不同丙型肝炎病毒基因分型检测方法学的比较

目的通过丙型肝炎基因分型检测方法学的比较,为实验室选择提供依据。方法选取宁夏回族自治区人民医院2019年1月至2021年12月丙型肝炎确诊患者血清样本148份,使用PCR-荧光探针法、PCR-反向点杂交法及Sanger测序法进行丙型肝炎病毒基因分型检测,并采用卡方检验、Kappa检验对这三种检测方法进行比较分析。结果PCR-荧光探针法检出136例,检出率91.89%,共检出4种基因型,分别为1b、2+、3+和6+。PCR-反向点杂交法检出135例,检出率为91.22%,共检出5种基因型,分别为1b、2a、3a、3b和6a。Sanger测序法检出148例,检出率100%,共检出7种基因型,分别为1b、2a、3a、3b、6a、1g和6xa。PCR-荧光探针法未检出的12例样本中,Sanger测序法均已检出,其中包括1例6xa型,1例1g型。两种方法的检出率比较差异无统计学意义(χ^(2)=7.565,P>0.05)。两种方法比较一致性较高(k=0.871,P<0.001)。PCR-反向点杂交法未能测出的13例样本,Sanger测序法均已检出,其中包括1例1g型。PCR-反向点杂交法检出1例3b型,Sanger测序法检出为6xa型。两种方法的检出率比较差异无统计学意义(χ^(2)=8.696,P>0.05)。PCR-反向点杂交法与Sanger测序法一致性高(k=0.609,P<0.05)。结论PCR-荧光探针法和PCR-反向点杂交法操作简单,适合临床推广,Sanger测序法准确性高,可对其他方法进行补充,实验室可结合自身情况进行选择。

丙型肝炎病毒基因分型的相关研究进展

丙型病毒性肝炎(丙肝)是常见的慢性传染病之一,是造成全球重大健康和经济负担的原因。丙型肝炎病毒基因分型是疾病严重程度和发病机制以及患者对抗病毒治疗反应的重要决定因素,基因分型的研究对了解丙肝流行病学特征、制定抗病毒治疗的个体化方案均有重要的临床参考价值,将有助于更好地为丙肝防治管理策略提供信息。

山西丙型肝炎病毒基因分型的初探

山西丙型肝炎病毒基因分型的初探山西医科大学第一医院传染病科（０３０００１）赵和平张玲荣王勤英邓春青郭慧安丙型肝炎病毒（ＨＣＶ）基因有很高的突变率。根据基因序列差异，不同的毒株被划分为不同的基因型。有资料表明ＨＣＶ基因型其分布有一定的地区差异。作者对我...

丙型肝炎病毒基因分型的研究进展

丙型肝炎病毒是一个高度异质性的RNA病毒,目前可分为6个基因型与不同的亚型。本文就HCV基因型构成、HCV基因分型的检测方法与命名、HCV基因型的流行病学的意义、HCV基因型与疾病严重性、急性HCV感染的转归、IFN-α疗效、HCV基因分型与疫苗的研制等有关的研究作一综述。

太原地区丙型肝炎病毒基因分型及其临床意义

目的了解本地区HCV基因型分布,探讨HCV基因分型的临床意义。方法用RT-nested-PCR方法扩增62例丙型肝炎患者血清HCV5’ UTR区,限制性内切酶HaeⅢ、Bsh1236Ⅰ进行双酶切得到不同长度基因片段,分析结果,确定基因型。结果62例丙型肝炎患者中,其中1b型43例,2a型9例,1b/2a混合型5例,1a型1例,3a型1例,未分型3例。基因1b型患者肝功能、肝脏脂肪变性均较非1b型严重。结论本地区丙型肝炎以基因1b型为主,且该型患者临床病情较其它型严重。

