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中国荷斯坦奶牛κ-酪蛋白基因第四外显子多态性与产奶性状的关联分析 被引量:15
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作者 鞠志花 李秋玲 +5 位作者 王洪梅 李建斌 安利国 杨桂文 仲跻峰 王长法 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2008年第10期1312-1318,共7页
以544头中国荷斯坦奶牛为研究对象,以κ-酪蛋白基因为产奶性状的候选基因,扩增779bp的片段,结合测序结果采用PCR-RFLP方法来检测κ-酪蛋白基因3个位点的多态性。结果在exon4的第10891bp、10927bp和10988bp处分别发生了T/C、C/A错义突变... 以544头中国荷斯坦奶牛为研究对象,以κ-酪蛋白基因为产奶性状的候选基因,扩增779bp的片段,结合测序结果采用PCR-RFLP方法来检测κ-酪蛋白基因3个位点的多态性。结果在exon4的第10891bp、10927bp和10988bp处分别发生了T/C、C/A错义突变和G/A同义突变,据此分别选择了TaqⅠ、HindⅢ、PstⅠ等3种限制性内切酶检测了其多态性。发现3个位点的A、B等位基因在群体中都有分布,且处于低度多态;A和B等位基因的频率分别为86.03%和13.97%;AA,AB和BB基因型频率分别为73.71%,24.63%和1.66%;χ2适合性检验表明,该群体在这3个位点的突变达到Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05);BB和AB基因型个体乳脂率显著高于AA基因型个体(P<0.05),AB基因型个体脂蛋白比显著高于AA基因型个体(P<0.05),但不同基因型对产奶量和乳蛋白率没有显著影响;3个位点的酶切多态性在所研究群体中是紧密连锁的。说明在中国荷斯坦奶牛群体中,κ-酪蛋白B等位基因可作为改良奶牛乳脂率性状的分子遗传标记。 展开更多
关键词 荷斯坦奶牛 κ-酪蛋白基因 多态性 PCR-RFLP 产奶性状
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精氨酸水平对奶牛乳腺上皮细胞体外生长及κ-酪蛋白基因表达的影响 被引量:13
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作者 徐柏林 王梦芝 +4 位作者 张兴夫 哈斯 王春艳 敖长金 王洪荣 《动物营养学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第5期852-858,共7页
本试验旨在研究培养基中添加不同浓度的精氨酸(Arg)对乳腺上皮细胞体外增殖及κ-酪蛋白(CSN3)基因表达的影响。选用中国荷斯坦奶牛乳腺上皮细胞进行体外培养,以无Arg的培养基(0.00 mg/L)为对照(0组),试验培养基分别添加69.50(0.25组)、1... 本试验旨在研究培养基中添加不同浓度的精氨酸(Arg)对乳腺上皮细胞体外增殖及κ-酪蛋白(CSN3)基因表达的影响。选用中国荷斯坦奶牛乳腺上皮细胞进行体外培养,以无Arg的培养基(0.00 mg/L)为对照(0组),试验培养基分别添加69.50(0.25组)、139.00(0.50组)、278.00(1.00组)、556.00(2.00组)、1 112.00(4.00组)和2 224.00 mg/L(8.00组)的精氨酸。结果表明:Arg能促进乳腺上皮细胞的增殖,24 h时,0.25~4.00组与0组相比均差异显著(P<0.05),8.00组与0组相比差异不显著(P>0.05);48和72 h时,各试验组与0组相比均差异显著(P<0.05)。Arg能促进CSN3基因的表达,各试验组与0组相比均差异显著(P<0.05),当Arg浓度为556.00 mg/L时,CSN3基因表达量最高。结果提示,Arg对乳腺上皮细胞增殖及CSN3基因表达均具有明显的促进作用,且在Arg浓度为69.50~1 112.00 mg/L时促细胞增殖效果较佳,在Arg浓度为556.00 mg/L时促CSN3基因表达作用最强。 展开更多
关键词 乳腺上皮细胞 精氨酸 细胞增殖 κ-酪蛋白基因 基因表达
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中国荷斯坦牛κ-酪蛋白基因第4和第5外显子多态性与泌乳性状的关联分析 被引量:7
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作者 鞠志花 王洪梅 +6 位作者 李秋玲 黄金明 李建斌 安利国 杨桂文 仲跻峰 王长法 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2009年第9期3279-3287,共9页
