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THE USE OF A SHUTTLE PLASMID TO STUDY NONTARGETED MUTAGENESIS AND ITS SEQUENCE SPECIFICITY
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作者 张小山 余应年 陈星若 《Chinese Medical Sciences Journal》 CAS CSCD 1995年第1期20-24,共5页
THEUSEOFASHUTTLEPLASMIDTOSTUDYNONTARGETEDMUTAGENESISANDITSSEQUENCESPECIFICITYZhangXiaoshan(张小山);YuYingnian(余... THEUSEOFASHUTTLEPLASMIDTOSTUDYNONTARGETEDMUTAGENESISANDITSSEQUENCESPECIFICITYZhangXiaoshan(张小山);YuYingnian(余应年)andChenXingruo... 展开更多
关键词 定位质粒 MNNG DNA损伤 突变频率 发生机制
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Simultaneous genotyping of human platelet antigens 1 through 6 by sequence specific PCR
2
《中国输血杂志》 CAS CSCD 2001年第S1期371-,共1页
关键词 Simultaneous genotyping of human platelet antigens 1 through 6 by sequence specific PCR
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Construction of Agropyrum intermedium 2Ai-2 Chromosome DNA Library and Cloning of Species-Specific DNA Sequences
3
作者 HECong-fen MAYou-zhi +2 位作者 XINZhi-yong XUQiong-fang LILian-cheng 《Agricultural Sciences in China》 CAS CSCD 2004年第1期1-7,共7页
The univalent from the meiosis-metaphase spreads of F1 (Z2× wheat variety Wan7107) wasidentified to be Agropyrum intermedium 2Ai-2 chromosome by GISH. The 2Ai-2 chromosomes weremicroisolated and collected. After ... The univalent from the meiosis-metaphase spreads of F1 (Z2× wheat variety Wan7107) wasidentified to be Agropyrum intermedium 2Ai-2 chromosome by GISH. The 2Ai-2 chromosomes weremicroisolated and collected. After two rounds of PCR amplification, the PCR products wereranged from 150-3 000 bp,with predominant fragments at about 200-2 000 bp. Using Ag.intermedium genomic DNA as a probe, Southern blotting analysis confirmed the products originatedfrom Ag. intermedium genome. The products were purified, ligated to pUC18 and then transformedinto competence E.coli DH5αto produce a 2Ai-2 chromosome DNA library. The microcloningexperiments produced approximately 5 ×105 clones, the size range of the cloned inserts was 200-1 500 bp, with an average of 580 bp. Using Ag.intermedium genomic DNA as a probe, dot blottingresults showed that 56% clones are unique/low copy sequences, 44% are repetitive sequences inthe library. Four Ag. intermedium clones were screened from the library by RFLP, and threeclones(Mag065, Mag088, Mag139)belong to low/single sequences, one clone(Mag104)was repetitivesequence, and GISH results indicated that Mag104 was Ag.intermedium species-specific repetitiveDNA sequence. 展开更多
关键词 Agropyrum intermedium Microisolation and microcloning of chromosome LA-PCR RFLP Species-specific DNA sequences
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The application of sequence specific primer and RT-PCR to LRRK2 gene polymorphism typing
4
作者 Biao G Gaisheng T +1 位作者 Qinxue L Fengrui L 《Discussion of Clinical Cases》 2019年第2期17-19,共3页
