民族药野梦花基源及提取物抗丙型肝炎病毒NS3/4A蛋白酶活性研究

目的研究民族药野梦花基源及提取物体外抗丙型肝炎病毒(HCV NS3/4A)蛋白酶活性。方法采用生药学常用鉴别方法确定野梦花基源,利用系统溶剂萃取法提取和初步分离野梦花,经荧光法测试野梦花提取物抗HCV NS3/4A蛋白酶活性。结果野梦花为瑞香科植物(Daphne papyracea Wall.ex Steud.var.crassiuscula Rehd.),其乙酸乙酯和正丁醇提取物,在浓度为100μg.ml-1时,对HCV NS3/4A蛋白酶的抑制率分别为70.5%和65.4%。结论民族药野梦花的乙酸乙酯和正丁醇部位为抗HCV NS3/4A蛋白酶的有效部位。

第二代丙型肝炎病毒NS3/4A丝氨酸蛋白酶抑制剂研究进展

本文综述了近年来基于特拉匹韦(telaprevir)、波西匹韦(boceprevir)和BILN-2061等第一代HCV NS3/4A丝氨酸蛋白酶抑制剂的第二代抑制剂的结构改造。第二代抑制剂可有效提高抑制效力,显著改善药代动力学参数,可在一定程度上克服由第一代抑制剂诱导产生的耐药性。同时探讨了各类抑制剂的构效关系。

慢性丙型肝炎患者NS3/4A蛋白酶抑制剂预存耐药的临床研究

【目的】了解我国华南地区从未接受任何抗病毒治疗的慢性丙型肝炎(慢丙肝)患者NS3/4A蛋白酶抑制剂相关耐药位点的流行情况、临床特点包括其对干扰素联合利巴韦林抗病毒治疗的影响。【方法】在接受抗病毒治疗前对183例慢丙肝患者的NS3/4A蛋白酶抑制剂相关的耐药位点采用自行设计型别特异性引物行巢式PCR,PCR产物纯化后直接测序法鉴定,有变异的患者为变异组(125例),无变异的患者为野生组(37例),对两组患者的临床资料包括干扰素联合利巴韦林抗病毒治疗后的持续病毒应答率等进行分析。【结果】183例患者中162例患者样本的NS3区扩增成功,其中125例(77.16%)患者检出耐药相关的变异位点266个,其中HCV 1b型A156S变异率为18.33%(11/60),T54S为5.00%(3/60);HCV 2a型V36L变异率为100.00%(14/14),A156S为64.29%(9/14);HCV 6a型Q80K变异率为95.45%(84/88),V36L为4.55%(4/88),D168E为2.27%(2/88),变异组患者经干扰素联合利巴韦林抗病毒治疗后的持续病毒性应答率为81.60%(102/125),而野生组的为81.03%(30/37),两者比较无明显差异(P=0.943)。【结论】我国不同基因型的慢丙肝患者对NS3/4A蛋白酶抑制剂存在不同的预存耐药,耐药变异对慢丙肝患者疾病状态包括干扰素联合利巴韦林的疗效无影响。预存耐药的存在警示我们未来在使用此类药物时需分析病毒基因型及预存耐药变异情况,从而为患者提供最好的病毒学监测及最优的治疗方案。

丙型肝炎病毒NS3丝氨酸蛋白酶抑制剂研究进展

综述了近年来丙型肝炎病毒NS3丝氨酸蛋白酶抑制剂的研究概况,从结构上分为肽醛类、硼酸类、α-酮酸类、肽酸类、四氢吡咯-5,5-反式-内酰胺非肽类和α-酮酰胺等。并探讨了各类药物的构效关系。

