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基于表型性状和KASP标记的玉米DUS测试品种的聚类分析
被引量:
3
1
作者
王艳平
潘红
+5 位作者
吴燕
王显生
汪鸿星
李华勇
于堃
沈奇
《江苏农业学报》
CSCD
北大核心
2022年第5期1171-1178,共8页
为探讨竞争性等位基因特异性PCR(KASP)标记在玉米DUS(特异性、一致性和稳定性)测试过程中近似品种筛选方面的应用,采用表型和KASP标记对玉米测试品种进行聚类分析。表型的二阶聚类结果显示,315份玉米品种可划分为普通型、甜质型以及糯...
为探讨竞争性等位基因特异性PCR(KASP)标记在玉米DUS(特异性、一致性和稳定性)测试过程中近似品种筛选方面的应用,采用表型和KASP标记对玉米测试品种进行聚类分析。表型的二阶聚类结果显示,315份玉米品种可划分为普通型、甜质型以及糯质型和甜糯混合型3类,“籽粒:类型”性状对聚类结果的影响最大;系统聚类结果显示,单交种和自交系间的分离比较明显,普通型玉米与甜质型、糯质型、甜糯混合型玉米间的分离也较明显,甜质型、糯质型、甜糯混合型玉米三者之间的分离不明显。KASP标记聚类结果显示,自交系与单交种交织在一起,普通型玉米与甜质型、糯质型、甜糯混合型玉米间明显分离,甜质型玉米与糯质型、甜糯混合型玉米间的分离也较明显,糯质型玉米和甜糯混合型玉米相互交织。综上分析可知,在繁殖类型上单交种和自交系表型聚类结果与KASP标记聚类结果不同,而在籽粒类型上2种聚类结果基本吻合。
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关键词
表型
竞争性等位基因特异性PCR(KASP)标记
玉米DUS(特异性、
一致性
和稳定性
)
测试
遗传多样性
下载PDF
职称材料
金针菇品种DUS测试性状的分级与评价
被引量:
9
2
作者
徐珍
章炉军
+6 位作者
尚晓冬
刘建雨
张丹
杨慧
于海龙
张美彦
王瑞娟
《菌物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第5期658-668,共11页
金针菇是著名的食、药两用真菌。以45份金针菇品种为试验材料,对21个性状进行分级与评价,对12个数量性状进行分级,并对其中10个数量性状的相关性和2个数量性状的不同测量部位的影响进行了研究。结果表明:所有性状均适合作为DUS(特异性...
金针菇是著名的食、药两用真菌。以45份金针菇品种为试验材料,对21个性状进行分级与评价,对12个数量性状进行分级,并对其中10个数量性状的相关性和2个数量性状的不同测量部位的影响进行了研究。结果表明:所有性状均适合作为DUS(特异性、一致性和稳定性)测试性状,12个数量性状可分别划分为3–5级;10个数量性状至少与1个其他数量性状显著相关;菌柄由上往下逐渐变粗,不同品种变粗程度略有差异,测量菌柄直径时要求测量菌柄上部1/3处;子实体数量由下往上逐渐减少,不同品种减少程度略有差异,测量子实体数量时要求测量单瓶中长度在基部1/3以上的子实体个数;形态性状的聚类分析结果支持将"菌落:表面色素"、"菌盖:纵切面形状"和"菌盖:表面颜色"作为分组性状。
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关键词
金针菇
特异性
一致性和稳定性测试
数量性状
分级
分组性状
原文传递
题名
基于表型性状和KASP标记的玉米DUS测试品种的聚类分析
被引量:
3
1
作者
王艳平
潘红
吴燕
王显生
汪鸿星
李华勇
于堃
沈奇
机构
江苏省农业科学院种质资源与生物技术研究所
出处
《江苏农业学报》
CSCD
北大核心
2022年第5期1171-1178,共8页
基金
江苏省农业科技自主创新基金项目[CX(20)3142]。
文摘
为探讨竞争性等位基因特异性PCR(KASP)标记在玉米DUS(特异性、一致性和稳定性)测试过程中近似品种筛选方面的应用,采用表型和KASP标记对玉米测试品种进行聚类分析。表型的二阶聚类结果显示,315份玉米品种可划分为普通型、甜质型以及糯质型和甜糯混合型3类,“籽粒:类型”性状对聚类结果的影响最大;系统聚类结果显示,单交种和自交系间的分离比较明显,普通型玉米与甜质型、糯质型、甜糯混合型玉米间的分离也较明显,甜质型、糯质型、甜糯混合型玉米三者之间的分离不明显。KASP标记聚类结果显示,自交系与单交种交织在一起,普通型玉米与甜质型、糯质型、甜糯混合型玉米间明显分离,甜质型玉米与糯质型、甜糯混合型玉米间的分离也较明显,糯质型玉米和甜糯混合型玉米相互交织。综上分析可知,在繁殖类型上单交种和自交系表型聚类结果与KASP标记聚类结果不同,而在籽粒类型上2种聚类结果基本吻合。
关键词
表型
竞争性等位基因特异性PCR(KASP)标记
玉米DUS(特异性、
一致性
和稳定性
)
测试
遗传多样性
Keywords
phenotype
kompetitive allele-specific PCR(KASP)markers
maize distinctness,uniformity and stability(DUS)test
genetic diversity
分类号
S513.01 [农业科学—作物学]
下载PDF
职称材料
题名
金针菇品种DUS测试性状的分级与评价
被引量:
9
2
作者
徐珍
章炉军
尚晓冬
刘建雨
张丹
杨慧
于海龙
张美彦
王瑞娟
机构
上海市农业科学院食用菌研究所上海市农业遗传育种重点开放实验室农业部南方食用菌资源利用重点实验室国家食用菌工程技术研究中心
出处
《菌物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第5期658-668,共11页
基金
农业部品种资源保护项目[农财发(2015)11号]
上海市食用菌产业技术体系建设专项资金[沪农科产字(2019)第9号]~~
文摘
金针菇是著名的食、药两用真菌。以45份金针菇品种为试验材料,对21个性状进行分级与评价,对12个数量性状进行分级,并对其中10个数量性状的相关性和2个数量性状的不同测量部位的影响进行了研究。结果表明:所有性状均适合作为DUS(特异性、一致性和稳定性)测试性状,12个数量性状可分别划分为3–5级;10个数量性状至少与1个其他数量性状显著相关;菌柄由上往下逐渐变粗,不同品种变粗程度略有差异,测量菌柄直径时要求测量菌柄上部1/3处;子实体数量由下往上逐渐减少,不同品种减少程度略有差异,测量子实体数量时要求测量单瓶中长度在基部1/3以上的子实体个数;形态性状的聚类分析结果支持将"菌落:表面色素"、"菌盖:纵切面形状"和"菌盖:表面颜色"作为分组性状。
关键词
金针菇
特异性
一致性和稳定性测试
数量性状
分级
分组性状
Keywords
Flammulina filiformis
distinctness
uniformity and stability testing
quantitative characteristics
grade
grouping characteristics
分类号
S646.15 [农业科学—蔬菜学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于表型性状和KASP标记的玉米DUS测试品种的聚类分析
王艳平
潘红
吴燕
王显生
汪鸿星
李华勇
于堃
沈奇
《江苏农业学报》
CSCD
北大核心
2022
3
下载PDF
职称材料
2
金针菇品种DUS测试性状的分级与评价
徐珍
章炉军
尚晓冬
刘建雨
张丹
杨慧
于海龙
张美彦
王瑞娟
《菌物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2019
9
原文传递
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