【目的】糖外排转运蛋白(sugars will eventually be exported transporters,SWEETs)在植物生长发育过程中发挥重要作用,解析SWEETs基因在枸杞果实发育过程中对糖积累作用,为进一步揭示SWEETs基因在枸杞果实发育过程中的作用提供参考。...【目的】糖外排转运蛋白(sugars will eventually be exported transporters,SWEETs)在植物生长发育过程中发挥重要作用,解析SWEETs基因在枸杞果实发育过程中对糖积累作用,为进一步揭示SWEETs基因在枸杞果实发育过程中的作用提供参考。【方法】用生物信息学方法对枸杞SWEET基因(LbaSWEETs)进行全基因组鉴定,并用已发表的转录数据分析LbaSWEETs在果实发育时期的基因表达情况。【结果】枸杞SWEET基因家族共有37个成员,随机分布于10条染色体上,分别编码152~621个氨基酸,蛋白质分子质量为16.87~69.97 kD,等电点为4.96~9.86。亚细胞定位预测位于叶绿体或质膜,大多数含有7个跨膜螺旋。系统进化分析发现,37个LbaSWEETs蛋白可分为4个亚群,每个亚群的基因结构和保守基序组成相似。启动子元件分析表明:Lba-SWEETs基因启动子富含大量激素响应、逆境胁迫和生长发育响应元件。转录组数据和qRT-PCR分析表明:LbaSWEET9和LbaSWEET29基因表达量随果实成熟呈现显著增加。相关性分析结果表明,LbaSWEET9和LbaSWEET29基因表达量与果糖含量呈显著正相关。【结论】LbaSWEET9和LbaSWEET29基因是果糖积累的关键基因。展开更多
SWEET(Sugars will eventually be exported transporters)是近年来在植物中发现的一组糖转运蛋白,在植物生长、发育和非生物及生物胁迫响应等多种生理过程中发挥着重要作用。本研究利用生物信息学方法对猕猴桃(Actinidia chinensis Pla...SWEET(Sugars will eventually be exported transporters)是近年来在植物中发现的一组糖转运蛋白,在植物生长、发育和非生物及生物胁迫响应等多种生理过程中发挥着重要作用。本研究利用生物信息学方法对猕猴桃(Actinidia chinensis Planch.)AcSWEET基因家族进行了鉴定,共获得29个AcSWEET基因,并对其氨基酸数量、相对分子量、等电点、不稳定系数、亚细胞定位、亲水指数进行了分析。结果显示:29个基因编码的氨基酸数目为680~906个;分子量范围为7.531~101.266 kDa,等电点在6.95~9.90,多数蛋白为定位于细胞膜的疏水性蛋白,具有1~2个MtN3结构域或PQ-loop结构域。此外,AcSWEET基因的外显子数量在4~6个,系统进化分析结果表明猕猴桃AcSWEET基因家族被分为4个亚族,同一亚族基因具有相似的内含子、外显子以及保守基序。表达模式分析结果表明,这些基因在果实不同发育时期具有表达特异性。推测AcSWEET26、AcSWEET7、AcSWEET15和AcSWEET13可能参与猕猴桃的蔗糖转运和积累。展开更多
SWEET(sugars will eventually be exported transporter)是一类介导蔗糖或己糖通过顺浓度梯度被动扩散跨细胞膜转运的新型糖转运蛋白。植物SWEET蛋白包括7个跨膜结构域,其中包含2个MtN3/Saliva结构域,可分为4个进化分支。SWEET转运蛋...SWEET(sugars will eventually be exported transporter)是一类介导蔗糖或己糖通过顺浓度梯度被动扩散跨细胞膜转运的新型糖转运蛋白。植物SWEET蛋白包括7个跨膜结构域,其中包含2个MtN3/Saliva结构域,可分为4个进化分支。SWEET转运蛋白在多种生理和生化过程中发挥着关键作用,包括韧皮部装载、激素运输、营养和生殖生长等。结合当前SWEET转运蛋白的研究进展,重点总结了SWEET的发现、蛋白结构及其在糖转运中的生物学功能,指出目前植物SWEET基因研究面临的问题,并对未来SWEET蛋白的研究重点进行了展望:1)探究SWEET蛋白的底物识别机制;2)挖掘提高作物产量和品质的关键SWEET基因;3)利用SWEET基因编辑和磷酸化等策略改良作物产量和品质。展开更多
【目的】挖掘参与油茶糖代谢及逆境响应的糖外排转运子(sugars will eventually be exported transporters,SWEETs)。【方法】利用生物信息学方法分析油茶SWEETs家族的基因结构、蛋白基序、染色体定位、共线性关系、启动子区顺式作用元...【目的】挖掘参与油茶糖代谢及逆境响应的糖外排转运子(sugars will eventually be exported transporters,SWEETs)。【方法】利用生物信息学方法分析油茶SWEETs家族的基因结构、蛋白基序、染色体定位、共线性关系、启动子区顺式作用元件及上游调控因子等,并利用RT-qPCR分析CoSWEETs在不同时期、不同组织及不同逆境胁迫下的基因表达情况。【结果】从油茶中鉴定得到14个CoSWEETs基因,不均匀分布于10条染色体上,不同成员间内含子-外显子数目存在差异。根据系统进化关系,14个CoSWEETs可分为 4个分支,均具有1-2个MtN3 保守结构域,同一分支具有相似的基因结构和基序。根据启动子顺式作用元件和上游转录因子预测的分析结果,CoSWEETs启动子中含有多个与生长发育、植物激素和应激相关的调节元件,其表达可能受到ERF、DOF、BBR-BPC、MYB等转录因子的调控。RT-qPCR分析表明大部分CoSWEETs成员在果实和根中高表达,在种子中的表达水平与发育时期相关,并根据低温、高盐和干旱等非生物胁迫下CoSWEETs的表达模式挖掘出CoSWEET1、CoSWEET2、CoSWEET17等响应油茶低温、干旱或高盐胁迫的基因。【结论】CoSWEET基因的表达受到多种激素及转录因子调控,并在油茶种子发育与逆境胁迫响应中发挥重要作用。展开更多