丙型肝炎病毒NS3/4A丝氨酸蛋白酶瞬时表达小鼠模型的建立

目的:建立丙型肝炎病毒NS3/4A丝氨酸蛋白酶体内活性评价模型。方法:利用NS4A/B是NS3/4A丝氨酸蛋白酶作用底物的特性,构建融合基因NS3/NS4A/B-SEAP,底物片段NS4A/B插在NS3/4A和人分泌性碱性磷酸酶(SEAP)之间,融合基因表达后SEAP的分泌依赖于有活性的NS3/4A在NS4A/B位点的切割。将含融合基因的质粒NS3/4A(△4AB)SEAP通过水动力转染技术转染到小鼠体内,检测小鼠血清中SEAP的活性,高活性的SEAP是该评价体系成立的证据。结果与结论:在瞬时表达NS3/4A的小鼠血清中检测到了高活性的SEAP,建立了可用于评价抗NS3/4A的小鼠体内瞬时模型。

Tet-on和Cre/loxP系统双重调控表达丙型肝炎病毒NS3/4A蛋白酶三转基因小鼠的建立

目的:建立Tet-On调控系统和Cre/loxP基因剔除系统双重调控表达丙型肝炎病毒(HCV)NS3/4A丝氨酸蛋白酶三转基因小鼠。方法:选择适龄并经鉴定的在Tet-on系统调控下肝脏特异性表达Cre重组酶的双转基因小鼠Lap/LC-1与在Tet-on系统调控下肝脏特异性表达萤光素酶(Luc)的双转基因小鼠Lap/NS3/4A交配,子代小鼠经PCR检测、筛选基因组中NS3/4A、Lap、LC-1等3个转基因片段均阳性的小鼠。三阳性的NS3/4A/Lap/LC-1小鼠经多西环素(Dox)诱导1周后,以在体生物发光成像系统(BLI)检测报告基因Luc的表达,免疫组化检测小鼠体内Cre重组酶、HCV NS3/4A丝氨酸蛋白酶的表达状况。结果:NS3/4A/Lap/LC-1小鼠经Dox诱导后,BLI结果显示仅在小鼠肝脏部位有强烈的发光信号,表明这些小鼠肝细胞内报告基因Luc特异高效表达;免疫组化结果证实Cre重组酶、NS3/4A蛋白酶仅在经诱导后的小鼠肝细胞中特异性表达。结论:建立了Tet-On调控系统和Cre/loxP基因剔除系统双重调控下表达HCV NS3/4A丝氨酸蛋白酶的三转基因小鼠模型,为进一步研究HCV NS3/4A丝氨酸蛋白酶在HCV感染后与宿主相互作用的机制,以及抗NS3/4A丝氨酸蛋白酶特异性抑制剂的筛选奠定了基础。

丙型肝炎病毒NS3-4A蛋白对MMP-9及天然免疫的影响

目的探讨HCV编码的NS3-4A蛋白对MMP-9表达的调节作用。方法利用Primer Premier5.0软件设计相关引物,构建在相应的载体上;使用PCR扩增目的基因;PCR产物以及双酶切产物的胶回收;冷氯化钙法制备感受态细胞;YC法转化感受态细胞;进行细胞培养基的配制;之后进行RT-PCR反应。结果在Huh7.5.1细胞内,内源性的MMP-9可以被NS3-4A蛋白上调表达;转染了p CMV-tag2A-NS3-4A质粒的Huh7.5.1细胞与未转染的细胞相比,其内源性MMP-9的表达可以明显被NS3-4A蛋白上调。在Huh7.5.1细胞中,IFN-α可以增促进MMP-9基因mRNA的表达,且这种增强作用呈现出剂量依赖性;在转染了p CMVtag2B-MMP-9质粒的Huh7.5.1细胞中,其内源性IFN-α及其受体IFNAR1和IFNAR2的表达可以被MMP-9蛋白抑制,且对IFN-α及IFNAR1的抑制作用具有较明显的剂量依赖性;向转染了p CMV-tag2B质粒的Huh7.5.1细胞中加入IFN-α可以上调其内源性的PKR和OAS2的表达,而MMP-9又可以抑制这些基因的表达,这反过来也说明MMP-9可以抑制IFN-α及其受体IFNAR1和IFNAR2的表达,进而抑制IFN-α下游PKR和OAS2的表达;IFN-α可以上调Huh7.5.1细胞中内源性的PKR和OAS2的表达,而MMP-9又可以抑制这些基因的表达,这与之前mRNA水平的检测结果相一致。结论在HCV的感染过程中,NS3-4A蛋白可以促进细胞内源性IFN-α的表达,而IFN-α的高表达又会导致MMP-9的高表达,MMP-9反过来又会抑制IFN-α及其受体IFNAR1和IFNAR2的表达水平,进而抑制IFN-α下游的PKR及OAS2基因。

