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大麦黄矮病毒PAV中国分离物外壳蛋白基因的克隆及同源性分析 被引量:6
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作者 贾力 吴茂森 +1 位作者 张文蔚 成卓敏 《植物病理学报》 CAS CSCD 北大核心 2001年第3期219-224,共6页
大麦黄矮病毒 PAV株系由麦长管蚜和禾谷缢管蚜传毒。本研究通过 RT- PCR、克隆和序列测定后 ,确认所得到的我国小麦 PAV分离物的外壳蛋白基因片段由 6 0 0个核苷酸组成 ,编码 199个氨基酸。序列同源性比较结果显示 ,与 BYDV的其它株系... 大麦黄矮病毒 PAV株系由麦长管蚜和禾谷缢管蚜传毒。本研究通过 RT- PCR、克隆和序列测定后 ,确认所得到的我国小麦 PAV分离物的外壳蛋白基因片段由 6 0 0个核苷酸组成 ,编码 199个氨基酸。序列同源性比较结果显示 ,与 BYDV的其它株系典型分离物的外壳蛋白基因同源性最高为74 .5 % ,而与国外发表的 PAV 8个分离物的 CP基因核苷酸同源性为 81%左右 ,且同源性比较的分值也较其它株系高。氨基酸序列的比较中 ,仅在 4 6到 6 0位氨基酸差别较大。 展开更多
关键词 大麦黄矮病毒 PAV中国分离物 外壳蛋白基因 同源性比较 基因克隆
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水稻条纹病毒中国分离物和日本分离物RNA1片段序列比较 被引量:2
2
作者 魏太云 林含新 +2 位作者 吴祖建 林奇英 谢联辉 《植物病理学报》 CAS CSCD 北大核心 2004年第2期141-145,共5页
首次测定了我国水稻条纹叶枯病常年流行区的云南楚雄(CX)及病害暴发区的江苏洪泽(HZ)的RSV 2个分离物RNA1片段的全长序列,这2个分离物RNA1片段的全长序列均为8970 nts。同源性分析结果表明,HZ与日本T分离物的亲缘关系较CX与T分离物的亲... 首次测定了我国水稻条纹叶枯病常年流行区的云南楚雄(CX)及病害暴发区的江苏洪泽(HZ)的RSV 2个分离物RNA1片段的全长序列,这2个分离物RNA1片段的全长序列均为8970 nts。同源性分析结果表明,HZ与日本T分离物的亲缘关系较CX与T分离物的亲缘关系更为接近。通过对纤细病毒属病毒RNA1编码的依赖于RNA的RNA聚合酶(RdRp)氨基酸序列分析的结果表明,该蛋白除了具有RNA聚合酶特征的基元序列结构外,还存在mRNA的转录过程中所采取的加帽起始机制的保守性结构域位点,这表明,纤细病毒属病毒和布尼安病毒科病毒及甲型流感病毒一样,都是采取加帽起始机制进行转录的。 展开更多
关键词 水稻 条纹病毒 中国分离物 日本分离 RNA1片段 序列比较
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水稻条纹病毒中国分离物和日本分离物RNA2节段序列比较(英文) 被引量:1
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作者 魏太云 林含新 +2 位作者 吴祖建 林奇英 谢联辉 《中国病毒学》 CSCD 2003年第4期381-386,共6页
测定了来源于我国水稻条纹叶枯病常年流行区的云南楚雄(CX)及病害暴发区的江苏洪泽(HZ)的水稻条纹病毒(RSV)2个分离物RNA2全长序列,其长度分别为3506bp和3514bp。与已报道的日本T和O分离物RNA2序列进行比较的结果表明,这4个分离物可分... 测定了来源于我国水稻条纹叶枯病常年流行区的云南楚雄(CX)及病害暴发区的江苏洪泽(HZ)的水稻条纹病毒(RSV)2个分离物RNA2全长序列,其长度分别为3506bp和3514bp。与已报道的日本T和O分离物RNA2序列进行比较的结果表明,这4个分离物可分为两组,其中,HZ、T和O分离物为一组,组内分离物之间,RNA2的毒义链(vRNA2)及RNA2的毒义互补链(vcRNA2)上的ORF的核苷酸一致性分别为97.2%~98.0%和96.8%~97.1%,5′端和3′端非编码区的序列则完全一致。但HZ分离物与T分离物的亲缘关系更为密切,其基因间隔区(IR)与T和O分离物的等长。另一组为我国CX分离物,组与组之间,vRNA2及vcRNA2上的ORF的核苷酸一致性分别为95.0%~95.7%和93.9%~94.4%。CX分离物的IR与HZ分离物相比缺失了一段8nt的片段。5′端非编码区的序列完全一致,但3′末端非编码区有一个碱基的差异。这些结果表明,RSV在自然界的分子变异与其地理分布具有密切的关系。此外,非编码区序列的高度保守性暗示着它们在病毒基因转录和复制的调控方面具有重要的功能。本文还讨论了RSV的分子流行病学。 展开更多
