产Ⅰ型新德里金属β-内酰胺酶耐药菌的研究概况及应对措施

2008年首次在大肠埃希菌和肺炎克雷伯菌中确认了Ⅰ型新德里金属β内酰胺酶（New Delhi Metallo-β-lactamase1，NDM—1）。目前产NDM-1酶细菌在印度、英国、美国、加拿大、荷兰、澳大利亚以及中国等国均有报道。研究发现至少一例NDM-1阳性菌对所有已知的抗生素具有耐药性。该文简要介绍了NDM-1耐药菌的发现、发展过程及其耐药性情况，基因特点以及NDM-1阳性菌的应对措施.

携带新德里金属β-内酰胺酶的猪源大肠杆菌全基因组测序及植物提取物药物筛选

为了解大肠杆菌携带新德里金属β-内酰胺酶(New Delhi metallo-β-lactamase,NDM)NDM耐药基因情况及筛选敏感植物提取物。采用16S rRNA菌种鉴定,PCR筛查菌耐药基因,bla NDM、bla TEM和AmpC酶耐药基因的确认,全基因组测序,BLAST和MEGA软件对序列进行生物信息学分析、系统进化树分析、NDM亚型鉴定和6种植物提取物药敏药物筛选研究。结果表明,从2021年(1-12月)临床猪腹泻病例中分离鉴定的91株大肠杆菌(Escherichia coli,E.coli)中鉴定出1株同时携带新德里金属β-内酰胺酶NDM4、NDM5和β内酰胺酶blaTEM、AmpC酶的大肠杆菌(HN2187)。对其进行11种抗生素和6种植物提取物药物敏感性测试,结果显示HN2187菌株对其均耐药。而HN2187对血根碱、贯叶连翘提取物敏感,对黄芩、姜黄素、千里光和大蒜提取物耐药。HN2187产B类酶,携带NDM4、NDM5、bla TEM、AmpC酶耐药基因,其中bla NDM-4位于质粒pNDM4-HN2187(Plasmid B)上,bla NDM-5位于质粒pNDM5-HN2187(Plasmid A)上,bla TEM1位于质粒pTEM1-HN2187(Plasmid B)上,AmpC酶耐药基因位于染色体上,分别介导bla NDM-4、bla NDM-5、bla TEM和AmpC耐药基因,是耐药菌传播的重要载体。以上研究表明,携带NDM4和NDM5的多重耐药菌已在养殖场传播和流行,应加强该类耐药基因的流行调查、监测和新药物研究,为临床超级细菌和多重耐药菌感染的流行和防治提供理论基础。

交叉感染引起的3株产Ⅰ型新德里金属β-内酰胺酶产气肠杆菌同源性检测

产气肠杆菌是一种可以引起院内感染的重要病原菌。其可以产生 IMP-1、VIM-2型金属酶，或结合其他的耐药机制，而表现对碳青霉烯类抗菌药物耐药［1］，但产Ⅰ型新德里金属β-内酰胺酶（NDM-1）的产气肠杆菌极为罕见。本研究旨在对交叉感染引起的3株产 NDM-1金属酶的产气肠杆菌的同源性进行检测。

产新德里金属β-内酰胺酶大肠埃希菌耐碳青霉烯类药物相关机制研究和分子分型

目的研究某三甲医院临床分离的产新德里金属β-内酰胺酶(NDM)大肠埃希菌的耐药机制和分子流行病学特征。方法在某三甲医院收集的耐碳青霉烯类大肠埃希菌中利用聚合酶链反应(PCR)筛查是否携带NDM基因,通过测序确定NDM型别并进一步检测其它碳青霉烯酶相关基因和广谱β-内酰胺酶类耐药基因。通过载体构建和表达研究NDM-1、NDM-6及NDM-9对亚胺培南的水解能力。采用多位点序列分型(MLST)对产NDM大肠埃希菌进行分子分型。结果共筛选出8株携带NDM大肠埃希菌,其中2株为NDM-9型,6株为NDM-6型。4株大肠埃希菌同时携带NDM-6、TEM和CTX-M-1基因,1株同时携带NDM-6、TEM和CTX-M-9基因。携带NDM-1、NDM-6与NDM-9重组菌对亚胺培南均耐药,最小抑菌浓度(MIC)分别为32μg/mL、128μg/mL和64μg/mL。产NDM大肠埃希菌MLST分型结果为ST226、ST648和ST1284型各1株,ST101型5株,此5株均来源于神经内科。结论首次发现同时携带NDM-6、TEM和CTX-M-1基因和携带NDM-6、TEM和CTX-M-9基因的大肠埃希菌,NDM-6、NDM-9对亚胺培南的耐药性比NDM-1强,应引起重视。MLST分型结果提示某三甲医院可能存在耐碳青霉烯类大肠埃希菌的院内局部传播。

