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分子动力学模拟研究靶向β分泌酶-1的选择性机制
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作者 周璇 许丹华 《中国药物化学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2020年第7期399-404,共6页
目的通过分子动力学模拟研究化合物Cpd-22选择性靶向β分泌酶-1(BACE-1)而非其同源蛋白β分泌酶-2(BACE-2)的选择性机制。方法采用分子动力学模拟技术,通过均方根偏差计算,评价化合物Cpd-22对BACE-1和BACE-2蛋白波动的影响;通过主成分分... 目的通过分子动力学模拟研究化合物Cpd-22选择性靶向β分泌酶-1(BACE-1)而非其同源蛋白β分泌酶-2(BACE-2)的选择性机制。方法采用分子动力学模拟技术,通过均方根偏差计算,评价化合物Cpd-22对BACE-1和BACE-2蛋白波动的影响;通过主成分分析,评价BACE-1和BACE-2蛋白结合Cpd-22的构象分布;通过溶剂可及表面积分析,评价BACE-1和BACE-2蛋白结合Cpd-22的蛋白在溶质中的稳定性;最后,通过结合自由能的计算与关键氨基酸残基,凸显BACE-1和BACE-2蛋白结合Cpd-22选择性差异的关键氨基酸残基。结果均方根偏差结果显示化合物Cpd-22在BACE-1中的波动明显小于在BACE-2中,说明Cpd-22在BACE-1中更为稳定。主成分分析研究显示,Cpd-22在BACE-1的构象相比BACE-2中的分布更为集中,验证了Cpd-22在BACE-1的构象变化小的结论。溶剂可及表面积分析同样显示,在溶质中,Cpd-22在BACE-1中的构象相比在BACE-2中更为稳定。关键氨基酸残基分解显示,氢键相互作用的关键氨基酸残基包括Gln97、Gly98等,是Cpd-22选择性靶向BACE-1的关键。结论本研究从动态结构上分析了选择性靶向BACE-1的构象变化和关键氨基酸残基,为后续靶向BACE-1的选择性抑制剂提供了设计思路。 展开更多
关键词 β分泌酶-1 β分泌-2 选择性 分子动力学模拟
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血尿酸对大鼠阿尔茨海默病生物标记物表达的影响 被引量:3
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作者 王君霞 刘庆新 肖新兴 《中国神经精神疾病杂志》 CAS CSCD 北大核心 2014年第8期479-482,共4页
目的观察不同血尿酸水平对大鼠阿尔茨海默病生物标记物β-淀粉样肽前体蛋白(amyloid recurosr protein,APP)及β分泌酶-1(beta-site amyloid precursor protein cleaving enzyme-1,BACE1)表达的影响。方法采用腹腔注射氧嗪酸钾盐(oxonic... 目的观察不同血尿酸水平对大鼠阿尔茨海默病生物标记物β-淀粉样肽前体蛋白(amyloid recurosr protein,APP)及β分泌酶-1(beta-site amyloid precursor protein cleaving enzyme-1,BACE1)表达的影响。方法采用腹腔注射氧嗪酸钾盐(oxonic acid Potassium salt,OAPS)的方法建立不同水平高尿酸血症(hyperuricemia,HUA)大鼠模型,HE染色观察大鼠海马区形态学变化;Western blot检测海马区APP及BACE1的表达,并进行统计学分析。结果与正常对照组比较,OAPS处理组血尿酸水平明显升高(P<0.01),海马区APP及BACE1的表达明显上调(P<0.001),与低剂量组比较,中、高剂量组血尿酸水平升高(P<0.05),海马区APP及BACE1表达减少(P<0.05),与中剂量组比较,高剂量组血尿酸水平增高(P<0.01),高剂量组的大鼠海马组织APP的表达减少(P<0.05),BACE1表达无统计学差异性(P>0.05)。结论高于正常水平的血尿酸可能为AD发生或发展的危险因素,其水平越高对AD危险性越低。 展开更多
关键词 高尿酸血症 β-淀粉样肽前体蛋白 β分泌酶-1
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