Objective:To establish a new detecting method for disease susceptibility loci R1628P and G2385R of Parkinson’s disease(PD)related gene LRRK2.Methods:Sequence specific primers were designed to make a genotyping of DNA... Objective:To establish a new detecting method for disease susceptibility loci R1628P and G2385R of Parkinson’s disease(PD)related gene LRRK2.Methods:Sequence specific primers were designed to make a genotyping of DNA markers with known genotypes by use of quantitative fluorescence real-time PCR(RT-PCR).100 cases of PD samples with unknown genotypes were tested,and verified by use of polymerase chain reaction linked restriction fragment length polymorphism(PCR-RLFP).Results:The genotyping results of DNA markers proved to be correct,and 100 cases of samples to be tested had a completely consistent genotyping result with PCR-RLFP genotyping result.Conclusions:Sequence specific primer and quantitative fluorescence RT-PCR can successfully make a genotyping for disease susceptibility loci R1628P and G2385R of LRRK2. 展开更多
关键词 Parkinson’s disease LRRK2 gene sequence specific primer Quantitative fluorescence RT-PCR GENOTYPE
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渐近平均伪轨跟踪性质、弱specification性质和分布混沌 被引量:2
5
作者 王立冬 王翔 刘恒 《大连民族大学学报》 2016年第1期43-46,共4页
证明了有渐近平均伪轨跟踪性质的非平凡紧致动力系统具有一致分布混沌或者按序列分布混沌。此外,在具有渐近平均伪轨跟踪性质系统中的分布混沌在测度中心是一致和稠密的,即有一个不可数的一致分布混沌集是由这样的点组成,它们的轨道闭... 证明了有渐近平均伪轨跟踪性质的非平凡紧致动力系统具有一致分布混沌或者按序列分布混沌。此外,在具有渐近平均伪轨跟踪性质系统中的分布混沌在测度中心是一致和稠密的,即有一个不可数的一致分布混沌集是由这样的点组成,它们的轨道闭包包含测度中心。作为一个推论,具有弱specification性质的系统也有类似的结果。 展开更多
关键词 渐近平均伪轨跟踪 specification性质 分布混沌 按序列分布混沌
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一些紧致系统的拓扑序列熵和广义specification性质 被引量:2
6
作者 胡超杰 马东魁 《广东工业大学学报》 CAS 2007年第2期24-26,共3页
研究了紧致度量空间上的连续满射f:X→X和逆极限空间上移位映射σf:Xf→Xf的拓扑序列熵的性质和逆极限空间上移位映射的广义spec ification性质.
关键词 移位映射 逆极限空间 拓扑序列熵 广义specification
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Novel Frequency Hopping Sequences Generator Based on AES Algorithm 被引量:2
7
作者 李振荣 庄奕琪 +1 位作者 张博 张超 《Transactions of Tianjin University》 EI CAS 2010年第1期22-27,共6页
A novel frequency hopping(FH) sequences generator based on advanced encryption standard(AES) iterated block cipher is proposed for FH communication systems.The analysis shows that the FH sequences based on AES algorit... A novel frequency hopping(FH) sequences generator based on advanced encryption standard(AES) iterated block cipher is proposed for FH communication systems.The analysis shows that the FH sequences based on AES algorithm have good performance in uniformity, correlation, complexity and security.A high-speed, low-power and low-cost ASIC of FH sequences generator is implemented by optimizing the structure of S-Box and MixColumns of AES algorithm, proposing a hierarchical power management strategy, and applying the