β-折叠蛋白质的二维网格模型及其能带计算

根据β-折叠蛋白质电子传递机制,建立了一种蛋白质的二维网格模型,并计算了其能带结构,所得禁带宽度基本符合A．Szent-Gyorgyi提出的一般蛋白质禁带宽度标准(2-5eV)．

分子模拟研究蛋白质β-折叠区结合随机RNA片段

选取来源于大肠杆菌O157:H7全基因组DNA序列随机转录的3条RNA片段,通过RNAComposer进行结构预测,30个核苷酸的RNA片段均形成了特定的空间结构,构象与碱基排列的序列特异性有关。NPDock可用于RNA-蛋白质相互作用的分子模拟预测,蛋白质的β-结构相对α-螺旋更容易裸露出特定氨基残基的特异性侧链基团,从而易于结合抗原等配体。