关键词 水稻条纹病毒 中国分离物 日本分离 RNA 序列分析 亲缘关系
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番茄花叶病毒中国分离物的生物学特性及其基因结构分析(英文)
4
作者 薛朝阳 周雪平 +1 位作者 青玲 李德葆 《浙江农业大学学报》 CSCD 北大核心 1998年第6期602-602,622,共2页
Tomatomosaicvirus(ToMV)isaspeciesofTobamovirus.Itwasfirstreportedin1909inAmerica.ToMVparticlesarestraighttub... Tomatomosaicvirus(ToMV)isaspeciesofTobamovirus.Itwasfirstreportedin1909inAmerica.ToMVparticlesarestraighttubules,about18nmind... 展开更多
关键词 番茄花叶病毒 中国分离物 学特性 基因结构
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甘薯病毒C中国分离物全基因组序列测定及比较分析 被引量:3
5
作者 秦艳红 渠瑞娜 +5 位作者 乔奇 王爽 张德胜 王永江 田雨婷 张振臣 《植物病理学报》 CAS CSCD 北大核心 2018年第3期324-329,共6页
利用RT-PCR结合RACE方法,从采自河南南阳的甘薯样品上获得甘薯病毒C中国分离物(SPVC-Ch1)的全长基因组序列。序列分析结果表明,SPVC-Ch1基因组由1 0846个核苷酸组成,3'末端包含poly(A)尾序。基因组含有1个由10 446个核苷酸构成的开... 利用RT-PCR结合RACE方法,从采自河南南阳的甘薯样品上获得甘薯病毒C中国分离物(SPVC-Ch1)的全长基因组序列。序列分析结果表明,SPVC-Ch1基因组由1 0846个核苷酸组成,3'末端包含poly(A)尾序。基因组含有1个由10 446个核苷酸构成的开放阅读框,编码一个由3 481个氨基酸残基构成的393 k Da多聚蛋白。将SPVC-Ch1与Gen Bank中登录的其他SPVC分离物序列进行比较分析发现,SPVC不同分离物间全基因组核苷酸序列相似性为92.7%~98.9%,多聚蛋白的氨基酸序列相似性为95.1%~99.2%,SPVC-Ch1与Bungo分离物的相似性最高,与C1分离物的相似性最低。系统进化树分析结果表明,SPVC-Ch1与日本的Bungo、以色列的IL、韩国的CW135和UN202等分离物形成一个分支,亲缘关系较近。这是SPVC中国分离物全基因组序列的首次报道,研究结果丰富了SPVC全基因组序列信息,有助于全面了解SPVC种群的遗传进化关系。 展开更多
关键词 甘薯病毒C(SPVC) 中国分离物 全长核苷酸序列 比较分析
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香蕉束顶病毒中国漳州分离物DNA 4编码区功能研究 被引量:5
6
作者 孙德俊 孙卉 +3 位作者 魏红艳 樊小雪 蔡文启 田颖川 《自然科学进展》 北大核心 2002年第7期708-712,共5页
利用PCR方法克隆了香蕉束顶病毒中国漳州分离物(BBTV-ZZ)DNA 4编码区,序列分析结果表明该编码区由351个核苷酸组成,推测其编码是一个含116个氨基酸的蛋白质,利用植物双元载体pBin438构建了含有BBTV-ZZ DNA 4编码区的植物组成型表达载体p... 利用PCR方法克隆了香蕉束顶病毒中国漳州分离物(BBTV-ZZ)DNA 4编码区,序列分析结果表明该编码区由351个核苷酸组成,推测其编码是一个含116个氨基酸的蛋白质,利用植物双元载体pBin438构建了含有BBTV-ZZ DNA 4编码区的植物组成型表达载体pBBTV-4B,经农杆菌介导转化了三生烟(Nicotiana tabacum Xanthi nc),在防虫条件下,将运动缺陷型CMV-Fny突变株(CMV-Fny-△MP)人工接种到转基因植株下部叶片上,12d后,在转基因植株的非接种叶上显现出不同程度的系统侵染症状,间接异种动物双抗体夹心酶联免疫吸附方法(DAS-ELISA)检测结果显示在转基因植株的上部非接种叶中有CMV-Fny的积累,而非转基因对照植株组的上部非接种叶中始终没有显现系统侵染症状,DAS-ELISA检测也未见CMV-Fny的积累,这些实验结果表明转基因植株能够支持CMV-Fny-△Mp从细胞到细胞和长距离运动并形成系统侵染症状,由此推测BBTV-ZZ DNA 4编码的蛋白质可能具有运动蛋白功能。 展开更多
关键词 香蕉束顶病毒 中国漳州分离 DNA4编码区 运动蛋白 CMV-Fny-△Mp PCR方法 表达载体
