青风藤内生链霉菌SZC001生物合成潜力分析及抗肿瘤天然产物η-rhodomycinone的鉴定

【目的】探究青风藤内生链霉菌SZC001的次级代谢产物生物合成潜力,挖掘未知的活性天然产物。【方法】表面消毒法分离SZC001并利用三代联合二代测序获得完整基因组,结合antiSMASH分析评估其天然产物合成潜力;使用4种培养基发酵初筛代谢谱,通过硅胶柱层析、高效液相制备、高分辨质谱以及核磁共振仪等对化合物进行分离鉴定;利用CCK-8法进行目标化合物的细胞毒性测定。【结果】鉴定研究菌株为链霉菌SZC001,基因组总长度9109166 bp,G+C含量71.08%;antiSMASH显示该菌株共含有31个潜在的生物合成基因簇,有17个基因簇与已知基因簇的相似度小于40%;在4种培养基中可产生多个蒽环类天然产物,经分离鉴定得到含量最高的2个化合物1和2。化合物1为已知化合物ε-rhodomycinone;化合物2为一个新化合物η-rhodomycinone,相对已知化合物α2-rhodomycinone其在C-10位羟基衍生化并且骨架6位羟基变为11位。化合物1与2对2种肿瘤细胞系均有较好的抑制活性,半抑制浓度(halfmaximal inhibitory concentration,IC50)为1.55-4.59μmol/L。【结论】SZC001是一株有挖掘活性天然产物潜力的菌株,从中获得的蒽醌类天然产物具有较好的抗肿瘤活性,后续值得进一步开发和利用。本研究增加了ε-rhodomycinone衍生物的种类,为青风藤内生菌资源的后续开发提供了基础。