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题名求解非格点模型的蛋白质结构预测问题的拟物拟人算法
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作者
刘景发
黄文奇
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机构
华中科技大学计算机学院
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出处
《小型微型计算机系统》
CSCD
北大核心
2006年第10期1889-1892,共4页
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基金
国家"九七三"项目(2004CB318000)资助
国家自然科学基金项目(10471051)资助.
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文摘
本文研究了一个具有两种氨基酸(疏水氨基酸和亲水氨基酸)的三维非格点的蛋白质模型.受物理世界的物体间相互作用的规律和人类社会生活经验的启发,给出了该模型蛋白质结构预测问题的拟物拟人算法.计算结果表明被提出的方法在非格点的蛋白质模型上是有效的.与文献中给出的所有算例的结果相比,无论是在最低能量值还是在计算时间上,本文算法都要好.对于这些算例中规模最大的3个,还找到了与文献中结构完全不同的最低能量构形.
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关键词
蛋白质结构预测
三维非格点模型
拟物拟人算法
NP难度问题
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Keywords
protein structure prediction
3D off-lattice model
quasi-physical and quasi-human algorithm
NP hard problem
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分类号
TP301.6
[自动化与计算机技术—计算机系统结构]
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题名基于NCEP资料的对流层低仰角折射剖面建模研究
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作者
李栩晗
邵逸瑄
李颖珊
苏思琦
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机构
南京信息工程大学数学与统计学院
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出处
《科教导刊(电子版)》
2020年第12期289-290,共2页
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基金
2019年度江苏省高等学校大学生创新创业训练计划项目"基于NCEP资料的对流层低仰角折射剖面建模研究"(NO.201910300103Y)。
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文摘
由于大气中对流层存在大气电特性的不均匀性引起大气的折射效应,影响到高空中的卫星向地面数据通信,从而对我们生活中的实际应用产生了影响。本文根据NCEP资料,利用温度、湿度、气压等各种大气参数数据以及Thayer方法建立了折射剖面模型——三维格点模型。该模型不仅可以给出水平梯度,而且还能反映出不同高度的水平梯度的变化,以及不同地区折射率的水平梯度的变化规律,可以进一步大大提高大气折射剖面的准确度,并且精准地确定出无线电波在其中传播的射线路径,从而可以提高无线电波在对流层空间的传播数据精度。随后,利用所得模型进行应用实践,选取青岛地区作为研究对象,收集了其2007年至2009年总共三年的数据资料,利用公式将水汽压。和高度单位转换得到并计算出对流层折射指数,最后得到了不同层的气压层的折射指数与地面折射指数的具体关系,为解决实际应用问题提供了新思路。
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关键词
NCEP资料
对流层
折射指数
三维格点模型
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分类号
P421
[天文地球—大气科学及气象学]
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题名预测蛋白质结构拟物算法的研究与改进
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作者
李明
苏显中
于敏
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机构
中国矿业大学化工学院生物工程系
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出处
《计算机工程与应用》
CSCD
北大核心
2010年第26期209-211,共3页
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基金
教育部留学回国人员科研启动基金
徐州市科技计划项目No.XM08C094~~
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文摘
研究了具有两种氨基酸(疏水氨基酸和亲水氨基酸)的三维非格点的蛋白质模型。给出了该模型蛋白质结构预测问题改进的拟物算法。氨基酸链的初始设置由完全随机改为随机线形结构,并找到了更优的计算参数。结果对于三个氨基酸链都找到了更好的最低势能值。
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关键词
蛋白质结构预测
拟物算法
三维非格点模型
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Keywords
protein structure prediction
quasi-physical algorithm
3D off-lattice model
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分类号
Q518.2
[生物学—生物化学]
TP301
[自动化与计算机技术—计算机系统结构]
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