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虾夷扇贝选育群体与野生群体基因组DNA甲基化的MSAP分析
被引量:
8
1
作者
吴彪
杨爱国
+5 位作者
董迎辉
郑利兵
刘志鸿
周丽青
孙秀俊
郑言鑫
《海洋与湖沼》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第4期976-982,共7页
基因组DNA甲基化作为表观遗传学研究的重要手段之一,在水产科学领域得到越来越广泛的应用。为从表观遗传学角度探讨虾夷扇贝选育群体-"玉贝"和普通虾夷扇贝群体的DNA甲基化差异,本文运用甲基化敏感扩增多态性(Methylation-sen...
基因组DNA甲基化作为表观遗传学研究的重要手段之一,在水产科学领域得到越来越广泛的应用。为从表观遗传学角度探讨虾夷扇贝选育群体-"玉贝"和普通虾夷扇贝群体的DNA甲基化差异,本文运用甲基化敏感扩增多态性(Methylation-sensitive amplification polymorphism,MSAP)技术分析了两群体的DNA序列中CCGG位点的甲基化情况。结果表明,筛选得到11对引物组合能够在两个群体中得到稳定扩增、清晰且多态性丰富的片段;11对引物在"玉贝"和对照群体中分别共检测到1432和1442个位点,其中发生甲基化的位点分别为306和341个,总甲基化率分别为21.5%和23.65%,"玉贝"总甲基化率下降2.15%;全甲基化位点分别为152和236个,全甲基化率为10.68%和16.37%,"玉贝"全甲基化率下降5.69%;半甲基化位点分别为154和105个,半甲基化率为10.82%和7.28%,"玉贝"半甲基化率上升3.54%;"玉贝"群体的甲基化多态性条带所占比例高于对照群体,分别为31%和29.167%,尤其是B类型条带链,"玉贝"群体明显高于对照群体。这说明,通过对虾夷扇贝生长和耐热性状的累代选育导致了DNA甲基化水平和模式的改变,本研究为进行虾夷扇贝抗逆基因的筛查提供了参考数据,丰富了表观遗传学在扇贝中的研究资料。
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关键词
虾夷扇贝
“玉贝”
DNA甲基化
甲基化敏感扩增多态性(MSAP)
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职称材料
题名
虾夷扇贝选育群体与野生群体基因组DNA甲基化的MSAP分析
被引量:
8
1
作者
吴彪
杨爱国
董迎辉
郑利兵
刘志鸿
周丽青
孙秀俊
郑言鑫
机构
农业部海洋渔业可持续发展重点实验室中国水产科学研究院黄海水产研究所
浙江省水产种质资源高效利用技术研究重点实验室浙江万里学院
上海海洋大学水产与生命学院
出处
《海洋与湖沼》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第4期976-982,共7页
基金
黄海水产研究所基本科研科业务费
20603022013012号
+3 种基金
浙江省水产种质资源高效利用技术研究重点实验室开放基金
KL2013-3号
山东省自主创新专项
2013CXC80202号
文摘
基因组DNA甲基化作为表观遗传学研究的重要手段之一,在水产科学领域得到越来越广泛的应用。为从表观遗传学角度探讨虾夷扇贝选育群体-"玉贝"和普通虾夷扇贝群体的DNA甲基化差异,本文运用甲基化敏感扩增多态性(Methylation-sensitive amplification polymorphism,MSAP)技术分析了两群体的DNA序列中CCGG位点的甲基化情况。结果表明,筛选得到11对引物组合能够在两个群体中得到稳定扩增、清晰且多态性丰富的片段;11对引物在"玉贝"和对照群体中分别共检测到1432和1442个位点,其中发生甲基化的位点分别为306和341个,总甲基化率分别为21.5%和23.65%,"玉贝"总甲基化率下降2.15%;全甲基化位点分别为152和236个,全甲基化率为10.68%和16.37%,"玉贝"全甲基化率下降5.69%;半甲基化位点分别为154和105个,半甲基化率为10.82%和7.28%,"玉贝"半甲基化率上升3.54%;"玉贝"群体的甲基化多态性条带所占比例高于对照群体,分别为31%和29.167%,尤其是B类型条带链,"玉贝"群体明显高于对照群体。这说明,通过对虾夷扇贝生长和耐热性状的累代选育导致了DNA甲基化水平和模式的改变,本研究为进行虾夷扇贝抗逆基因的筛查提供了参考数据,丰富了表观遗传学在扇贝中的研究资料。
关键词
虾夷扇贝
“玉贝”
DNA甲基化
甲基化敏感扩增多态性(MSAP)
Keywords
Patinopecten yessoensis
"Yubei"
DNA methylation
methylation-sensitive amplification polymorphism(MSAP)
分类号
Q75 [生物学—分子生物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
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1
虾夷扇贝选育群体与野生群体基因组DNA甲基化的MSAP分析
吴彪
杨爱国
董迎辉
郑利兵
刘志鸿
周丽青
孙秀俊
郑言鑫
《海洋与湖沼》
CAS
CSCD
北大核心
2015
8
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