西安地区丙型肝炎病毒基因分型研究

目的 了解西安地区不同人群ＨＣＶ 基因型分布．方法 先用逆转录－ 套式多聚酶链反应检测抗－ ＨＣＶ 阳性血清的ＲＮＡ， 阳性者再用限制性片段长度多态性分析法进行ＨＣＶ 基因分型．结果 １１３ 份ＨＣＶＲＮＡ 阳性血清的基因型如下：输血后丙肝组，Ⅱ型、Ⅲ型及Ⅱ／ Ⅲ混合型分别为８０ ％ ，１６－７ ％ 和３－３ ％ ．散发性丙肝组，Ⅱ型、Ⅲ型分别为７８－９ ％ 和２１－１ ％ ，未检出Ⅱ／Ⅲ混合型． 肝硬变组， Ⅱ型、Ⅲ型及Ⅱ／ Ⅲ混合型分别为８７－９ ％ ，９－１ ％ 和３ ％ ． 原发性肝癌组，Ⅱ型、Ⅲ型分别为８７－１ ％和１２－９ ％ ，未检出Ⅱ／ Ⅲ混合型． 分型总结果为：ＨＣＶⅡ型、Ⅲ型及Ⅱ／ Ⅲ混合型分别为８４－１ ％ ，１４－２ ％ 和１－７ ％ ．结论 ＨＣＶⅡ型是西安地区优势株． 不同人群中ＨＣＶ 基因型总体分布差异无显著性．

南京地区丙型肝炎病毒基因分型的研究

目的了解南京地区丙型肝炎病毒（HCV）基因型分布的特点.方法采用针对HCV三种主要基因型1，2，3和1b亚型设计的型-特异性引物，通过RT—PCR和套式PCR扩增HCV基因组高度保守的5’端非编码区，检测55例HCVIgG阳性血清的HCVRNA，并对其中40例进行基因分型.结果PCR检测的抗HCVIgG阳性血清标本55例中，50例为HCVRNA阳性，阳性率为90．91%;对40例HCVRNA阳性的血清进行分型，发现23例为1b型，15例为2，1b混合型，HCV—1b亚型舍有率为95%，其余两例分别为2型和1，2混合型.结论该地区HCV流行优势株为1b亚型.

维持性血液透析患者感染丙型肝炎病毒基因分型特点及意义

1MHD患者HCV流行情况丙型肝炎病毒（HCV）全球感染率约为3%,由此推算全球有1.7亿～2.0亿人感染过丙型肝炎病毒。维持性血液透析（maintenance hemodialysis,MHD）患者由于免疫功能低下、血液透析时频繁的血管穿刺和体外循环、输血及各种医源性因素等,

丙型肝炎病毒基因分型研究

为了解青岛地区丙型肝炎病毒(HCV)基因型分布情况以及HCV5’NC和HCV-NS5b两区域分型结果间的差异。本文对采自147例各型内肝患者和7例有偿供血者的共154份HCV RNA阳性血清,同时进行了HCV5’NC和HCV-NS5b两个区域酶切分型研究结果显示,两区域的HCVⅡ(1B)型感染分别占82.5％和83.1％;在各临床类型中,肝硬变患者的HCVⅡ(1b)型占91.3％,高于其它临床类型.提示HCVⅡ(1b)型为青岛地区HCV感染的优势株,并且可能和肝病的进展密切相关.研究结果同时还表明,HCV-5’NC区和HCV-NS5b区酶切分型结果间具有良好的相互对应关系。

河北省丙型肝炎病毒基因分型研究

丙型肝炎病毒 (Hepatitis C virus, HCV)感染是输血后肝炎的主要原因[1],主要通过输血或使用污染的血制品传播[2],且与肝硬化和肝细胞癌的发生有密切关系.

