基于中药整合药理学平台分析黄连汤治疗胃炎的作用机制研究

目的基于中药整合药理学平台(TCMIP)探究黄连汤治疗胃炎的作用机制。方法借助TCMIP,提前预测采用黄连汤治疗胃炎的药物有效成分及相应的作用靶点,同时对黄连汤多成分—多靶点—多通路治疗胃炎的作用机制进行分析。结果黄连汤治疗胃炎共筛选出175个核心成分,538条关键靶标,通过T细胞受体、雌激素及趋化因子等信号通路在胃炎发生发展的病理环节中发挥重要调控作用。结论本研究初步探究了黄连汤治疗胃炎的可能作用机制与活性成分,进而为该药方的临床合理应用奠定良好基础。

基于中药整合药理学计算平台的小柴胡汤抗脓毒症的分子机制研究

目的:探讨小柴胡汤抗脓毒症的物质基础和作用机制,为该方的临床应用和研发提供参考。方法:借助中药整合药理学计算平台(TCMIP)进行小柴胡汤化学成分分析、疾病靶标预测、基因功能和通路富集分析,并建立“中药-化学成分-核心靶标-关键通路”的多维网络关系,对小柴胡汤抗脓毒症的作用机制进行探讨。结果:预测小柴胡汤的224个化学成分(包括柴胡皂苷、人参皂苷、甘草苷等)与脓毒症相关的118个核心靶标之间有相互作用,包括直接靶标血小板因子(PF)4、髓样分化因子(MYD)88、Toll样家族受体(TLR)4、CD14、一氧化氮合酶(NOS)3等,其抗脓毒症作用机制涉及神经系统、内分泌、免疫应答、能量代谢等。结论:小柴胡汤基于“神经-内分泌-免疫-代谢”等从多层面、多途径、多通路实现其抗脓毒症的作用。本研究初步揭示了小柴胡汤抗脓毒症潜在作用机制,为该方进一步的药效物质基础和作用机制研究以及临床应用提供了理论依据。

基于中药整合药理学平台探讨补中益气汤治疗甲状腺功能减退症的作用机制研究

目的:基于整合药理学思路和方法,对经典名方补中益气汤治疗甲状腺功能减退症的物质基础及分子机制进行初步分析。方法:利用中药整合药理学计算平台(TCMIP,www.tcmip.cn)预测补中益气汤治疗甲减的主要活性成分及作用靶点,筛选关键靶标并进行通路富集分析,构建补中益气汤"中药材-核心成分-关键靶标-主要通路"多维网络,探索其治疗甲减的可能机制。结果:共预测得到517个活性成分。其作用机制涉及1466个关键药靶及线粒体氧化应激、嘌呤代谢、内分泌系统、雌激素信号通路等相关生物过程和代谢通路。"关键成分-核心靶标-关键通路"分析显示36个化学成分与63个靶点可能参与了补中益气汤治疗甲减。结论:补中益气汤是以多成分交互作用于多靶点,通过多通路对甲减发挥一定的治疗作用。

基于中药整合药理学平台探讨酸枣仁-龙眼肉治疗失眠的分子机制

目的基于中药整合药理学平台探讨酸枣仁-龙眼肉治疗失眠的分子机制。方法基于中药整合药理学平台,进行酸枣仁-龙眼肉活性成分分析、药物及疾病靶标预测、蛋白质相互作用(PPI)网络构建、KEGG通路富集及GO功能分析,并建立“中药-活性成分-核心靶标-关键通路”多维网络,对酸枣仁-龙眼肉治疗失眠的分子机制进行探讨。基于网络分析结果,将60只KM雄性健康小鼠随机分为空白组、模型组、地西泮组及酸枣仁-龙眼肉低、中、高剂量组,采用对氯苯丙氨酸(PCPA)腹腔注射方法建立失眠动物模型,各组在相应药物灌胃28 d后进行自主活动实验,观察小鼠活动次数、活动时间和活动路程。采用酶联免疫吸附实验(ELISA)检测小鼠下丘脑组织中的白细胞介素-6(IL-6)、白细胞介素-1β(IL-1β)、5-羟色胺(5-HT)水平。结果酸枣仁-龙眼肉治疗失眠主要与29个活性成分相关,其活性成分可针对多个靶标、多条通路,作用涉及IL-6、IL-1β等炎性因子靶标和多巴胺D2受体(DRD2)、糖皮质激素受体基因(NR3C1)等神经递质靶标,主要通过cAMP信号通路等调节睡眠。动物实验表明,与模型组比较,酸枣仁-龙眼肉中、高剂量组活动次数减少,活动时间、活动路程缩短,下丘脑组织中的IL-1β、IL-6水平降低,5-HT水平升高(P<0.01)。结论酸枣仁-龙眼肉可能通过调控cAMP信号通路影响5-羟色胺能反应,对失眠起到治疗作用,该研究为进一步探讨酸枣仁-龙眼肉治疗失眠的机制提供了科学依据。