丙型肝炎病毒的非结构蛋白3抑制剂

丙型肝炎严重威胁人类健康,非结构蛋白3(NS3)在丙型肝炎病毒(HCV)多聚蛋白水解过程中起重要作用,被公认为治疗丙型肝炎的有效药物靶标。该文介绍目前国内外有关NS3蛋白酶抑制剂(包括寡肽类抑制剂和非肽小分子抑制剂)的研究进展。

HCV NS3/4A丝氨酸蛋白酶和NS5B RNA聚合酶抑制剂的临床研究进展

丙型肝炎病毒(hepatitis C virus,HCV)NS3/4A丝氨酸蛋白酶和NS5B RNA依赖的RNA聚合酶是病毒蛋白前体加工成熟和复制过程中十分重要的两个酶,是抗HCV治疗的理想靶点.近年来,关于HCV NS3/4A蛋白酶和NS5B RNA聚合酶抑制剂的研究是抗HCV研究最为活跃的方向,本文综述了他们在临床试验中的最新研究进展.

新的HCV蛋白酶抑制剂可有效抵抗丙型肝炎病毒

德国萨尔大学医院的Christoph Sarrazin博士及其同事在4月的《胃肠病学》（Gastroenterology，2007；132：1270—1278，1611—1615）杂志上报道。一种新的口服HCV蛋白酶抑制剂SCH503034，可被良好耐受，并可有效地抵抗干扰素难治的基因型1丙型肝炎病毒（HCV）。SCH503034是NS3蛋白酶的一种特异性抑制剂，在HCV复制中起重要作用。

HCV NS3/4A丝氨酸蛋白酶在大肠杆菌中表达、纯化

在大肠杆菌中HCV NS3/4A丝氨酸蛋白酶获得表达并进行纯化。根据NS3与NS4A两者形成异源二聚体的结构要求,并参照文献,通过基因拼接的方法设计了单链NS3/4A丝氨酸蛋白酶的基因。合成相应引物,利用反转录PCR从HCV患者血液中扩增出该蛋白酶的编码基因,克隆入原核表达载体pRSET-A,将重组表达质粒pRSET-A-ns3/4a转化BL211(DE3)大肠杆菌,并诱导表达与纯化。成功地构建了重组表达质粒pRSET-A-ns3/4a;重组质粒转化的BL21工程菌经IPTG诱导表达后,表达产物经SDS-PAGE和Western-blot证实为NS3/4A丝氨酸蛋白酶,并用镍离子亲和层析方法获得纯化蛋白酶。获得的纯化NS3/4A丝氨酸蛋白酶为建立其酶活性测定系统奠定了基础。

酶联免疫吸附试验检测HCV NS3-4A蛋白酶活性

目的 建立一种检测丙型肝炎病毒 (HCV) NS3- 4A丝氨酸蛋白酶的酶联免疫吸附试验 (EL ISA)方法 ,用于筛选 HCV蛋白酶抑制剂。方法 将质粒 p MAL- c2 / NS3- 4A转化到大肠杆菌 K1 2 TB1 中 ,经 IPTG诱导表达 ,亲和层析柱纯化后得到麦芽糖结合的 NS3/ NS3- 4A融合蛋白 ,用 Western blot分析其免疫学活性 ,并以酶联免疫吸附试验检测其生物学活性。结果 SDS- PAGE电泳分析并用考马斯亮蓝染色 ,显示相对分子质量 112 0 0 0和116 0 0 0处有麦芽糖结合的 NS3及 NS3- 4A融合蛋白带出现 ;Western blot分析表明 ,表达的产物可与抗 NS3蛋白的单克隆抗体发生阳性反应。EL ISA证实 HCV NS3- 4A蛋白酶能使特异底物裂解。正交实验获得 EL ISA的最佳实验条件 ,其 P/ N值为 3.6 3,批内和批间变异系数 (CV)分别为 4.16 %和 7.5 2 %。此方法测定 1,4萘醌对 HCV蛋白酶活性 5 0 %抑制浓度 (IC5 0 )为 8.36 μm ol/ L。结论 建立的 EL ISA方法 ,用于测定 HCV蛋白酶活性 ,具有简便、快速、重复性好等特点 ,为以 HCV NS3- 4A蛋白酶为靶酶的抑制剂筛选及抗 HCV药物的研究奠定了基础。

