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分子动力学模拟研究靶向β分泌酶-1的选择性机制
1
作者
周璇
许丹华
《中国药物化学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第7期399-404,共6页
目的通过分子动力学模拟研究化合物Cpd-22选择性靶向β分泌酶-1(BACE-1)而非其同源蛋白β分泌酶-2(BACE-2)的选择性机制。方法采用分子动力学模拟技术,通过均方根偏差计算,评价化合物Cpd-22对BACE-1和BACE-2蛋白波动的影响;通过主成分分...
目的通过分子动力学模拟研究化合物Cpd-22选择性靶向β分泌酶-1(BACE-1)而非其同源蛋白β分泌酶-2(BACE-2)的选择性机制。方法采用分子动力学模拟技术,通过均方根偏差计算,评价化合物Cpd-22对BACE-1和BACE-2蛋白波动的影响;通过主成分分析,评价BACE-1和BACE-2蛋白结合Cpd-22的构象分布;通过溶剂可及表面积分析,评价BACE-1和BACE-2蛋白结合Cpd-22的蛋白在溶质中的稳定性;最后,通过结合自由能的计算与关键氨基酸残基,凸显BACE-1和BACE-2蛋白结合Cpd-22选择性差异的关键氨基酸残基。结果均方根偏差结果显示化合物Cpd-22在BACE-1中的波动明显小于在BACE-2中,说明Cpd-22在BACE-1中更为稳定。主成分分析研究显示,Cpd-22在BACE-1的构象相比BACE-2中的分布更为集中,验证了Cpd-22在BACE-1的构象变化小的结论。溶剂可及表面积分析同样显示,在溶质中,Cpd-22在BACE-1中的构象相比在BACE-2中更为稳定。关键氨基酸残基分解显示,氢键相互作用的关键氨基酸残基包括Gln97、Gly98等,是Cpd-22选择性靶向BACE-1的关键。结论本研究从动态结构上分析了选择性靶向BACE-1的构象变化和关键氨基酸残基,为后续靶向BACE-1的选择性抑制剂提供了设计思路。
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关键词
β分泌酶-1
β分泌
酶
-
2
选择性
分子动力学模拟
原文传递
血尿酸对大鼠阿尔茨海默病生物标记物表达的影响
被引量:
3
2
作者
王君霞
刘庆新
肖新兴
《中国神经精神疾病杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2014年第8期479-482,共4页
目的观察不同血尿酸水平对大鼠阿尔茨海默病生物标记物β-淀粉样肽前体蛋白(amyloid recurosr protein,APP)及β分泌酶-1(beta-site amyloid precursor protein cleaving enzyme-1,BACE1)表达的影响。方法采用腹腔注射氧嗪酸钾盐(oxonic...
目的观察不同血尿酸水平对大鼠阿尔茨海默病生物标记物β-淀粉样肽前体蛋白(amyloid recurosr protein,APP)及β分泌酶-1(beta-site amyloid precursor protein cleaving enzyme-1,BACE1)表达的影响。方法采用腹腔注射氧嗪酸钾盐(oxonic acid Potassium salt,OAPS)的方法建立不同水平高尿酸血症(hyperuricemia,HUA)大鼠模型,HE染色观察大鼠海马区形态学变化;Western blot检测海马区APP及BACE1的表达,并进行统计学分析。结果与正常对照组比较,OAPS处理组血尿酸水平明显升高(P<0.01),海马区APP及BACE1的表达明显上调(P<0.001),与低剂量组比较,中、高剂量组血尿酸水平升高(P<0.05),海马区APP及BACE1表达减少(P<0.05),与中剂量组比较,高剂量组血尿酸水平增高(P<0.01),高剂量组的大鼠海马组织APP的表达减少(P<0.05),BACE1表达无统计学差异性(P>0.05)。结论高于正常水平的血尿酸可能为AD发生或发展的危险因素,其水平越高对AD危险性越低。
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关键词
高尿酸血症
β
-
淀粉样肽前体蛋白
β分泌酶-1
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职称材料
题名
分子动力学模拟研究靶向β分泌酶-1的选择性机制
1
作者
周璇
许丹华
机构
浙江大学医学院/附属杭州市第一人民医院药学部
出处