dynamic clock gating technology based on finite state machine and clock gating.SMIC 0.18 μm standard CMOS technology shows that the scale of ASIC is only about 10.68 kgate, power consumption is 33.8 μW/MHz, and the maximum hop-rate is 1 098 901 hop/s.This design is suitable for portable FH communication system for its advantages in high-security and hop-rate, low-power and low-cost.The proposed FH sequences generator has been employed in Bluetooth SoC design. 展开更多
关键词 频率跳跃序列 先进加密标准 低力量 便宜 申请特定的集成电路
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河北省5株牛支原体的分离鉴定和药敏试验
8
作者 张锦程 白和平 +4 位作者 赵桂新 王少华 郭建军 吴同垒 史秋梅 《中国兽医杂志》 CAS 北大核心 2024年第6期64-69,共6页
为了确定肉牛场犊牛患呼吸道疾病死亡的致病原,本试验采集河北省秦皇岛地区5个肉牛养殖场病牛的肺脏组织进行病原的分离培养,采用染色镜检、培养特性观察、支原体特异性oppD/F基因鉴定、16S rRNA序列比对和同源性分析鉴定分离菌株,并通... 为了确定肉牛场犊牛患呼吸道疾病死亡的致病原,本试验采集河北省秦皇岛地区5个肉牛养殖场病牛的肺脏组织进行病原的分离培养,采用染色镜检、培养特性观察、支原体特异性oppD/F基因鉴定、16S rRNA序列比对和同源性分析鉴定分离菌株,并通过药敏试验筛选敏感药物,检测中西药对分离菌株的抑菌效果。结果显示,分离菌株在PPLO肉汤固体基础培养基上为针尖大小白色菌落,瑞氏染色菌体呈球状;oppD/F基因和16S rRNA基因扩增均可得预期目的条带,16S rRNA基因序列与NCBI中牛支原体参考序列同源性达99%,在遗传进化树中处于同一分支,共从病牛肺脏分离鉴定出5株牛支原体,分别命名为ZYT-1~ZYT-5;药敏试验结果显示,5株牛支原体分离菌株对恩诺沙星、环丙沙星、土霉素和氟苯尼考极度敏感,对中药苏木、五味子、白头翁和乌梅极度敏感。结果表明,肉牛场患病犊牛的致病原为牛支原体,本试验结果可为当地牛支原体感染临床病例的治疗用药提供参考依据。 展开更多
关键词 牛支原体 瑞氏染色 16S rRNA序列比对 特异基因检测 药敏试验
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应用Q-PCR定性检测KIR基因有无方法的建立
9
作者 李宇楠 甄建新 +2 位作者 梁爽 喻琼 邓志辉 《中国输血杂志》 CAS 2024年第6期660-665,共6页
目的建立定性检测KIR基因有无的Q-PCR方法。方法根据高分辨水平中国人群KIR等位基因的多态性,并参考国际IPD-KIR数据库,针对16种KIR基因及2DS4-Normal、2DS4-Deleted两种亚型,设计KIR基因特异性引物用于Q-PCR扩增反应;同时设置一孔阴性... 目的建立定性检测KIR基因有无的Q-PCR方法。方法根据高分辨水平中国人群KIR等位基因的多态性,并参考国际IPD-KIR数据库,针对16种KIR基因及2DS4-Normal、2DS4-Deleted两种亚型,设计KIR基因特异性引物用于Q-PCR扩增反应;同时设置一孔阴性对照、一孔阳性对照(特异性扩增人体生长激素HGH基因片段),以监控假阳性、假阴性的结果。为验证Q-PCR方法的可靠性,随机选择302份已采用KIR PCR-SSP商品化试剂盒检测的标本,采用Q-PCR方法盲检和对比。结果300人份的Q-PCR检测结果与已知的PCR-SSP检测结果相符,有2份标本结果不一致,其中1例标本的2DS5基因Q-PCR检测结果为阴性,而PCR-SSP检测结果为阳性;另一例标本2DS1基因Q-PCR检测结果为阳性,而PCR-SSP检测结果为阴性。对2份标本分别进行2DS5、2DS1基因测序分型,证实Q-PCR定性检测结果正确。结论本文建立的KIR Q-PCR方法结果准确、可靠,可用于KIR基因有无的定性检测。 展开更多
关键词 杀伤细胞免疫球蛋白样受体(KIR) KIR基因有无 实时荧光定量-PCR 序列特异性引物-PCR 测序分型
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大黄鱼优势腐败菌的致腐能力及对挥发性风味的影响
10
作者 柴庭庭 朱星橦 +2 位作者 柴保臣 陈军辉 陈跃文 《中国食品学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2024年第6期329-340,共12页
为评估冷藏大黄鱼优势腐败菌的致腐能力,从贮藏末期的鱼肉中分离出7种腐败菌,分析接种7种腐败菌的鱼肉样品的菌落总数值(TVC)、总挥发性盐基氮值(TNB-N)和挥发性成分组成。结果表明,接种不同菌株的鱼肉样品间的TVC值呈现显著性差异(P<... 为评估冷藏大黄鱼优势腐败菌的致腐能力,从贮藏末期的鱼肉中分离出7种腐败菌,分析接种7种腐败菌的鱼肉样品的菌落总数值(TVC)、总挥发性盐基氮值(TNB-N)和挥发性成分组成。结果表明,接种不同菌株的鱼肉样品间的TVC值呈现显著性差异(P<0.05),其中魏氏假单胞菌、波罗的海希瓦氏菌、麦芽糖肉食杆菌在贮藏末期增长缓慢;接种液化沙雷氏菌、软体气单胞菌、波罗的海希瓦氏菌的TNB-N值增幅较快,与初始时相比分别增加了7.31%,4.92%,7.03%,而对照组仅增加0.98%。产量因子结果显示:波罗的海希瓦氏菌是真空包装大黄鱼贮藏期间的优势腐败菌,其末期值高达46.58×10^(-8)mg TVB-N/CFU,其次是液化沙雷氏菌和软体气单胞菌。通过气相色谱-离子迁移谱(GC-IMS)共鉴定出81种挥发性风味物质,其中对照组主要产生醚类、醇类、烯类、噻唑类物质。明显不同于对照组,在7种腐败菌作用下挥发性成分主要为酯类、醛酮类、烃类以及含氮含硫类化合物,接种不同菌种后鱼块的气味物质种类存在着较大的差异,不同接菌鱼块会产生其特有的风味物质。本研究为后期进一步探究贮藏大黄鱼的腐败机制提供参考。 展开更多
