个体供血者丙型肝炎病毒基因亚型分析

对血清抗-HCV阳性的65名个体供血者进行血清HCV-RNA检测,并作HCV基因分型,结果发现其中60例为HCV-RNA阳性,且均为HCV-Ⅱ型,提示本组个体供血者中以HCV-Ⅱ型为感染优势株。通过对HCV5＇-非编码区基因PCR为基础的核酸内切酶分型法和HCV核心区基因PCR直接分型法的比较发现,前者在敏感性及经济、简便等方面优于后者。

云南地区丙型肝炎病毒基因亚型及RNA载量在丙型肝炎进展中的变化

目的检测云南地区慢性丙型肝炎、丙肝相关性肝硬化、丙肝相关性肝癌患者中丙肝病毒(HCV)的基因亚型及RNA载量在疾病进展过程中的变化.方法通过收集2016年1月至2017年4月昆明医科大学第一附属医院及云南省传染病医院收治的患者241例,其中丙型肝炎组患者169例,丙肝相关性肝硬化组56例,丙肝相关的肝癌组16例作为研究对象.采用PCR荧光探针法检测血清中丙肝病毒基因亚型以及HCV RNA载量.结果在丙型肝炎患者中3b型最多(27.81%);在丙肝相关性肝硬化患者中1b型最多(30.36%);在丙肝相关性肝癌中3 b型最多(31.25%).3组患者基因亚型比例无显著差别(P>0.05).慢性丙型肝炎、丙肝相关性肝硬化、丙肝相关性肝癌组患者的HCV RNA载量分别为(332±114)Copies/m L、(189±73)Copies/m L、(152±56)Copies/m L.3组患者HCV RNA载量的差异显著(P<0.01),慢性丙型肝炎组高于其他2组(P<0.01),但丙肝相关性肝硬化组与丙肝相关性肝癌组患者HCV RNA载量没有明显差别(P>0.05).结论云南地区丙型肝炎中以3b型为主,丙肝相关性肝硬化中以1b型为主,丙肝相关性肝癌中3b型为主.在慢性丙型肝炎进展过程中HCV RNA载量减低.

反向点杂交法检测广东地区丙型肝炎病毒基因型和基因亚型

目的建立并应用HCV基因分型技术PCR-反向点杂交法(PCR-RDH),调查广东地区丙型肝炎病毒(HCV)基因型和亚型的分布情况。方法应用生物信息学软件针对HCV5'端非编码区(5'UTR)和核心蛋白区(C区)设计特异性捕获探针及生物素标记引物,建立HCV基因分型的PCR-反向点杂交技术。应用本技术对115例慢性丙型肝炎患者血清标本进行HCV基因型和亚型检测,同时对其中38份标本中的HCV进行RT-PCR扩增、测序、系统进化树分析确定HCV基因型和亚型,以评价反向点杂交法的准确性及临床应用价值。结果 115份血清标本中,反向点杂交法HCV基因型及亚型检出率为96.5%(111/115),15份阴性对照全部为阴性。111例检出基因型的标本中1b型63例(56.8%)、2a型9例(8.1%)、3a型4例(3.6%)、3b型6例(5.4%)、6a型28例(25.2%)、1b/2a混合型1例(0.9%)。经测序分型确定此法检测准确度为100%,特异度为100%。结论 HCV基因型反向点杂交法检测准确可靠、简便经济、高效,适用于临床检测。广东地区的HCV基因型分布以1b型为主,呈现出1b型比例下降,3a、6a型比例升高的趋势。

南京地区肝病患者丙型肝炎病毒基因型与乙型肝炎病毒亚型分布

目的:了解南京地区丙型肝炎病毒(HCV) 感染及乙型肝炎病毒(HBV) 抗原亚型分布情况。方法:对1993 ～1995 年住院肝病患者2 157 例,应用RT- PCR、HCV 进行基因型、阳性克隆序列分析及HBV亚型的检测。结果:HCVRNA 阳性率为8.7 % 。对100 例HCV 基因型分析:Ⅱ型占91% ,Ⅲ型占6% 。HBV亚型分析:adr 占55.6% ,adw 占38.4% 。2 例HCV 阳性克隆均为Ⅲ型,与日本株(HC- J5 、HC-J6)密切相关。结论:中国南京的HCV可能是近代从日本传入的,HBV亚型以adr、adw

云南省德宏州美沙酮维持治疗者丙型肝炎病毒基因亚型分布

HCV感染主要通过血液、母婴和密切接触等途径传播。我国HCV感染率为2．5％～4．9％，感染人数已超过3000万，药物成瘾人群的感染率远高于一般人群。HCV的基因型与干扰素应答密切相关，了解HCV基因分型有助于制定抗病毒治疗的个性化方案。