基于中药整合药理学平台的百合地黄汤治疗抑郁症的作用机制研究

经典名方百合地黄汤经化裁可用于多种病因所致抑郁,但目前多为基础理论研究或临床研究,缺乏对其活性成分及其作用机制的研究。该文以经典名方百合地黄汤为研究对象,借助中药整合药理学平台（TCMIP）探讨其活性成分、作用靶点和作用机制。该研究共预测得到10个活性成分,其中百合成分4个,分别为6-O-β-D-吡喃葡萄糖基-3β,26-二羟基-Δ5-胆甾烯-16,22-二氧代-3-O-α-L-吡喃鼠李糖基-（1→2）-β-D-吡喃葡萄糖苷、岷江百合苷D、百合皂苷、百合苷C;地黄成分6个,分别为谷氨酸、蔗糖、苍耳苷、腺苷、L-精氨酸、甘露三糖。其作用机制涉及54个关键药靶及嘌呤代谢、氨基酸代谢障碍、神经营养因子、雌激素信号通路等相关生物过程和代谢通路。这些靶点及通路均与文献报道的抑郁症发病机制相吻合,证明TCMIP在预测中药及复方作用机制方面具有较高的准确性。此外,研究还显示百合地黄汤在帕金森病、抗肿瘤、儿童急性白血病的治疗中存在一定的应用价值。该研究为进一步研究百合地黄汤抗抑郁作用机制提供科学依据,同时为经典名方的研究提供了新的研究思路。

基于中药整合药理学平台探究开心散治疗AD的物质基础与作用机制

目的:探究开心散治疗阿尔茨海默病的"成分-靶点-疾病"相互关系。方法:利用中药整合药理学平台V1.0收集开心散所含4味中药的相关活性成分及潜在靶点,并搜索阿尔茨海默病疾病靶标,对其节点(hubs)进行基因本体数据库和京都基因与基因组百科全书数据库富集分析。结果:开心散的250个化合物中有2 877个靶点与阿尔茨海默病相互关联。其中线粒体三功能酶α亚基(HADHA),羟基酰基辅酶A脱氢酶(HADH),甾醇-4-α-羧酸盐3-脱氢酶(NSDHL)等关键靶标主要通过调控嘌呤代谢、核苷酸代谢、亨廷顿氏病、阿尔茨海默病、神经退行性疾病,氧化磷酸化以及内分泌与代谢性疾病等生物过程,在细胞质、线粒体、三磷酸腺苷结合、线粒体基质等分子反应中发挥其药理作用。结论:通过该平台能够预测出开心散治疗阿尔茨海默病的关键靶标及其参与的相关通路,可为深入揭示该复方的物质基础和作用机制提供参考,同时为深入挖掘和开发经典名方开心散提供依据。

基于中药整合药理学平台探究二陈汤防治肥胖的物质基础与作用机制

目的挖掘二陈汤防治肥胖的物质基础与作用机制。方法以中医药大数据的信息技术为手段,基于中药整合药理学计算平台的中药方剂数据库、中药材数据库、中药成分数据库、疾病症状靶标数据库为支撑,对二陈汤防治肥胖进行关联分析。共同构建"二陈汤-中药材-化学成分-核心靶标-关键通路"的可视化网络探讨二陈汤防治肥胖的物质基础和作用机制。结果利用平台筛选出二陈汤的305个化合物中有105个靶点与肥胖病的关键靶点相互关联,其中关键靶点HADHA、HADH、NSDHL等参与调控了磷脂酰胆碱生物合成、RNA聚合酶II启动子转录对内质网应激的正调控等过程。结论本实验通过中药整合药理学平台筛选出二陈汤化学成分,并预测出其治疗肥胖的作用靶点和相关通路,可能与甘油磷脂代谢、脂质代谢、神经系统方面密切相关。为阐明其防治肥胖的分子机制奠定基础,对深入挖掘和开发经典名方二陈汤有重要意义。

