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中国南部沿海美蓝拟相手蟹的群体遗传多样性研究
1
作者
杨明柳
高霆炜
+1 位作者
阎冰
吴斌
《广西科学院学报》
2023年第3期243-253,共11页
为探明中国南部沿海美蓝拟相手蟹(Parasesarma eumolpe)的群体遗传多样性,本文基于线粒体DNA的细胞色素氧化酶亚基Ⅰ(Cytochrome OxidaseⅠ,COⅠ)基因片段序列,对中国南部沿海8个美蓝拟相手蟹地理群体共95个个体进行群体遗传多样性分析...
为探明中国南部沿海美蓝拟相手蟹(Parasesarma eumolpe)的群体遗传多样性,本文基于线粒体DNA的细胞色素氧化酶亚基Ⅰ(Cytochrome OxidaseⅠ,COⅠ)基因片段序列,对中国南部沿海8个美蓝拟相手蟹地理群体共95个个体进行群体遗传多样性分析。结果表明,美蓝拟相手蟹所有个体的线粒体COⅠ基因片段序列长度均为631 bp,共有49个单倍型,群体平均单倍型多样度为0.8768±0.0325,平均核苷酸多样度为0.0422±0.0263,表现为高水平的遗传多样性。单倍型邻接关系树的拓扑结构显示美蓝拟相手蟹群体没有分化出明显的单倍型类群,尚未形成显著的分支谱系;单倍型的网络关系图呈现出明显的星状结构,未表现出显著的地理谱系结构。分子方差分析(Analysis of Molecular Variance,AMOVA)和群体间的遗传分化指数F st值结果表明,美蓝拟相手蟹群体在分布范围内尚未形成独立的遗传结构,遗传变异主要来自群体内。核苷酸不配对分布和中性检验结果表明,美蓝拟相手蟹在历史上经历了明显的群体扩张,扩张时间大约在14万年前。幼体阶段具较强的潜在扩散能力,群体间能进行频繁的基因交流,再加上群体扩张事件,可能是美蓝拟相手蟹群体间无显著遗传分化的原因。研究结果有助于揭示我国红树林潮间带相手蟹类种群遗传结构和分子系统地理学规律。
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关键词
美蓝拟相手蟹
COⅠ基因
遗传多样性
群体历史动态
中国南部沿海
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职称材料
中国南部沿海文昌鱼形态的研究
被引量:
9
2
作者
"文昌鱼资源调查"课题组
《福建水产》
1988年第3期1-6,共6页
文昌鱼是一种驰名中外的脊索动物,不但有丰富的营养价值,而且是研究脊索动物进化的稀有材料。据以往报道,在我国仅福建同安刘五店和山东青岛、烟台有分布。近年,在河北秦皇岛、广西合浦和广东遂溪也有关于文昌鱼分布和形态特征研究...
文昌鱼是一种驰名中外的脊索动物,不但有丰富的营养价值,而且是研究脊索动物进化的稀有材料。据以往报道,在我国仅福建同安刘五店和山东青岛、烟台有分布。近年,在河北秦皇岛、广西合浦和广东遂溪也有关于文昌鱼分布和形态特征研究的报道一。1986年10月以来,我们在开展文昌鱼资源调查工作中,
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关键词
中国南部沿海
地区
文昌鱼
形态特征
分布
比较研究
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职称材料
我国南部海域条纹斑竹鲨线粒体DNA控制区遗传多态性研究
被引量:
12
3
作者
陈骁
杨圣云
潘聪
《海洋学报》
CAS
CSCD
北大核心
2008年第6期115-121,共7页
在对我国南部沿海闽东、闽南、粤西、海南、北部湾5个海域的条纹斑竹鲨群体线粒体控制区多态性研究中,获得长度为1 094-1 096 bp的线粒体控制区完整序列。序列比对发现了6个多态性核苷酸位点,定义了8个单倍型。5个群体的单倍型多样度(h...
在对我国南部沿海闽东、闽南、粤西、海南、北部湾5个海域的条纹斑竹鲨群体线粒体控制区多态性研究中,获得长度为1 094-1 096 bp的线粒体控制区完整序列。序列比对发现了6个多态性核苷酸位点,定义了8个单倍型。5个群体的单倍型多样度(h=0.542 5-0.744 8)和核苷酸多样度(π=0.000 571-0.000 980)均处于较低水平,说明条纹斑竹鲨的线粒体DNA进化速率较低。分子方差分析(AMOVA)结果显示群体间的遗传差异较小(Fst=0.216 26,P〈0.000 1),变异主要发生在群体内部。10 000步Markov链计算的群体间遗传分化概率及单倍型系统地理学分析结果将5个群体分成两个地理种群(台湾海峡种群、南海北部种群)。综合分析表明条纹斑竹鲨的基因流主要在浅海近岸水域扩散,遗传变异程度受地理结构和距离隔离影响。
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关键词
中国南部沿海
条纹斑竹鲨
线粒体控制区
基因流
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职称材料
华东中南部山区淡水鱼类物种多样性及动物地理区划
被引量:
2
4
作者
唐文乔
宋小晶
张亚
《水生生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第5期621-629,I0001-I0009,共18页
为摸清华东中南部山区淡水鱼类物种多样性、阐明其在动物地理区划中的位置,研究先后5次对本地区所属长江下游、鄱阳湖、钱塘江、瓯江、闽江和韩江水系的132个河段作了实地调查,采集鱼类标本13000余尾。结合标本和历史文献的综合分析,发...