中国丙型肝炎病毒基因型的进化树分析

目的了解丙型肝炎病毒的基因型在中国的分布,对各基因型做遗传进化树分析。方法分型方法按5′端非编码区(5′NCR)ABC程序酶切分型技术进行。应用BsrBⅠ、HaeⅡ、HinfⅠ、BstUⅠ、HaeⅢ等5种限制性内切酶,对HCV阳性血清进行分型研究。对1a、3b基因型进行HCVNS5bPCR,测序。对5′NCR和NS5b进行遗传进化树分析。结果测序结果证实中国存在HCV3b和1a型;进化树分析结果表明第86、98、123株样品与3bD49374相关,获美国NCBI的GenBank认证;第61株与HC J1D107491a型相关;5′NCR测序结果证实第16、62株与HC J82b型相关。结果表明中国存在着HCV1a、2b、3b型的感染。结论经过遗传进化树分析证实了ABC程序酶切分型技术可准确地检测1a～6aHCV基因型。

慢性丙型肝炎患者病毒基因型与IL-28B基因型分布

目的了解慢性丙型肝炎患者白细胞介素-28B(IL-28B)基因型多态性分布的特点及其临床意义。方法在27例慢性丙型肝炎患者,分离外周血细胞DNA,采用IPLEX Gold法检测宿主IL-28B基因多态性;分析患者IL-28B基因型与血清丙型肝炎病毒(HCV)基因型、HCV RNA载量和肝功能指标的相关性。结果在27例慢性丙型肝炎患者中,感染HCV基因1型1例(3.7%),1b基因型7例(25.9%),其它基因型19例(19/27,70.4%);在IL-28B基因型中,rs12979860 CC基因型、rs12980275 AA基因型及rs8099917 TT基因型共24例(88.9%),而IL28B rs12979860 CT基因型、rs12980275 GA基因型和rs8099917 GT基因型共3例(11.1%);在HCV基因1型或1b型感染者中,IL28B rs12979860 CC基因型、rs12980275 AA基因型和rs8099917 TT基因型占62.5%(5/8),而HCV其他基因型感染者IL28B rs12979860 CC基因型、rs12980275 AA基因型和rs8099917 TT基因型占100%(19/19);HCV基因1型或1b型感染者与HCV其他基因型感染者比,其IL28B rs12979860位点、rs12980275位点和rs8099917位点基因型分布有显著性差异(P<0.01);IL-28B基因多态性分布与患者血清HCV RNA载量或肝功能指标的变化无显著性相关。结论本组慢性丙型肝炎患者HCV基因型大多为非1型;大多数感染者IL-28B基因为rs12979860 CC、rs12980275 AA和rs8099917 TT基因型。

武汉地区丙型肝炎病毒基因型分布及其少见基因亚型系统进化树分析

目的研究武汉地区丙型肝炎病毒(HCV)基因型分布情况,构建HCV少见基因亚型系统进化树。方法收集武汉地区258例慢性丙型肝炎患者血浆样本,采用基于HCV非结构蛋白5B(NS5B)区的Sanger测序法对患者HCV进行基因分型,将HCV NS5B区测序结果与NCBI Genotyping tool中HCV基因型数据库进行比对,得到受检患者的HCV基因亚型,采用MEGA5.0软件对武汉地区HCV少见基因亚型进行系统进化树分析。结果 258例丙型肝炎患者样本均被成功分型,共检出6种基因亚型:1b型(71.32%)、2a型(20.16%)、6a型(3.49%)、3b型(2.71%)、3a型(1.16%)、1a型(1.16%)。武汉地区HCV少见基因亚型系统进化树被成功构建。结论武汉地区HCV优势基因亚型为1b型和2a型,6a型、3a型、3b型、1a型较少见。武汉地区3例3a型HCV可能由日本传入;大部分3b型HCV可能由越南传入,NO.379样本出现较大变异;6a型HCV可能由越南传入。

太原地区丙型肝炎病毒基因分型及其临床意义

目的了解本地区HCV基因型分布,探讨HCV基因分型的临床意义。方法用RT-nested-PCR方法扩增62例丙型肝炎患者血清HCV5’ UTR区,限制性内切酶HaeⅢ、Bsh1236Ⅰ进行双酶切得到不同长度基因片段,分析结果,确定基因型。结果62例丙型肝炎患者中,其中1b型43例,2a型9例,1b/2a混合型5例,1a型1例,3a型1例,未分型3例。基因1b型患者肝功能、肝脏脂肪变性均较非1b型严重。结论本地区丙型肝炎以基因1b型为主,且该型患者临床病情较其它型严重。