基于中药整合药理学平台的温脾汤治疗溃疡性结肠炎作用机制研究

目的借助中药整合药理学平台,探讨温脾汤抗溃疡性结肠炎的潜在作用靶点和作用机制。方法基于中药整合药理学平台构建温脾汤成分-靶标-疾病靶标网络,分析筛选关键节点,进行功能和通路富集分析,探索温脾汤治疗溃疡性结肠炎可能参与的生物过程。结果测得温脾汤共有455个活性成分,预测靶标3044个。其作用机制主要涉及434个核心靶标及趋化因子信号通路、雌激素信号通路、甲状腺激素信号通路、MAPK信号通路、PI3K/Akt信号通路等。结论该研究初步分析了温脾汤治疗溃疡性结肠炎的潜在靶标及其可能的作用机制,为进一步开展温脾汤治疗溃疡性结肠炎的实验研究提供科学依据。

基于中药整合药理学平台分析保元解毒汤干预恶性肿瘤作用机制研究

目的前期研究发现,保元解毒汤可以改善恶性肿瘤模型生存质量,延长生存期,提示本方可能对恶性肿瘤有多靶点治疗效应。因此,基于整合药理学平台,运用网络药理学研究方法,开展保元解毒汤针对恶性肿瘤的靶标发现和机制研究。方法基于中药整合药理学平台(integrative pharmacology platform of TCM,TCM-IP;www.tcmip.cn),搜索保元解毒汤的化学成分,设置相似性分数≥0.8,预测保元解毒汤干预恶性肿瘤的主要活性成分和作用靶点,建立药物靶标与疾病靶标的相互作用网络,富集分析候选靶标参与的功能和通路,构建核心成分—关键靶标—主要通路交互网络图。结果在预测出的保元解毒汤147个活性成分中,人参皂苷Rg3、乌头碱、黄芪甲苷、阿魏酸、绿原酸和甘草酸苷等主要活性成分可以从调节免疫功能、抑制肿瘤浸润转移等途径参与对恶性肿瘤的干预,并且与细胞周期蛋白依赖性激酶(Cyclin-dependent kinase,CDK)、表皮生长因子受体(epidermal growth factor receptor,EGFR)等62个关键靶标具有相互作用,通过趋化因子、表皮生长因子和血管内皮生长因子等信号通路,参与抗恶性肿瘤转移、抗肿瘤免疫反应等关键病理环节的调控。结论初步揭示了保元解毒汤干预恶性肿瘤的活性成分、作用靶标和相关信号通路,为进一步的药效物质基础和作用机制研究提供了理论依据。

基于整合药理学的中药注射剂质量风险管控策略及关键技术

该文聚焦于中药注射剂质量风险问题,通过分析其重大技术需求,提出中药整合药理学研究策略,进而构建了中药注射剂质量风险管控关键技术体系。然后以生脉注射液为例,研究建立了基于整合药理学的中药注射剂质量风险管控方法。

基于整合药理学平台探究参苓白术散治疗2型糖尿病的物质基础和作用机制

目的：探究参苓白术散治疗2型糖尿病的＂成分-靶点-疾病＂相关关系。方法：利用中药整合药理学计算平台搜索参苓白术散中所有药物相关的活性成分及潜在靶点,并搜索2型糖尿病疾病靶标,二者进行富集分析。结果：参苓白术散有499个药物化学成分,药物之间可能有较强的协同作用,经过基因本体数据库和京都基因与基因组百科全书数据库富集结果显示,其化学成分对应的关键靶点定位于细胞质、线粒体、髓鞘等,参与调控腺嘌呤核苷三磷酸结合、蛋白激酶活性等1 481个生物过程、基因功能,并参与嘌呤代谢、核苷酸代谢、神经系统等179个相关通路来治疗2型糖尿病。结论：本研究通过中药整合药理学平台筛选出了参苓白术散的化学成分,并预测出其治疗2型糖尿病的作用靶点和相关通路,可能与糖脂代谢、能量代谢等密切相关,为阐明其抗2型糖尿病的分子机制奠定基础,对深入挖掘和开发经典名方参苓白术散具有重要意义。

