‘鄞红’葡萄HDR基因的克隆与生物信息学分析

4-羟基-3-甲基丁-2-烯基二磷酸还原酶(HDR)作为甲基赤藓醇磷酸(MEP)途径的关键酶,在植物萜类物质合成过程中起到极为重要的作用。为了了解HDR基因在植物体内发挥的特殊功能,以‘鄞红’葡萄为材料,利用RT-PCR等技术克隆了HDR基因全长,并对该基因进行生物信息学分析。结果显示,HDR基因全长为1143 bp,编码380个氨基酸。通过多种软件比对分析,‘鄞红’葡萄与柑橘(Citrus sinensis)、南瓜(Manihot esculenta)、猕猴桃(Actinidia deliciosa)、黄瓜(Cucumis sativus)的相似性高达80%以上,亲缘关系较近。该结果为进一步研究‘鄞红’葡萄HDR的功能以及揭示该基因在植物萜类物质合成过程中发挥的作用提供了一定基础。

‘鄞红’葡萄PP2C基因的克隆与生物信息学分析

PP2C是一类重要的蛋白磷酸酶,广泛参与各种逆境胁迫响应。为了了解PP2C基因在植物体内发挥的特殊功能,以‘鄞红’葡萄为材料,利用RT-PCR等技术克隆了全长,并对该基因进行生物信息学分析。结果显示,PP2C基因全长为1522 bp,其中开放阅读框(ORF)长度为1512 bp,编码506个氨基酸。通过多种软件比对分析,‘鄞红’葡萄与柑橘(Citrus sinensis)、樱桃李(Prunus avium)、草莓(Fragaria vesca)、黄瓜(Cucumis melo)的相似性高达95%以上,亲缘关系较近。该结果为进一步研究‘鄞红’葡萄PP2C蛋白功能以及揭示该蛋白在植物响应非生物胁迫过程中发挥的作用提供了一定基础。

‘鄞红’葡萄cyFPB基因克隆及其表达分析

胞质1,6-二磷酸果糖酶(cyFPB)是糖异生途径关键调控基因,对植物果实的糖含量积累与发育有重要的调控作用。为了了解cyFPB基因在葡萄果实发育过程中的功能,本研究以完熟期‘鄞红’葡萄果实为材料,利用RT-PCR等技术克隆了全长,并对该基因进行生物信息学分析。同时,以‘鄞红’葡萄不同成熟时期的果实为材料,利用RT-qPCR测定cyFPB的表达量。结果显示,cyPFB基因全长为1 158 bp,其中开放阅读框(ORF)度为1020bp,编码了339个氨基酸。通过序列比对分析显示‘,鄞红’cyFPB与霞多丽在遗传关系上极为接近,不同物种cyFPB的氨基酸序列相似度高达80%。RT-qPCR测定发现:在‘鄞红’葡萄果实发育时期,cyFPB的表达量显著上升,其中完熟期cyFPB的表达量最大。由此说明cyFPB基因对‘鄞红’葡萄果实发育有重要的调控作用。