肽链的刚性结构对氮-(ω-三甲基硅甲基)聚肽链邻苯二甲酰胺单电子转移环化反应的影响

在光诱导下,激发态的氮-(ω-三甲基硅甲基)聚肽链邻苯二甲酰胺经单电子转移形成1,ω-双自由基,其耦合形成聚肽环化物。1,ω-双自由基的1位和ω位间距离与环化物的产率有关:距离愈大,自由基碰撞机率越小,环化物产率越低。肽链的刚性弯曲结构使双自由基1位和ω位的距离呈不规则的变化,从而使聚肽环化物的产率呈不规则的变化。

蛋白质二级结构的条件隐Markov性及其预测问题

蛋白质二级结构预测问题自1957年首次被提出迄今已有40多年了,从知道的文献中可以得出如下信息:在统计意义之下,蛋白质序列中氨基酸之间的相互作用较弱,所以,统计方法中所依赖的独立性假设虽然不是从物理背景中得来的,但的确有其合理性和方便之处;交互信息准则优于均方误差准则;信息和统计的思想和方法在预测二级结构中不可低估;加入蛋白质的一级结构之外的信息可帮助提高二级结构预测的精度;而直接从一级结构出发无附加信息的情况下预测二级结构,现存在的预测方法的预测精度仍然无较大突破;预测精度和所使用的蛋白质样本序列在总体样本中的覆盖率,是评估各种预测方法的有效性的两个重要指标。本文作者建立了一个集蛋白质一、二级结构为一体联合结构模型,并将上述信息囊括在其中。由该模型首先得到蛋白质一、二级结构的信息与统计特性,然后利用这些特性分别对蛋白质一、二级结构中各种变量的信息传递关系及隐Markov性进行定量分析和确切地统计描述。最后给出直接从一级结构出发预测二级结构的几个原则。