SWEET(Sugars will eventually be exported transporter)蛋白是一类新型糖转运蛋白。本研究基于扁蓿豆(Medicago ruthenica)基因组对MrSWEET基因家族进行了鉴定和生物信息学分析,并通过qPCR初步分析MrSWEET在干旱和寒冷环境下的表达模...SWEET(Sugars will eventually be exported transporter)蛋白是一类新型糖转运蛋白。本研究基于扁蓿豆(Medicago ruthenica)基因组对MrSWEET基因家族进行了鉴定和生物信息学分析,并通过qPCR初步分析MrSWEET在干旱和寒冷环境下的表达模式,以期深入探究扁蓿豆SWEET基因家族在非生物胁迫中的作用。结果表明,扁蓿豆SWEET糖转运蛋白家族共有18个成员,都具有典型的MtN3_saliva/PQ-Loop结构域。系统发育分析表明,其可分为4个进化枝,其中CladeⅠ包括MrSWEET1a、-1b、-2a、-2b、-3a、-3b;CladeⅡ包括MrSWEET4~6;CladeⅢ包括MrSWEET9~15,MrSWEET16~17属于CladeⅣ。所有的MrSWEET成员都含有Motif 1、3、4、5,可能与糖转运蛋白的功能有关。MrSWEET基因启动子区域含有多个与光响应、激素响应和非生物胁迫以及植物生长发育有关的功能元件。在干旱(15%PEG6000)和寒冷(4℃)胁迫下,扁蓿豆根部的MrSWEET基因表达水平相对高于叶片,且根部大多数基因在干旱和寒冷胁迫处理6、12 h时表达量最高;干旱处理下,根部的MrSWEET1a和MrSWEET16相对表达量在3、6、12、24 h和7 d时均高于对照,寒冷处理下根部的MrSWEET16表达量以及处理7 d的MrSWEET1a表达量高于对照,说明其可能参与调控扁蓿豆对干旱和寒冷胁迫的响应。展开更多
In this article, we investigated the influence of size and initial water content on the effective diffusion coefficient of sweet potatoes samples cut into cubic and cylindrical shapes. The sizes of the cubic samples a...In this article, we investigated the influence of size and initial water content on the effective diffusion coefficient of sweet potatoes samples cut into cubic and cylindrical shapes. The sizes of the cubic samples are 0.5, 1, 1.5, 1.75, 2, 2.5 and 3 cm edge with a respective initial water content of 2.7, 3.76, 3.48, 2.68, 3.28, 2.17 and 2.29 kg/kgms. For cylindrical samples, the radius is set at 0.5 cm and sample heights are 1, 1.5, 2, 2.5, 3, 3.5 and 4 cm with respective water contents of 2.2, 3.19, 2.85, 2.1, 2.17, 2.39 and 2.03 kg/kgms. The effective diffusion coefficients of cubic samples are of the order of 10−10 and 10−9 m2∙s−1 grew with sample edge. As for the cylindrical samples, the effective diffusion coefficients were of the order of 10−9 m2∙s−1 and there was no linear correlation between cylinder height and their effective diffusion coefficient. As for the examination of the initial water content on the effective diffusion coefficient, it turned out that the initial water content had no influence on the effective diffusion coefficient of the sweet potato samples.展开更多
