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基于果蝇周期蛋白PER调控网络构建的两导数Runge-Kutta算法
1
作者
程小昊
刘雪萍
+1 位作者
Ibrahim Hussein Musa
游雄
《南京农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2014年第3期152-158,共7页
为更准确地模拟基因调控网络的动力学行为,考虑采用新的两导数Runge-Kutta模拟算法。这种数值算法的特点是在格式中融入了真实解的二阶结构,使得模拟结果更为精确。与通用的经典四级四阶Runge-Kutta算法RK4相比,二级四阶两导数Runge-Ku...
为更准确地模拟基因调控网络的动力学行为,考虑采用新的两导数Runge-Kutta模拟算法。这种数值算法的特点是在格式中融入了真实解的二阶结构,使得模拟结果更为精确。与通用的经典四级四阶Runge-Kutta算法RK4相比,二级四阶两导数Runge-Kutta算法TDRK2s4具有3个优势:1)构造简单,易于编程实现;2)计算成本小,RK4每步需要计算4次非线性函数,而TDRK2s4只需要计算3次;3)存储空间小,RK4方法需要4个内级存储单元,而TDRK2s4只要2个。TDRK2s4用于模拟具有持续振荡特征的果蝇周期蛋白PER与per mRNA负反馈调控网络。与RK4相比较,对不同步长(h=1/2,1/4,1/8,1/16),TDRK2s4的误差远小于RK4的误差;而且TDRK2s4对大步长(h=1/2)的误差远小于RK4对小步长(h=1/16)的误差。对固定步长(h=1/4),随着模拟区间的延长,TDRK2s4的累积误差增长十分缓慢,而RK4的累积误差增长很快。对不同步长(h=1/2,1/4,1/8,1/16),TDRK2s4计算耗费的CPU时间也明显少于RK4。TDRK2s4的模拟效率远高于RK4。结论:当基因调控网络微分方程组右端函数的导数容易得到时,TDRK算法比传统的RK算法更适用于大步长、长时间的高效数值模拟。
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关键词
果蝇周期蛋白
两导数runge-kutta算法
精度
效率
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职称材料
相拟合两导数Runge-Kutta方法
2
作者
苏伟伟
房永磊
《枣庄学院学报》
2015年第2期55-60,共6页
本文给出求解振荡问题的相拟合两导数Runge-Kutta方法,这个方法的代数阶为4.分析了方法的数值稳定性和相误差,数值试验验证了新方法的有效性.
关键词
两
导数
runge-kutta
方法
相拟合
振荡问题1
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职称材料
基于幅值计算的电网电压同步信号检测
被引量:
1
3
作者
肖静
杨艺云
+1 位作者
张阁
肖园园
《电测与仪表》
北大核心
2017年第10期63-68,共6页
针对目前电网电压锁相算法计算复杂、响应速度慢的缺陷,本文提出了基于幅值计算的电网电压同步信号检测算法,该算法的设计思路是当电网电压波形畸变较小时,得到一种快速跟踪电网电压同步信号的算法。本文首先介绍了满足快速性要求的电...
