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“兰箭3号”春箭筈豌豆叶绿体全基因组草图及特征分析
被引量:
16
1
作者
陶晓丽
马利超
+2 位作者
聂斌
王彦荣
刘志鹏
《草业科学》
CAS
CSCD
北大核心
2017年第2期321-330,共10页
箭筈豌豆(Vicia sativa)是自花授粉的二倍体一年生豆科牧草,可为我国高海拔地区的反刍动物提供优质蛋白粗饲料。以"兰箭3号"春箭筈豌豆为研究对象,采用DNase I法纯化叶绿体,利用第二代高通量测序平台Illumina Hiseq2000进行测...
箭筈豌豆(Vicia sativa)是自花授粉的二倍体一年生豆科牧草,可为我国高海拔地区的反刍动物提供优质蛋白粗饲料。以"兰箭3号"春箭筈豌豆为研究对象,采用DNase I法纯化叶绿体,利用第二代高通量测序平台Illumina Hiseq2000进行测序,并对"兰箭3号"叶绿体全基因组序列的结构特征进行分析。结果表明,"兰箭3号"叶绿体基因组仅包括一个单拷贝的反向重复序列,其叶绿体全基因组大小为121 883bp,共编码了109个基因,包括4个核糖体RNA(rRNA)基因,29个转运RNA(tRNA)基因,75个蛋白质编码基因和1个假基因。"兰箭3号"在叶绿体基因组结构、基因种类、排列顺序上与其它豆科植物基本一致。其叶绿体全基因组序列已在GenBank注册,序列号为KU053796。"兰箭3号"叶绿体全基因组测序的成功为叶绿体分子生物学研究奠定了基础,并可有效地促进箭筈豌豆遗传育种和分子进化研究。
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关键词
箭筈豌豆
“兰箭3号”
叶绿体
全基因组
密码子偏好性
进化分析
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职称材料
题名
“兰箭3号”春箭筈豌豆叶绿体全基因组草图及特征分析
被引量:
16
1
作者
陶晓丽
马利超
聂斌
王彦荣
刘志鹏
机构
草地农业生态系统国家重点实验室兰州大学草地农业科技学院
中国科学院青岛生物能源与过程研究所
出处
《草业科学》
CAS
CSCD
北大核心
2017年第2期321-330,共10页
基金
国家重点基础研究发展计划(973计划)--重要牧草
乡土草抗逆优质高产的生物学基础(2014CB138704)
中央高校基本科研业务费专项资金(lzujbky-2016-2)
文摘
箭筈豌豆(Vicia sativa)是自花授粉的二倍体一年生豆科牧草,可为我国高海拔地区的反刍动物提供优质蛋白粗饲料。以"兰箭3号"春箭筈豌豆为研究对象,采用DNase I法纯化叶绿体,利用第二代高通量测序平台Illumina Hiseq2000进行测序,并对"兰箭3号"叶绿体全基因组序列的结构特征进行分析。结果表明,"兰箭3号"叶绿体基因组仅包括一个单拷贝的反向重复序列,其叶绿体全基因组大小为121 883bp,共编码了109个基因,包括4个核糖体RNA(rRNA)基因,29个转运RNA(tRNA)基因,75个蛋白质编码基因和1个假基因。"兰箭3号"在叶绿体基因组结构、基因种类、排列顺序上与其它豆科植物基本一致。其叶绿体全基因组序列已在GenBank注册,序列号为KU053796。"兰箭3号"叶绿体全基因组测序的成功为叶绿体分子生物学研究奠定了基础,并可有效地促进箭筈豌豆遗传育种和分子进化研究。
关键词
箭筈豌豆
“兰箭3号”
叶绿体
全基因组
密码子偏好性
进化分析
Keywords
common vetch
V. sativa cv. Lanjian No.
3
chloroplast
whole gonome
codon usage bias
evolutionary analysis
分类号
S542.9 [农业科学—作物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
“兰箭3号”春箭筈豌豆叶绿体全基因组草图及特征分析
陶晓丽
马利超
聂斌
王彦荣
刘志鹏
《草业科学》
CAS
CSCD
北大核心
2017
16
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