关键词 大黄鱼 16S rDNA测序 优势腐败菌 挥发性成分
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基于简化基因组测序评估陇南山羊群体遗传多样性和群体结构
11
作者 马克岩 刘占经 +1 位作者 白雅琴 马友记 《中国畜禽种业》 2024年第4期8-17,共10页
该试验旨在利用简化基因组测序(specific-locus amplified fragment sequencing, SLAF-seq)分析陇南山羊群体遗传多样和群体结构,为陇南山羊后续保种计划的制订提供依据。该研究对50只陇南山羊(公、母各25只)进行全基因组SNP检测;计算... 该试验旨在利用简化基因组测序(specific-locus amplified fragment sequencing, SLAF-seq)分析陇南山羊群体遗传多样和群体结构,为陇南山羊后续保种计划的制订提供依据。该研究对50只陇南山羊(公、母各25只)进行全基因组SNP检测;计算观测杂合度(Ho)、期望杂合度(He)、多态信息含量(PIC)、香浓维纳指数(SHI)、基因多样性指数(Nei)及次要等位基因频率(MAF)等6个指标进行遗传多样性评估。结果表明,50只陇南山羊共检测到655514个SNPs位点。陇南山羊的Ho、 He、 PIC、 SHI、 Nei及MAF指标值分别为0.193、0.286、 0.236、 0.449、 0.290、 0.200,说明该群体遗传多样性较低。陇南山羊群体LD值较低,衰退速度较快,说明该群体并未受到过强烈的人工选择压力。此外,PCA与系统发育树结果均表明陇南山羊群体内部出现分化,可分为2个大的亚群。陇南山羊群体平均IBS遗传距离为0.7391,结合亲缘关系G矩阵热图,表明陇南山羊群体大部分个体亲缘关系较远。50只陇南山羊个体共检测到47206个ROH,平均ROH长度37.86 Mb,基于ROH的近交系数FROH范围为0.0535~0.2574,平均FROH值为0.1472,说明陇南山羊群体存在近交风险。可见,陇南山羊内部存在分化,可分为2个大的亚群,陇南山羊群体遗传多样性较低,部分个体间存在较大的近交风险,可能需要采取保种措施保护陇南山羊遗传资源。 展开更多
关键词 陇南山羊 简化基因组测序 种质资源 遗传多样性 连续纯合片段
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基于PACA的复杂空中目标战术意图识别方法
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作者 宋晓程 冯舒婷 +1 位作者 姜涛 李陟 《现代防御技术》 北大核心 2024年第3期48-54,共7页
针对战场中空中目标航迹动态性、时序变化性及意图多样的特性,提出一种基于端到端类属属性学习的识别方法,作为智能多意图识别模型的基本框架。融合目标航迹中的时序特征及属性特点,通过压缩及修正预处理统一输入编码信息,封装专家的知... 针对战场中空中目标航迹动态性、时序变化性及意图多样的特性,提出一种基于端到端类属属性学习的识别方法,作为智能多意图识别模型的基本框架。融合目标航迹中的时序特征及属性特点,通过压缩及修正预处理统一输入编码信息,封装专家的知识经验为标签,学习指挥员战时情况判断的思维方式,消除其隐蔽性、欺骗性和对抗性所带来的干扰因素,得出特定目标的复杂战术意图。通过仿真实验,采用常用多分类评价体系分析端到端训练方式对结果的影响,以及与相关方法的对比分析表明,所提算法针对多意图识别更具有效性和参考价值,可用于支撑作战筹划系统建立非合作目标与保卫要地的关联关系。 展开更多
关键词 意图识别 时序特征 多标签分类 空中目标 面向多标签分类的端到端类属属性学习 航迹序列
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Cloning and characterization of a C genome-specific repetitive sequence in Aegilops caudata L. 被引量:1
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作者 Xiuying Kong Ronghua Zhou +1 位作者 Yuchen Dong Jizeng Jia 《Chinese Science Bulletin》 SCIE EI CAS 1999年第14期1301-1306,共6页
pAeca212 is 204 bp in length, and the G + C content is 51%. It disperses on all seven chromosome pairs of Aegilops caudata except centromeres and secondary constrictions.Compared with the 316893 DNA sequences register... pAeca212 is 204 bp in length, and the G + C content is 51%. It disperses on all seven chromosome pairs of Aegilops caudata except centromeres and secondary constrictions.Compared with the 316893 DNA sequences registered in Genbank/EMBL/DDJB/PDB, pAeca212 is a new C-genome specific repetitive sequence. The results of genomic specificity analysis of pAeca212 show that there are no hybridization signals detected in all donor Poaceae plants except in rye. pAeca212 is a very useful molecular marker in the study of the origin of Triticeace and the detection of C chromatin in wheat background. 展开更多
关键词 AEGILOPS CAUDATA GENOME specific REPETITIVE sequence.
