低深度全基因组测序技术在复发性流产遗传学病因诊断中的应用

目的应用低深度全基因组拷贝数变异分析(CNV-seq)技术研究胚胎染色体异常在复发性流产(RSA)及偶发流产(SA)中的差异。方法采集158例RSA患者(RSA组)和244例SA患者(SA组)的流产组织进行CNV-seq检测,对可疑染色体异常的夫妇进行高分辨外周血染色体核型检测。结果402例样本中有2例检测失败,检测成功率99.5%(400/402)。共检测出染色体异常238例(59.5%),包括染色体数目异常212例(89.1%),致病性拷贝数变异25例(10.5%),单亲二倍体1例(0.4%)。RSA组和SA组总体染色体异常、非整倍体、三倍体发生率差异均无统计学意义。RSA组致病性拷贝数变异在染色体异常中的构成比显著高于SA组(P<0.05)。高分辨外周血核型分析检测共发现4例平衡易位携带者。35~39岁年龄段中SA组胚胎染色体异常率高于RSA组(P<0.05)。2组早期流产中胚胎染色体异常率均明显高于中期流产;早期流产中,SA组的流产组织(POC)染色体异常率高于RSA组(P<0.05)。结论CNV-seq可以对胚胎染色体数目异常和染色体片段重复/缺失进行精准诊断,在RSA和SA的遗传学病因诊断中同样重要,可为再生育指导提供依据。

1例常染色体隐性遗传多囊肾的PKHD1基因分析

目的 对1例患常染色体隐性遗传多囊肾疾病（ARPKD）的新生儿进行家族史、临床、病理调查,并对致病基因PKHD1进行突变鉴定,探讨该病的临床特点和分子发病机制.方法 根据患儿产前超声、临床表现、死亡后病理检查及家族史进行临床诊断,应用PCR扩增、DNA直接测序技术对患儿及其父母进行PKHD1基因突变分析.结果 患儿PKHD1基因第58号外显子发生了无义突变c.9319C〉T,从而使PKHD1蛋白多肽链的合成提前终止.结论 ARPKD可在胎儿期及生后早期导致不良的结局,临床医生应提高对该病的认识,PKHD1基因突变是ARPKD的遗传基础,进行PKHD1基因突变分析有助于产前基因诊断技术的开展.

肠肿瘤的DNA染色体、癌遗传基因、癌抑制遗传基因

随着遗传工程学的飞速发展,有关DNA遗传基的水平癌研究的报道,逐渐增多。本文将有关大肠癌因最新研究情况介绍如下。根据形态学进行癌的诊断,就如相面一样,当然,不仅要考虑其细胞异型及构造异型,还应将其他表现等因素综合考虑进行诊断,尽可能正确、科学研究了解每个细胞的特点。

遗传的物质基础

知识梳理 本专题包括基因和染色体的关系、基因的本质、基因的表达三部分内容。

山东省原发性高血压1号染色体基因扫描

目的对原发性高血压患者及正常对照者的1号染色体进行扫描,查找与原发性高血压关联的遗传位点。方法在1号染色体上间隔10 cM遗传距离选择31个微卫星遗传位点,用DNA混合池的方法对原发性高血压患者450例和正常对照者450例的DNA样本进行基因扫描。采用CLUMP软件对患者组和对照组每个位点的等位基因频率进行比较。结果在D1S196位点(1q24.2)、D1S249位点(1q32)和D1S2667位点(1p36.22)发现患者组与对照组的等位基因频率存在显著性差异(P<0.01)。结论山东省原发性高血压患者在1号染色体的D1S196、D1S249与D1S2667位点附近可能存在原发性高血压易感基因,需要进行候选基因突变筛查。

山东地区冠状动脉粥样硬化性心脏病患者3号染色体基因扫描研究

目的对冠心病患者及正常对照者的3号染色体进行扫描,查找与冠心病关联的遗传位点。方法在3号染色体上采用间隔为10 cM(厘摩)遗传距离的23个微卫星遗传标记,分别对156例冠心病患者和450名正常对照者的DNA混合池样本进行基因组扫描,采用CLUMP软件对比患者组与对照组等位基因频率的差异。结果在D3S1278(3q13.31)位点和D3S1300(3p14.2)位点患者组与对照组的等位基因频率差异有统计学意义(P<0.001)。结论山东地区冠心病患者群体中存在与3号染色体q13.31和p14.2区域的关联,致病基因或调控因子可能位于其附近。

