乙型肝炎病毒(hepatitis B virus,HBV)感染仍然是全世界主要的健康负担。它可以引起不同程度的肝损伤,并与肝硬化和肝细胞癌的发展密切相关。由于HBV独特、复杂的基因组和复制模式,使其难以从体内被彻底清除。目前,α干扰素仍然是抗HBV...乙型肝炎病毒(hepatitis B virus,HBV)感染仍然是全世界主要的健康负担。它可以引起不同程度的肝损伤,并与肝硬化和肝细胞癌的发展密切相关。由于HBV独特、复杂的基因组和复制模式,使其难以从体内被彻底清除。目前,α干扰素仍然是抗HBV的一线药物之一,其可通过诱导干扰素刺激基因来发挥抗HBV作用。越来越多的研究发现三重基序蛋白(tripartite motif-containing proteins,TRIM)的家族成员与HBV的发生、发展密切相关,并且部分TRIM蛋白可被α干扰素诱导,凭借其特殊的结构和功能可发挥对HBV的抑制作用。因此,现对具有抗HBV作用的TRIM进行综述,以期为HBV的清除和治疗提供新思路。展开更多
目的研究根皮苷对食管癌细胞系表达谱的影响,探索根皮苷作用于食管癌细胞系的信号通路及其潜在功能。方法使用根皮苷处理人食管癌KYSE450细胞,提取总RNA并建立测序文库,进行转录组测序;使用DESeq2程序鉴定差异表达基因,对差异表达基因...目的研究根皮苷对食管癌细胞系表达谱的影响,探索根皮苷作用于食管癌细胞系的信号通路及其潜在功能。方法使用根皮苷处理人食管癌KYSE450细胞,提取总RNA并建立测序文库,进行转录组测序;使用DESeq2程序鉴定差异表达基因,对差异表达基因进行基因本体(gene ontology,GO)功能及京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)通路富集分析;使用MCODE进行差异基因核心模块筛选,使用GEPIA数据库分析核心模块中的基因对食管癌生存的影响;使用TIMER在线分析根皮苷对食管癌组织免疫细胞浸润的影响。结果转录组测序结果显示,根皮苷处理后的食管癌细胞具有4602个差异表达基因,其中2407个为上调基因,2195个为下调基因。通路富集分析显示,根皮苷对蛋白质加工、胰岛素抵抗、基因复制和细胞周期等信号通路产生影响。在差异表达基因核心模块中,E3泛素蛋白连接酶2(E3 ubiquitin ligase mind bomb 2,MIB2)高表达可降低食管癌患者的总体生存率;环指蛋白19B(ring finger protein19B,RNF19B)、三重基序蛋白69(tripartite motif-containing protein 69,TRIM69)、泛素连接酶(ubiquitin conjugating enzyme,UBC)和克隆E3泛素连接酶(homologous to the E6-associated protein carboxyl terminus domain containing 2,HECTD2)的表达水平可影响食管癌癌组织的纯度以及免疫细胞浸润的类型。结论根皮苷可影响食管癌细胞的转录谱,其差异表达基因主要集中在细胞生长相关的信号通路。展开更多
文摘乙型肝炎病毒(hepatitis B virus,HBV)感染仍然是全世界主要的健康负担。它可以引起不同程度的肝损伤,并与肝硬化和肝细胞癌的发展密切相关。由于HBV独特、复杂的基因组和复制模式,使其难以从体内被彻底清除。目前,α干扰素仍然是抗HBV的一线药物之一,其可通过诱导干扰素刺激基因来发挥抗HBV作用。越来越多的研究发现三重基序蛋白(tripartite motif-containing proteins,TRIM)的家族成员与HBV的发生、发展密切相关,并且部分TRIM蛋白可被α干扰素诱导,凭借其特殊的结构和功能可发挥对HBV的抑制作用。因此,现对具有抗HBV作用的TRIM进行综述,以期为HBV的清除和治疗提供新思路。
文摘目的研究根皮苷对食管癌细胞系表达谱的影响,探索根皮苷作用于食管癌细胞系的信号通路及其潜在功能。方法使用根皮苷处理人食管癌KYSE450细胞,提取总RNA并建立测序文库,进行转录组测序;使用DESeq2程序鉴定差异表达基因,对差异表达基因进行基因本体(gene ontology,GO)功能及京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)通路富集分析;使用MCODE进行差异基因核心模块筛选,使用GEPIA数据库分析核心模块中的基因对食管癌生存的影响;使用TIMER在线分析根皮苷对食管癌组织免疫细胞浸润的影响。结果转录组测序结果显示,根皮苷处理后的食管癌细胞具有4602个差异表达基因,其中2407个为上调基因,2195个为下调基因。通路富集分析显示,根皮苷对蛋白质加工、胰岛素抵抗、基因复制和细胞周期等信号通路产生影响。在差异表达基因核心模块中,E3泛素蛋白连接酶2(E3 ubiquitin ligase mind bomb 2,MIB2)高表达可降低食管癌患者的总体生存率;环指蛋白19B(ring finger protein19B,RNF19B)、三重基序蛋白69(tripartite motif-containing protein 69,TRIM69)、泛素连接酶(ubiquitin conjugating enzyme,UBC)和克隆E3泛素连接酶(homologous to the E6-associated protein carboxyl terminus domain containing 2,HECTD2)的表达水平可影响食管癌癌组织的纯度以及免疫细胞浸润的类型。结论根皮苷可影响食管癌细胞的转录谱,其差异表达基因主要集中在细胞生长相关的信号通路。