【目的】研究中国荷斯坦牛κ-酪蛋白基因第4和第5外显子多态性与泌乳性状的关联性,为培育高乳蛋白及高乳脂率奶牛提供参考依据。【方法】采用DNA测序、PCR-RFLP和CRS-PCR技术,对544头中国荷斯坦牛κ-酪蛋白基因的外显子4和5序列进行研究... 【目的】研究中国荷斯坦牛κ-酪蛋白基因第4和第5外显子多态性与泌乳性状的关联性,为培育高乳蛋白及高乳脂率奶牛提供参考依据。【方法】采用DNA测序、PCR-RFLP和CRS-PCR技术,对544头中国荷斯坦牛κ-酪蛋白基因的外显子4和5序列进行研究,通过SHEsis软件和PHASE软件进行配对连锁不平衡分析和单倍型分析。【结果】发现6个新的SNPs,包括外显子5上A12907G、G12950A、C12989T、A13028G、T12980C共5个SNP位点,证实前4个位点紧密连锁;外显子4上A10996T共1个SNP位点。单位点基因型与泌乳性状关联分析表明,A10996T突变位点的TT和AT基因型个体乳脂率显著高于AA基因型个体(P<0.05);T12980C突变位点的TC和CC基因型个体乳脂率、乳蛋白率分别极显著(P<0.01)、显著(P<0.05)高于TT基因型个体;紧密连锁的4个突变位点的DE基因型个体乳脂率极显著高于DD基因型个体(P<0.01)。与泌乳性状的关联分析表明,共构建出7种单倍型,发现16种单倍型组合;其中H6H6单倍型组合个体乳脂率最高,H1H4次之;H1H4单倍型组合个体乳蛋白率最高;H5H6单倍型组合个体乳蛋白率及乳脂率最低。【结论】H1H4单倍型组合在乳蛋白率和乳脂率方面为有利单倍型组合,可作为选择高乳蛋白高乳脂率牛群的分子标记。 展开更多
关键词 中国荷斯坦牛 κ-酪蛋白基因 多态性 泌乳性状 单倍型
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天祝白牦牛α_(S1)-酪蛋白基因和κ-酪蛋白基因的PCR-RFLP研究 被引量:5
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作者 白文林 郑玉才 +2 位作者 尹荣焕 罗光彬 朱建勇 《湖北农业科学》 北大核心 2005年第3期15-17,共3页
利用PCR—RFLP技术熏检测了天祝白牦牛αS1-酪蛋白(αS1-casein,αS1-CN)基因和κ-酪蛋白(κ-casein,κ-CN)基因部分序列的遗传多态性熏结果表明:天祝白牦牛群体αS1-CN基因表现单态,κ-CN基因存在遗传多态性。κ-CN基因PCR-RFLP位点等... 利用PCR—RFLP技术熏检测了天祝白牦牛αS1-酪蛋白(αS1-casein,αS1-CN)基因和κ-酪蛋白(κ-casein,κ-CN)基因部分序列的遗传多态性熏结果表明:天祝白牦牛群体αS1-CN基因表现单态,κ-CN基因存在遗传多态性。κ-CN基因PCR-RFLP位点等位基因A和B的基因频率分别为0.0745和0.9255。κ-CN基因PCR-RFLP位点的基因型分布符合Hardy-Weinberg平衡定理(P>0.05)。天祝白牦牛群体内平均基因一致度、基因多样度和有效等位基因数分别为0.9311、0.0689和1.0739。 展开更多
关键词 天祝白牦牛 αS1-广酪蛋白基因 κ-酪蛋白基因 PCR—RFLP
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水牛κ-酪蛋白基因(CSN3)外显子4序列多态性研究 被引量:3
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作者 祁宏 刘丽仙 +3 位作者 袁峰 李大林 袁跃云 苗永旺 《家畜生态学报》 北大核心 2012年第2期13-19,共7页
分别设计位于CSN3 5个外显子旁侧引物,采用DNA测序法对沼泽型和河流型水牛CSN3编码区结构进行了分析,并对10个水牛群体共106个样本CSN3第4外显子序列进行了变异检测。结果表明,两类水牛CSN3编码区由848个核苷酸组成,包括ORF序列573bp、5... 分别设计位于CSN3 5个外显子旁侧引物,采用DNA测序法对沼泽型和河流型水牛CSN3编码区结构进行了分析,并对10个水牛群体共106个样本CSN3第4外显子序列进行了变异检测。结果表明,两类水牛CSN3编码区由848个核苷酸组成,包括ORF序列573bp、5′-UTR序列69bp和3′-UTR序列206bp。在水牛CSN3第4外显子中共检测到4个SNP,其中c.445G>A,c.467C>T和c.516A>C为异义替换,导致相应的κ-CN成熟肽中氨基酸发生p.Val128Ile、p.Thr135Ile和p.Glu151Asp改变,c.467C>T和c.516A>C替换可能对κ-CN功能产生了影响。群体遗传分析表明,在河流型水牛中,等位基因c.445G、c.467C、c.471C和c.516A均为优势等位基因,而在沼泽型水牛中,仅c.445G、c.467C和c.471C为优势等位基因,河流型和沼泽型水牛的遗传差异主要体现在SNP516位点的群体遗传组成上。 展开更多
关键词 河流型水牛 沼泽型水牛 κ-酪蛋白基因 多态性 凝乳过程
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草原红牛κ-酪蛋白基因的多态性及与泌乳性状关联性分析 被引量:1
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作者 申瑞雪 郭将 +7 位作者 马倩 赵衍铜 李传民 邱峥艳 高妍 张国梁 赵志辉 张永宏 《东北农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第6期55-59,共5页