基于TCMIP V2.0的溃疡性结肠炎不同中医证候和推荐方药的科学内涵

溃疡性结肠炎(ulcerative colitis,UC)是一种病因还尚未明确的慢性疾炎症性肠病。本研究运用TCMIP V2.0(http://www.tcmip.cn/),探析溃疡性结肠炎不同中医证候和推荐方剂对证治疗的分子机制。其结果显示,“中药方剂-中药材-化学成分-疾病-核心靶标-关键通路”的相关分子预测UC不同证候和推荐方药的科学内涵。中医临床症状或体征是中西医共同理解的指标体系,本文以“疾病-证候-方剂”为切入口,探析中医证候的潜在分子基础和方剂治疗作用可能分子机制,用现代分子生物学诠释中医证候和方剂作用机理的科学内涵,以期对中医药防治UC提供参考。

基于组方规律和分子靶点的雄激素性脱发治疗中药发现

目的通过治疗雄激素性脱发(AGA)方剂的组方用药规律分析,并结合网络靶标反向查找中药,发现治疗AGA的有效中药,为处方发现提供依据。方法以“脱发”为关键词,在中医药百科全书在线数据库(ETCM v2.0)检索古代方剂和中成药,按照排除标准进行筛选后,采用中医传承辅助系统(v2.5)开展用药频次、药性理论、关联规则等分析。利用文献检索AGA相关通路及靶点,反向查找靶点所对应的中药,对2部分中药进行交集,按照中药材对应靶点个数进行排序,在中医药整合药理学研究平台(TCMIP v2.0)收集排名前20味中药的化学成分,用Cytoscape 3.8.0软件构建“中药-成分-靶点-通路”网络图,并进行可视化。结果分析得出传统组方中治疗脱发的高频次中药为当归、川芎、熟地黄、茯苓、附子、白术等,核心组合10个,使用频次>10的关联规则6个。依据数据库分析富集靶点个数最多的中药为枸杞子、山药、半夏、地黄等,同时富集4条通路及雄激素受体(AR)、II型5α-还原酶(SRD5A2)基因的中药为丹参,其发挥作用的成分为丹参环庚三烯酚酮、胡萝卜苷、齐墩果醇酸、丹参醛、丹酚酸B。结论针对AGA的中药主要以补肝血、养血滋阴类为主。丹参可能是治疗AGA的潜在有效中药材,并可能是通过丹参环庚三烯酚酮、胡萝卜苷、齐墩果醇酸、丹参醛、丹酚酸B等成分发挥作用。

基于TCMIP V2.0探析新型冠状病毒肺炎全病程中医证候和推荐方剂的科学内涵

新型冠状病毒肺炎(coronavirus disease 2019,COVID-19)自首次确诊以来,引起了全社会的高度关注,中医药针对COVID-19肺炎发病全过程治疗的参与度高,临床疗效确切。中医药以整体观念和辨证论治为理论和思维特色,证候是中医药理论的核心,该研究以"症状"为切入点,运用中药整合药理学网络计算平台2.0(TCMIP V2.0,http://www.tcmip.cn/),构建COVID-19肺炎初期(寒湿郁肺证)、重症期(疫毒闭肺证)、危重期(内闭外脱证)、恢复期(肺脾气虚证)4个时期代表证候和代表方剂的分子网络,探析COVID-19肺炎各阶段证候的生物学基础及推荐方剂对证治疗的分子机制。结果显示,"免疫-炎症"相关分子可能贯穿COVID-19肺炎发病和进展全过程,在重症期和危重期患者炎症分子网络占比明显加大,该时期可能存在细胞因子风暴,同时出现呼吸障碍、心肺功能失调、神经系统紊乱等多脏器分子网络失衡。推荐方剂具有潜在的增强机体免疫功能、减轻炎症反应、加强营养物质吸收代谢、调节能量代谢、缓解心肺功能异常、调节神经系统功能等多方面作用,推测对呼吸困难、胸闷气促、腹胀便秘、汗出肢冷、神昏、烦躁等症状具有较好的改善作用,体现了"多成分、多靶标、多通路、多效应"的整合干预特点。该研究系统构建COVID-19发病4个阶段证候的分子网络,体现"对证"和"对症"治疗的中医优势和特色,对于揭示推荐方剂作用原理和科学内涵有所帮助,以期对中医药防治COVID-19提供参考。