基于DNA barcoding(条形码)技术的中药材鉴定

DNA条形码(DNA barcoding)是根据对一段标准的DNA序列的分析来鉴定物种,已成为生物物种鉴定的新方向,受到世界40多个国家130多个组织中传统生物分类学家、分子生物学家和生物信息学家等多学科专家的关注。本文通过介绍DNA条形码的产生、发展和研究现状,探讨其在中药材鉴定中应用的技术方法、技术路线、关键问题以及应用范围,并展望了DNA条形码在中药材鉴定中的应用前景。

DNA条形码技术在中药材鉴定中的应用

DNA条形码技术是一种新兴的分子鉴定方法,它能弥补传统化学方法和形态学方法鉴定中药材的不足之处。通过查阅文献,在分析DNA条形码技术的原理、发展的基础上,对目前一些热门的DNA条形码候选序列ITS、ITS2、psbA-trnh、rbcL、matK展开讨论,重点分析其在植物类和动物类中药材鉴定中的应用,为中药材的鉴定提供新的思路。

基于DNA条形码的中药材种子种苗鉴定研究——以重楼为例

目的:以重楼为例,探讨DNA条形码技术在中药材种子种苗鉴定中的应用,为中药材种子种苗基原物种鉴定提供技术参考。方法:采用DNA条形码技术,建立重楼中国药典物种标准条形码数据库,通过序列比对、遗传距离比较和系统NJ树构建,研究DNA条形码在种子种苗鉴定中的应用。结果:云南重楼和七叶一枝花种内遗传距离分别小于种间遗传距离,ITS条形码可有效鉴别正品重楼及其混伪品的种子种苗。结论:DNA条形码技术是中药材种子种苗鉴定的有效手段,应用前景广阔。

中药材DNA条形码鉴定研究进展

DNA条形码技术给中药鉴定学发展带来新的机遇,中药材DNA条形码鉴定数据库及中草药DNA条形码生物鉴定体系的创建有利于推进中药鉴定标准化和国际化。中药材DNA条形码分子鉴定法指导原则已纳入《中华人民共和国药典》2010版第三增补本,为中药材基原物种鉴定提供强有力的科技支撑,将在中药材及中成药流通监管、道地药材鉴别、保健食品和食品质量安全控制等领域发挥重要作用。将中药材DNA条形码分子鉴定法与中国药典规定的其他鉴别方法相结合,能够对药品质量进行综合评价与有效监控。

DNA条形码分子鉴定技术在中药材鉴定中的应用

DNA分子鉴定技术是一种新兴的基于基因层面的中药材鉴别方式,具有特异性强、准确率高等优势。植物类中药材中常选用的DNA条形码片段为内转录间隔区(ITS)、RNA转录体II型内含子剪切酶基因(matK)、叶绿体psbA-trnH基因、叶绿体核酮糖-1,5-二磷酸羧化酶大亚基(rbcL)等。动物类药材中常选用的DNA条形码片段为线粒体细胞色素C氧化酶亚基I(COI)、核糖体RNA(rRNA)、线粒体细胞色素b基因(Cytb)等。本文重点探讨DNA条形码等分子鉴定技术在动、植物类中药材鉴定中的应用,并分析其存在的局限性及应用前景,为中药材鉴定及质量控制提供新的参考。

基于ITS2的中药材金莲花DNA条形码鉴定研究

金莲花(Trollius chinensis Bge.)是毛茛科金莲花亚科多年生草本植物的干燥花及花蕾[1].金莲花味微苦、性寒、无毒,具有清热解毒、滋补阴气、清热降火、抗菌消炎、养阴清热、消炎杀菌等功效[2].金莲花以花入药,其形态受气候环境等多种因素影响,采用传统鉴定方法具有一定局限性.DNA条形码技术是基于遗传物质DNA对物种进行鉴定,不受生长环境、地理位置及人为因素的影响.本研究尝试建立一种基于ITS2序列的DNA条形码鉴定方法,以期为中药材金莲花的鉴定提供参考依据.

建立我国中药材DNA条形码数据库方法的探讨和前景展望

中药鉴定是中药学的核心。我国的中药材种类繁多,资源丰富,由于来源复杂,真伪难辨,传统的中药鉴定技术有各种不足。近些年出现的DNA条形码可以很好地应用于中药材的鉴定。建立一个中药材的DNA条形码数据库对我国中药材鉴定是非常有益的,可以极大地提高中药材的鉴定水平,促进中药的现代化。DNA条形码在动物中采用线粒体基因已经确定,但是植物中还没有广泛认同的条形码标准片段。由于中药材绝大多数是植物,目前植物类中药材条形码的研究倾向于用一种或多种条形码联合应用。

DNA条形码技术在中药领域的应用研究进展

DNA条形码技术是一种有效、实用的分子鉴定手段,能有效弥补传统鉴定方法在中药鉴定方面的不足,与色谱、代谢组学等结合,科学地判断中药的真伪与品质优劣。现基于DNA条形码在中药材、中药饮片和中成药方面的应用现状作以综述,以期为中药的鉴定研究和质量评价提供思路。