上海闵行区中心医院就诊丙型肝炎患者丙型肝炎病毒基因亚型分布情况分析

目的了解上海闵行区中心医院就诊丙型肝炎患者丙型肝炎病毒(hepatitis C virus,HCV)感染基因亚型分布情况,为今后制定丙型肝炎防治策略及针对性治疗提供依据。方法收集2012-2015年上海闵行区中心医院门诊及住院本地区丙型肝炎患者样本267例,所有样本HCV抗体阳性,巢式RT-PCR扩增HCV NS5B区,核酸阳性样本进行基因测序,运用邻近法(neighbor-joining)构建系统进化树,进行HCV基因亚型分析,比较不同基因亚型年龄分布和暴露因素的差异。结果病例均为上海本地区人,通过扩增获得132条HCV NS5B区序列,对132例样本进行基因分型,6a型56例(42.42%),3a型40例(30.30%),1b型26例(19.70%),2a型10例(7.58%),6a、3a型HCV感染者平均年龄低于1b型HCV感染者(P<0.01),不同基因亚型病毒性肝炎患者各暴露因素差异无统计学意义。结论上海局部地区丙型肝炎患者HCV亚型分布多样化,主要流行6a型和3a型。

丙型肝炎病毒基因型与丙型肝炎患者自身抗体的相关性

目的探讨湖州地区丙型肝炎病毒(hepatitis C virus,HCV)感染患者HCV基因型与自身抗体变化的关系,同时分析HCV含量与抗核抗体(anti-nuclear antibody,ANA)检出率的关系。方法收集湖州市中心医院2008年1月至2010年1月传染科门诊和住院HCV RNA阳性患者血清,采用DNA测序法检测HCV基因型,间接免疫荧光法检测ANA和抗平滑肌抗体,斑点免疫印迹法检测抗线粒体抗体M2、Sm、SSA、RO52、SSB及抗着丝点抗体,散射比浊法检测类风湿因子。血清样本按照HCV RNA病毒载量分为高、中、低载量3组。结果共纳入94例HCV患者,其中1a型5例(5.3%),1b型77例(81.9%),2a型9例(9.6%),3a型1例(1.1%),6a型2例(2.1%)。94例HCV患者自身抗体阳性检出率39.4%,其中1b型检出率46.8%,2a型检出率11.1%,1b型与2a型检出率比较差异有统计学意义(P<0.05),其他基因型未检出自身抗体阳性。1b型77例患者可检出ANA、类风湿因子、抗平滑肌抗体、M2、SSA、RO52、SSB、抗着丝点抗体8种自身抗体,2a型9例患者检出ANA、类风湿因子和M23种自身抗体。HCV患者ANA以低滴度颗粒型为主,ANA 1∶100滴度占59.5%(2237),颗粒型占ANA的35.1%(1337),其次是着丝点型。3个载量组分别与对照组比较,差异均有统计学意义(χ2分别为6.4、19.9、53.1,均P<0.05)。高载量组和低、中载量组比较,差异均有统计学意义(χ2分别为19.5、9.8,均P<0.05)。结论湖州地区HCV基因型以1b型为主,HCV不同基因型与自身抗体之间存在密切的关系,其载量高低与自身抗体检出率成正比。

维持性血液透析患者感染丙型肝炎病毒基因分型特点及意义

1MHD患者HCV流行情况丙型肝炎病毒（HCV）全球感染率约为3%,由此推算全球有1.7亿～2.0亿人感染过丙型肝炎病毒。维持性血液透析（maintenance hemodialysis,MHD）患者由于免疫功能低下、血液透析时频繁的血管穿刺和体外循环、输血及各种医源性因素等,

丙型肝炎病毒基因型与慢性丙型肝炎患者预后的相关性研究

目的探讨丙型肝炎(HCV)病毒基因型与慢性HCV患者经抗病毒治疗实现持续病毒学应答(sustained virological response,SVR)之间的关系。方法选取慢性HCV患者45例,根据治疗后患者是否实现SVR分为SVR组(n=14)和非SVR组(n=31)。采用线性探针反向杂交法(INNO-LiPA)检测HCV基因型,两组患者经聚乙二醇干扰素(PEG-IFN)联合利巴韦林(RBV)治疗后检测SVR,分析HCV基因型与SVR之间的相关性。结果非SVR组中HCV基因1型患者显著多于SVR组,差异具有统计学意义(P<0.05);HCV基因型与PEG-IFN联合RBV治疗响应有显著相关性,HCV基因2、3型是与治疗反应相关的最强因素,且独立于其他变量之外,差异具有统计学意义(P<0.05)。结论 HCV基因型是慢性HCV感染患者经PEG-IFN联合RBV治疗预后的一个重要独立预测因素,可用于患者最佳抗病毒治疗方案的选择。