海南2株大肠埃希菌中发现新德里金属β-内酰胺酶1

目的分离和确认2株耐碳青霉烯类药物大肠埃希菌(E.coli)携带新德里金属β-内酰胺酶1(NDM-1)基因。方法用法国生物梅里埃公司API20E生化鉴定条和Vitek 2全自动细菌鉴定仪和配套GNS卡鉴定出2株耐亚胺培南和美罗培南的E.coli;并对其进行亚胺培南/亚胺培南+EDTA纸片法协同试验、IP/IPI E-test试条法协同试验检测金属β-内酰胺酶,对目的菌株进行NDM-1基因PCR特异性扩增,扩增产物测序鉴定;对目的菌株进行质粒接合转移试验分析其耐药机制。结果 2株测试菌亚胺培南/亚胺培南+EDTA纸片法协同试验、IP/IPI E-test试纸条法协同试验均为阳性,PCR扩增及测序证实为携带NDM-1耐药基因;体外药敏试验除对多黏菌素B和替加环素敏感外,其他广谱抗菌药物包括头孢菌素类、β-内酰胺类加酶抑制剂类、碳青霉烯类、氨基糖苷类和喹诺酮类均呈现高水平耐药,2株接合子E.coli对所有β-内酰胺类药物的MIC值高于受体菌E.coli J53,其中对美罗培南和亚胺培南MIC均提高了8倍以上,头孢他啶及头孢曲松则提高了64倍以上。结论海南地区出现携带NDM-1基因的E.coli,该基因可在不同菌株之间传递。

2株耐碳青霉烯类肠杆菌科细菌发现新德里金属β-内酰胺酶基因

目的调查新德里金属β-内酰胺酶1基因(New Delhi metallo-β-lactamase 1,blaNDM-1)在我院碳青霉烯类抗菌药物耐药肠杆菌科细菌中的流行状况。方法收集并鉴定临床分离碳青霉烯类抗菌药物耐药肠杆菌科细菌51株。药物敏感试验用琼脂稀释法;改良Hodge试验检测碳青霉烯酶;亚胺培南和亚胺培南+EDTA双纸片协同法检测金属β-内酰胺酶;PCR法检测blaNDM-1基因及其他主要的碳青霉烯酶基因(blaVIM、blaIMP、blaSIM、blaKPC、blaGES、blaSME、blaOXA-48),PCR扩增产物进行DNA测序分析。通过质粒转化试验来确定耐药基因的转移性。结果 1株阴沟肠杆菌和1株大肠埃希菌检出blaNDM-1基因,其他碳青霉烯酶基因阴性。2株细菌改良Hodge试验均为阳性,均产金属β-内酰胺酶,对所有的β-内酰胺类抗菌药物均耐药。耐药基因质粒转化试验阳性,转化子blaNDM-1基因检测阳性,并对青霉素类、头孢菌素类以及碳青霉烯类抗菌药物产生较高的耐药性。结论在本地区首次发现blaNDM-1基因,临床工作者应高度重视,加强对此类耐药基因的监测。

产新德里金属-β-内酰胺酶耐药菌的相关文献计量分析

目的从文献计量学角度对国内外产新德里金属-β-内酰胺酶(NDM-1)相关文献进行分析。方法检索至今的Pubmed、Embase、CNKI、维普和万方数据库中NDM-1相关文献,对纳入研究的文献进行统计分析。结果纳入研究的文献共57篇。目前有超过20个国家或地区有撰文报道该耐药菌,相关病例报告主要集中在印度和欧洲部分国家。结论产NDM-1细菌全球流行趋势明显,国外已建立较为完善的监控体系并进行了初步研究。