山东省孤独症7号染色体基因扫描研究

目的对孤独症患者、其父母及正常对照者的7号染色体进行扫描,查找与孤独症关联的遗传位点。方法在7号染色体上间隔10cM遗传距离选择22个微卫星遗传位点,用DNA混合池的方法对38例孤独症患者、75例患者父母和1000例正常对照者的DNA样本进行基因扫描。采用CLUMP软件和SPSS10.0对患者组、父母组以及对照组每个位点的等位基因频率进行比较。结果在D7S513位点(7p21.3)发现患者组与对照组的等位基因频率存在显著性差异(P<0.01)。结论山东省孤独症患者在7号染色体的D7S513位点存在关联,需要在其附近进行易感基因筛查。

山东省双相情感障碍6号染色体基因扫描研究

目的对双相情感障碍患者及正常对照者的6号染色体进行扫描,查找双相情感障碍的关联位点,进而定位易感基因。方法在6号染色体上间隔10cM(厘摩)遗传距离选择了20个微卫星遗传标记,对104例发病年龄≤20岁的双相情感障碍患者与1000例正常对照者组成的DNA混合样本分别进行了扫描。采用CLUMP软件进行统计学分析,逐一比较患者组与对照组等位基因频率的差异。结果在D6S262位点发现患者组与对照组的等位基因频率差异有显著性意义(P<0.05)。结论山东省双相情感障碍患者与6号染色体上D6S262位点关联,基因突变或甲基化调控等致病因子可能位于其附近。

山东省孤独症4号染色体基因扫描研究

目的查找与山东省孤独症相关联的4号染色体上的遗传位点。方法在4号染色体上选择间隔为10 cM的22个微卫星位点,用DNA混合池的方法对38例孤独症患者、75例患者父母和1 000例正常对照者进行基因组扫描。采用CLUMP软件对患者组与对照组及患者组与患者父母组每个位点的等位基因频率进行比较。结果患者组与患者父母组的等位基因频率在D4S392位点(4q13.3)有显著性差异(P<0.01);患者组与对照组的等位基因频率在D4S1535位点(4q35.1)有显著性差异(P<0.01)。结论 4号染色体的D4S392位点和D4S392位点可能是与山东省孤独症患者相关联的遗传位点,在其附近可能存在孤独症的易感基因。

两个常染色体显性遗传先天性白内障家系突变热点筛查

【目的】对2个常染色体显性遗传先天性白内障中国家系进行基因突变热点筛查,以了解这两个家系的先天性白内障是否与文献报道的17个突变热点相关。【方法】对两个家系共20名成员(包括患者11人,非患者9人)抽取外周血提取基因组DNA,针对截至2003年1月为止国外文献报道的与常染色体显性遗传先天性白内障发病相关的10个基因上的17个突变热点,包括CRYAA(ARG116CYS),CRYAB(del450A),CRYBA1(EX3-4DEL),CRYBB2(GLN155TER),CRYGC(THR5PRO,5-BPDUPatNT226),CRYGD(ARG14-CYS,PRO23THR,ARG58HIS,ARG36SER),GJA3(ASN63SER,PRO187LEU),GJA8(GLU48LYS,PRO88SER),BFSP2(ARG287TRP)及MIP(GLU134GLY,THR138ARG),设计引物使PCR扩增片段涵盖上述热点,对扩增产物进行序列分析,检测这11名患者在突变热点上是否有相应的序列改变。【结果】20名被检者的10个基因片段序列与GenBank发表序列相同,在17个突变热点均未发现相应基因突变。【结论】初步排除这个家系的先天性白内障与17个突变热点相关。

常染色体显性遗传小眼球病与12个微卫星多态标志的初步连锁分析

本文报道了一个常染色体显性遗传小眼球的大家系,初步排除了此家系致病基因在目前已知位点(CHX10、MITF、RX、MCOP、NNO1、NNO2)的可能,并探讨了与11号染色体上的微卫星DNA标志的连锁关系。采用聚合酶链(PCR)扩增微卫星DNA片段,扩增产物进行聚丙烯酰胺凝胶电泳,用银染显示结果;用MLINK连锁分析软件计算LOD值。结果显示,本家系小眼球致病基因与6个已知位点及11号染色体上的微卫星DNA标志之间不存在连锁,提示此家系的致病位点目前尚未被定位。

