基于PacBio的三代测序的三七基因组测序分析

目的丰富三七的基因组信息,为三七的开发利用提供依据。方法通过采摘新鲜的3年生三七叶,利用PacBio Sequel平台进行三七的基因组测序。结果在PacBio Sequel平台测得读取聚合酶729094个,总数据共25.80 GB。通过NT和NR注释,发现三七基因与胡萝卜、葡萄、芝麻、咖啡的相似比分别为:54.77%、6.22%、2.21%、2.18%。KOG发现一般功能预测所占基因数最多,达6545;其次为信号转导基因,达4437。KEGG发现三七中参与代谢的基因最多,达14064。通过SwissPort注释发现NR所特有的基因最多,达1279;KOG最少,仅为3。结论通过对三七叶的三代测序,有利于对三七进一步开发与利用,为三七的基因组研究奠定了基础,也为中药材现代化提供一定的帮助。