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4,5,6-三取代嘧啶苯磺酰脲类化合物的生物活性、分子对接与3D-QSAR关系研究
被引量:
7
1
作者
郭万成
马翼
+2 位作者
李永红
王素华
李正名
《化学学报》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2009年第6期569-574,共6页
用柔性分子对接方法(FlexX)将15个4,5,6-三取代嘧啶苯磺酰脲化合物以及3个不含5-位取代嘧啶苯磺酰脲化合物(分别为4,6-双取代嘧啶和4-取代嘧啶)和乙酰羟酸合成酶(AHAS)活性口袋进行了对接,对接程序预测的抑制剂和酶之间的相互作用能与...
用柔性分子对接方法(FlexX)将15个4,5,6-三取代嘧啶苯磺酰脲化合物以及3个不含5-位取代嘧啶苯磺酰脲化合物(分别为4,6-双取代嘧啶和4-取代嘧啶)和乙酰羟酸合成酶(AHAS)活性口袋进行了对接,对接程序预测的抑制剂和酶之间的相互作用能与抑制活性之间有一定的相关性,相关系数为0.660.然后采用比较分子相似性指数分析(CoMSIA)对27个新型4,5,6-三取代嘧啶苯磺酰脲类化合物的除草活性进行三维定量构效关系(3D-QSAR)研究.建立了三维定量构效关系CoMSIA模型,立体场、静电场和氢键的贡献分别为47.3%,32.8%,19.9%.交叉验证系数q2值为0.520.根据CoMSIA模型的立体场、静电场、氢键给体场三维等值线图不仅直观地解释了结构与活性的关系,并且与用FlexX预测的结合模式相一致,证明了我们预测的结合模式是可靠的,为进一步设计高活性的标题化合物提供较好的理论指导.
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关键词
分子对接
乙
酰
羟酸合成酶
比较分子相似性指数分析
三
维定量构效关系
三取代嘧啶苯磺酰脲
除草活性
原文传递
新三取代嘧啶苯磺酰脲衍生物除草活性的QSAR
被引量:
4
2
作者
李鸣建
冯长君
《华中科技大学学报(自然科学版)》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2011年第3期128-132,共5页
利用MOPAC-AM1方法计算了23种新三取代嘧啶苯磺酰脲衍生物的28个量化参数.基于这些参数,运用最佳变量子集回归方法建立新三取代嘧啶苯磺酰脲衍生物对油菜和反枝苋的除草活性(Bf和Af)的三参数(Hf,Q17,Q21)回归方程,相应复相关系数(R2)、...
利用MOPAC-AM1方法计算了23种新三取代嘧啶苯磺酰脲衍生物的28个量化参数.基于这些参数,运用最佳变量子集回归方法建立新三取代嘧啶苯磺酰脲衍生物对油菜和反枝苋的除草活性(Bf和Af)的三参数(Hf,Q17,Q21)回归方程,相应复相关系数(R2)、去一法(LOO)交互检验复相关系数(Q2)分别为0.876,0.808和0.864,0.799,表明所建立的定量结构/活性关系(QSAR)模型具有良好的稳定性和预测能力.根据许禄规则和Andrea规则得到网络结构为3∶3∶1,Bf-BP和Af-BP模型的相关系数分别为0.995和0.997,显示了非常好的非线性关系.
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关键词
三取代嘧啶苯磺酰脲
量化参数
油菜
反枝苋
除草活性
多元线性回归
反向传播算法
原文传递
题名
4,5,6-三取代嘧啶苯磺酰脲类化合物的生物活性、分子对接与3D-QSAR关系研究
被引量:
7
1
作者
郭万成
马翼
李永红
王素华
李正名
机构
南开大学元素有机化学研究所元素有机化学国家重点实验室
出处
《化学学报》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2009年第6期569-574,共6页
基金
国家自然科学基金(No.20432010)
天津市应用基础研究计划(No.07JCYBJC00200)资助项目
文摘
用柔性分子对接方法(FlexX)将15个4,5,6-三取代嘧啶苯磺酰脲化合物以及3个不含5-位取代嘧啶苯磺酰脲化合物(分别为4,6-双取代嘧啶和4-取代嘧啶)和乙酰羟酸合成酶(AHAS)活性口袋进行了对接,对接程序预测的抑制剂和酶之间的相互作用能与抑制活性之间有一定的相关性,相关系数为0.660.然后采用比较分子相似性指数分析(CoMSIA)对27个新型4,5,6-三取代嘧啶苯磺酰脲类化合物的除草活性进行三维定量构效关系(3D-QSAR)研究.建立了三维定量构效关系CoMSIA模型,立体场、静电场和氢键的贡献分别为47.3%,32.8%,19.9%.交叉验证系数q2值为0.520.根据CoMSIA模型的立体场、静电场、氢键给体场三维等值线图不仅直观地解释了结构与活性的关系,并且与用FlexX预测的结合模式相一致,证明了我们预测的结合模式是可靠的,为进一步设计高活性的标题化合物提供较好的理论指导.
关键词
分子对接
乙
酰
羟酸合成酶
比较分子相似性指数分析
三
维定量构效关系
三取代嘧啶苯磺酰脲
除草活性
Keywords
molecular docking
AHAS
CoMSIA
3D-QSAR
N-(trisubstituted pyrimidin-2-yl)-N′-benzenesulfonylurea
herbicidal activity
分类号
TQ450.1 [化学工程—农药化工]
原文传递
题名
新三取代嘧啶苯磺酰脲衍生物除草活性的QSAR
被引量:
4
2
作者
李鸣建
冯长君
机构
徐州工程学院化学化工学院
出处
《华中科技大学学报(自然科学版)》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2011年第3期128-132,共5页
基金
国家自然科学基金资助项目(21075138)
江苏省高校自然科学基金资助项目(08KJD610003)
+1 种基金
徐州工程学院培育课题资助项目(XKY2008313
XKY2009208)
文摘
利用MOPAC-AM1方法计算了23种新三取代嘧啶苯磺酰脲衍生物的28个量化参数.基于这些参数,运用最佳变量子集回归方法建立新三取代嘧啶苯磺酰脲衍生物对油菜和反枝苋的除草活性(Bf和Af)的三参数(Hf,Q17,Q21)回归方程,相应复相关系数(R2)、去一法(LOO)交互检验复相关系数(Q2)分别为0.876,0.808和0.864,0.799,表明所建立的定量结构/活性关系(QSAR)模型具有良好的稳定性和预测能力.根据许禄规则和Andrea规则得到网络结构为3∶3∶1,Bf-BP和Af-BP模型的相关系数分别为0.995和0.997,显示了非常好的非线性关系.
关键词
三取代嘧啶苯磺酰脲
量化参数
油菜
反枝苋
除草活性
多元线性回归
反向传播算法
Keywords
trisubstituted pyrimidine phenylsulfonylurea; quantum chemistry parameter; Brassicanapus; Amaranthus retroflexus L.; herbicidal activity; multiple linear regression equation; back-propagation (BP) algorithm;
分类号
O641.121 [理学—物理化学]
O625.756 [理学—有机化学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
4,5,6-三取代嘧啶苯磺酰脲类化合物的生物活性、分子对接与3D-QSAR关系研究
郭万成
马翼
李永红
王素华
李正名
《化学学报》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2009
7
原文传递
2
新三取代嘧啶苯磺酰脲衍生物除草活性的QSAR
李鸣建
冯长君
《华中科技大学学报(自然科学版)》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2011
4
原文传递
已选择
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