PAM细胞中猪MMP14不同转录本检测及其生物信息学分析

基质金属蛋白酶14(MMP14)是基质金属蛋白酶家族中首个被发现的膜型基质金属蛋白酶。MMP14蛋白能水解多种细胞外基质组分和血清蛋白,促进细胞外基质降解,并可水解细胞因子、趋化因子和生长因子等。研究发现猪肺泡巨噬细胞(PAM)中存在2种猪MMP14转录本,利用荧光定量PCR技术检测了PRRSV感染的猪PAM细胞中猪MMP14基因不同转录本的表达水平变化,发现PRRSV感染后导致转录本NM_214239.2显著下调表达(P<0.05),而转录本XM_021098303.1极显著上调表达(P<0.01)。通过生物信息学分析发现,2种转录本编码的蛋白前肽区序列存在明显差异。XM_021098303.1编码的蛋白比NM_214239.2编码的蛋白序缺少了RRKR基序和PG_binding_1功能区,可能导致MMP14蛋白不具有功能活性。推测PRRSV感染后抑制MMP14活性,与PRRSV刺激细胞因子与趋化因子的大量表达相关。然而,MMP14在PRRSV感染中的具体作用还有待进一步研究。