三代全长高通量测序分析新稻草和陈稻草的微生物特征

通过传统培养法和三代全长高通量测序技术分析高温大曲培菌发酵过程中使用的新、陈稻草的微生物组成和代谢通路的差异。结果表明,陈稻草样品中菌落总数、耐热菌和真菌数量显著高于新稻草(P<0.05)。两种稻草的群落结构存在差异,主要体现在细菌群落,新稻草中主要优势细菌属为泛菌属(Pantoea)和伯克霍尔德菌属(Burkholderia),而陈稻草为芽孢杆菌属(Bacillus)和糖多孢菌(Saccharopolyspora)。四折叠球菌属(Quadrisphaera)、微杆菌属(Microbacterium)、曲霉属(Aspergillus)、孢堆黑粉菌属(Sporisorium)等是新稻草中的标志菌属,而糖多孢菌属(Saccharopolyspora)、变形闭囊鞘属(Chromocleista)和节担菌属(Wallemia)等是陈稻草中的标志菌属。新稻草中的细菌在L-色氨酸生物合成、L-精氨酸/腐胺/4-氨基丁酸降解和甲基乙二醛降解所占功能丰度更高,而陈稻草中的真菌在辛烷氧化、L-色氨酸降解和硝酸盐还原途径中的功能丰度更高。

妊娠期糖尿病孕妇个体化饮食干预前后肠道菌群的对比

目的利用16S rDNA全长高通量测序技术,探索妊娠期糖尿病(gestational diabetes mellitus,GDM)孕妇饮食干预前后肠道菌群的变化及与口服葡萄糖耐量试验(oral glucose tolerance test,OGTT)结果的相关性。方法选取2022年7月至2023年3月在新疆医科大学第一附属医院定期产检的孕妇30例,根据24~28周OGTT结果,分为研究组(15例)和正常组(15例)。收集其一般资料和实验室相关检查指标,同时对研究组孕妇进行个体化饮食干预,对正常组孕妇给予常规饮食指导干预,干预时间均为2周,分别收集两组干预前、后的粪便,共收集到60份粪便样本。通过PacBio测序平台,利用单分子实时测序对受试者粪便DNA进行第三代微生物16S rDNA全长多样性测序,比较两组干预前、后肠道菌群的结构、丰度及多样性。结果两组孕妇的菌群丰度有显著差异的物种共有74种,其中54种在研究组中富集。纳入OGTT结果作为环境因子进行相关性分析显示,毛螺菌(P=0.002)和未分类的细菌(P=0.035)与OGTT 0 h血糖呈正相关,差异有统计学意义(P<0.05);厚壁菌(P=0.018)、颤螺菌(P=0.045)与OGTT 0 h血糖呈负相关,差异有统计学意义(P<0.05);毛螺菌(P=0.027)、未分类的细菌(P=0.028)与OGTT 1 h血糖呈正相关,差异有统计学意义(P<0.05),颤螺菌与OGTT 1 h血糖呈负相关(P=0.025),差异有统计学意义(P<0.05);毛螺菌(P=0.027)与OGTT 2 h血糖呈正相关,差异有统计学意义(P<0.05)。结论GDM孕妇经过个体化饮食干预后,肠道菌群中的优势菌发生了改变,GDM孕妇空腹血糖较干预前降低,由此可推断GDM孕妇可通过个体化饮食干预调节紊乱的肠道菌群,这一发现为饮食干预治疗妊娠期糖尿病提供有力的支持。