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福建茶树潜隐病毒1的检测及全基因组序列特征
被引量:
1
1
作者
许瑜婷
丁莹
+4 位作者
沈建国
陈细红
章淑玲
杜振国
高芳銮
《植物病理学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第3期386-394,共9页
为明确福建茶树潜隐病毒(camellia cryptic virus 1,CCV1)发生情况,探明其全基因组序列特征及其与油茶潜隐病毒1(camellia oleifera cryptic virus 1,CoCV1)的关系,本研究通过RT-PCR方法对采自福建7个茶树种植区疑似感染CCV1的叶片进行...
为明确福建茶树潜隐病毒(camellia cryptic virus 1,CCV1)发生情况,探明其全基因组序列特征及其与油茶潜隐病毒1(camellia oleifera cryptic virus 1,CoCV1)的关系,本研究通过RT-PCR方法对采自福建7个茶树种植区疑似感染CCV1的叶片进行检测,并随机选取18个CCV1分离物,经扩增、克隆获得全基因组序列,对其序列特征和系统发育关系进行分析。结果显示,431份样品中共有94份样品检测出CCV1,检出率为21.81%。测定获得的18个CCV1分离物dsRNA1、dsRNA2和dsRNA3的核苷酸序列全长分别为1722-1725 bp、1504-1506 bp和1497-1499 bp。克隆获得的RdRp、CP和mCP的氨基酸序列与CCV1代表分离物Won(GenBank登录号MH898482-MH898484)和CoCV1代表分离物PXCS5(GenBank登录号MH814756-MH814758)的一致性值分别≥91%、≥84%和≥90%,超过了δ-分体病毒属(Deltapartitivirus)中种的界定标准阈值。进一步的系统发育分析结果显示,所有CCV1分离物与CoCV1分离物以高置信值相聚成簇,证实CCV1和CoCV1为Deltapartitivirus属的同一种病毒。
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关键词
茶树潜隐
病毒
1
油茶潜隐
病毒
1
δ-分体病毒属
系统发育分析
分子特征
原文传递
题名
福建茶树潜隐病毒1的检测及全基因组序列特征
被引量:
1
1
作者
许瑜婷
丁莹
沈建国
陈细红
章淑玲
杜振国
高芳銮
机构
福建农林大学植物病毒研究所
福建省检验检疫技术研究重点实验室
福建农业职业技术学院园艺园林学院
出处
《植物病理学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第3期386-394,共9页
基金
福建省农业引导性(重点)项目(2020N0024)
福建省检验检疫技术研究重点实验室开放课题(FJKF2019-03)
文摘
为明确福建茶树潜隐病毒(camellia cryptic virus 1,CCV1)发生情况,探明其全基因组序列特征及其与油茶潜隐病毒1(camellia oleifera cryptic virus 1,CoCV1)的关系,本研究通过RT-PCR方法对采自福建7个茶树种植区疑似感染CCV1的叶片进行检测,并随机选取18个CCV1分离物,经扩增、克隆获得全基因组序列,对其序列特征和系统发育关系进行分析。结果显示,431份样品中共有94份样品检测出CCV1,检出率为21.81%。测定获得的18个CCV1分离物dsRNA1、dsRNA2和dsRNA3的核苷酸序列全长分别为1722-1725 bp、1504-1506 bp和1497-1499 bp。克隆获得的RdRp、CP和mCP的氨基酸序列与CCV1代表分离物Won(GenBank登录号MH898482-MH898484)和CoCV1代表分离物PXCS5(GenBank登录号MH814756-MH814758)的一致性值分别≥91%、≥84%和≥90%,超过了δ-分体病毒属(Deltapartitivirus)中种的界定标准阈值。进一步的系统发育分析结果显示,所有CCV1分离物与CoCV1分离物以高置信值相聚成簇,证实CCV1和CoCV1为Deltapartitivirus属的同一种病毒。
关键词
茶树潜隐
病毒
1
油茶潜隐
病毒
1
δ-分体病毒属
系统发育分析
分子特征
Keywords
camellia cryptic virus 1
camellia oleifera cryptic virus 1
Deltapartitivirus
phylogenetic analysis
molecular characterization
分类号
S432.41 [农业科学—植物病理学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
福建茶树潜隐病毒1的检测及全基因组序列特征
许瑜婷
丁莹
沈建国
陈细红
章淑玲
杜振国
高芳銮
《植物病理学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023
1
原文传递
已选择
0
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引用分析
参考文献
引证文献
统计分析
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