为摸清华东中南部山区淡水鱼类物种多样性、阐明其在动物地理区划中的位置,研究先后5次对本地区所属长江下游、鄱阳湖、钱塘江、瓯江、闽江和韩江水系的132个河段作了实地调查,采集鱼类标本13000余尾。结合标本和历史文献的综合分析,发现华东中南部山区自然分布的纯淡水鱼类有5目22科99属255种,其中有鲤形目182种、鲈形目40种、鲇形目27种、合鳃鱼目4种和胡瓜鱼目2种。特有鱼类多达58种,包括鲤科20种、虾虎鱼科17种、腹吸鳅科16种、鳅科2种,及沙鳅科、爬鳅科和钝头科各1种,主要发现于韩江(20种)、闽江(20种)和瓯江(16种)等南部水系。6个水系之间的物种相似度在50.8%—79.8%,全部9种拟腹吸鳅属及7种缨口鳅属中的6种集中分布于本地及邻近区域。区系分析显示,江河平原鱼类所占比例,从北面水系的50.0%逐渐下降到南部水系的40.0%,暖水性鱼类则从南部水系的32.5%下降至北面水系的15.6%。文章认为:南岭—武夷山—洞宫山山脉是东洋区南东亚亚区华南小区与华东小区的分界线,南面的闽江和韩江水系属于华南小区,此线以北属于华东小区;鉴于区域内特有种多又是属级分化中心等特点,将包括闽江、韩江在内的福建及广东南部水系定名为华南小区的闽粤分区,瓯江、钱塘江至长江下游水系定名为华东小区的浙苏皖分区,鄱阳湖水系则是华东小区赣湘分区的一部分。
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关键词
中国
东
南部
沿海
山区
物种多样性
区系特征
动物地理区划
淡水鱼类
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职称材料
题名
中国南部沿海美蓝拟相手蟹的群体遗传多样性研究
1
作者
杨明柳
高霆炜
阎冰
吴斌
机构
广西海洋科学院(广西红树林研究中心)
出处
《广西科学院学报》
2023年第3期243-253,共11页
基金
国家自然科学基金项目(32060282)资助。
文摘
为探明中国南部沿海美蓝拟相手蟹(Parasesarma eumolpe)的群体遗传多样性,本文基于线粒体DNA的细胞色素氧化酶亚基Ⅰ(Cytochrome OxidaseⅠ,COⅠ)基因片段序列,对中国南部沿海8个美蓝拟相手蟹地理群体共95个个体进行群体遗传多样性分析。结果表明,美蓝拟相手蟹所有个体的线粒体COⅠ基因片段序列长度均为631 bp,共有49个单倍型,群体平均单倍型多样度为0.8768±0.0325,平均核苷酸多样度为0.0422±0.0263,表现为高水平的遗传多样性。单倍型邻接关系树的拓扑结构显示美蓝拟相手蟹群体没有分化出明显的单倍型类群,尚未形成显著的分支谱系;单倍型的网络关系图呈现出明显的星状结构,未表现出显著的地理谱系结构。分子方差分析(Analysis of Molecular Variance,AMOVA)和群体间的遗传分化指数F st值结果表明,美蓝拟相手蟹群体在分布范围内尚未形成独立的遗传结构,遗传变异主要来自群体内。核苷酸不配对分布和中性检验结果表明,美蓝拟相手蟹在历史上经历了明显的群体扩张,扩张时间大约在14万年前。幼体阶段具较强的潜在扩散能力,群体间能进行频繁的基因交流,再加上群体扩张事件,可能是美蓝拟相手蟹群体间无显著遗传分化的原因。研究结果有助于揭示我国红树林潮间带相手蟹类种群遗传结构和分子系统地理学规律。
关键词
美蓝拟相手蟹
COⅠ基因
遗传多样性
群体历史动态
中国南部沿海
Keywords
Parasesarma eumolpe
COⅠgene
genetic diversity
population historical dynamics
the southern coast of China
分类号
Q347 [生物学—遗传学]
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职称材料
题名
中国南部沿海文昌鱼形态的研究
被引量:
9
2
作者
"文昌鱼资源调查"课题组
机构
福建省水产研究所
出处
《福建水产》
1988年第3期1-6,共6页
文摘
文昌鱼是一种驰名中外的脊索动物,不但有丰富的营养价值,而且是研究脊索动物进化的稀有材料。据以往报道,在我国仅福建同安刘五店和山东青岛、烟台有分布。近年,在河北秦皇岛、广西合浦和广东遂溪也有关于文昌鱼分布和形态特征研究的报道一。1986年10月以来,我们在开展文昌鱼资源调查工作中,
关键词
中国南部沿海
地区
文昌鱼
形态特征
分布
比较研究
分类号
Q959.287 [生物学—动物学]
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职称材料
题名
我国南部海域条纹斑竹鲨线粒体DNA控制区遗传多态性研究
被引量:
12
3
作者
陈骁
杨圣云
潘聪
机构
厦门大学海洋与环境学院
出处
《海洋学报》
CAS
CSCD
北大核心
2008年第6期115-121,共7页
基金