产新德里金属β-内酰胺酶耐药菌感染治疗的研究进展

新德里金属β-内酰胺酶(NDM)自2009年首次被报道以来,产NDM耐药菌已在全球范围流行并引发多种类型感染,有效控制和治疗产NDM耐药菌感染具有重要的现实意义。然而,目前并没有确切的关于产NDM耐药菌的临床治疗方案。我们对产NDM耐药菌感染的治疗研究现状做简要综述,为产NDM耐药菌感染的控制和临床治疗提供科学合理的依据和指导。

唐山地区CRE产新德里金属β-内酰胺酶亚型情况分析

目的探讨唐山地区2018—2019年碳青霉烯耐药肠杆菌科细菌(CRE)产新德里金属β-内酰胺酶(NDM)亚型情况及流行特点,为临床合理用药提供依据。方法收集唐山地区3所三级甲等综合医院2018—2019年临床分离CRE 252株,采用Vitek 2 Compact细菌鉴定仪进行菌种鉴定和药敏试验,采用改良碳青霉烯类灭活试验(mCIM)和EDTA协同改良碳青霉烯类灭活试验(eCIM)进行表型筛查,并用PCR扩增blaNDM基因并测序。结果76株CRE检测出blaNDM基因。其中blaNDM-5型占60.53%(46/76)、blaNDM-1占36.84%(28/76)、blaNDM-9占2.63%(2/76)。标本来源主要为痰液(44.74%)、尿液(30.26%)。76株产NDM的肠杆菌科细菌中大肠埃希菌占比为50.00%(38/76),肺炎克雷伯菌为38.15%(29/76)。产NDM菌株对氨曲南、阿米卡星、妥布霉素、复方磺胺甲噁唑的耐药率分别为77.6%、77.6%、89.5%、82.9%,仅发现2株产NDM菌株对替加环素耐药,对其余抗菌药物100.0%耐药。结论唐山地区NDM亚型主要是NDM-5和NDM-1,耐药基因主要存在于大肠埃希菌中。blaNDM阳性者耐药性严重,医院应加强此类细菌的防控从而防止疾病的暴发、流行。

碳青霉烯类药物不敏感的产气肠杆菌产新德里金属β-内酰胺酶

目的探讨3株对碳青霉烯类药物不敏感的产气肠杆菌的耐药机制及同源性。方法用生化和16S rDNA测序的方法鉴定细菌;用Bio Mérieux公司全自动药敏分析仪测定最小抑菌浓度(MIC),对亚胺培南和美罗培南的MIC用E-test法验证;双纸片协同实验测定金属酶的表型;PCR法扩增blaIMP、blaVIM、blaGIM、blaSPM、blaSIM、blaOXA-51-like、blaOXA-23-like、blaOXA-40-like、blaOXA-58-like和blaNDM-1,阳性产物克隆转化后提取质粒进行测序和BLAST比对分析;用肠杆菌基因间重复一致序列PCR(enterobacterial repetitive intergenic consensus-PCR,ERIC-PCR)进行菌株分型。结果两种方法鉴定3株细菌均为产气肠杆菌,对左氧氟沙星、环丙沙星、多黏菌素B敏感,对青霉素类、头孢菌素类和碳青霉烯类均表现耐药或中介。双纸片协同实验均为阳性,扩增和序列比对的结果证明均携带blaNDM-1,其余金属β-内酰胺酶和OXA类β-内酰胺酶基因的扩增均为阴性。ERIC-PCR分型获得的条带完全一致,证明3株产气肠杆菌为同一克隆。结论产Ⅰ型新德里金属β-内酰胺酶(NDM-1)的产气肠杆菌为院内交叉感染获得,应加强产NDM-1细菌的监控。

