《中国医药科学》讯（中科院）1月13日，美国《神经元》（Neuron）杂志发表了中国科学院上海生命科学研究院神经科学研究所张旭研究员和生物化学与细胞生物学研究所鲍岚研究员领导的科研团队的研究成果--“Facilitation of μ-opioid re...《中国医药科学》讯（中科院）1月13日，美国《神经元》（Neuron）杂志发表了中国科学院上海生命科学研究院神经科学研究所张旭研究员和生物化学与细胞生物学研究所鲍岚研究员领导的科研团队的研究成果--“Facilitation of μ-opioid receptor activity by preventing δ-opioid receptor-mediated co-degradation”。展开更多
中国科学院上海生命科学研究院谢东研究组最新研究论文，以Cilia loss sensitizes cells to transformationby activating the mevalonate pathway为题，在线发表在《Journal of Experimental Medicine》上，研究揭示纤毛丢失在肿瘤代...中国科学院上海生命科学研究院谢东研究组最新研究论文，以Cilia loss sensitizes cells to transformationby activating the mevalonate pathway为题，在线发表在《Journal of Experimental Medicine》上，研究揭示纤毛丢失在肿瘤代谢及细胞转化中的重要作用。展开更多
10月9日,国际学术期刊《细胞通讯》(Cell Reports)在线发表了中国科学院上海生命科学研究院(营养与健康研究院)计算生物学研究所韩敬东研究组的论文“Accurate Drug Reposition through Non-Tissue Specific Core Signatures from Cance...10月9日,国际学术期刊《细胞通讯》(Cell Reports)在线发表了中国科学院上海生命科学研究院(营养与健康研究院)计算生物学研究所韩敬东研究组的论文“Accurate Drug Reposition through Non-Tissue Specific Core Signatures from Cancer Transcriptomes”。该研究通过从多组织的癌症基因组学数据构建非组织特异性的基因突变的核心标签,并与药物基因组学数据整合,构建了药物-基因靶定模式和药物特异性的评估方法,为靶点预测及药物重定位研究提供了新视角。针对药物重定位的大规模实验筛选常常被局限在基于体外细胞或非人模式动物的环境下进行,缺少对真实人体情况的反映。基于细胞实验的筛选结果通常带有细胞系特异性,而且所能研究的靶点数目有限。在该研究中,研究人员构建了基于人体内环境的无细胞或组织特异性偏好的高通量药物靶基因的计算筛选方法,从TCGA癌症数据库中提取了8476个人类编码基因的单基因突变的、非组织特异性的“转录组核心标签”并将癌症背景予以去除,从而构建了全基因组水平的单基因靶点的筛选体系;并开发了“核心标签-药物-基因相互作用”(core-signature Drug-to-Gene,csD2G)算法,用这8476个转录组核心标签分别扫描3546个药物处理转录组标签来预测药物重定位新靶点,并且构建药物-靶点特异性评估体系,为1938个药物和3758个基因筛选出179004个高特异性的药物-基因靶向关系。在靶点预测的覆盖率和特异性上,csD2G优于体外细胞实验基因干扰标签、L1000实验标签的药物-靶点预测以及现存的药物重定位算法。展开更多
中国科学院上海生命科学研究院营养科学研究所陈雁研究组完成的一项关于细胞外信号调节激酶（extracellular signal—regulated protein kinase，ERK）信号通路调控的最新研究成果，日前刊登在国际权威学术刊物《美国国学科学院院刊》...中国科学院上海生命科学研究院营养科学研究所陈雁研究组完成的一项关于细胞外信号调节激酶（extracellular signal—regulated protein kinase，ERK）信号通路调控的最新研究成果，日前刊登在国际权威学术刊物《美国国学科学院院刊》上。专家认为，该研究为未来研究肿瘤细胞过度增生的分子机理，进而治疗癌症提供了新思路和新靶点。展开更多
文摘《中国医药科学》讯（中科院）1月13日，美国《神经元》（Neuron）杂志发表了中国科学院上海生命科学研究院神经科学研究所张旭研究员和生物化学与细胞生物学研究所鲍岚研究员领导的科研团队的研究成果--“Facilitation of μ-opioid receptor activity by preventing δ-opioid receptor-mediated co-degradation”。
文摘中国科学院上海生命科学研究院谢东研究组最新研究论文，以Cilia loss sensitizes cells to transformationby activating the mevalonate pathway为题，在线发表在《Journal of Experimental Medicine》上，研究揭示纤毛丢失在肿瘤代谢及细胞转化中的重要作用。
文摘10月9日,国际学术期刊《细胞通讯》(Cell Reports)在线发表了中国科学院上海生命科学研究院(营养与健康研究院)计算生物学研究所韩敬东研究组的论文“Accurate Drug Reposition through Non-Tissue Specific Core Signatures from Cancer Transcriptomes”。该研究通过从多组织的癌症基因组学数据构建非组织特异性的基因突变的核心标签,并与药物基因组学数据整合,构建了药物-基因靶定模式和药物特异性的评估方法,为靶点预测及药物重定位研究提供了新视角。针对药物重定位的大规模实验筛选常常被局限在基于体外细胞或非人模式动物的环境下进行,缺少对真实人体情况的反映。基于细胞实验的筛选结果通常带有细胞系特异性,而且所能研究的靶点数目有限。在该研究中,研究人员构建了基于人体内环境的无细胞或组织特异性偏好的高通量药物靶基因的计算筛选方法,从TCGA癌症数据库中提取了8476个人类编码基因的单基因突变的、非组织特异性的“转录组核心标签”并将癌症背景予以去除,从而构建了全基因组水平的单基因靶点的筛选体系;并开发了“核心标签-药物-基因相互作用”(core-signature Drug-to-Gene,csD2G)算法,用这8476个转录组核心标签分别扫描3546个药物处理转录组标签来预测药物重定位新靶点,并且构建药物-靶点特异性评估体系,为1938个药物和3758个基因筛选出179004个高特异性的药物-基因靶向关系。在靶点预测的覆盖率和特异性上,csD2G优于体外细胞实验基因干扰标签、L1000实验标签的药物-靶点预测以及现存的药物重定位算法。
文摘中国科学院上海生命科学研究院营养科学研究所陈雁研究组完成的一项关于细胞外信号调节激酶（extracellular signal—regulated protein kinase，ERK）信号通路调控的最新研究成果，日前刊登在国际权威学术刊物《美国国学科学院院刊》上。专家认为，该研究为未来研究肿瘤细胞过度增生的分子机理，进而治疗癌症提供了新思路和新靶点。