为研究草原红牛κ-酪蛋白基因的多态性及与泌乳性状相关性,采用PCR-RFLP方法检测κ-酪蛋白基因外显子5的遗传多态性。结果检测到TT、TC和CC三种基因型,统计分析表明,此多态位点与草原红牛乳蛋白和乳糖呈显著相关,乳蛋白:CC基因型极显著... 为研究草原红牛κ-酪蛋白基因的多态性及与泌乳性状相关性,采用PCR-RFLP方法检测κ-酪蛋白基因外显子5的遗传多态性。结果检测到TT、TC和CC三种基因型,统计分析表明,此多态位点与草原红牛乳蛋白和乳糖呈显著相关,乳蛋白:CC基因型极显著高于CT基因型和TT基因型(P<0.01),而CT基因型也极显著高于TT基因型(P<0.01)。乳糖:TT基因型和TC基因型极显著高于CC基因型(P<0.01),而TT和TC基因型之间差异不显著(P>0.01)。其他泌乳性状的基因型间差异不显著(P>0.01)。结果表明,κ-CN基因对草原红牛乳蛋白和乳糖具有较大的遗传效应,可初步推断κ-CN是控制这一性状的众多基因之一,是影响草原红牛乳蛋白和乳糖的一个主效基因或与主效基因相连锁,可作为选育草原红牛高乳蛋白及低乳糖奶牛的分子标记,用于标记辅助选择意义重大。 展开更多
关键词 草原红牛 κ-酪蛋白基因 PCR-RFLP 泌乳性状
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GLGI技术鉴定奶山羊乳腺中的κ-酪蛋白基因 被引量:2
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作者 孙瑞秋 赵婧 +2 位作者 闫宏博 李庆章 高学军 《中国乳品工业》 CAS 北大核心 2010年第12期4-7,共4页
采用GLGI技术扩增本实验室构建的Long-SAGE标签库中的κ-酪蛋白基因。使用SMARTTM RACE cDNA Ampliication Kit通过RT-PCR把奶山羊乳腺组织中的mRNA逆转录成cDNA,分别用3’RACE和5’RACE扩增κ-酪蛋白基因的3’端和5’端。扩增产物经TA... 采用GLGI技术扩增本实验室构建的Long-SAGE标签库中的κ-酪蛋白基因。使用SMARTTM RACE cDNA Ampliication Kit通过RT-PCR把奶山羊乳腺组织中的mRNA逆转录成cDNA,分别用3’RACE和5’RACE扩增κ-酪蛋白基因的3’端和5’端。扩增产物经TA克隆后转化大肠杆菌,随机挑取阳性克隆后进行测序分析。通过序列比对、拼接,获得全长的κ-酪蛋白基因。应用GLGI技术成功获得了完整的奶山羊乳腺CSN3序列,为CSN3结构分析和功能研究奠定了重要基础。 展开更多
关键词 GLGI RACE κ-酪蛋白基因
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中国荷斯坦牛κ-酪蛋白基因外显子1的多态性研究 被引量:1
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作者 郧亚宁 王晓薇 顾亚玲 《中国奶牛》 2012年第17期27-28,共2页
本试验以64头中国荷斯坦牛为研究对象,采用PCR-SSCP方法对κ-酪蛋白基因外显子1的多态性进行研究,结果显示外显子1在群体中存在多态性,此结果为荷斯坦牛标记辅助选择提供了理论依据。
关键词 荷斯坦牛 κ-酪蛋白基因 外显子1 PCR-SSCP
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荷斯坦牛κ-酪蛋白基因5′和3′侧翼序列多态性研究 被引量:1
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作者 黄亮 尚海彬 +3 位作者 魏蕊 宁素恒 杜文斌 张娟 《中国奶牛》 2014年第10期25-28,共4页
本试验采用PCR-SSCP技术检测了宁夏荷斯坦牛κ-酪蛋白(κ-casein protein,κ-CN)基因5′和3′侧翼区的遗传多态性。结果表明:κ-CN基因5′和3′侧翼区均存在遗传多态性,5′侧翼区有3种基因型(AA、BB和AB),等位基因频率分别为0.5345、0.4... 本试验采用PCR-SSCP技术检测了宁夏荷斯坦牛κ-酪蛋白(κ-casein protein,κ-CN)基因5′和3′侧翼区的遗传多态性。结果表明:κ-CN基因5′和3′侧翼区均存在遗传多态性,5′侧翼区有3种基因型(AA、BB和AB),等位基因频率分别为0.5345、0.4655;3′侧翼区有2种基因型(GG和GT),等位基因频率分别为0.8621、0.1379。κ-CN基因5′侧翼区基因型不符合Hardy-Weinberg平衡(P<0.01),3′侧翼区基因型分布符合Hardy-Weinberg平衡(P>0.05)。5′和3′侧翼区的多态信息含量分别为0.3738、0.2095,分别表现为中度多态和低度多态;其杂合度、有效等位基因数分别为0.5019、0.2399和1.9905、1.3120。研究认为κ-CN基因5′侧翼区更适用于分析多态性与生产性能的关系,以及用于数量遗传座位的定位研究。 展开更多
关键词 荷斯坦牛 κ-酪蛋白(κ-CN)基因 PCR-SSCP
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天祝白牦牛三个功能基因部分序列的PCR-RFLP研究 被引量:4
