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四种三齿线虫核糖体ITS序列的比较分析及亲缘关系探讨
被引量:
6
1
作者
段红
高俊峰
+4 位作者
刘泽轩
刘宇婷
齐珊珊
李荣
王春仁
《黑龙江八一农垦大学学报》
2015年第4期54-57,共4页
对短尾三齿线虫(Triodontophorus brevicauda)、锯齿三齿线虫(T.serratus)、小三齿线虫(T.minor)和日本三齿线虫(T.nipponicus)核糖体内转录间隔区(ITS)序列进行扩增、测序和比较分析。基于ITS序列,采用最大似然法(ML)构建...
对短尾三齿线虫(Triodontophorus brevicauda)、锯齿三齿线虫(T.serratus)、小三齿线虫(T.minor)和日本三齿线虫(T.nipponicus)核糖体内转录间隔区(ITS)序列进行扩增、测序和比较分析。基于ITS序列,采用最大似然法(ML)构建系统发生树,分析4种三齿线虫与其他圆线虫的亲缘关系。结果 4种三齿线虫ITS1、5.8S和ITS2序列大小分别为370~376 bp、153 bp和322~334 bp;4种虫体ITS1核苷酸同源性为88.4%~100%,5.8S为100%,ITS2为82.9%~97.8%;进化树中盅口科线虫和圆形科线虫各形成一个大的分支,但盅口科中微小杯环线虫聚集在圆形科这一分支中;小三齿线虫与日本三齿线虫,短尾三齿线虫与锯齿三齿线虫各形成一小的分支,两两亲缘关系较近,4种三齿线虫与盆口属和食道齿属的关系较圆线属近研究结果可为三齿线虫的遗传进化和分子鉴定提供参考。
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关键词
三齿属线虫
核糖体内转录间隔区序列
序列分析
进化分析
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职称材料
题名
四种三齿线虫核糖体ITS序列的比较分析及亲缘关系探讨
被引量:
6
1
作者
段红
高俊峰
刘泽轩
刘宇婷
齐珊珊
李荣
王春仁
机构
黑龙江八一农垦大学动物科技学院
黑龙江省兽医科学研究所
出处
《黑龙江八一农垦大学学报》
2015年第4期54-57,共4页
基金
黑龙江八一农垦大学研究生创新科研项目(YJSCX-Y2015-18)
黑龙江八一农垦大学省级重点实验室开放项目(AMKL201304)
文摘
对短尾三齿线虫(Triodontophorus brevicauda)、锯齿三齿线虫(T.serratus)、小三齿线虫(T.minor)和日本三齿线虫(T.nipponicus)核糖体内转录间隔区(ITS)序列进行扩增、测序和比较分析。基于ITS序列,采用最大似然法(ML)构建系统发生树,分析4种三齿线虫与其他圆线虫的亲缘关系。结果 4种三齿线虫ITS1、5.8S和ITS2序列大小分别为370~376 bp、153 bp和322~334 bp;4种虫体ITS1核苷酸同源性为88.4%~100%,5.8S为100%,ITS2为82.9%~97.8%;进化树中盅口科线虫和圆形科线虫各形成一个大的分支,但盅口科中微小杯环线虫聚集在圆形科这一分支中;小三齿线虫与日本三齿线虫,短尾三齿线虫与锯齿三齿线虫各形成一小的分支,两两亲缘关系较近,4种三齿线虫与盆口属和食道齿属的关系较圆线属近研究结果可为三齿线虫的遗传进化和分子鉴定提供参考。
关键词
三齿属线虫
核糖体内转录间隔区序列
序列分析
进化分析
Keywords
Triodontophorus
ITS rDNA sequence
sequence analysis
phylogenetic relationship
分类号
S855.91 [农业科学—临床兽医学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
四种三齿线虫核糖体ITS序列的比较分析及亲缘关系探讨
段红
高俊峰
刘泽轩
刘宇婷
齐珊珊
李荣
王春仁
《黑龙江八一农垦大学学报》
2015
6
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