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香蕉束顶病毒中国漳州分离物DNA4编码区的克隆及在大肠杆菌中的表达
7
作者 樊小雪 孙德俊 +1 位作者 陈毓荃 蔡文启 《西北农业学报》 CAS CSCD 2002年第2期38-42,共5页
利用 PCR方法克隆了香蕉束顶病毒中国漳州分离物 (Banana bunchy top virus Chinese Zhangzhou,BBTV-ZZ) DNA 4编码区 ,序列分析结果表明 ,该编码区由 3 5 1个核苷酸组成 ,推测其编码一个含 1 1 6个氨基酸的蛋白质 (M.W.1 4.5 ku)。将 B... 利用 PCR方法克隆了香蕉束顶病毒中国漳州分离物 (Banana bunchy top virus Chinese Zhangzhou,BBTV-ZZ) DNA 4编码区 ,序列分析结果表明 ,该编码区由 3 5 1个核苷酸组成 ,推测其编码一个含 1 1 6个氨基酸的蛋白质 (M.W.1 4.5 ku)。将 BBTV DNA 4编码区克隆到原核表达载体 p TYB2上 ,构建了该基因的融合表达载体 p TYB-Β4。SDS-PAGE电泳分析表明 ,69ku的融合蛋白在大肠杆菌 ER2 5 66(DE3 )中正确表达。以含表达产物的凝胶为抗原 ,免疫家兔 ,制备了 BBTV DNA4编码蛋白的特异抗血清 ,Western blot显示 ,在Southern blot分析为阳性的转 BBTV DNA4编码区烟草中 ,1 4.5 ku的 BBTV DNA4编码区蛋白得到表达。这为进一步研究 BBTV DNA 4编码区蛋白在整个植株体内的功能奠定了基础。 展开更多
关键词 中国漳州分离 DNA4编码区 克隆 香蕉束顶病 原核表达 香蕉 束顶病
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香蕉束顶病毒中国漳州分离物DNA4非编码区启动子活性的研究 被引量:1
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作者 魏红艳 孙德俊 +2 位作者 李云 孙卉 蔡文启 《北京林业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2003年第5期34-37,共4页
应用PCR方法亚克隆了香蕉束顶病毒中国漳州分离物 (BananabunchytopvirusChineseZhangzhouisolate ,BBTV ZZ)DNA 4非编码区 (Po1)、主要共同区缺失片段 (Po2 )和主要共同区及茎环共同区都缺失片段 (Po3) ,分别插入到植物表达载体pCAMBI... 应用PCR方法亚克隆了香蕉束顶病毒中国漳州分离物 (BananabunchytopvirusChineseZhangzhouisolate ,BBTV ZZ)DNA 4非编码区 (Po1)、主要共同区缺失片段 (Po2 )和主要共同区及茎环共同区都缺失片段 (Po3) ,分别插入到植物表达载体pCAMBIA 130 4的gfp::gus基因上游 ,替代椰菜花叶病毒启动子 (CaMV 35S) ,得到重组质粒pTA2、pC2 6和pC45 .通过Agroinfiltration法 ,将含pTA2、pC2 6、pC45和pCAMBIA 130 4的根癌土壤杆菌 (Agrobacteriumtu mefaciens)注射进烟草 (NicotianatabacumL .cv .XanthiNC)叶片 ,进行 β 葡糖苷酸酶 (GUS)和绿荧光蛋白 (GFP)含量的瞬间表达分析 .含有pTA2、pC2 6、pC45、pCAMBIA 130 4和未注射的烟草叶片其GUS活性分别为 1 0 0 7、0 85 2、0 939、2 0 6 9和 0 0 2 1pmol·MU (μg·min) ;间接酶连免疫试验 (ELISA)结果表明每毫克总蛋白中的GFP于 490处的吸收值 (A490 )分别为 89 5 77、6 5 184、72 0 96、10 0 4 40和 3 2 87.以上表明Po1、Po2和Po3具有较强的启动子活性 .此外 ,转基因烟草的GUS组织化学定位检测试验进一步表明Po1、Po2和Po3具有维管组织特异性 . 展开更多
关键词 香蕉束顶病毒中国漳州分离 DNA 4 启动子活性 GUS GFP
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CMV甜瓜分离物外壳蛋白基因的克隆及植物表达载体的构建 被引量:2
9
作者 马新艳 古勤生 +4 位作者 刘丽锋 李宁 杨民和 彭斌 李莉 《中国病毒学》 CAS CSCD 2005年第3期307-310,共4页
