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接头蛋白复合体AP2B1基因的克隆与分析
被引量:
1
1
作者
柴佳
苗燕
蔡霞
《基因组学与应用生物学》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第9期3909-3918,共10页
泽漆(Euphorbia helioscopia L.)为大戟科(Euphorbiaceae)大戟属(Euphorbia)一年生或两年生草本植物,整棵植株含乳汁。作为一种古老的民间草药,泽漆的主要药用成分存在于乳汁中。因此,研究乳汁管的发育可为泽漆乳汁中药用成分的...
泽漆(Euphorbia helioscopia L.)为大戟科(Euphorbiaceae)大戟属(Euphorbia)一年生或两年生草本植物,整棵植株含乳汁。作为一种古老的民间草药,泽漆的主要药用成分存在于乳汁中。因此,研究乳汁管的发育可为泽漆乳汁中药用成分的合成、积累和转运提供理论依据。AP-2B1是接头蛋白复合体2(AP-2)的beta-型亚基。我们通过前期的研究发现,AP-2B1可能在泽漆乳汁管发育过程溶酶体酶的分拣和转运中有重要的作用。为此,我们采用RACE技术从泽漆中分离克隆出AP-2B1基因,序列全长3 176 bp,命名为Eh AP-2B1(登录号:KP995937)。再利用NCBI网站及生物信息学软件对其进行分析,Eh AP-2B1基因编码903个氨基酸,蛋白相对分子量为100.37 k D,等电点为5.10。Eh AP-2B1基因编码的蛋白属于亲水性蛋白,具有3个保守区域。通过氨基酸序列比对,Eh AP-2B1蛋白与麻风树(Jatropha carcas)的AP-2B1蛋白相似度达到100%,与可可树(Theobroma cacao)、甜橙(Citrus sinensis)的相似度达到99%。根据系统进化树的分析结果表明,泽漆AP-2B1蛋白与蓖麻(Ricinus communis)AP-2B1蛋白的亲缘关系最近,与麻风树的AP-2B1蛋白平行进化。通过对该蛋白二级结构预测分析显示,多肽链中α-螺旋(α-helix)最多,占45.63%,其次为无规则卷曲(random coil),占31.56%,最后为延伸链(extended strand)和β-转角(β-turn),分别占17.17%和5.65%。此研究结果为后期进行乳汁管发育与调控的研究提供理论依据。
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关键词
泽漆
AP
-
2复合物亚基β
-
1
基因克隆
信息学分析
原文传递
题名
接头蛋白复合体AP2B1基因的克隆与分析
被引量:
1
1
作者
柴佳
苗燕
蔡霞
机构
西北大学生命科学学院
出处
《基因组学与应用生物学》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第9期3909-3918,共10页
基金
国家自然科学基金项目(31270220)资助
文摘
泽漆(Euphorbia helioscopia L.)为大戟科(Euphorbiaceae)大戟属(Euphorbia)一年生或两年生草本植物,整棵植株含乳汁。作为一种古老的民间草药,泽漆的主要药用成分存在于乳汁中。因此,研究乳汁管的发育可为泽漆乳汁中药用成分的合成、积累和转运提供理论依据。AP-2B1是接头蛋白复合体2(AP-2)的beta-型亚基。我们通过前期的研究发现,AP-2B1可能在泽漆乳汁管发育过程溶酶体酶的分拣和转运中有重要的作用。为此,我们采用RACE技术从泽漆中分离克隆出AP-2B1基因,序列全长3 176 bp,命名为Eh AP-2B1(登录号:KP995937)。再利用NCBI网站及生物信息学软件对其进行分析,Eh AP-2B1基因编码903个氨基酸,蛋白相对分子量为100.37 k D,等电点为5.10。Eh AP-2B1基因编码的蛋白属于亲水性蛋白,具有3个保守区域。通过氨基酸序列比对,Eh AP-2B1蛋白与麻风树(Jatropha carcas)的AP-2B1蛋白相似度达到100%,与可可树(Theobroma cacao)、甜橙(Citrus sinensis)的相似度达到99%。根据系统进化树的分析结果表明,泽漆AP-2B1蛋白与蓖麻(Ricinus communis)AP-2B1蛋白的亲缘关系最近,与麻风树的AP-2B1蛋白平行进化。通过对该蛋白二级结构预测分析显示,多肽链中α-螺旋(α-helix)最多,占45.63%,其次为无规则卷曲(random coil),占31.56%,最后为延伸链(extended strand)和β-转角(β-turn),分别占17.17%和5.65%。此研究结果为后期进行乳汁管发育与调控的研究提供理论依据。
关键词
泽漆
AP
-
2复合物亚基β
-
1
基因克隆
信息学分析
Keywords
Euphorbia helioscopio L.
AP
-
2
complex
subunit
Beta
-
1
Gene clone. Bio
-
informatics analyses
分类号
S567.2 [农业科学—中草药栽培]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
接头蛋白复合体AP2B1基因的克隆与分析
柴佳
苗燕
蔡霞
《基因组学与应用生物学》
CAS
CSCD
北大核心
2018
1
原文传递
已选择
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参考文献
引证文献
统计分析
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