新德里金属-β-内酰胺酶的流行现状与水解机制分析

随着抗生素的乱用与滥用,细菌的耐药性及其机制也不断发展,其中金属-β-内酰胺酶(MBLs)介导的严重甚至多药耐药性,使得传统抗生素如青霉素类、头孢菌素类、碳青霉烯类等已无法应对这些耐药菌引起的感染,给人类的健康安全也带来了日益严重的威胁。了解金属酶耐药基因的检出和传播状况,深入研究金属酶耐药机制,对于及时诊断、合理用药以及预防新的耐药菌等具有重大意义。本文介绍了新德里金属β-内酰胺酶的流行现状及其结构与机制的研究概况,并分析了NDM-1突变体的发生趋势,提示科研和医务工作者,可靠的实验室检测方法,安全的防感染控制措施以及完善的综合监测系统是我们预防或应对"超级细菌"爆发的迫切需求。

我国北方地区部分医院产新德里金属β-内酰胺酶肠杆菌分子流行病学研究

目的调查北京、沈阳、济南、兰州等我国北方地区医院中产新德里金属β-内酰胺酶(NDM)耐药基因大肠埃希菌和肺炎克雷伯菌流行情况。方法采用改良Hodge试验筛选产碳氢霉烯酶菌株;采用亚胺培南-EDTA协同试验检测金属β-内酰胺酶的产生;采用聚合酶链式反应(PCR)扩增测序筛查NDM基因;采用脉冲场凝胶电泳法(PFGE)和多位点序列分析法(MLST)对阳性菌株进行同源性分析。结果 31株大肠埃希菌和84株肺炎克雷伯菌Hodge试验阳性。其中15株大肠埃希菌和15株肺炎克雷伯菌筛选出NDM基因。MLST结果序列型(ST分型)与PFGE分型吻合。PFGE试验结果显示大肠埃希菌SY01、SY02、SY03与JN06属于同一分群,大肠埃希菌SY01、SY02、SY03图谱完全相同,且与JN06图谱同源性较高,且这4株菌ST型均为ST167。结论产NDM耐药基因的大肠埃希菌和肺炎克雷伯菌已出现于我国北方地区多个省会城市,且有局部散在的克隆性流行,需引起临床科室和医院感染控制部门的高度重视。

产吲哚金黄杆菌金属β-内酰胺酶及其基因型检测

目的了解产吲哚金黄杆菌(Chryseobacteriumindologenes)耐药特性和金属β-内酰胺酶(MBL)的产酶率及其基因型。方法琼脂稀释法检测25株产吲哚金黄杆菌的最低抑菌浓度(MIC),增效法、改良三维试验法进行MBL表型检测,聚合酶链反应(PCR)筛查MBL和整合酶基因,全编码基因检测以及序列分析以确定IND型MBL的基因型;接合试验监测耐药基因是否具有可转移性,等电聚焦电泳(IEF)测定β-内酰胺酶等电点(pI)。结果产吲哚金黄杆菌对亚胺培南、美罗培南的耐药率为88.0%,但利福平、加替沙星、左氧氟沙星的耐药率均<12.0%;表型检测19株细菌产MBL,PCR初筛检测仅IND-like通用引物扩增出20株阳性,全编码基因分析,blaIND-1型9株,blaIND-2型10株,IND-like型MBL基因1株,其中5株blaIND碱基序列和演绎的氨基酸序列均发生改变;接合试验均为阴性,19株检测到1(17株)或2个(2株)pI值,携带blaIND-1的菌株(CI-5)经IEF和MBL表型检测均为阴性。结论产吲哚金黄杆菌具有很高的MBL检出率,本地区的产吲哚金黄杆菌以产IND-1、IND-2型MBL为主,blaIND可能存在蛋白质的不表达或低水平表达。

产IMP-4型金属β-内酰胺酶多药耐药产酸克雷伯菌耐药基因分析

目的了解产IMP-4型获得性金属β-内酰胺酶产酸克雷伯菌耐药基因存在的状况。方法分别采用K-B法、双纸片增效法、Etest法、聚合酶链反应(PCR)及序列分析方法检测其产金属β-内酰胺酶(MBLs)表型及相关的耐药基因。结果多药耐药产酸克雷伯菌除对阿米卡星、多黏菌素B敏感外,对碳青酶烯类、三代、四代头孢菌素、头孢西丁、氟喹诺酮类、头孢哌酮/舒巴坦、复方新诺明、阿莫西林/克拉维酸、替卡西林/克拉维酸、哌拉西林、哌拉西林/他唑巴坦、利福平等均耐药;金属β-内酰胺酶基因型别为IMP-4型(blaIMP-4)、intⅠ1、qacEΔ1-sul1、aadA1、AmpC(blaADC)、CTX-M-14基因阳性。结论产酸克雷伯菌的多药耐药与整合子相关,且携带有多种耐药基因。