从河南省临颖县采集的病毒感染的甜瓜样本经ELISA检测和接种分离获得黄瓜花叶病毒(Cucunbermosaicvirus,CMV)分离物。把该分离物接种西葫芦,从发病的叶片中提取总RNA,并以此为模板经RTPCR扩增获得CMV的外壳蛋白(cp)基因,将其克隆到pUCm... 从河南省临颖县采集的病毒感染的甜瓜样本经ELISA检测和接种分离获得黄瓜花叶病毒(Cucunbermosaicvirus,CMV)分离物。把该分离物接种西葫芦,从发病的叶片中提取总RNA,并以此为模板经RTPCR扩增获得CMV的外壳蛋白(cp)基因,将其克隆到pUCmT质粒上。经序列测定和分析,结果表明该cp基因由657个核苷酸组成,编码218个氨基酸。其核苷酸序列与黄瓜花叶病毒亚组I的分离物有较高的同源性,达92.2%~93.9%,与亚组II的同源性仅为76.8%~77.8%,与我国报道的CMV分离物的cp基因序列比较,除香蕉株系XB外核苷酸序列的同源性达91.8%~93.4%。根据这些分析,该CMV分离物属于亚组I。将cp基因通过中间载体pJIT163定向克隆到植物表达载体pBINPLUS中(重组双元载体质粒命名为pBCP),并经冻融法导入农杆菌中,经PCR及酶切鉴定,证实质粒已被导入。利用该植物表达载体对西瓜的遗传转化工作目前正在进行中。 展开更多
关键词 CMV 中国分离物 外壳蛋白基因 序列分析 表达载体
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CMV甜瓜分离物外壳蛋白基因的克隆及其生物信息学分析 被引量:1
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作者 马新艳 《南阳师范学院学报》 CAS 2008年第12期55-58,共4页
从河南省临颖县采集的病毒感染的甜瓜样本经ELISA检测和接种分离获得黄瓜花叶病毒(Cucumber mosaic vi-rus,CMV)分离物。把该分离物接种于西葫芦,从发病的叶片中提取总RNA,并以此为模板经RT-PCR扩增获得CMV的外壳蛋白(cp)基因,将其... 从河南省临颖县采集的病毒感染的甜瓜样本经ELISA检测和接种分离获得黄瓜花叶病毒(Cucumber mosaic vi-rus,CMV)分离物。把该分离物接种于西葫芦,从发病的叶片中提取总RNA,并以此为模板经RT-PCR扩增获得CMV的外壳蛋白(cp)基因,将其克隆到pUCm-T质粒上。经序列测定和生物信息学分析,结果表明该cp基因由657个核苷酸组成,编码218个氨基酸。预测该蛋白的等电点为5。12,分子量约为24kD。其核苷酸序列与黄瓜花叶病毒亚组I的分离物有较高的同源性,达92.2%~93.9%,与亚组II的同源性仅为76.8%~77.8%,与我国报道的CMV分离物的cp基因序列比较,只有香蕉株系XB外核苷酸序列的同源性达91.8%~93.4%。根据这些分析,该CMV分离物属于亚组I。另外还对黄瓜花叶病毒外壳蛋白的高级结构作出了预测。 展开更多
关键词 CMV 中国分离物 外壳蛋白基因 序列分析 信息学分析
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小西葫芦黄花叶病毒外壳蛋白基因的克隆及序列分析 被引量:16
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作者 古勤生 范在丰 +3 位作者 Piero Roggero 陈红运 俞正旺 李怀方 《植物病理学报》 CAS CSCD 北大核心 2003年第6期498-502,共5页
以小西葫芦黄花叶病毒(Zucchini yellow mosaic virus,ZYMV)的中国分离物(CH-87)接种发病的叶片中提取的总RNA为模板,经RT-PCR扩增获得ZYMV CP基因,将其克隆到pUCm-T质粒上进行序列分析。结果表明该CP基因由837个核苷酸组成,编码279个... 以小西葫芦黄花叶病毒(Zucchini yellow mosaic virus,ZYMV)的中国分离物(CH-87)接种发病的叶片中提取的总RNA为模板,经RT-PCR扩增获得ZYMV CP基因,将其克隆到pUCm-T质粒上进行序列分析。结果表明该CP基因由837个核苷酸组成,编码279个氨基酸。与已发表序列相比较,该CP基因与国际上已报道的4个基因型不同,应属于新的基因型,暂命名为基因型Ⅴ。 展开更多
关键词 ZYMV 中国分离物 外壳蛋白基因 基因型
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感染BBWV2的豌豆叶细胞线粒体结构变化
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作者 洪健 王卫兵 +1 位作者 徐颖 黎军英 《电子显微学报》 CAS CSCD 2005年第4期419-419,共1页
