民猪FSHβ-亚基基因的多态性分析

采用PCR-SSCP方法,对108头民猪的FSHβ-亚基基因的2个基因座位进行了研究。结果表明:FSHβ-亚基基因的这2个基因座位在民猪内都存在AA、AB、BB3种基因型,A、B基因频率之间差异显著。本实验进一步证明了FSHβ-亚基基因在民猪内存在着丰富的多态性。

姜曲海猪FSHβ-亚基基因PCR-SSCP分析

用 PCR- SSCP方法对 15 2头姜曲海猪的 FSHβ-亚基基因进行了分型。结果表明 ,FSHβ-亚基基因在姜曲海猪中有 AA、AB、BB三种基因型 ,其频率分别为 0 .2 89、0 .493和 0 .2 17;A基因频率为 0 .5 36 ,B基因频率为 0 .46 4。A、B基因频率方差及两基因频率协方差分别为 0 .0 0 1、0 .0 0 1和 - 0 .0 0 1。A基因频率的群体估计值的 95 %置信区间为 [0 .473,0 .5 99],B基因频率对应为 [0 .40 1,0 .5 2 7];基因杂合度为 0 .498。经检验 ,该座位处于哈迪 -温伯格平衡状态。

牛科物种FSHβ基因外显子1和外显子2遗传特征分析

促卵泡素(follicle-stimulating hormone,FSH)对刺激动物卵泡发育和促进精子生成具有重要作用,但有关牛科物种FSH基因的群体遗传特征还不十分清楚。本文针对FSHβ基因外显子1和外显子2,采用PCR-SS-CP结合PCR产物直接测序技术对353头水牛(来自11个水牛群体)、30头牦牛和30头大额牛样品进行了群体变异检测,并结合NCBI数据库中已发表的普通牛、山羊和绵羊等物种同源序列进行了群体遗传和生物信息学分析。在FSHβ基因外显子1中,水牛中发现1个核苷酸替换和1个缺失,即c.-49A>G和c.-31delG;其中,SNP-49在河流型和沼泽型水牛中均存在,等位基因c.-49A为优势等位基因,而c.-31delG只存在于沼泽型水牛中,且为杂合状态,基因频率为0.077。在牦牛外显子1中检测到c.-37G>A和c.-12T>C替换,且为连锁遗传的,而在大额牛外显子1中未检测到SNP位点。在FSHβ基因外显子2中,水牛中发现c.132G>A替换,该位点在河流型和沼泽型水牛均存在,但等位基因频率在两类水牛间不一致。在牦牛外显子2中检测到c.9C>T和c.21C>T替换,该替换也存在于普通牛中;大额牛外显子2为单态,未见SNP位点。生物信息学分析显示,在一些牛科物种FSHβ基因外显子2中发现的SNP位点均为同义替换,揭示了其序列的高度保守性。在牛科物种中,山羊和绵羊FSHβ基因第36位密码子编码氨基酸与其他物种不同,可作为区分它们的遗传标记。

与大豆β-伴球蛋白缺失性状连锁的分子标记

大豆的贮藏蛋白质β-伴球蛋白在其亚基中含有主要的变态反应原，与球蛋白比较，其含硫氨基酸含量、凝胶形成能力和凝胶强度都低。因此，降低β-伴球蛋白含量成了目前大豆的一个育种目标。在日本熊本县发现的野生大豆品系QT2缺乏β-伴球蛋白的全部3种亚基；这种性状是受单一的显性基因Scg-1支配的。通过杂交将这种β-伴球蛋白缺失性状导入Fukuyutaka品种，再通过回交育成近等基因系QY7-25；然后用近等基因系QY7-25和Fukuyutaka品种开发出了与β-伴球蛋白缺失性状连锁的DNA标记。在测定β-伴球蛋白的各种亚基基因的碱基序列时，在Fukuyutska品种和QY7—25品系间的β-亚基基因中检测到10种单一的碱基多态。利用这种单一的碱基多态，分析了以Fukuyutaka和QY7-25作为双亲进行杂交所获得的118个F2植株中与β-伴球蛋白缺失性状间的连锁情况，结果查明，2个β-伴球蛋白亚基基因是与β-伴球蛋白缺失性状共同分离的。