我国近海海洋调查与评价专项(908-01-ST09)
文摘
在对我国南部沿海闽东、闽南、粤西、海南、北部湾5个海域的条纹斑竹鲨群体线粒体控制区多态性研究中,获得长度为1 094-1 096 bp的线粒体控制区完整序列。序列比对发现了6个多态性核苷酸位点,定义了8个单倍型。5个群体的单倍型多样度(h=0.542 5-0.744 8)和核苷酸多样度(π=0.000 571-0.000 980)均处于较低水平,说明条纹斑竹鲨的线粒体DNA进化速率较低。分子方差分析(AMOVA)结果显示群体间的遗传差异较小(Fst=0.216 26,P〈0.000 1),变异主要发生在群体内部。10 000步Markov链计算的群体间遗传分化概率及单倍型系统地理学分析结果将5个群体分成两个地理种群(台湾海峡种群、南海北部种群)。综合分析表明条纹斑竹鲨的基因流主要在浅海近岸水域扩散,遗传变异程度受地理结构和距离隔离影响。
关键词
中国南部沿海
条纹斑竹鲨
线粒体控制区
基因流
Keywords
coastal waters of southern China
Chiloscyllium plagiosum
mitochondrial control region
gene flow
分类号
Q958.1 [生物学—动物学]
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职称材料
题名
华东中南部山区淡水鱼类物种多样性及动物地理区划
被引量:
2
4
作者
唐文乔
宋小晶
张亚
机构
上海海洋大学海洋动物系统分类与进化上海高校重点实验室
上海海洋大学水产种质资源发掘与利用教育部重点实验室
出处
《水生生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第5期621-629,I0001-I0009,共18页
基金
科技基础性工作专项(2015FY110200)资助。
文摘
为摸清华东中南部山区淡水鱼类物种多样性、阐明其在动物地理区划中的位置,研究先后5次对本地区所属长江下游、鄱阳湖、钱塘江、瓯江、闽江和韩江水系的132个河段作了实地调查,采集鱼类标本13000余尾。结合标本和历史文献的综合分析,发现华东中南部山区自然分布的纯淡水鱼类有5目22科99属255种,其中有鲤形目182种、鲈形目40种、鲇形目27种、合鳃鱼目4种和胡瓜鱼目2种。特有鱼类多达58种,包括鲤科20种、虾虎鱼科17种、腹吸鳅科16种、鳅科2种,及沙鳅科、爬鳅科和钝头科各1种,主要发现于韩江(20种)、闽江(20种)和瓯江(16种)等南部水系。6个水系之间的物种相似度在50.8%—79.8%,全部9种拟腹吸鳅属及7种缨口鳅属中的6种集中分布于本地及邻近区域。区系分析显示,江河平原鱼类所占比例,从北面水系的50.0%逐渐下降到南部水系的40.0%,暖水性鱼类则从南部水系的32.5%下降至北面水系的15.6%。文章认为:南岭—武夷山—洞宫山山脉是东洋区南东亚亚区华南小区与华东小区的分界线,南面的闽江和韩江水系属于华南小区,此线以北属于华东小区;鉴于区域内特有种多又是属级分化中心等特点,将包括闽江、韩江在内的福建及广东南部水系定名为华南小区的闽粤分区,瓯江、钱塘江至长江下游水系定名为华东小区的浙苏皖分区,鄱阳湖水系则是华东小区赣湘分区的一部分。
关键词
中国
东
南部
沿海
山区
物种多样性
区系特征
动物地理区划
淡水鱼类
Keywords
Coastal mountainous areas in Southeast China
Species diversity
Fauna characteristics
Zoogeographical divisions
Freshwater fishes
分类号
S932.4 [农业科学—渔业资源]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
中国南部沿海美蓝拟相手蟹的群体遗传多样性研究
杨明柳
高霆炜
阎冰
吴斌
《广西科学院学报》
2023
0
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职称材料
2
中国南部沿海文昌鱼形态的研究
"文昌鱼资源调查"课题组
《福建水产》
1988
9
下载PDF
职称材料
3
我国南部海域条纹斑竹鲨线粒体DNA控制区遗传多态性研究
陈骁
杨圣云
潘聪
《海洋学报》
CAS
CSCD
北大核心
2008
12
下载PDF
职称材料
4
华东中南部山区淡水鱼类物种多样性及动物地理区划
唐文乔
宋小晶
张亚
《水生生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022
2
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职称材料
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