慢性丙型肝炎患者对NS3/4A蛋白酶抑制剂预存耐药的研究

目的对我国南方184例无抗病毒治疗史的慢性丙型肝炎患者进行NS3/4A蛋白酶抑制剂相关耐药位点检测。方法 NS3/4A蛋白酶抑制剂相关的耐药位点分析采用自行设计型别特异性引物行巢式PCR,PCR产物经纯化后采用直接测序法鉴定。结果 184例样本中有162例扩增成功,其中125例(77.16%)患者共检出266个变异位点。HCV1b型A156S变异率为18.33%,V170I为16.67%;HCV2a型V36L、Q80G、V170I变异率为100%,A156S为64.29%;HCV6a型Q80K变异率为95.45%,V170I为98.86%。结论未使用抗病毒药的慢性丙型肝炎患者对NS3/4A蛋白酶抑制剂也存在预存耐药,变异率因HCV基因型而不同。1b型发生变异较少,HCV2a型及6a型普遍发生变异。

活体荧光成像监测HCV NS3/4A蛋白在小鼠体内的瞬时表达

目的建立HCV NS3/4A蛋白酶在小鼠体内可视化表达模型。方法利用水动力转染技术将融合基因NS3/4A-Fluc转染至小鼠肝脏,建立目的基因的瞬时表达模型,通过RT-PCR方法检测目的基因Fluc及NS3/4A的RNA表达水平,以及通过Western blot方法检测目的基因NS3/4A-Fluc的蛋白表达水平。结果建立了通过报告基因Fluc反映HCV NS3/4A蛋白酶的瞬时表达可视化小鼠模型。结论成功建立了可用于评价NS3/4A蛋白酶的可视化小鼠模型。

中药活性成分中新型冠状病毒3CL蛋白酶抑制剂的消息传递机制神经网络虚拟筛选

目的在新型冠状病毒感染尚无特效药的情况下,根据潜在的治疗靶点,从中药活性成分中筛选出先导化合物为药物研发、中药组方等提供理论线索。方法构建消息传递机制神经网络(message passing neural networks,MPNN)模型,以化合物描述符SMILES码为输入,以化合物对新型冠状病毒3CL蛋白酶抑制活性为输出,利用开源数据对模型进行训练和优化。结果用优化后的模型从186味清热解毒中药所含的3863个活性成分中筛选出101个潜在的抑制剂。其中龙胆素、桑辛素C、5-羟基-4-氧代戊酸甲酯等化合物预测活性较高,黄芩、苍耳子、昆布、芫荽、紫苏等中药含有的潜在抑制剂数量较多。结论使用MPNN模型虚拟筛选出的抑制剂中约1/5已被其他的研究报道验证有效,证明了MPNN模型虚拟筛选结果的可靠性。此外,优化的神经网络模型微调后可用于分子其他属性的预测,在药物虚拟筛选领域有着广泛的应用前景。

丙型肝炎直接抗病毒药物的应用进展

抗病毒治疗是丙型肝炎重要治疗手段。丙型肝炎直接抗病毒药物(DAAs)主要包括NS3/4A蛋白酶抑制剂、NS5A抑制剂、NS5B聚合酶抑制剂三大类。通过一种或多种DAAs联合治疗,慢性丙型肝炎患者持续病毒学应答率可达90%。丙型肝炎DAAs多处于临床试验阶段,仅有部分药物已用于临床,疗效和不良反应差异较大。