102例丙型肝炎病毒基因分型结果分析

目的分析了解萍乡地区慢性丙型肝炎患者的丙型肝炎病毒(HCV)基因分型情况,为HCV诊断和治疗提供有力的依据。方法利用门诊及住院患者血清HCV抗体阳性标本,经荧光定量PCR检测HCVRNA阳性的102例标本用基因芯片进行不同基因分型检测。结果检测HCV感染标本102例,共检出7种基因亚型,分别为1b、6型、2a、1b+2a、1b+3a、3a和3b,其中1b占72.6%,6型占8.8%,2a占7.8%,1b+2a占5.9%,1b+3a占2.9%,3a占1.0%,3b占1.0%。结论萍乡地区HCV基因型主要为1b与中国南方地区HCV基因型分布比较一致。按照年龄分组20岁以下4例,占3.9%,20～30岁33例,占32.4%,30～40岁39例,占38.2%,40～50岁11例,占10.8%,50～60岁4例,占3.9%,60岁以上11例,占10.8%。青壮年和有吸毒史、外伤手术史、输注血液制品史的人群阳性率较高。

逆向点杂交技术在丙型肝炎病毒基因分型中的应用

目的:改进并应用本实验室创建的丙型肝炎病毒(HCV)基因分型方法检测HCV基因分型。方法:应用PCR-逆向点杂交技术(PCR-RBD),联合HCV的核心区和5′非编码区设计引物和分型探针,对122份HCV RNA阳性的血清标本及作为阴性对照的20份抗HCV阴性的血清标本进行基因分型,并通过与基因测序结果比较确定本方法的有效性。结果:122份受试标本共检出5种HCV基因型,分别为1a、1b、2a、3b和6a。20份阴性对照全部阴性。本研究的基因分型结果与测序分型结果一致。结论:联合HCV核心区和5′非编码区应用PCR-RBD技术可以准确有效地进行HCV基因分型,适用于常规临床检测与流行病学研究。

辽宁地区丙型肝炎病毒基因分型特点及其临床意义

目的研究辽宁地区丙型肝炎病毒(HCV)基因分型特点,并分析其临床意义。方法选取100例丙型肝炎患者作为样本,首先采用聚合酶链式反应(PCR)-荧光探针法对丙型肝炎患者HCV基因分型进行测定,对PCR法分不出型别的样本,采用测序法检测,对HCV基因分型特点进行观察。结果辽宁地区100例HCV感染患者中,基因型包括1a型、1b型、2a型、3a型、3b型、6a型、6n型7种类型。上述类型中,1b型患者占比最高,1a型患者占比最低。各年龄段中,30~60岁患者各基因型占比更高。1b型、3b型患者,以男性居多;其他基因型患者,以女性居多。1a型患者感染途径以静脉吸毒为主,1b型患者可经血液、静脉吸毒、性传播、母婴传播等多种途径感染,各途径感染风险均较高。2a型患者,感染途径以输血、血制品等院内感染为主。3a型患者感染风险低,感染途径一般为静脉吸毒及性传播。3b型患者,经血液、静脉吸毒感染者居多。6a型及6n型患者,多为血液感染及静脉吸毒感染。结论辽宁地区HCV基因,以1b型基因为主,该基因型可经多种途径感染,临床应以之为重点,对HCV感染进行诊断以及治疗,抑制病情进展,改善患者的生活质量。

5′端非翻译区和NS5B区在丙型肝炎病毒基因分型中意义的再评价

目的研究丙型肝炎病毒(HCV)的5′端非翻译区(5′-UTR)和NS5B区对中国人群感染的HCV基因分型的确切意义。方法选择NCBI核苷酸数据库中来源于中国人的HCV全基因组,利用NCBI基因分型工具,对同一条HCV序列中5′-UTR区、NS5B区和全长基因组进行基因分型,确定5′-UTR区和NS5B区在HCV基因分型中的全基因组代表性。在此基础上,选择NS5B区对125例临床HCV-RNA大于1.0E3的标本进行了基因分型。结果与全长基因组的分型结果相比,5′-UTR区基因分型在基因型判断上存在差异,仅有45%的符合率,特别是其无法精确判断基因亚型;而NS5B区基因分型结果与全长基因组的分型结果无论在基因型还是在基因亚型的判断上都具有良好的一致性,符合率可达95%;利用NS5B区对临床125例标本成功进行了基因分型,结果显示以1b和2a两种亚型为主。结论 NS5B区在HCV基因分型中具有良好的全基因组序列的代表性,能够有效用于临床常规的HCV基因分型检测。