检测临床分离的产金属β-内酰胺酶铜绿假单胞菌的基因型

目的:研究铜绿假单胞菌中金属β-内酰胺酶的的基因型及基因的转移机制,为监控产酶菌株的流行及指导临床合理选择抗生素提供依据。方法:E-test筛选对亚胺培南或头孢他啶耐药的铜绿假单胞菌中的产金属β-内酰胺酶菌株,PCR扩增耐药基因imp、vim、spm和gim。接合试验检测质粒型耐药基因。结果:75株耐亚胺培南和/或头孢他啶的铜绿假单胞菌中21株E-test阳性,PCR检测imp基因阳性菌株11株,vim基因阳性菌株3株,spm基因可疑阳性菌株4株,3株经E-test试验阳性而用特异引物PCR扩增金属酶基因为阴性。接合试验未获得接合子。结论:我院和新疆地区临床分离的铜绿假单胞菌所产金属β-内酰胺酶基因型以IMP型为主。

新德里金属β内酰胺酶-1序列和抗药性的生物信息学分析

在2009年报导的新德里金属-β-内酰胺酶-1（NDM-1）是“超级细菌”的一种主要的抗药物酶，具有通过基因重组在不同物种间转移的潜力，而且它具有广谱耐药性，目前已知的抗生素中，仅替加环素对其有抑制作用。本文旨在通过生物信息学技术探索NDM-1的基因重组的方式，并利用分子对接方法研究替加环素抑制NDM-1的分子机制。通过对一系列金属-β-内酰胺酶的氨基酸序列的进化树分析，发现三种来自海洋生物的蛋白与NDM-1具有较近的功能类似性，而相应编码基因的进化树分析发现仅其中一种与NDM-1有较近的进化距离。GC含量分析也发现NDM-1上游100～350bp剧烈波动，而在编码区段与该种基因的GC含量较为相似。因此认为NDM-1基因可能通过该基因水平转移的获得其特殊的功能。另外，通过半柔性分子对接，对NDM-1与替加环素的优势结合构象的潜在氢键进行分析，并与另外5种抗生素与NDM-1的对接结果进行比较，初步确定替加环素对于NDM-1蛋白存在竞争抑制优势，从而为NDM-1抑制剂的设计提供有价值的信息。

产超广谱β-内酰胺酶大肠埃希菌中检出aac(6′)-Ⅰb-suzhou型基因

目的了解质粒介导的喹诺酮耐药基因在产超广谱β-内酰胺酶(ELBLs)大肠埃希菌的耐药特点及耐药机制。方法用纸片扩散法检测59株产ESBLs的大肠埃希菌对11种抗生素的敏感性,采用聚合酶链反应(PCR)检测qnrA、qnrB和qnrS、qnrC、aac(6′)-Ⅰb及qepA基因,并对扩增阳性基因qnrB、aac(6′)-Ⅰb测序后进行BLAST比对分析。结果 59株产超广谱β-内酰胺酶的大肠埃希菌共检出qnrB 3株(5.1%)、aac(6′)-Ⅰb 22株(37.3%),qnrB经测序证实为qnrB4,aac(6′)-Ⅰb经测序证实为aac(6′)-Ⅰb-cr型1株(1.7%)和aac(6′)-Ⅰb-suzhou型3株(5.1%)。结论大肠埃希菌多重耐药机制与产超广谱β-内酰胺酶及携带qnrB4、aac(6′)-Ⅰb和aac(6′)-Ⅰb-cr基因有关;本研究是国内首次从大肠埃希菌中检出aac(6′)-Ⅰb-suzhou型基因。