辽宁地区丙型肝炎病毒基因分型特点及其临床意义

目的研究辽宁地区丙型肝炎病毒(HCV)基因分型特点,并分析其临床意义。方法选取100例丙型肝炎患者作为样本,首先采用聚合酶链式反应(PCR)-荧光探针法对丙型肝炎患者HCV基因分型进行测定,对PCR法分不出型别的样本,采用测序法检测,对HCV基因分型特点进行观察。结果辽宁地区100例HCV感染患者中,基因型包括1a型、1b型、2a型、3a型、3b型、6a型、6n型7种类型。上述类型中,1b型患者占比最高,1a型患者占比最低。各年龄段中,30~60岁患者各基因型占比更高。1b型、3b型患者,以男性居多;其他基因型患者,以女性居多。1a型患者感染途径以静脉吸毒为主,1b型患者可经血液、静脉吸毒、性传播、母婴传播等多种途径感染,各途径感染风险均较高。2a型患者,感染途径以输血、血制品等院内感染为主。3a型患者感染风险低,感染途径一般为静脉吸毒及性传播。3b型患者,经血液、静脉吸毒感染者居多。6a型及6n型患者,多为血液感染及静脉吸毒感染。结论辽宁地区HCV基因,以1b型基因为主,该基因型可经多种途径感染,临床应以之为重点,对HCV感染进行诊断以及治疗,抑制病情进展,改善患者的生活质量。

丙型肝炎病毒基因分型及其临床意义

丙型肝炎病毒(hepatitis C virus，HCV)是单股正链RNA病毒，属黄病毒科丙型肝炎病毒属。全长约9．4kb，其序列为：341b的5’非编码区(5’URT)，编码3011个氨基酸的长开放读框，约27b的3’非编码区(3’URT)。在病毒复制中，氨基端有三个蛋白(C、E1、E2／NSl)，羧基端有四个蛋白(NS2、NS3、NS4、NS5)。由于RNA复制酶的低保真性及缺乏校正功能，HCV呈高度异质性；不同地区，不同患者，甚至同一患者在不同病程中HCV分离株，无论是核苷酸序列，还是氨基酸序列均有显著差异^[1][2][3]。本文就丙型肝炎病毒基因分型及其临床意义作一综述。

基因芯片检测血清标本的丙型肝炎病毒基因型

目的:探讨丙型肝炎病毒(HCV )基因分型检测芯片在临床的初步应用及意义。方法:基因芯片检测15 0例血清标本中HCV基因型,并与HCV RNA定性及测序结果进行比较。结果:HCV基因分型检测芯片检出的阳性结果与HCV- RNA定性及测序结果的相对符合率为10 0 .0 %。结论:HCV基因分型检测芯片是一种准确性好、灵敏度高、特异性强、操作简便快速的基因检测方法,可以为临床诊断。

丙型肝炎病毒基因Ⅱ型感染对干扰素治疗的应答反应

对 31例丙肝病人进行基因分型及干扰素治疗。其中 2 7例 HCV基因 型感染病人治疗结束时的应答率为92 .6 % (生化 )及 6 3% (病毒 ) ,一年的稳定应答率为 2 6 % (生化及病毒学 ) ,不应答率为 8.4%。结论 :国人 HCV 型感染对干扰素治疗有良好的近期应答 ,如何提高稳定应答率 ,减少复发是临床研究应注意的问题。

膜显色DNA芯片技术检测丙型肝炎病毒基因型及临床意义

目的了解丙型肝炎病毒基因型分布及其临床意义。方法应用逆转录聚合酶链反应(RTPCR)对89例抗HCV阳性血清进行HCVRNA扩增,再应用膜显色DNA芯片技术,对HCV进行基因分型,并对部分标本用基因测序法作对照。结果89份抗HCV阳性血清中,检测出HCVRNA阳性73例。其中,HCV/1b型66例(90.4%),HCV/1a型1例(1.4%),2a型3例(4.1%),3b型3例(4.1%)。13例标本作基因测序分型对照,分型结果完全一致。15例献血员血清中未检出HCVRNA。结论HCV/1b型是江苏常州地区丙肝病毒优势株。膜显色DNA芯片可用于HCVRNA检测及基因分型检测,方法简便、快速、准确,适合临床推广应用及流行病学研究。