丙型肝炎病毒基因分型与临床关系的研究

目的：研究不同基因型丙型肝炎病毒（HCV）感染后丙型肝炎（HC）患者的临床特征。方法：对90例血清HCVRNA阳性HC患者进行基因分型，并对不同型患者的临床资料进行比较。结果：（1）徐州地区HCV流行株基因型主要为Ⅱ型（78.9％），同时存在Ⅲ型（18．9％）及Ⅱ／Ⅲ混合型（2.2％）。本地区HCV基因型分布符合我国HCV基因型分布的总特征，可能反映我国东部沿海地区HCV基因型分布。（2）Ⅱ型患者肝报重于Ⅲ型，而其免疫原性低于Ⅲ型，两者在致病机理方面可能存在一定差异。（3）Ⅱ／Ⅲ混合型感染与反复输血制品及多次血液透析有关，在致病过程中可能起协同作用。

新疆地区丙型肝炎病毒基因分型及临床意义的研究

目的研究新疆地区丙型肝炎病毒(HCV)基因型分布特点,并探讨HCV基因型分布与性别、年龄、民族、病毒载量、肝脏损伤炎症程度、肝病转归的相关性,以及病毒载量与肝脏损伤炎症程度的关系。方法选取2013年6月至2016年10月期间于新疆医科大学第一附属医院住院病例331例,采用实时荧光定量PCR技术检测血清HCV RNA水平,并检测丙氨酸转氨酶(ALT)、天冬氨酸转氨酶(AST)等肝功能相关指标,HCV基因分型采用聚合酶链反应荧光探针法。结果 (1)331例患者中,男/女为156/175,年龄范围12~80岁,平均年龄50.8岁,其中1b型231例,占69.79%(102/129);2a型66例,占19.94%(32/34);3a型22例,占6.67%(13/9);3b型11例,占3.32%(8/3);6a型1例,占0.03%(1/0)。(2)HCV基因型分布与年龄的相关性差异有统计学意义(P<0.05),与性别、ALT、AST、肝病转归的相关性差异无统计学意义(P>0.05)。(3)HCV基因型分布与民族、病毒载量的相关性差异有统计学意义(P<0.05)。(4)病毒载量与ALT、AST的相关性差异无统计学意义(P>0.05)。结论新疆地区HCV感染以1b型为主。HCV基因型分布与性别、肝脏损伤炎症程度、肝病转归等无关,与民族、年龄、病毒载量有关。HCV病毒载量与肝脏损伤炎症程度无关。

丙型肝炎病毒基因分型及其临床意义

丙型肝炎病毒(hepatitis C virus，HCV)是单股正链RNA病毒，属黄病毒科丙型肝炎病毒属。全长约9．4kb，其序列为：341b的5’非编码区(5’URT)，编码3011个氨基酸的长开放读框，约27b的3’非编码区(3’URT)。在病毒复制中，氨基端有三个蛋白(C、E1、E2／NSl)，羧基端有四个蛋白(NS2、NS3、NS4、NS5)。由于RNA复制酶的低保真性及缺乏校正功能，HCV呈高度异质性；不同地区，不同患者，甚至同一患者在不同病程中HCV分离株，无论是核苷酸序列，还是氨基酸序列均有显著差异^[1][2][3]。本文就丙型肝炎病毒基因分型及其临床意义作一综述。

经宫内传播的丙型肝炎病毒基因分型

目的:探讨经宫内传播的丙型肝炎病毒(hepatitisCvirus,HCV)在母亲与子代间的基因型别一致性,进一步确定HCV母婴传播的分子学基础。方法:选择6对母亲与胎儿抗-HCV与HCVRNA(ribonucileicacid)均阳性者为研究对象,以PCR技术检测母亲与胎儿HCVRNA的基因型别。结果:6对母亲与胎儿的HCVRNA基因型均一致,其中5对基因型别属Ⅱ型,1对属Ⅲ型。结论:母亲与胎儿所携的HCV基因型别一致。