药物设计中的三维结构搜索方法

利用分子的三维特征，在三维结构数据库中进行三维结构搜索的方法是一种发现先导化合物的快捷而有效的方法，已经得到了广泛的重视。本文综述了三维结构搜索方法的原理、发展及其近年来在药物分子设计中的应用。

3DFS:用于药物设计的三维结构柔性搜索系统

在三维结构数据库中搜索含有某种药效团的分子的三维结构搜索法已经成为新药研制的重要手段，近年已有了广泛的发展。３ＤＦＳ是我室研制的用于药物分子设计的三维结构柔性搜索系统，该系统支持由化学功能基团定义的药效团，并详细定义了氢键给体、氢键受体、电荷中心、疏水区等重要化学功能基团的结构类型，并且具有三维构象柔性搜索功能。

计算机药物设计方法简述

简要介绍了计算机药物设计的方法 -三维结构搜索法 ,主要是包括常用的三维结构数据库及其搜索程序 。

柔性构象搜索:遗传算法与POWELL优化法的比较

在三维结构搜索中采用何种算法作构象搜索对系统的搜索速度和命中率有极大的影响。本文在自行研制的三维结构搜索系统３ＤＦＳ的基础上对遗传算法和ＰＯＷＥＬＬ法的构象搜索能力进行了比较。五个典型药效团的搜索结果表明，两种算法在速度和优化能力上各有优势，应视系统的要求区别使用。