目的:利用网络药理学的技术和方法探索“金银花-连翘”(简称“银翘”)药对对防治新型冠状病毒肺炎(coronavirus disease 2019,COVID-19)作用的活性成分及其作用机制。方法:通过中药系统药理学分析平台(traditional Chinese medicine sys...目的:利用网络药理学的技术和方法探索“金银花-连翘”(简称“银翘”)药对对防治新型冠状病毒肺炎(coronavirus disease 2019,COVID-19)作用的活性成分及其作用机制。方法:通过中药系统药理学分析平台(traditional Chinese medicine system pharmacology,TCMSP)根据口服生物利用度(oral bioavailability,OB)和类药性(drug-likeness,DL)检索中药“金银花”“连翘”中的化学成分和作用靶点,并在人类基因数据库(genecards:the human gene database)数据库中寻找“novel coronavirus pneumonia”的相关靶点,将“银翘”药对作用靶点与COVID-19相关靶点进行映射分析,筛选“银翘”药对防治COVID-19的活性成分和作用靶点。并用Cytoscape 3.7.2软件建立“中药活性成分-作用靶点-疾病”网络、通过STRING平台构建蛋白相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络、通过DAVID分析平台,对靶点基因GO富集分析和KEGG代谢通路进行分析,探究“银翘”药对防治COVID-19的作用机制。结果:从“金银花”中筛选化合物23个,“连翘”中化合物23个,二者有效作用靶点204个,通过Venn图获得与COVID-19有关的作用靶点44个,PPI网络发现IL-6、IL-1B、MAPK1、MAPK8、CXCL8、RELA、CCL2、IL10、ICAM1、IL-2、PTGS2、CASP3、MAPK14、STAT1、EGFR、FOS、IL-4等可能是“银翘”药对防治COVID-19的作用靶点。GO功能分析发现79个条目,涉及转录因子活性、受体活性、细胞因子活性、酶活性及生物合成过程的调控等方面。KEGG通路分析发现44个疾病药物交集靶点显著富集在146条通路上(P<0.01),涉及炎症、免疫、凋亡、自噬、激素代谢、肿瘤等方面,通路包括糖尿病并发症中的AGE-RAGE信号通路、IL-17信号通路、TNF信号通路、Toll样受体信号通路、C型凝集素受体信号通路、HIF-1信号通路、NF-κB信号通路、NOD样受体信号通路等经典信号通路,此外还参与细菌或病毒感染通路,如甲型流感、丙肝、百日咳、结核、巨细胞病毒感染、EB病毒感染等。这些作用通路可能是“银翘”药对防治COVID-19的依据。结论:初步验证了“银翘”药对防治COVID-19的作用机制,“银翘”药对相须配伍具有多个活性成分,能通过多个靶点、多个通路以发挥抗病毒、抑菌抗炎、调节免疫作用来防治COVID-19。展开更多
目的:基于网络药理学原理探讨消疕汤核心药对金银花-连翘干预银屑病的分子通路及作用机制。方法:应用中药系统药理学数据库与分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform,TCMSP)检索...目的:基于网络药理学原理探讨消疕汤核心药对金银花-连翘干预银屑病的分子通路及作用机制。方法:应用中药系统药理学数据库与分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform,TCMSP)检索金银花、连翘化学成分、作用靶点,并通过GeneCards数据库获取银屑病差异性靶点基因,预测中药与银屑病相关的作用靶点,通过STRING平台构建蛋白质-蛋白质相互作用信息网络(PPI),运用DAVID数据库对筛选出的靶点基因进行基因富集分析,获得基因本体论功能富集分析(gene ontology,GO)和KEGG富集分析(kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)信号通路注释结果,构建“中药成分-关键靶标-主要通路”的可视化网络图,探究金银花-连翘药对干预银屑病的分子作用机制。结果:金银花-连翘药对干预银屑病,共预测得到28个活性成分,涉及核心靶标基因127个,生物功能138个和信号通路155个。结论:金银花-连翘药对主要活性成分通过多靶点、多通路干预银屑病,主要涉及核受体的活性、转录因子活性、细胞因子受体结合、细胞因子生物功能等和白细胞介素17(interleukin-17,IL-17)信号通路、肿瘤坏死因子(tumor necrosis factor,TNF)信号通路、磷脂酰肌醇3-激酶(phosphatidylinositol 3-kinase,PI3K)-蛋白激酶B(protein kinase B,Akt)信号通路等。展开更多