细胞周期检测点激酶2在调节DNA损伤以及维持染色体稳定中的作用

细胞周期检测点激酶2(cell cycle checkpoint kinase 2,CHK2)是由抑癌基因CHEK2编码的丝氨酸/苏氨酸激酶,是DNA双链断裂后参与DNA修复应答反应的重要的信号转导蛋白。CHK2被毛细血管扩张性共济失调突变基因(ataxia telangiectasia mutated,ATM)磷酸化后,CHK2可磷酸化多个底物,包括细胞分裂周期25同源物(cell division cycle 25 homolog,Cdc25)、P53、乳腺癌遗传易感基因1(breast cancer 1,early onset,BRCA1)蛋白、E2F-1转录因子和早幼粒细胞白血病(promye-locytic leukemia,PML)蛋白,使细胞周期进程发生阻滞,促进细胞对DNA损伤进行修复或诱导凋亡。细胞在没有DNA损伤时,CHK2也可以将BRCA1磷酸化,这一过程对保持有丝分裂纺锤体组装的正确性以及染色体稳定性十分必要。基于在DNA损伤和细胞有丝分裂中的作用,CHK2有望成为抗肿瘤治疗的靶点。

细菌人工染色体及其在基因组学研究中的应用

细菌人工染色体(BAC)是一种新发展起来的DNA载体系统它具有容量大、遗传特性稳定、易于操作等优点,在基因组研究和基因功能分析等方面应用广泛。本文综述BAC的发展及近年来在基因组学研究中的一些应用情况。

13/17染色体易位纯合子猪DNA指纹分析

13/17染色体易位纯合子猪是孙金海等于1991年通过易位杂合子互交在国内外首次获得的一种新遗传类型家猪[2n=36,XY或XXrob(13;17)]。本研究用噬菌体M13mp18单链小卫星DNA作探针对该种新遗传类型猪、13/17染色体易位杂合子猪及正常核型家猪进行了DNA指纹分析。采用限制性内切酶HinfⅠ和HaeⅢ均成功地获得高分辨的、具有个体特异性的DNA指纹图谱。研究结果表明。

线粒体DNA突变与遗传性耳聋

1概述 遗传性耳聋是指由于人类个体基因（包括核基因及线粒体基因）异常所致的耳聋。它可以分为非综合征型遗传性耳聋（non-syndromic hearing impair-ment）和综合征型遗传性耳聋（syndromic hearing im-pairment）两大类。综合征型遗传性耳聋通常为染色体结构或功能异常引起的一类同时伴有多种其他临床表现或疾病的耳聋,这类患者约占遗传性耳聋的30%。

细菌人工染色体文库的构建与鉴定

细菌人工染色体是继 λ噬菌体、黏粒、噬菌体人工染色体、酵母人工染色体等载体系统之后发展起来的 DNA载体系统 ,以其容量大、遗传特性稳定、嵌合体少、插入片段易回收、操作简便等优点 ,而被广泛应用于基因组较大的真核生物基因组研究中 ,并发挥着前所未有的重要作用。因此本文概括性地阐述了细菌人工染色体的发展 ,以及利用此载体构建基因组文库的机理和程序及其鉴定方法。

无创产前基因检测的临床应用及遗传咨询

无创产前基因检测(NIPT)是一项发展迅猛的新技术。为保障孕妇群体的健康利益以及NIPT稳定、持续性地发展,2016年国家卫生和计划生育委员会组织专家结合国内外临床研究成果,制定了我国《孕妇外周血胎儿游离DNA产前筛查与诊断技术规范》。该规范的颁布,为临床规范、有序、高质量地开展NIPT提供依据。规范开展NIPT,对于提高染色体非整倍体的检出率,降低假阳性率及侵入性检测率具有重要意义。本刊选登天津医科大学总医院张颖主任医师在2017年首届云津计划生育优生优育高峰论坛上的报告,介绍NIPT技术的临床应用情况和规范的重点内容,旨为广大读者学习借鉴,促进我国优生优育事业的发展。