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Microdissection of chromosome 7B of common wheat and cloning of low-copy specific DNA sequences
14
作者 Bao Liu Junkang Rong +5 位作者 Yingshan Dong Fangpu Han Zhenlan Liu Mengyuan He Baiqu Huang Shui Hao 《Chinese Science Bulletin》 SCIE EI CAS 1999年第7期632-636,共5页
The 7B chromosome of common wheat was microdissected from pollen mother cells of the 7B monosomic line of common wheat cv. Chinese Spring (CS). After proteinase K and DNA topoisomerase Ⅰtreatments, the isolated chrom... The 7B chromosome of common wheat was microdissected from pollen mother cells of the 7B monosomic line of common wheat cv. Chinese Spring (CS). After proteinase K and DNA topoisomerase Ⅰtreatments, the isolated chromosomes were subjected to 1—3 rounds of DOPPCR amplification, which produced continuous DNA fragments ranging from 150 to 700 bp. Genomic Southern hybridization confirmed that the PCR products were originated from the wheat genome. Cloning of portion ( 】 200 bp) of the 3rd round DOP-PCR products (50 μL) could generate about 20 000 recombinant clones. Characterization of 50 randomly chosen clones indicated that 21 clones produced discrete PCR products with the size of 240—600 bp. Dot-blot hybridization showed that among the 21 clones, 11 (~ 55%) were of low-copy nature while 10 (~45%) were repetitive. Southern hybridization with the complete set of the CS 'nullisomic-tetrasomic (NT)' lines demonstrated that all the 6 low-copy clones were specific to either chromosome 7B or the 7th 展开更多
关键词 wheat CHROMOSOME MICRODISSECTION DOP-PCR specific DNA sequences.
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The Sequence Modeling Method Based on ECCin Developing Program Specifications
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作者 蔡家楣 《Journal of Computer Science & Technology》 SCIE EI CSCD 1999年第4期337-348,共12页
This article discusses the developing process of the version sequencesof specifications and the formal expressions of various reconstructions including theexpansion and revision of the version at each stage. The autho... This article discusses the developing process of the version sequencesof specifications and the formal expressions of various reconstructions including theexpansion and revision of the version at each stage. The author suggests using ECC(Extended Calculus of Construction) to describe the specifications of formal systemand using functional language ML to implement this developing process. 展开更多