SWEET(sugars will eventually be exported transporter)基因家族是一类新型的糖转运蛋白,可顺浓度梯度对糖分进行双向跨膜运输。SWEET在植物光合同化物韧皮部装载、蜜腺花蜜分泌、种子灌浆、花粉发育、病原菌互作、逆境调控等过程中...SWEET(sugars will eventually be exported transporter)基因家族是一类新型的糖转运蛋白,可顺浓度梯度对糖分进行双向跨膜运输。SWEET在植物光合同化物韧皮部装载、蜜腺花蜜分泌、种子灌浆、花粉发育、病原菌互作、逆境调控等过程中起着关键作用,近年来受到广泛关注。尽管SWEET广泛存在于植物中,但目前对其功能研究主要集中在水稻和拟南芥上。介绍了SWEET基因家族的发现、蛋白结构特征、生理功能及逆境调控的最新研究进展,有助于将来对SWEET基因家族进行更深入和全面的研究。展开更多
[Objective] This study aimed to investigate the salt-tolerance mechanism of sweet potato.[Method]Two sweet potato varieties of Xu 25-2(salt-tolerant cultivar)and Triumph 100(salt-sensitive cultivar)were treated by sod...[Objective] This study aimed to investigate the salt-tolerance mechanism of sweet potato.[Method]Two sweet potato varieties of Xu 25-2(salt-tolerant cultivar)and Triumph 100(salt-sensitive cultivar)were treated by sodium chloride with the concentration of 0 mmol/L and 100 mmol/L.After 20 days,Na+ content and Na+/K+ ratio in the roots,shoots and leave were determined by the flame photometer,while dry weight and fresh weight of roots,shoots and leave in different varieties were also studied.[Result]The growth of two sweet potato varieties was inhibited under salt stress,so the plant became shorter,leaf and root became fewer,dry weight of roots and leave decreased,but seedlings of Xu 25-2 were inhibited slightly.Furthermore,Na+ content and Na+/K+ ratio in roots,shoots and leaves of two sweet potato varieties increased.Na+ content of salt-tolerant Xu 25-2 was low in roots,shoots and leaves,while Na+ content of salt-sensitive Triumph 100 was high in shoots and leave of seedlings,but the change range of Xu 25-2 was less than that of Triumph 100.[Conclusion]The lower Na+ content and Na+/K+ ratio in leaves under salt stress were the most important characteristics for salt-tolerance of sweet potato varieties.展开更多
文摘【目的】糖外排转运蛋白(sugars will eventually be exported transporters,SWEETs)在植物生长发育过程中发挥重要作用,解析SWEETs基因在枸杞果实发育过程中对糖积累作用,为进一步揭示SWEETs基因在枸杞果实发育过程中的作用提供参考。【方法】用生物信息学方法对枸杞SWEET基因(LbaSWEETs)进行全基因组鉴定,并用已发表的转录数据分析LbaSWEETs在果实发育时期的基因表达情况。【结果】枸杞SWEET基因家族共有37个成员,随机分布于10条染色体上,分别编码152~621个氨基酸,蛋白质分子质量为16.87~69.97 kD,等电点为4.96~9.86。亚细胞定位预测位于叶绿体或质膜,大多数含有7个跨膜螺旋。系统进化分析发现,37个LbaSWEETs蛋白可分为4个亚群,每个亚群的基因结构和保守基序组成相似。启动子元件分析表明:Lba-SWEETs基因启动子富含大量激素响应、逆境胁迫和生长发育响应元件。转录组数据和qRT-PCR分析表明:LbaSWEET9和LbaSWEET29基因表达量随果实成熟呈现显著增加。相关性分析结果表明,LbaSWEET9和LbaSWEET29基因表达量与果糖含量呈显著正相关。【结论】LbaSWEET9和LbaSWEET29基因是果糖积累的关键基因。