基于DNA条形码分子技术的海龙及其混伪品鉴定研究

目的:基于DNA条形码分子技术对动物药海龙及其混伪品进行鉴别,建立一种统一的海龙鉴定技术手段。方法:对收集到的动物药海龙及其混伪品进行DNA提取、PCR扩增和双向测序检测,运用CodonCodeAligner进行序列拼接,采用MEGA7.0软件进行序列比对分析,比较种内、种间序列差异,构建动物药海龙及其混伪品的系统发育树。结果:所有海龙药材及其混伪品均可以使用中药材DNA条形码分子鉴定技术进行鉴别,共得到7个物种129条序列,各物种之间序列区分明显。结论:中药材DNA条形码鉴定技术能够准确有效地鉴别动物药海龙及其混伪品,可以作为海龙类中药的统一鉴定方法,为海龙的临床用药安全提供了新的分子技术手段。

环境DNA条形码技术在水生生物种类鉴定中的简化应用分析

为有效保护地球生物多样性,推动生态环境可持续性发展,我国相关部门大力开展生物技术研发工作,逐步开创了环境DNA条形码技术(eDNA),借此来对生物种类进行鉴定,为生态环境保护事业作出贡献。对比传统分子生物学方法,环境DNA条形码技术(eDNA)无论是操作方式、还是在成本支出方面都更为精简高效,也可有效缩减样品提取量,为水生生物种类鉴定工作提供良好支持和帮助。相关工作人员可从不同方面对环境DNA条形码技术进行分析,从而明确水生生物种类鉴定过程中环境DNA条形码技术简化应用策略。

DNA条形码技术在中药制剂中鸡内金鉴定的应用研究

探究DNA条形码技术在中药制剂中鸡内金鉴定的应用效果。方法 抽选不同种类鸡内金成分的中药制剂,利用DNA条形码技术进行药材鉴别,探究鉴别效果。结果 DNA样品A260/A230均超过2.0,A260/A280均在1.7-1.9之间,DNA浓度均在10 μg/mL至50 μg/mL之间。含鸡内金药品HE-PCR扩增产物序列与鸡内金线粒体COI基因序列对比相似度均超过98%,部分相似度可以达到100%。结论 在中药制剂中鸡内金鉴定采取DNA条形码技术可以更好的鉴别中药制剂中的成分,操作简单、准确率高、鉴别速度快,值得推广。

药用植物DNA条形码与分子标记技术的研究进展

目的对药用植物DNA条形码技术和分子标记技术的研究进展进行综述,为药用植物鉴定、遗传育种及种质资源保护的进一步研究奠定基础。方法查阅总结近年来国内外文献,对DNA条形码技术和分子标记技术的特征、种类及在药用植物中的应用情况进行总结。结果DNA条形码和分子标记技术已经被广泛应用于药用植物中。DNA条形码技术能够迅速且精确地对药用植物进行鉴定,克服了传统鉴别方式的缺陷;分子标记技术则以其操作简便、敏感度高、结果精确等优势,在促进药用植物的科学研究中获得了广泛的应用。结论DNA条形码和分子标记技术的出现对药用植物的鉴定产生了积极的影响,为种质资源的保护、鉴定、亲缘关系分析和遗传进化提供了依据,随着科技的不断进步,DNA条形码和分子标记技术也将不断精确,并对中医药现代化产生更加深远的影响。

COI基因DNA条形码技术在福建省蜱类鉴定中的应用

目的探讨基于线粒体细胞色素C氧化酶亚基I(COI)基因的DNA条形码技术应用于福建省蜱类鉴定的可行性。方法蜱标本经形态学鉴定后提取基因组DNA,PCR扩增COI基因片段,并进行测序和比对,用Kimura-2-parameter模型计算种内及种间遗传距离,以邻接法构建系统发育树。结果经形态学鉴定,97只蜱隶属于5属12种,遗传距离计算结果显示,种间遗传距离(14.65%~26.79%)显著大于种内遗传距离(0~7.14%);BLAST同源性比对发现GenBank数据库中尚无越原血蜱(Haemophysalis Yeni)与基刺硬蜱(Ixodes spinicoxalis)的COI基因序列,褐黄血蜱(H.flava)、台岛血蜱(H.formosensis)、豪猪血蜱(H.hystricis)、粒形硬蜱(I.granulatus)、微小扇头蜱(Rhipicephalus microplus)与血红扇头蜱(R.sanguineus)的形态学鉴定与DNA条形码鉴定结果一致,但是,龟形花蜱(Amblyomma testudinarium)、台湾革蜱(Dermacentor taiwanensis)、中华硬蜱(I.sinensis)的形态学鉴定与COI基因DNA条形码鉴定结果不一致;系统发育树显示,同一物种的不同个体均形成高支持率的单系,种间分支很明显。结论COI基因DNA条形码测定是一种快速准确的蜱类鉴定新兴技术,但现阶段,COI基因DNA条形码技术尚不能完全脱离传统的形态学鉴定而独立进行,两者应有机结合。