关键词 version sequence of specification reconstruction ECC (ExtendedCalculus of Construction) language ML
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转基因玉米ND207转化事件特异性定性PCR检测方法及其标准化 被引量:1
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作者 常丽娟 梁晋刚 +6 位作者 宋君 刘文娟 付成平 代晓航 王东 魏超 熊梅 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第7期1818-1828,共11页
转基因玉米ND207是中国农业大学研发的转mCry1Ab和mCry2Ab基因的抗虫玉米,本研究的目的是建立ND207转化事件特异性定性PCR检测方法。根据研发者提供的引物进行PCR扩增,PCR产物测序分析,获得了5’端旁侧序列262 bp,包括109 bp的载体序列... 转基因玉米ND207是中国农业大学研发的转mCry1Ab和mCry2Ab基因的抗虫玉米,本研究的目的是建立ND207转化事件特异性定性PCR检测方法。根据研发者提供的引物进行PCR扩增,PCR产物测序分析,获得了5’端旁侧序列262 bp,包括109 bp的载体序列和153 bp的玉米基因组序列, 3’端旁侧序列316 bp,包括76 bp的载体序列和240bp的玉米基因组序列。针对两端旁侧序列设计14条引物,组成25对引物组合进行引物筛选,选中3’端一对最佳引物优化PCR反应体系及反应条件,建立ND207的转化事件特异性定性PCR检测方法, PCR产物片段大小为166 bp。经过测试,该方法的检出限为0.1%,相当于20个拷贝的ND207特异分子片段。国内8家转基因生物安全检测机构对本方法进行了特异性测试、检出限测试和再现性测试,循环验证报告显示:该方法符合国家标准方法的各项要求,可在检测行业推广应用。ND207转化事件特异性定性PCR检测方法的建立,为我国ND207及其衍生品系的安全监管提供技术支撑。 展开更多
关键词 转基因玉米 ND207 旁侧序列 转化事件特异性 定性PCR
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Flow-rSSO及PCR-SBT方法检测KIR基因有无的对比研究 被引量:1
17
作者 钟福玲 杨智超 +1 位作者 陈浩 邓志辉 《中国输血杂志》 CAS 2023年第7期563-566,共4页
目的研究流式磁珠序列特异性寡核苷酸探针(Flow-rSSO)杂交及测序分型(PCR-SBT)方法鉴定KIR基因有无的一致性。方法对131例汉族人群的DNA标本采用Flow-rSSO方法鉴定全部16种KIR基因的有无,并采用本实验室建立的PCR-SBT方法对14种功能性KI... 目的研究流式磁珠序列特异性寡核苷酸探针(Flow-rSSO)杂交及测序分型(PCR-SBT)方法鉴定KIR基因有无的一致性。方法对131例汉族人群的DNA标本采用Flow-rSSO方法鉴定全部16种KIR基因的有无,并采用本实验室建立的PCR-SBT方法对14种功能性KIR基因进行高分辨水平基因检测;分析Flow-rSSO及PCR-SBT两种方法鉴定14种功能性KIR基因有无的一致性。对初检结果不一致的标本,采用同一厂家、不同批号的Flow-rSSO试剂盒进行复检,并采用序列特异性引物-PCR(PCR-SSP)方法进行检测。结果131例标本中有129例完全一致,2例不一致,占1.5%(2/131)。不一致的两例标本,1例标本3DL1基因、另1例标本2DS3及2DS5基因,其Flow-rSSO初检结果均为阴性,而PCR-SBT结果均为阳性。更换新的批号Flow-rSSO试剂盒复检,两例标本的结果均为阳性;采用PCR-SSP方法检测的结果亦为阳性。结论经Flow-rSSO试剂盒检测KIR基因有无,出现2例标本初检结果错误,提示检测KIR基因有无时,试剂的质控工作至关重要。 展开更多
关键词 KIR基因 测序分型 流式磁珠序列特异性寡核苷酸探针 序列特异性引物-PCR
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大豆转化体E8A7027外源T-DNA分析及特异性检测体系建立
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作者 闫伟 马月 +5 位作者 谢彦博 董立明 龙丽坤 李葱葱 张玲 李飞武 《大豆科学》 CAS CSCD 北大核心 2023年第5期579-585,共7页