文摘目的:利用网络药理学的技术和方法探索“金银花-连翘”(简称“银翘”)药对对防治新型冠状病毒肺炎(coronavirus disease 2019,COVID-19)作用的活性成分及其作用机制。方法:通过中药系统药理学分析平台(traditional Chinese medicine system pharmacology,TCMSP)根据口服生物利用度(oral bioavailability,OB)和类药性(drug-likeness,DL)检索中药“金银花”“连翘”中的化学成分和作用靶点,并在人类基因数据库(genecards:the human gene database)数据库中寻找“novel coronavirus pneumonia”的相关靶点,将“银翘”药对作用靶点与COVID-19相关靶点进行映射分析,筛选“银翘”药对防治COVID-19的活性成分和作用靶点。并用Cytoscape 3.7.2软件建立“中药活性成分-作用靶点-疾病”网络、通过STRING平台构建蛋白相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络、通过DAVID分析平台,对靶点基因GO富集分析和KEGG代谢通路进行分析,探究“银翘”药对防治COVID-19的作用机制。结果:从“金银花”中筛选化合物23个,“连翘”中化合物23个,二者有效作用靶点204个,通过Venn图获得与COVID-19有关的作用靶点44个,PPI网络发现IL-6、IL-1B、MAPK1、MAPK8、CXCL8、RELA、CCL2、IL10、ICAM1、IL-2、PTGS2、CASP3、MAPK14、STAT1、EGFR、FOS、IL-4等可能是“银翘”药对防治COVID-19的作用靶点。GO功能分析发现79个条目,涉及转录因子活性、受体活性、细胞因子活性、酶活性及生物合成过程的调控等方面。KEGG通路分析发现44个疾病药物交集靶点显著富集在146条通路上(P<0.01),涉及炎症、免疫、凋亡、自噬、激素代谢、肿瘤等方面,通路包括糖尿病并发症中的AGE-RAGE信号通路、IL-17信号通路、TNF信号通路、Toll样受体信号通路、C型凝集素受体信号通路、HIF-1信号通路、NF-κB信号通路、NOD样受体信号通路等经典信号通路,此外还参与细菌或病毒感染通路,如甲型流感、丙肝、百日咳、结核、巨细胞病毒感染、EB病毒感染等。这些作用通路可能是“银翘”药对防治COVID-19的依据。结论:初步验证了“银翘”药对防治COVID-19的作用机制,“银翘”药对相须配伍具有多个活性成分,能通过多个靶点、多个通路以发挥抗病毒、抑菌抗炎、调节免疫作用来防治COVID-19。
文摘目的:基于网络药理学原理探讨消疕汤核心药对金银花-连翘干预银屑病的分子通路及作用机制。方法:应用中药系统药理学数据库与分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform,TCMSP)检索金银花、连翘化学成分、作用靶点,并通过GeneCards数据库获取银屑病差异性靶点基因,预测中药与银屑病相关的作用靶点,通过STRING平台构建蛋白质-蛋白质相互作用信息网络(PPI),运用DAVID数据库对筛选出的靶点基因进行基因富集分析,获得基因本体论功能富集分析(gene ontology,GO)和KEGG富集分析(kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)信号通路注释结果,构建“中药成分-关键靶标-主要通路”的可视化网络图,探究金银花-连翘药对干预银屑病的分子作用机制。结果:金银花-连翘药对干预银屑病,共预测得到28个活性成分,涉及核心靶标基因127个,生物功能138个和信号通路155个。结论:金银花-连翘药对主要活性成分通过多靶点、多通路干预银屑病,主要涉及核受体的活性、转录因子活性、细胞因子受体结合、细胞因子生物功能等和白细胞介素17(interleukin-17,IL-17)信号通路、肿瘤坏死因子(tumor necrosis factor,TNF)信号通路、磷脂酰肌醇3-激酶(phosphatidylinositol 3-kinase,PI3K)-蛋白激酶B(protein kinase B,Akt)信号通路等。