文摘SWEET(Sugars will eventually be exported transporters)是近年来在植物中发现的一组糖转运蛋白,在植物生长、发育和非生物及生物胁迫响应等多种生理过程中发挥着重要作用。本研究利用生物信息学方法对猕猴桃(Actinidia chinensis Planch.)AcSWEET基因家族进行了鉴定,共获得29个AcSWEET基因,并对其氨基酸数量、相对分子量、等电点、不稳定系数、亚细胞定位、亲水指数进行了分析。结果显示:29个基因编码的氨基酸数目为680~906个;分子量范围为7.531~101.266 kDa,等电点在6.95~9.90,多数蛋白为定位于细胞膜的疏水性蛋白,具有1~2个MtN3结构域或PQ-loop结构域。此外,AcSWEET基因的外显子数量在4~6个,系统进化分析结果表明猕猴桃AcSWEET基因家族被分为4个亚族,同一亚族基因具有相似的内含子、外显子以及保守基序。表达模式分析结果表明,这些基因在果实不同发育时期具有表达特异性。推测AcSWEET26、AcSWEET7、AcSWEET15和AcSWEET13可能参与猕猴桃的蔗糖转运和积累。
文摘SWEET(sugars will eventually be exported transporter)是一类介导蔗糖或己糖通过顺浓度梯度被动扩散跨细胞膜转运的新型糖转运蛋白。植物SWEET蛋白包括7个跨膜结构域,其中包含2个MtN3/Saliva结构域,可分为4个进化分支。SWEET转运蛋白在多种生理和生化过程中发挥着关键作用,包括韧皮部装载、激素运输、营养和生殖生长等。结合当前SWEET转运蛋白的研究进展,重点总结了SWEET的发现、蛋白结构及其在糖转运中的生物学功能,指出目前植物SWEET基因研究面临的问题,并对未来SWEET蛋白的研究重点进行了展望:1)探究SWEET蛋白的底物识别机制;2)挖掘提高作物产量和品质的关键SWEET基因;3)利用SWEET基因编辑和磷酸化等策略改良作物产量和品质。
文摘【目的】挖掘参与油茶糖代谢及逆境响应的糖外排转运子(sugars will eventually be exported transporters,SWEETs)。【方法】利用生物信息学方法分析油茶SWEETs家族的基因结构、蛋白基序、染色体定位、共线性关系、启动子区顺式作用元件及上游调控因子等,并利用RT-qPCR分析CoSWEETs在不同时期、不同组织及不同逆境胁迫下的基因表达情况。【结果】从油茶中鉴定得到14个CoSWEETs基因,不均匀分布于10条染色体上,不同成员间内含子-外显子数目存在差异。根据系统进化关系,14个CoSWEETs可分为 4个分支,均具有1-2个MtN3 保守结构域,同一分支具有相似的基因结构和基序。根据启动子顺式作用元件和上游转录因子预测的分析结果,CoSWEETs启动子中含有多个与生长发育、植物激素和应激相关的调节元件,其表达可能受到ERF、DOF、BBR-BPC、MYB等转录因子的调控。RT-qPCR分析表明大部分CoSWEETs成员在果实和根中高表达,在种子中的表达水平与发育时期相关,并根据低温、高盐和干旱等非生物胁迫下CoSWEETs的表达模式挖掘出CoSWEET1、CoSWEET2、CoSWEET17等响应油茶低温、干旱或高盐胁迫的基因。【结论】CoSWEET基因的表达受到多种激素及转录因子调控,并在油茶种子发育与逆境胁迫响应中发挥重要作用。
文摘SWEET(Sugars will eventually be exported transporter)蛋白是一类新型糖转运蛋白。本研究基于扁蓿豆(Medicago ruthenica)基因组对MrSWEET基因家族进行了鉴定和生物信息学分析,并通过qPCR初步分析MrSWEET在干旱和寒冷环境下的表达模式,以期深入探究扁蓿豆SWEET基因家族在非生物胁迫中的作用。结果表明,扁蓿豆SWEET糖转运蛋白家族共有18个成员,都具有典型的MtN3_saliva/PQ-Loop结构域。系统发育分析表明,其可分为4个进化枝,其中CladeⅠ包括MrSWEET1a、-1b、-2a、-2b、-3a、-3b;CladeⅡ包括MrSWEET4~6;CladeⅢ包括MrSWEET9~15,MrSWEET16~17属于CladeⅣ。所有的MrSWEET成员都含有Motif 1、3、4、5,可能与糖转运蛋白的功能有关。MrSWEET基因启动子区域含有多个与光响应、激素响应和非生物胁迫以及植物生长发育有关的功能元件。在干旱(15%PEG6000)和寒冷(4℃)胁迫下,扁蓿豆根部的MrSWEET基因表达水平相对高于叶片,且根部大多数基因在干旱和寒冷胁迫处理6、12 h时表达量最高;干旱处理下,根部的MrSWEET1a和MrSWEET16相对表达量在3、6、12、24 h和7 d时均高于对照,寒冷处理下根部的MrSWEET16表达量以及处理7 d的MrSWEET1a表达量高于对照,说明其可能参与调控扁蓿豆对干旱和寒冷胁迫的响应。
文摘In this article, we investigated the influence of size and initial water content on the effective diffusion coefficient of sweet potatoes samples cut into cubic and cylindrical shapes. The sizes of the cubic samples are 0.5, 1, 1.5, 1.75, 2, 2.5 and 3 cm edge with a respective initial water content of 2.7, 3.76, 3.48, 2.68, 3.28, 2.17 and 2.29 kg/kgms. For cylindrical