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作者 白文林 郑玉才 +3 位作者 尹荣焕 朱建勇 颜卉 罗光彬 《江苏农业科学》 CSCD 北大核心 2005年第4期84-86,共3页
采用PCR-RFLP技术,检测了天祝白牦牛αS1-酪蛋白(αS1-casein,αS1-CN)基因、κ-酪蛋白(κ-casein,κ-CN)基因和生长激素(growthhormone,GH)基因部分序列的遗传多态性。结果表明,天祝白牦牛群体中αS1-CN基因PCR-RFLP位点呈单态;κ-CN... 采用PCR-RFLP技术,检测了天祝白牦牛αS1-酪蛋白(αS1-casein,αS1-CN)基因、κ-酪蛋白(κ-casein,κ-CN)基因和生长激素(growthhormone,GH)基因部分序列的遗传多态性。结果表明,天祝白牦牛群体中αS1-CN基因PCR-RFLP位点呈单态;κ-CN基因和GH基因两个PCR-RFLP位点均呈多态性。κ-CN基因PCR-RFLP位点等位基因A和B的基因频率分别为0.0745和0.9255,GH基因PCR-RFLP位点等位基因A和B的基因频率分别为0.1277和0.8723;该3个位点平均基因一致度和基因多样度分别为0.8798和0.1202。 展开更多
关键词 天祝白牦牛 αS1-酪蛋白基因 κ-酪蛋白基因 生长激素基因 多态性
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大通牦牛三个功能基因部分序列的PCR-RFLP研究 被引量:2
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作者 白文林 郑玉才 +3 位作者 尹荣焕 窦全林 颜卉 罗光彬 《黑龙江畜牧兽医》 CAS 北大核心 2006年第4期13-15,共3页
采用PCR-RFLP技术,检测了大通牦牛α_(S1)-酪蛋白(α_(S1)-casein,α_(S1)-CN)基因、κ酪蛋白(κ-casein,κ-CN)基因和生长激素(growth hormone,GH)基因部分序列的遗传多态性。结果表明大通牦牛群体中α_(S1)-CN基因PCR-RFLP位点呈单态;... 采用PCR-RFLP技术,检测了大通牦牛α_(S1)-酪蛋白(α_(S1)-casein,α_(S1)-CN)基因、κ酪蛋白(κ-casein,κ-CN)基因和生长激素(growth hormone,GH)基因部分序列的遗传多态性。结果表明大通牦牛群体中α_(S1)-CN基因PCR-RFLP位点呈单态;κ-CN基因和GH基因2个PCR-RFLP位点均呈多态性。κ-CN基因PCR-RFLP位点等位基因A和B的基因频率分别为0.1117和0.8883;GH基因PCR-RFLP位点等位基因A和B的基因频率分别为0.1755和0.8255。适合性卡方检验结果表明,大通牦牛GH基因和κ-CN基因PCR-RFLP位点的基因型分布均极显著偏离Hardy-Weinberg平衡定理(P<0.01);该3个位点平均基因一致度和基因多样度分别为0.8374和0.1626。 展开更多
关键词 大通牦牛 αS1-酪蛋白基因 κ-酪蛋白基因 生长激素基因 多态性
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水牛κ-酪蛋白外显子4基因的克隆及序列分析
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作者 覃广胜 杨炳壮 +4 位作者 黄加祥 张秀芳 陈明棠 梁贤威 蒋和生 《畜牧与兽医》 北大核心 2010年第9期34-36,共3页
本研究根据普通牛的κ-酪蛋白基因设计一对引物,首次成功扩增出了水牛的κ-酪蛋白外显子4基因,并经序列分析,结果表明κ-酪蛋白外显子4基因片段长780 bp。利用GenBank上的Blast进行比较,中国水牛κ-酪蛋白外显子4序列与地中海水牛、牛... 本研究根据普通牛的κ-酪蛋白基因设计一对引物,首次成功扩增出了水牛的κ-酪蛋白外显子4基因,并经序列分析,结果表明κ-酪蛋白外显子4基因片段长780 bp。利用GenBank上的Blast进行比较,中国水牛κ-酪蛋白外显子4序列与地中海水牛、牛、牦牛的κ-酪蛋白外显子4序列同源性分别为99.5%、96.4%、95.9%;氨基酸同源性比较,中国水牛、地中海水牛、牛、牦牛均编码260个氨基酸,中国水牛与地中海水牛、牛、牦牛同源性分别为98.9%、92.0%和91.2%。核苷酸和氨基酸序列同源性结果显示,中国水牛和地中海水牛κ-酪蛋白基因变异不大。但由于在碱基230 bp处发生了一个碱基(A→C)的变化,从而导致其氨基酸也发生了变化,即K(Lys赖氨酸)→R(Arg精氨酸)。本研究为进一步对该基因的功能奠定基础。 展开更多
关键词 κ-酪蛋白基因 克隆 序列分析 水牛
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Genetic Polymorphism of Kappa Casein (K-CN)in Iraqi Buffalo Using Polymerase Chain Reaction-Restriction Fragment Length Polymorphism
