKeng)Actin基因同源片段,为研究其他基因在蒙古冰草中的表达和调控提供内标参照。根据禾本科植物小麦Actin基因(AB181991)的保守序列设计2对引物A4和A5,采用RT-PCR扩增蒙古冰草的Ac... 旨在利用同源序列法分离蒙古冰草(Agropyron mongolicumKeng)Actin基因同源片段,为研究其他基因在蒙古冰草中的表达和调控提供内标参照。根据禾本科植物小麦Actin基因(AB181991)的保守序列设计2对引物A4和A5,采用RT-PCR扩增蒙古冰草的Actin基因片段,分别得到656 bp和848 bp的片段,使用DNAman和DNAuser等分子生物学软件进行序列分析,将2个片段的重复序列合并后获得一段长度为962 bp的基因片段,编码237个氨基酸,将克隆的Actin基因片段命名为MwACT。该序列与其它植物Actin基因核苷酸序列的同源性均在80%以上,其中与小麦、大麦的同源性达到94%;与氨基酸序列的同源性均在90%以上。 展开更多
关键词 蒙古冰草 actin基因 克隆 序列分析
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模式植物狗尾草响应不同干旱及盐胁迫表达的内参基因actin及其应用 被引量:5
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作者 张丽丽 赵辉 +6 位作者 郭静远 夏启玉 贺萍萍 霍姗姗 屈静 符冬妹 郭安平 《热带作物学报》 CSCD 北大核心 2019年第12期2418-2425,共8页
为了研究应用于狗尾草响应不同干旱及盐胁迫基因表达的内参基因,本研究从网站https://phytozome.jgi.doe.gov/pz/portal.html上获得狗尾草A10品系8个actin基因的cDNA序列,设计荧光定量PCR引物,以不同程度的干旱及不同浓度盐胁迫处理的... 为了研究应用于狗尾草响应不同干旱及盐胁迫基因表达的内参基因,本研究从网站https://phytozome.jgi.doe.gov/pz/portal.html上获得狗尾草A10品系8个actin基因的cDNA序列,设计荧光定量PCR引物,以不同程度的干旱及不同浓度盐胁迫处理的狗尾草幼苗cDNA做模板,进行荧光定量PCR试验,通过实时荧光定量PCR扩增片段电泳分析,扩增曲线及溶解曲线综合分析,结果表明登录号Sevir.9G114100对应的actin基因是8个actin基因中最合适的内标基因。并对所选内标的实用性进行了验证,验证的结果与转录组数据的结果保持一致,证明所选内标基因可用于后续狗尾草响应不同干旱及盐胁迫狗尾草转录组基因表达的验证工作,为深入研究狗尾草功能基因奠定分子基础。 展开更多
关键词 狗尾草 actin基因 干旱胁迫 盐胁迫 荧光定量PCR
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茶树根系Actin基因克隆及表达分析 被引量:5
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作者 李远华 陆建良 +1 位作者 范方媛 石玉涛 《茶叶科学》 CAS CSCD 北大核心 2015年第4期336-346,共11页
采用SSH技术分析了VA菌根处理后福鼎大白茶根系基因差异表达情况,获得了差异序列,序列比对显示,在下调表达序列中可能包含了10种未知功能的基因;在上调表达序列中可能包含了5种可能的基因。采用RACE技术获得了Actin基因全长序列,Actin... 采用SSH技术分析了VA菌根处理后福鼎大白茶根系基因差异表达情况,获得了差异序列,序列比对显示,在下调表达序列中可能包含了10种未知功能的基因;在上调表达序列中可能包含了5种可能的基因。采用RACE技术获得了Actin基因全长序列,Actin基因长1 606 bp(Gen Bank,登录号KJ946252),具有1 131bp开放阅读框(1st^1 131st),编码377个氨基酸。分子生物信息学分析表明,Actin蛋白分子量约30.69 k D,等电点为5.27,定位于细胞核等亚细胞区位。研究还显示,Actin在不同品种中表达无显著差异,对非生物性胁迫响应也较弱。 展开更多
关键词 茶树 actin 基因克隆 表达
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