samples, the radius is set at 0.5 cm and sample heights are 1, 1.5, 2, 2.5, 3, 3.5 and 4 cm with respective water contents of 2.2, 3.19, 2.85, 2.1, 2.17, 2.39 and 2.03 kg/kgms. The effective diffusion coefficients of cubic samples are of the order of 10−10 and 10−9 m2∙s−1 grew with sample edge. As for the cylindrical samples, the effective diffusion coefficients were of the order of 10−9 m2∙s−1 and there was no linear correlation between cylinder height and their effective diffusion coefficient. As for the examination of the initial water content on the effective diffusion coefficient, it turned out that the initial water content had no influence on the effective diffusion coefficient of the sweet potato samples.
文摘SWEET(sugars will eventually be exported transporter)基因家族是一类新型的糖转运蛋白,可顺浓度梯度对糖分进行双向跨膜运输。SWEET在植物光合同化物韧皮部装载、蜜腺花蜜分泌、种子灌浆、花粉发育、病原菌互作、逆境调控等过程中起着关键作用,近年来受到广泛关注。尽管SWEET广泛存在于植物中,但目前对其功能研究主要集中在水稻和拟南芥上。介绍了SWEET基因家族的发现、蛋白结构特征、生理功能及逆境调控的最新研究进展,有助于将来对SWEET基因家族进行更深入和全面的研究。
基金Supported by the National Natural Science Foundation(30670177)Scientific Research Foundation for the Outstanding Young Scientist of Shangdong Province(006BS06002)National Ministry of Education Doctoral Fund(20050445003)~~
文摘[Objective] This study aimed to investigate the salt-tolerance mechanism of sweet potato.[Method]Two sweet potato varieties of Xu 25-2(salt-tolerant cultivar)and Triumph 100(salt-sensitive cultivar)were treated by sodium chloride with the concentration of 0 mmol/L and 100 mmol/L.After 20 days,Na+ content and Na+/K+ ratio in the roots,shoots and leave were determined by the flame photometer,while dry weight and fresh weight of roots,shoots and leave in different varieties were also studied.[Result]The growth of two sweet potato varieties was inhibited under salt stress,so the plant became shorter,leaf and root became fewer,dry weight of roots and leave decreased,but seedlings of Xu 25-2 were inhibited slightly.Furthermore,Na+ content and Na+/K+ ratio in roots,shoots and leaves of two sweet potato varieties increased.Na+ content of salt-tolerant Xu 25-2 was low in roots,shoots and leaves,while Na+ content of salt-sensitive Triumph 100 was high in shoots and leave of seedlings,but the change range of Xu 25-2 was less than that of Triumph 100.[Conclusion]The lower Na+ content and Na+/K+ ratio in leaves under salt stress were the most important characteristics for salt-tolerance of sweet potato varieties.