海南黑山羊GH1基因nsSNPs功能性预测及生物信息学分析

为了研究海南黑山羊生长性状的分子遗传信息,试验利用GH1基因筛选可能影响海南黑山羊生长性状的功能性突变位点。结果表明在GH1基因外显子1、 2、 3、 4区域共检测到10个SNP位点,有4个错义突变,6个为同义突变。第一外显子350bp处发生的G→A导致氨基酸由原来的甘氨酸(Gly)变为丝氨酸(Ser),第二外显子739bp处发生G→A突变导致氨基酸由原来甘氨酸(Gly)变为丝氨酸(Ser),第三外显子1101bp处发生A→G突变导致氨基酸由原来天冬氨酸(Asp)变为甘氨酸(Gly),第三外显子1154bp处发生C→T突变导致氨基酸由原来精氨酸(Arg)变为色氨酸(Trp)。利用生物信息学方法对nsSNPs进行功能性预测、并进行mRNA二级结构、蛋白质二级结构和三级结构进行分析和建模,预测到Exon2-739G→A (G85S), Exon3-1120G→A (D129G)、 Exon3-1154C→T (R147W) 3个突变位点属于有害突变,对蛋白功能有较大影响,可能是导致海南黑山羊个体矮小,生长缓慢的功能性SNP。

围栏与放牧对高山嵩草草甸植物个体形态特征的影响

为了研究草地利用方式对高寒草地植物个体的影响,对三江源区高山嵩草草甸围栏与放牧植物水平方向(分种盖度)、垂直方向(高度)、营养枝、生殖枝、地上生物量和种子繁殖体重等指标进行综合比较。结果表明:长期放牧条件下优良牧草个体矮小化特征明显,集中体现在盖度下降,生殖枝减少,单株生物量和种子繁殖重下降,毒杂草则不明显。说明放牧因子对于高寒草甸植物具有"修饰"作用。