关键词 线粒体 叶细胞 结构变化 蚕豆萎蔫病毒2 豌豆 感染 病毒侵染 细胞学特征 中国分离物
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Cloning of Banana Bunchy Top Virus Chinese Zhangzhou Isolate DNA 4 and the Promoter Activity of Its Non_coding Region
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作者 孙德俊 魏红艳 +1 位作者 蔡文启 田颖川 《Acta Botanica Sinica》 CSCD 2002年第8期941-945,共5页
Banana bunchy top virus Chinese Zhangzhou isolate (BBTV-ZZ) DNA 4 was amplified by PCR and cloned. Sequence analysis showed that BBTV-ZZ DNA 4 is 1 039 nucleotides (nts) in length and this virus could be one member of... Banana bunchy top virus Chinese Zhangzhou isolate (BBTV-ZZ) DNA 4 was amplified by PCR and cloned. Sequence analysis showed that BBTV-ZZ DNA 4 is 1 039 nucleotides (nts) in length and this virus could be one member of BBTV Asian group. Transcriptional initiation site A, which is at the 269 nucleotide, was preliminarily determined by using 5' RACE method. BBTV-ZZ DNA 4 non-coding region was sub-cloned by PCR and inserted into upstream of gfp : : gus plant expression vector pCAMBIA 1304 to construct recombinant plasmid pTA2. Agrobacterium tumefaciens harboring pTA2 was injected into leaves of the tobacco (Nicotiana tabacum L. cv. Xanthi NC) via Agrobacterium-infiltration procedure. Transient expressions of GUS and GFP were determined in injected leaves 3 - 5 d later. GUS activities of pTA2, pCAMBIA 1304 injected and non-injected tobacco leaves respectively were 1.007 0 pmol MU(.)mug(-1.)min(-1), 2.069 0 pmol MU(.)mug(-1.)min(-1) and 0.021 4 pmol MU(.)mug(-1.)min(-1). Indirect ELISA for GFP in 1 mg total protein from pTA2, pCAMBIA 1304 injected and non-injected leaves showed an A(490 nm) value of 89.577, 100.440 and 3.287, respectively. These results showed that the non-coding region of BBTV-ZZ DNA 4 has a promoter activity not only in the virus replication in monocot, but also in driving the expression of a foreign gene in dicot plants. 展开更多
关键词 banana bunchy top virus Chinese Zhangzhou isolate DNA 4 5 ' RACE PROMOTER GFP GUS
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