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作者 Talib Ahmed Jaayid Muntaha Yakoub Yousief Bashar Falih Zaqeer Jaafer Mohammed Owaid 《Journal of Agricultural Science and Technology(A)》 2013年第10期835-841,共7页
This study was carried out the animal production department, genetic engineering lab, college of agriculture, (UoB), Iraq. The aim of this study was to use the polymerase chain reaction restriction fragment length p... This study was carried out the animal production department, genetic engineering lab, college of agriculture, (UoB), Iraq. The aim of this study was to use the polymerase chain reaction restriction fragment length polymorphism (PCR-RFLP) as a fast, efficient and low cost method to detect the genetic variants of kappa-casein gene (k-CN) in Iraqi buffalo using three different primers specific for bovine k-CN to amplify the gene segment, followed by digestion using restriction enzyme (Hind III) for genotyping. DNA from 50 Iraqi buffaloes was extracted by phenol chloroform method. PCR was carried out in a final reaction volume of 25 μL and the reaction mixture was subjected to standard PCR protocol. The results of this work show that among the examined 50 Iraqi Buffalo were homozygous for the K-CN and genotyped as BB for all three primers but gave different bands. Thus PCR-RFLP using Hind III revealed all the samples to be monomorphic for this locus. The restriction digestion analysis of 397 bp PCR product of k-CN indicates the presence of two fragments of 154 bp and 225 bp for BB-genotype. A 437 bp fragment of the bovine genomic K-CN gene was amplified. One Hind III restriction site is found in position 346 of the amplified fragment of allele k-CN B, yielded 91 bp and 346 bp. Amplified products from Iraqi buffalo (530), after being digested with Hind III, yielded two separate DNA fragments of different sizes i.e., 160 bp and 370 bp. For the first time completed research such specifications in Iraq, for the first time using molecular biology in genetic identification. Our objectives of this study have been to aid in understanding domestication, Buffalo origin and their history and evolution, to identify genetically unique breeds, to provide an objective basis for conservation decisions and to aid the formulation of breeding plans. 展开更多
关键词 POLYMORPHISM kappa casein gene Iraqi buffalo Hind III PCR-RFLP.
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