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显微介导中国对虾基因鲤转录组测序及差异表达基因分析
1
作者
闫学春
栾培贤
何立川
《水产学杂志》
CAS
北大核心
2022年第5期1-7,共7页
运用显微介导的远缘杂交技术,将中国明对虾(Fenneropenaeus chinensis)总DNA直接导人鲤(Cyprinus carpio)受精卵内,创建鲤外源DNA导入系。利用Illumina高通量测序平台,对未进行显微介导和显微介导中国明对虾基因的2种鲤的肌肉组织进行...
运用显微介导的远缘杂交技术,将中国明对虾(Fenneropenaeus chinensis)总DNA直接导人鲤(Cyprinus carpio)受精卵内,创建鲤外源DNA导入系。利用Illumina高通量测序平台,对未进行显微介导和显微介导中国明对虾基因的2种鲤的肌肉组织进行转录组测序分析,结果获得差异表达基因417个,并对其进行GO(Gene Ontology)功能注释和KEGG代谢通路注释,得到18个与氨基酸相关的差异表达基因,其中14个下调基因,4个上调基因。分析发现,其中有2个基因在氨基酸代谢通路中能引起氨基酸含量的升高,即氨甲酰-磷酸合成酶(CPS2)基因和脯氨酰4-羟化酶(P4H)基因。对这2个基因进行实时荧光定量PCR验证发现,其基因的表达趋势与转录组结果一致,从而证实了转录组的分析结果。
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关键词
显微介导
中国对虾总dna
转录组测序
差异表达基因
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题名
显微介导中国对虾基因鲤转录组测序及差异表达基因分析
1
作者
闫学春
栾培贤
何立川
机构
中国水产科学研究院黑龙江水产研究所
出处
《水产学杂志》
CAS
北大核心
2022年第5期1-7,共7页
基金
中国水产科学研究院基本科研业务费资助(2020TD22)
中央级公益性科研院所基本科研业务费专项(HSY201707M)
国家高技术研究发展计划(863计划)项目(2011AA100404).
文摘
运用显微介导的远缘杂交技术,将中国明对虾(Fenneropenaeus chinensis)总DNA直接导人鲤(Cyprinus carpio)受精卵内,创建鲤外源DNA导入系。利用Illumina高通量测序平台,对未进行显微介导和显微介导中国明对虾基因的2种鲤的肌肉组织进行转录组测序分析,结果获得差异表达基因417个,并对其进行GO(Gene Ontology)功能注释和KEGG代谢通路注释,得到18个与氨基酸相关的差异表达基因,其中14个下调基因,4个上调基因。分析发现,其中有2个基因在氨基酸代谢通路中能引起氨基酸含量的升高,即氨甲酰-磷酸合成酶(CPS2)基因和脯氨酰4-羟化酶(P4H)基因。对这2个基因进行实时荧光定量PCR验证发现,其基因的表达趋势与转录组结果一致,从而证实了转录组的分析结果。
关键词
显微介导
中国对虾总dna
转录组测序
差异表达基因
Keywords
micromediation
total
dna
of Fenneropenaeus chinensis
transcriptome sequencing
differentially expressed gene
分类号
S917.4 [农业科学—水产科学]
Q959 [生物学—动物学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
显微介导中国对虾基因鲤转录组测序及差异表达基因分析
闫学春
栾培贤
何立川
《水产学杂志》
CAS
北大核心
2022
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