针对目前电网电压锁相算法计算复杂、响应速度慢的缺陷,本文提出了基于幅值计算的电网电压同步信号检测算法,该算法的设计思路是当电网电压波形畸变较小时,得到一种快速跟踪电网电压同步信号的算法。本文首先介绍了满足快速性要求的电网电压同步信号检测算法原理,然后给出了三种计算电网电压幅值的算法,并对它们进行了对比分析,最后通过仿真和实验分别验证了本文提出的三种电网同步信号检测算法在检测电网电压同步信号上的有效性。
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关键词
电网电压同步信号检测
Mann-Morrison
导数
算法
两
采样值积
算法
三采样值积
算法
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职称材料
题名
基于果蝇周期蛋白PER调控网络构建的两导数Runge-Kutta算法
1
作者
程小昊
刘雪萍
Ibrahim Hussein Musa
游雄
机构
南京农业大学理学院
出处
《南京农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2014年第3期152-158,共7页
基金
国家自然科学基金项目(11171155)
中央高校基本科研业务费自主创新重点项目(KYZ201424
Y0201100265)
文摘
为更准确地模拟基因调控网络的动力学行为,考虑采用新的两导数Runge-Kutta模拟算法。这种数值算法的特点是在格式中融入了真实解的二阶结构,使得模拟结果更为精确。与通用的经典四级四阶Runge-Kutta算法RK4相比,二级四阶两导数Runge-Kutta算法TDRK2s4具有3个优势:1)构造简单,易于编程实现;2)计算成本小,RK4每步需要计算4次非线性函数,而TDRK2s4只需要计算3次;3)存储空间小,RK4方法需要4个内级存储单元,而TDRK2s4只要2个。TDRK2s4用于模拟具有持续振荡特征的果蝇周期蛋白PER与per mRNA负反馈调控网络。与RK4相比较,对不同步长(h=1/2,1/4,1/8,1/16),TDRK2s4的误差远小于RK4的误差;而且TDRK2s4对大步长(h=1/2)的误差远小于RK4对小步长(h=1/16)的误差。对固定步长(h=1/4),随着模拟区间的延长,TDRK2s4的累积误差增长十分缓慢,而RK4的累积误差增长很快。对不同步长(h=1/2,1/4,1/8,1/16),TDRK2s4计算耗费的CPU时间也明显少于RK4。TDRK2s4的模拟效率远高于RK4。结论:当基因调控网络微分方程组右端函数的导数容易得到时,TDRK算法比传统的RK算法更适用于大步长、长时间的高效数值模拟。
关键词
果蝇周期蛋白
两导数runge-kutta算法
精度
效率
Keywords
period protein(PER) in Drosophila
two-derivative
runge-kutta
algorithm
accuracy
efficiency
分类号
O241.8 [理学—计算数学]
Q811.4 [生物学—生物工程]
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职称材料
题名
相拟合两导数Runge-Kutta方法
2
作者
苏伟伟
房永磊
机构
枣庄学院数学与统计学院
出处
《枣庄学院学报》
2015年第2期55-60,共6页
基金
国家自然科学基金项目(项目编号:11101357)
文摘
本文给出求解振荡问题的相拟合两导数Runge-Kutta方法,这个方法的代数阶为4.分析了方法的数值稳定性和相误差,数值试验验证了新方法的有效性.
关键词
两
导数
runge-kutta
方法
相拟合
振荡问题1
Keywords
two derivatives
runge-kutta
method
phase fitted
oscillatory problems
分类号
O241.82 [理学—计算数学]
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职称材料
题名
基于幅值计算的电网电压同步信号检测
被引量:
1
3
作者
肖静
杨艺云
张阁
肖园园
机构
广西电网有限责任公司电力科学研究院
出处
《电测与仪表》
北大核心
2017年第10期63-68,共6页
文摘
针对目前电网电压锁相算法计算复杂、响应速度慢的缺陷,本文提出了基于幅值计算的电网电压同步信号检测算法,该算法的设计思路是当电网电压波形畸变较小时,得到一种快速跟踪电网电压同步信号的算法。本文首先介绍了满足快速性要求的电网电压同步信号检测算法原理,然后给出了三种计算电网电压幅值的算法,并对它们进行了对比分析,最后通过仿真和实验分别验证了本文提出的三种电网同步信号检测算法在检测电网电压同步信号上的有效性。
关键词
电网电压同步信号检测
Mann-Morrison
导数
算法
两
采样值积
算法
三采样值积
算法
Keywords
detection of the grid voltage synchronous signal, Mann-Morrison derivative algorithm, two samples plot algorithm, three samples plot algorithm
分类号
TM464 [电气工程—电器]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于果蝇周期蛋白PER调控网络构建的两导数Runge-Kutta算法
程小昊
刘雪萍
Ibrahim Hussein Musa
游雄
《南京农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2014
0
下载PDF
职称材料
2
相拟合两导数Runge-Kutta方法
苏伟伟
房永磊
《枣庄学院学报》
2015
0
下载PDF
职称材料
3
基于幅值计算的电网电压同步信号检测
肖静
杨艺云
张阁
肖园园
《电测与仪表》
北大核心
2017
1
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职称材料
已选择
0
条
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引用分析
参考文献
引证文献
统计分析
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