基于DNA条形码对湖北中药材市场的调查分析

目的:湖北省中药历史悠久,是我国重要的药材主产区之一,调查分析湖北市场流通中药材真伪情况对市场监管具有重要意义。方法:本文利用DNA条形码鉴定技术对抽样于湖北中药材市场的12份动物药及494份植物药提取总DNA并扩增相应鉴定序列,比对标准数据库实现真伪鉴别。结果:针对所抽样品,获得鉴定序列COI 12条,ITS2 482条,扩增成功率为98%;477份样品准确鉴定到种,鉴定成功率97%;共鉴定出伪品28份,占所抽查样品的5.5%,其中皂角刺掺伪9%,川贝母掺伪20%,桃仁掺伪44%。结论:DNA条形码技术作为一种快速、准确、易标准化的鉴定方法,为保障中药材用药安全提供有力技术手段,将在中药材市场监管中发挥重要技术支撑作用。

基于DNA条形码技术的香梨优斑螟分子鉴定

香梨优斑螟(Euzophera pyriella Yang)作为新疆林果的重要害虫,对水果生产和贸易都有一定的影响。其各虫态的形态特征与近缘种相似,不易进行快速鉴定。本研究选择线粒体DNA细胞色素氧化酶I(COI)基因片段作为物种鉴定的条形码,结合BOLD系统的鉴定工具和系统发育树构建,对香梨优斑螟进行了分子鉴定。结果发现检测的9个样本(成虫、蛹、幼虫和卵)全为香梨优斑螟,相似度在99.23%以上,在以NJ方法构建的系统发育树中,明显与近缘种枇杷暗斑螟(Euzopherabigella)区分开。

DNA分子标记技术在中药材品质鉴定中的应用进展

目的了解DNA分子标记技术在中药材品质鉴定中的应用进展。方法检索本领域国内外相关文献资料并进行分析、整理和总结。结果DNA分子标记技术在该领域中得到了广泛应用。结论DNA分子标记技术可以作为中药材品质鉴定的重要手段。

DNA条形码技术在动物类中药鉴定中的应用研究进展

DNA条形码鉴定技术可以实现对物种进行快速鉴定,本文从肌肉类中药材、贝壳类中药材、角骨类中药材等方面对DNA条形码技术在动物类中药鉴定中的应用研究现状与展望展开综述,DNA条形码数据库是动物类中药材分子鉴定的重要参考依据,应完善基础数据库建设以及相关标准的制定,推动动物类中药材分子鉴定和产业化的深入发展。

DNA条形码技术及其在动物物证鉴定中的应用

野生动植物是地球自然资源的重要组成部分,具有很高的生态意义,并包括了科学、文化、经济在内的多方面价值。然而,随着人类文明的不断发展和社会的进步,野生动物的栖息地已经并仍在被人类不断侵蚀,加之动植物资源过度消耗,全球动植物资源总量下降较快。

利用DNA条形码技术鉴定一批鳄鱼产品

DNA条形码技术现已广泛应用于物种鉴定及分类研究。采用该技术对海关查获的一批走私鳄鱼产品进行鉴定,从该批鳄鱼产品中抽取3类样品(鳄鱼肉干、鳄鱼鞭及鳄鱼皮干)各1份,提取样品中的线粒体DNA,并使用通用引物扩增各样品的COⅠ基因部分序列,将扩增到的序列与GenBank中下载的5种鳄鱼的18条同源序列进行比对分析,并利用MEGA4.0计算物种间的遗传距离,发现3种未知样品与暹罗鳄(Crocodylus siamensis)的序列相似性最高,达到99.6%-100%,遗传距离最小,为0.000-0.003。以孟加拉巨蜥(Varanus bengalensis)作为外群,采用P-distance等模型,构建NJ树,结果 3类样品均与暹罗鳄聚为一枝。上述结果分析表明,3类未知样品均来自暹罗鳄,该结果也为海关人员执法提供了依据。

利用DNA条形码技术对截获瓜实蝇幼虫的鉴定研究

瓜实蝇是世界重要的检疫性害虫之一,对果蔬生产及其国际贸易具有很大的影响。该虫在口岸截获时均为幼虫或卵,通常采用形态学鉴定方法对卵和幼虫在室内饲养、羽化出成虫后再进行鉴定。采用DNA条形码技术,可以对复合体之外的实蝇种类卵、幼虫进行鉴定。本文以进境越南西瓜中所截获的瓜实蝇为对象,对上述两种鉴定方法进行了比较研究,结果显示,DNA条形码技术鉴定比常规形态学鉴定快3倍以上,前者可实现对口岸截获的瓜实蝇幼虫的快速鉴定。