为进一步分析转AgGlpF基因耐盐转基因大豆E8A7027转化体的分子特征信息并对其进行特异性检测,本研究分离该转化体的旁侧序列并建立其特异性PCR检测体系。基于基因组重测序技术并结合Sanger测序技术,将基因组重测序分析获得的序列信息与... 为进一步分析转AgGlpF基因耐盐转基因大豆E8A7027转化体的分子特征信息并对其进行特异性检测,本研究分离该转化体的旁侧序列并建立其特异性PCR检测体系。基于基因组重测序技术并结合Sanger测序技术,将基因组重测序分析获得的序列信息与参考大豆基因组进行对比,确定E8A7027转化体的T-DNA区在大豆基因组上的插入位点及其5′端和3′端的旁侧序列。根据旁侧序列设计PCR检测引物,并对检测体系的特异性、灵敏度进行实验室内验证。结果显示:转基因大豆E8A7027的整合位点为Chr09染色体的33886331位点,整合方式为单拷贝插入,受体基因组DNA在插入位点缺失了1段58 bp序列,分别获得E8A7027大豆的5′端旁侧序列910 bp和3′端旁侧序列802 bp。根据这两个旁侧序列设计引物建立的PCR检测方法,能够特异性地将E8A7027大豆转化体与其他转基因作物和非转基因大豆区分开,方法的检测灵敏度为0.05%。研究结果可为E8A7027转化体的安全评价和监管检测提供技术支撑。 展开更多
关键词 转基因大豆 高通量测序 旁侧序列 微滴式数字PCR 转化体特异性检测
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基于PASS技术的EGFR基因突变比例检测方法的建立与评价
19
作者 邓桢 曾璐璐 +3 位作者 呙阳 叶玉涛 李俊明 江梅 《实验与检验医学》 2023年第5期533-539,共7页
目的近期临床研究发现EGFR-TKI并非对所有EGFR基因激活突变的NSCLC患者都有效,提示EGFR-TKI的治疗效果也可能与NSCLC患者中EGFR基因突变比例相关。本研究基于平行等位基因特异性测序(Parallel Allele-Specific Sequencing,PASS)方法,建... 目的近期临床研究发现EGFR-TKI并非对所有EGFR基因激活突变的NSCLC患者都有效,提示EGFR-TKI的治疗效果也可能与NSCLC患者中EGFR基因突变比例相关。本研究基于平行等位基因特异性测序(Parallel Allele-Specific Sequencing,PASS)方法,建立一个稳定可靠的EGFR突变基因比例检测平台。方法构建野生型和突变型EGFR基因重组质粒,建立EGFR基因突变比例检测的PASS平台,从灵敏度、精密度以及准确度对PASS检测平台进行性能评价。结果建立的PASS平台可用于EGFR基因点突变和缺失突变的检测,能够检测到的最小基因拷贝数为1,能够稳定检测到的最小基因拷贝数为10,在野生型基因中最低能检测出0.01%的突变基因。线性回归分析显示,检测到的突变型/野生型比例与预期的突变型/野生型比例呈良好的线性相关(R_(2)=0.9962)。结论该方法的建立能够对EGFR基因突变比例进行灵敏、准确测定,这对其在临床中的应用奠定了良好的技术基础,对于评价EGFR基因突变比例与EGFR-TKI靶向治疗NSCLC患者疗效的关系也具有重要意义。 展开更多
关键词 平行等位基因特异性测序 表皮生长因子受体 基因突变比例
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基于微生物指标评价冷冻熟制小龙虾食用安全风险 被引量:1
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作者 公方朔 陈一丹 +3 位作者 杨方 姜启兴 许艳顺 夏文水 《食品科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2023年第13期60-66,共7页
小龙虾营养美味,但其食用安全性一直困扰消费者,为了探究冷冻熟制小龙虾食用安全风险,本研究首先根据小龙虾样品的总挥发性盐基氮(total volatile basic nitrogen,TVB-N)值和pH值确定食用终点,然后通过高通量测序法分析食用终点小龙虾... 小龙虾营养美味,但其食用安全性一直困扰消费者,为了探究冷冻熟制小龙虾食用安全风险,本研究首先根据小龙虾样品的总挥发性盐基氮(total volatile basic nitrogen,TVB-N)值和pH值确定食用终点,然后通过高通量测序法分析食用终点小龙虾内脏与鳃、虾肉、虾壳和调味汤料4个部分的微生物菌群结构和群落多样性。结果显示:熟制小龙虾冷冻贮藏过程中,内脏与鳃和虾肉pH值呈缓慢下降趋势,调味汤料和虾壳pH值先上升后下降;各部分TVB-N值均呈上升趋势,贮藏至180 d时虾肉、内脏与鳃的TVB-N值分别为32.42 mg/100 g和31.26 mg/100 g,到达食用终点。高通量测序结果显示,食用终点的熟制小龙虾各部分细菌群落结构存在差异,不同部分菌群丰度由高至低依次为调味汤料、内脏与鳃、虾壳和虾肉,且各部分优势菌属组成不同,其中调味汤料中乳酸杆菌属(Lactobacillus)为优势菌;内脏与鳃中以嗜冷杆菌属(Psychrobacter)和弧菌属(Vibrio)为主;虾壳中优势菌属为弧菌属、乳酸杆菌属和嗜冷杆菌属;虾肉中优势菌属为嗜冷杆菌属和不动杆菌属(Acinetobacter)。综上所述,冷冻熟制小龙虾产品中调味汤料和内脏与鳃食用安全风险相对较高,在小龙虾加工中可通过复合清洗、调整调味汤料酸度以及使用抑菌剂来降低食用安全风险。 展开更多
关键词 冷冻熟制小龙虾 食用安全风险 高通量测序 微生物多样性 优势腐败菌
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