《中国药物化学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第7期399-404,共6页
文摘
目的通过分子动力学模拟研究化合物Cpd-22选择性靶向β分泌酶-1(BACE-1)而非其同源蛋白β分泌酶-2(BACE-2)的选择性机制。方法采用分子动力学模拟技术,通过均方根偏差计算,评价化合物Cpd-22对BACE-1和BACE-2蛋白波动的影响;通过主成分分析,评价BACE-1和BACE-2蛋白结合Cpd-22的构象分布;通过溶剂可及表面积分析,评价BACE-1和BACE-2蛋白结合Cpd-22的蛋白在溶质中的稳定性;最后,通过结合自由能的计算与关键氨基酸残基,凸显BACE-1和BACE-2蛋白结合Cpd-22选择性差异的关键氨基酸残基。结果均方根偏差结果显示化合物Cpd-22在BACE-1中的波动明显小于在BACE-2中,说明Cpd-22在BACE-1中更为稳定。主成分分析研究显示,Cpd-22在BACE-1的构象相比BACE-2中的分布更为集中,验证了Cpd-22在BACE-1的构象变化小的结论。溶剂可及表面积分析同样显示,在溶质中,Cpd-22在BACE-1中的构象相比在BACE-2中更为稳定。关键氨基酸残基分解显示,氢键相互作用的关键氨基酸残基包括Gln97、Gly98等,是Cpd-22选择性靶向BACE-1的关键。结论本研究从动态结构上分析了选择性靶向BACE-1的构象变化和关键氨基酸残基,为后续靶向BACE-1的选择性抑制剂提供了设计思路。
关键词
β分泌酶-1
β分泌
酶
-
2
选择性
分子动力学模拟
Keywords
BACE
-
1
BACE
-
2
selectivity
molecular dynamics simulation
分类号
R914 [医药卫生—药物化学]
原文传递
题名
血尿酸对大鼠阿尔茨海默病生物标记物表达的影响
被引量:
3
2
作者
王君霞
刘庆新
肖新兴
机构
滨州医学院附属医院神经内科
出处
《中国神经精神疾病杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2014年第8期479-482,共4页
基金
山东省高等学校科技计划项目(编号:J12LL04)
文摘
目的观察不同血尿酸水平对大鼠阿尔茨海默病生物标记物β-淀粉样肽前体蛋白(amyloid recurosr protein,APP)及β分泌酶-1(beta-site amyloid precursor protein cleaving enzyme-1,BACE1)表达的影响。方法采用腹腔注射氧嗪酸钾盐(oxonic acid Potassium salt,OAPS)的方法建立不同水平高尿酸血症(hyperuricemia,HUA)大鼠模型,HE染色观察大鼠海马区形态学变化;Western blot检测海马区APP及BACE1的表达,并进行统计学分析。结果与正常对照组比较,OAPS处理组血尿酸水平明显升高(P<0.01),海马区APP及BACE1的表达明显上调(P<0.001),与低剂量组比较,中、高剂量组血尿酸水平升高(P<0.05),海马区APP及BACE1表达减少(P<0.05),与中剂量组比较,高剂量组血尿酸水平增高(P<0.01),高剂量组的大鼠海马组织APP的表达减少(P<0.05),BACE1表达无统计学差异性(P>0.05)。结论高于正常水平的血尿酸可能为AD发生或发展的危险因素,其水平越高对AD危险性越低。
关键词
高尿酸血症
β
-
淀粉样肽前体蛋白
β分泌酶-1
Keywords
Hyperuricemia
Amyloid recurosr protein
Beta
-
site amyloid precursor protein cleaving enzyme
-
1
分类号
R749.16 [医药卫生—神经病学与精神病学]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
分子动力学模拟研究靶向β分泌酶-1的选择性机制
周璇
许丹华
《中国药物化学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2020
0
原文传递
2
血尿酸对大鼠阿尔茨海默病生物标记物表达的影响
王君霞
刘庆新
肖新兴
《中国神经精神疾病杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2014
3
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职称材料
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