IMP型金属β-内酰胺酶及其抑制剂研究进展

IMP型金属β-内酰胺酶是一类广谱酶,能够水解除了单环β-内酰胺以外的几乎所有β-内酰胺类抗生素,给临床的抗菌治疗带来了严峻的挑战。本文从IMP型金属β-内酰胺酶的发现与分类、分子生物学特征、产生耐药的机制及其抑制剂的研究现状等方面进行论述,以促进对抗耐药菌的药物研发。

氨曲南联合头孢他啶/阿维巴坦对产新德里金属β-内酰胺酶大肠埃希菌的体外抗菌活性评估

目的评估氨曲南联合头孢他啶/阿维巴坦对产新德里金属β-内酰胺酶(NDM)大肠埃希菌的体外抗菌活性。方法收集2018—2020年临床分离的碳青霉烯耐药大肠埃希菌30株,采用微量肉汤稀释法检测常规药物的敏感性,采用E-test试验检测菌株对氨曲南和头孢他啶/阿维巴坦的最低抑菌浓度(MIC),双E-test纸条法检测氨曲南与头孢他啶/阿维巴坦之间的协同作用;酶抑制剂增强试验检测碳青霉烯酶表型;PCR扩增和测序技术检测碳青霉烯酶基因和超广谱β-内酰胺酶(ESBLs)基因;多位点序列分型(MLST)对菌株进行分子分型。结果碳青霉烯酶表型检测结果显示,30株大肠埃希菌均为金属酶表型,基因检测结果显示携带NDM-5基因26株,携带NDM-7基因2株,携带NDM-1和NDM-9基因各1株。另外,15株携带TEM-1基因,22株携带CTX-M-1组基因(10株携带CTX-M-15,12株携带CTX-M-55),9株携带CTX-M-9组基因(均为CTX-M-27)。MLST将30株菌分为8个不同的ST型,以ST167(40%,12/30)、ST405(20%,6/30)和ST410(20%,6/30)为主。30株细菌仅对替加环素和多黏菌素敏感,对阿米卡星耐药率为46.7%。27株对氨曲南耐药的菌株,在联合头孢他啶/阿维巴坦后25株细菌由耐药变为敏感,氨曲南MIC_(50)和MIC_(90)分别下降至2μg/mL和4μg/mL。结论氨曲南联合头孢他啶/阿维巴坦对产NDM金属酶大肠埃希菌有较强的体外协同作用,可成为一种治疗产金属酶大肠埃希菌感染的潜在药物组合。

聊城地区新德里金属β-内酰胺酶菌株的分子流行病学及感染危险因素研究

目的研究聊城地区新德里金属β-内酰胺酶(NDM)菌株的分子流行病学及感染危险因素。方法采用分层抽样法从聊城地区2014年1月至2018年12月15所医院中抽取样本5689例,其中,临床标本中分离的碳青霉烯类耐药肠杆菌科细菌共112份,回顾性研究分析院内感染危险因素。用改良Hodge试验、ETP-EDTA协同试验、mCIM试验确证表型。用PCR法扩增碳青霉烯酶基因。结果5689例样本中临床标本中分离的碳青霉烯类耐药肠杆菌科细菌共112份,发生率1.97%。可见,不同危重度、合并基础疾病、存在侵入性操作、使用糖皮质激素、使用免疫抑制剂药物是碳青霉烯类耐药情况下碳青霉烯类耐药肠杆菌科细菌感染率差异有统计学意义(P<0.05)。Logistic回归分析模型结果显示,危重度(符合并入住ICU)、合并基础疾病(2种及以上)、存在侵入性操作、使用糖皮质激素、使用免疫抑制剂药物是碳青霉烯类耐药肠杆菌科细菌感染的独立危险因素(OR=1.977、1.558、1.103、1.078、1.770,P<0.05),26株产NDM肠杆菌科细菌呈现多重耐药性,其中7株对亚胺培南耐药、8株对厄他培南耐药、6株对美罗培南耐药,5株对3种药物都敏感。PCR结果显示,26株产NDM的大肠埃希菌分为4个基因型,其中9株D型,8株B型,5株C型,4株A型。结论医院已出现多种NDM亚型,主要感染因素为侵袭性操作及抗生素的应用,主要通过X3型质粒在肠杆菌科细菌中传播。